Ch7 Flashcards

1
Q

Maladie infectieuse:

A

Maladie causée par un agent infectieux, i.e. capable de multiplication

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Types d’agents infectieux

A

– bactéries
– levures/moisissures
– vers
- virus et prions
– protozoaires

—> 61% sont zoonotiques (transmissibles entre humains et animaux)

—> plupart des pathogènes en émergence sont des virus, puis des bactéries

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Postulats de Koch

A

Critères pour établir la cause d’une maladie infectieuse

Conditions:
– Isolation du pathogène à partir de tous les individus ou des tissus malades
– Propagation au laboratoire
– Reproduction de la maladie dans un hôte semblable par inoculation
– Ré-isolation de l’agent pathogène de ces hôtes

Conditions supplémentaires pour les virus
• Détection d’une réponse immunitaire spécifique au virus
• En général filtrable (0,22 μm)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Conditions supplémentaires aux Postulats de Koch (4)
- pathogénicité

A
  • Une maladie est associée avec une souche pathogénique
  • Le gène de virulence en question est présent dans la souche pathogénique mais absent dans une souche non virulente
  • L’inactivation de ce gène résulte dans la perte de virulence de la souche pathogénique
  • Le transfert de ce gène dans une souche non pathogénique restaure la pathogénicité
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Complexité des postulats de Koch

A

• Parfois difficile d’obtenir des échantillons chez des patients en vie (ex: une tranche du cerveau!)

• Les humains sains sont positifs pour plusieurs pathogènes
– Virus herpès simplex : 80-90% des adultes
– Adénovirus: 60% dès l’âge de 10 ans

• Commun de trouver plusieurs agents infectieux chez un individu malade

• Impossible de ré-inoculer des individus (modèles animaux)

• Relation de cause à effet difficile mais pas impossible à prouver (épidémiologie)

• Les techniques de mutagénèse modernes peuvent introduire des mutations indésirables (introduire erreurs)

• Système digestif rempli de bactéries (pas pour autant pathogéniques)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Aspect important pour l’identification du pathogène

A

La taille

• plupart virus passent a travers filtre

(b sans capside ou capside molle peuvent passer aussi)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Méthodes d’Identification de protozoaires

& classification

A

• 10-100 um
• unicellulaire
• eucaryote
• Présence d’organites internes (délimités par une membrane lipidique)

Classification par:

• Morphologie (organites intracellulaires)
• Mode de locomotion (eg: flagelles, cils, pseudopodes)
• Formation de spores

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Bactéries
Identification et classification

A

• procaryotes
• taille variable (quelques um)
• pas d’organite ou membrane interne
• paroi cellulaire (gram +/-)
• unicellulaire

Classification par
• Forme (bâtonnet, cocci)
• Motilité
• Croissance sur divers milieux
• Colorations
• Tests enzymatiques

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Virus
Identification et classification

A

• majorité filtrables (<0,22 μm)
• 10-100 nn - necessite microscope electronique
• Croissance intracellulaire obligatoire
• Pas de membranes lipidique interne mais plutôt une capside (fait de protéines)

Classification

• Nature du génome (ARN, ADN)
• Brin positif ou négatif (ARN)
• Nombre de brins, segmentation
• Forme des capsides
• Avec ou sans une enveloppe lipidique
• Tropisme/Hôte

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Particularité des virus

A

• non-vivants
—> pas capable de se multiplier par lui meme (l’espèce)

• Parasites intracellulaires obligatoires
—> génome des virus sont trop petits - peuvent pas coder pour tout
ce qu’il a besoin (ex. ribosomes)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Tropisme (mouvement) des virus

A

• Diverses voies d’entrée (e.g. peau, aérien, système digestif, muqueuses)
—> dépendante de récepteurs c-aires

• divers modes d’internalisation
—> fusion membranaire
—> endocytose

– Expression des gènes viraux

– Réplication du génome

– Assemblage de nouveaux virions

– Transport intracellulaire et relâche dans le milieu de culture

– Évasion du système immunitaire

– Dépendance envers des fonctions cellulaires
(répertoire de 833 gènes de l’hôte affectant la réplication du VIH)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Impact des virus sur la morphologie cellulaire

A

outil diagnostique vu par microscopie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

effets cytopathiques définition (CPE)

A

altérations visibles des c qui résultent d’une infection par un agent pathogène, comme un virus, une bactérie ou un champignon

Ex.
• fusion entre cellules
• lyse de cellules (virus lytique)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

SIDA: symptômes

A

Syndrome d’immunodéficience acquise

—> symptômes apparaissent des années après infection

– Immunodéficience
– Perte de poids
– Asthénie (fatigue physique)
– Formes rares et atypiques de cancers
(Ex. sarcome de Kaposi)

– Effets variés sur:
• Le cerveau (encéphalite, méningite)
• Les yeux (rétinite)
• Les poumons (pneumonie, tuberculose, autre)
• Le système intestinal (diarrhée, tumeurs)
• La peau

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

SIDA origine et passage à l’homme

A

Origine animale

VIH (virus d’immunodéficience humaine)
dérivé par mutation du VIS (virus d’immunodéficience simien)

Passage à l’homme
– Chasse (dépeçage)
– Animal de compagnie (morsure)
– Évènements distincts pour VIH 1 & 2 car très différents

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

VIH

A

Virus enveloppé avec deux copies complètes de son génome d’ARN (simples brins positifs)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

SIDA particularités

A

• Latence d’environ 10 ans entre la séropositivité (présence du virus) et le SIDA (manifestation de la maladie)

• Causes proposées de la pandémie
Urbanisation,
prostitution,
déplacements de la population*,
changements de
comportements sexuels,
apparition de drogues injectables

*: Propagation initiale liée au chemin de fer
*: Transfert aux USA attribué à un passager arrivé par avion

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

SIDA : Modes de transmission

A

• Transmission horizontale
- Voie sexuelle (voie principale)
- Voie sanguine (drogues, transfusions, professionnels de la santé)

• Transmission verticale
- mère-enfant (l’accouchement, grossesse, allaitement)

—> pour réduire:
- dépistage
- médicaments
- césarienne

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Développement du SIDA

A

Phase aigüe
- infection LT CD4+
- Perte graduelle de l’immunité mucosale

phase chronique
- activation syst. Immunitaire
- cytokines proinflamm. (Toxicité)
- apoptose des c CD4+
- production de nouveau LT ⬇️
- Immunodéficience
- Exposition aux agents opportunistes (cytomégalovirus, hépatite, kaposi, etc.)
—> cytopathie
- Mort causée par les infections opportunistes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Bases moléculaires de l’évasion immunitaire du SIDA

A

• VIH infecte les lymphocytes T CD4+, les macrophages et les cellules dendritiques

• Mort des lymphocytes T CD4+
—> immunité humorale et cellulaire inhibée

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Mécanismes de destruction cellulaire du SIDA (LT CD4+)

A
  1. Lyse par bourgeonnement
    —> does not immediately kill the cell, the host cell can continue producing virus for some time, leading to persistent infection
  2. formation d’un syncytium
    —> c multinucléée dysfonctionnelle formée par la fusion d’une c CD4+ infectée (gp120) avec une c CD4+ saine (gp41)
    —> va mourrir
  3. lyse par LT cytotoxique
    —> LT CD8+ tuent les c infectées au début de l’infection
    —> par apoptose ou «fuite» via perforines
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

2 modifications de l’apoptose par virus

A
  1. Inhiber apoptose
    —> pour se répliquer dans la c
  2. Activer apoptose
    —> pour libérer virus

quelques virus peuvent faire les 2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

VIH mécanismes d’évasion

A
  1. Taux de recombinaison ++

—> présence de 2 copies du génome (ARN) dans chaque particule virale ⬆️ sa stabilité et sa diversité génétique

  1. Détection commune de plusieurs souches

= forte résistance aux médicaments uniques

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Intégration du VIH

A
  1. ARN viral et transcriptase inverse entrent dans c
  2. ADNc synthétisé par reverse transcriptase
  3. Dégradation ARN & synthèse 2e brin ADN
  4. ADN se circularise ou s’intègre dans le génome
  5. Activation c : ADN viral transcrit
    = enzymes virales et protéines structurelles formées (ARNm viral)
    = ARN génomique viral formé
  6. Transport à la membrane caire & bourgeonnement
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

3 mécanismes VIH augmentant variation génétique

A

1) Recombinaison
—> statistiquement peu probable dans les c car il n’y a que 1 à 8 copies du génome viral par cellule (éloignement)

—> requiert la co-insertion de 2 brins distincts dans un virion (i.e. attaché) et l’infection d’une nouvelle c

—> recombinaison a lieu lorsque la transcriptase inverse saute d’un brin à l’autre

—> Dépend du ratio des activités polymérasique* et RNase H de la transcriptase
Activité RNAse H = digestion des brins ARN des duplexes ARN:ADN

Polymérase ↓ et RNase H normale → ⬆️ de la recombinaison, car plus de brins simples d’ADN sont générés, favorisant la recombinaison génétique.

Polymérase normale et RNase H ↓ → ⬇️ de la recombinaison, car moins de brins simples sont générés, limitant les possibilités de recombinaison.

RNase H pourrait être une bonne cible thérapeutique

2) Erreur de la polymérase virale
—> polymerase ARN font bcp d’erreurs (pas de mecanismes de correction)
—> responsable de 2% des mutations

3) A3G (cytidine déaminase)
—> responsable de 98% des mutations
—> enzyme qui catalyse la désamination de la cytidine en uridine
—> Cause la mutation de codons en TAG, TGA ou TAA (stop)
• Contrecarré par la protéine virale VIF qui se lie à A3G et induit sa dégradation

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

SIDA: Prévention

A

• préservatifs
• dépistage virus
• programmes de seringues
• substitut à l’allaitement naturel
• Césarienne

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

SIDA: Traitements

A

• Diagnostic du VIH via des kits qui examinent la présence d’anticorps

• Remèdes (Antiretroviral Therapy - ART)

– Pas encore de vaccins

– Pas de cure, seulement le traitement des symptômes (trithérapie)

• 2 inhibiteurs de la transcriptase inverse (analogues de nucléotides)

• + Inhibiteur non-nucléosidique de la transcriptase inverse ou

• + Inhibiteur d’entrée, fusion, intégrase, protéase ou recombinaison

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Grippe étiologie et concept

A

Étiologie: influenza

Concept: variation antigénique
(processus par lequel les agents pathogènes modifient leurs antigènes de surface pour échapper au système immunitaire)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

SIDA étiologie et concept

A

Étiologie: VIH

concept: immunodeficience
(état où le système immunitaire est affaibli ou incapable de défendre efficacement l’organisme )

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

Influenza
C’est quoi?
Mode de transmission
Symptômes

A

• virus enveloppé contenant un génome fragmenté de 7 à 8 segments d’ARN simple brin négatif
—> Changement régulier d’épitopes

• Mode de transmission:
– Aérosol
– gouttelettes
– contact

• Symptômes:
– Rhume mais plus accentué, avec fièvre, douleur musculaire, toux
– Mortalité accrue chez les plus jeunes, plus âgées et immunodéprimées

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

grippe espagnole

A

Pandémie* de 1918 (influenza H1N1)

—> entre 20 et 100 millions de morts

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

Définition endémique, épidémie, pandémie

A

Endémique: région géographique bien délimitée

Épidémie: désigne l’⬆️ rapide de l’incidence d’une pathologie en un
lieu donné sur un moment donné (i.e. local)

Pandémie: épidémie touchant une partie exceptionnellement importante de la population et présente sur une large zone géographique (i.e. très répandue)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

Influenza: Nomenclature

A

Influenza A, B, C, D selon la nucléoprotéine (gène NP) et la matrice (gène M)

A : mute rapidement, responsable de la plupart des grandes pandémies (forme la plus sévère du virus).
Il infecte aussi les animaux.

B : peut être mortel, cause des épidémies, se mute peu et n’infecte principalement que les humains.

C : le + stable des trois types, le moins pathogénique

D : n’affecte que le bétail

Sous types basés sur 2 autres protéines virales
Hémagglutinine (H1, H2, H3,…H18)
Neuraminidase (N1, N2, N3…N11)

Sous-types d’Influenza A et B (ville, numéro)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

Concept: Réassortissement antigénique

A

• Changement antigénique majeur
• Aucune ou peu d’immunité dans la population
• Source de pandémie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

Réassortissement antigénique
3 théories

A

– Recirculation de souches pré-existantes (réapparition lorsque le taux
d’immunité dans la population s’amenuise – cycle de 70-80 ans!)

– Adaptation de souches animales chez l’humain
• Responsable des épidémies (i.e. moins grandes envergures que les pandémies)
• Cycle de 10-12 ans
• Causé par des mutations naturelles combinées à une sélection par
l’immunité de la population

Réassortissement (mélange des 7-8 ARNs composant le génome du virus)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

Origine du virus H1N1 (2009)

A

• Mélange de virus porcin, aviaire et humain

• Propagation inter- et intra-espèces par proximité via des gouttelettes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

Pathogénèse de la grippe

A

• Mécanisme probable (hypothèse)
– Activation massive d’une cytokine dans les poumons
– Infiltration par des leucocytes
– Destruction des tissus du poumon
– Sécrétion de liquide dans le poumon (œdème)
– Problèmes respiratoires (embolie)
i.e. patients tués par leur système immunitaire (asphyxie)

• Complications
– Infections 2e par des bactéries (pneumonie bactérienne)
– Pléiades d’autres conditions potentielles (rare)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

Influenza: Traitements

A

• Prévention
– Vaccins (pas memes vaccins dans hemisphere nord et sud, combinaisons différentes - on essaie de deviner)
– Hygiène / Mise en quarantaine / Masque

• Remèdes
– Traitement des symptômes
– Plusieurs antiviraux
• Inhibiteurs de la neuraminidase
• Inhibiteurs de la réplication

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

Maladia / Paludisme étiologie et concepts

A

Étiologie: Plasmodium (protozoaires)
—> 120 espèces
Plasmodium falciparum: responsable de 80% des cas de paludisme et de 90% de la mortalité

Concepts:
Modes de transmission
&
Variation antigénique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

les animaux les plus mortels

A

Les moustiques

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

Plaudisme transmission

A

Vecteur : Par un organisme intermédiaire
—> Anophèles femelles (moustiques)

Congénital : De la mère à l’enfant, souvent in utero

Transfusion sanguine

—> tue principalement <5 ans et femmes enceintes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

Paludisme/Malaria: Description et symptômes

A

• Maladie pseudogrippale aiguë endémique

• Potentiellement mortelle

• Symptômes
– Fièvre
– Maux de tête
– Frissons (spasmes musculaires)
– Augmentation possible du volume de la rate
– Sensibilité occasionnelle du foie
– Changement de personnalité *
– Confusion *
– Léthargie *
– Crises épileptiques *
– Coma*
– Insuffisance rénale et respiratoire*

*: selon l’espèce du pathogène

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q

Paludisme: Historique

A

• Présent depuis plus de 100 000 ans (dans momies)

• Malariothérapie vers 1930 (avant la découverte des antibiotiques, la syphilis était guérie par le paludisme en provoquant de la fièvre)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
44
Q

Cycle de vie de Plasmodium

A

• Moustique : Développement sexuée (fécondation, oocyste, sporozoïtes).

• Humain : Phase hépatique (sporozoïtes → mérozoïtes) puis phase sanguine (multiplication asexuée et gamétocytes).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
45
Q

Concept: Variation antigénique dans plaudisme

A

génère une diversité antigénique énorme,
—> permettant au parasite de contourner les réponses immunitaires spécifiques

PfEMP1
– Ag majeur de Plasmodium

• Variation clonale de var (gène codant pour PfEMP1)

– 50-150 copies
– 60 membres distincts
– dispersés sur 14 chromosomes du parasite
- localisation en clusters : facilite la proximité entre différents gènes var, ⬆️ la probabilité de recombinaison

• Régulation de l’expression de chacun des gènes var par:
– Histones
– Méthylation
– Acétylation
– Remodellage de la chromatine
– Micro ARN

46
Q

Paludisme: Pathogénèse

A

• ampleur de multiplication +++++ dans le foie

• Infection synchrone des GR (phase sanguine)

• Destruction massive des GR (hémolyse)

• hémolyse synchrone et intense =
– Anémie
– Forte fièvre (via la libération d’hémozoïne -> la perturbation de l’hypothalamus -> l’augmentation de TNFa)
- rosettes (structures formées lorsque des GR normaux se lient à des GR infectés par Plasmodium falciparum via PfEMP1- molécule d’adhésion qui se lia à un sucre à la surface de c (chondroitin sulfate A)

—> obstruction des vaisseaux sanguins
- si du cerveau (paludisme cérébral)

47
Q

Plaudisme détection, remèdes, prévention

A

• Détection
– Fièvre cyclique et anémie
– Frottis sanguins et coloration
– Kit de détection d’antigènes du parasite
– PCR

• Remèdes
– Plusieurs composés chimiques (Ex: Artémisinine, DDT, quinine et dérivés,
chloroquine)
Problème de variation antigénique
– Vaccin (2021)

• Prévention
– Éviter les piqûres et les zones à risque
– Élimination du vecteur
– Chloroquine, artémisinine ou dérivé
– Mosquirix / R21/Matrix-M

48
Q

Mode d’action de la chloroquine

A

Pour Plaudisme

• prévient la cristallisation de l’Hème (toxique) en cristaux d’hémozoïne à l’intérieur de la vacuole digestive du parasite

• Le parasite est tué pendant qu’il séjourne dans nos globules rouges

NB: l’hémozoïne cause la forte fièvre

49
Q

Mode d’action de l‘Artémisinine

A

Contre Plaudisme

L’artémisinine bloquerait une enzyme qui permet au parasite de pomper le calcium et l’empêchant ainsi de se développer

50
Q

Maladie Congénitale au CMV
Étiologie et concepts

A

Étiologie: Cytomégalovirus

Concepts: Transmission verticale &
Inhibition du complexe majeur d’histocompatibilité de classe I
Bloque la présentation antigénique

51
Q

Cytomegalovirus fait partie de quelle famille?

A

Famille herpétique

Au-delà de 100 membres
—> 9 pathogènes humains

52
Q

Propriétés physiques et biologiques communes de la famille de herpès

A

grosse taille et gros génome (ADNdb)

Enveloppe lipidique

• Génome codant pour plusieurs enzymes
- Réplication (ex: hélicase/primase/polymérase)
- Métabolisme des acides nucléiques (ex: TK)
- Modifications des protéines (ex: kinases)

• Réplication dans le noyau
• Cycle lytique
• Latent / récurrent

53
Q

CMV symptômes

A

Asymptomatique dans la plupart des cas
– Semblable à la mononucléose (fatigue, malaise général, perte d’appétit, douleur musculaire, fièvre, mal de gorge, inflammation des nodes lymphatiques, perte de poids)

Grave pour les gens immunocompromis (SIDA, greffés, foetus)

Primo-infection maternelle du fœtus
– Atteinte neurologique plus ou moins sévère, retard mental, une calcification
cérébrale à l’échographie
– Attaque des nerfs sensoriels (surdité, choriorétinite)
– Trouble hépatique (ictère ou jaunisse, troubles hémorragiques)
– Thrombopénie (réduction des plaquettes du sangs)
– Retard de croissance intra-utérin
– Hyperéchogénicité intestinale (incapacité à rebondir un écho)

• Manifestations cliniques et/ou échographiques chez 10% des foetus de mères atteintes

54
Q

CMV Modes de transmission

A

– Maladie congénitale la plus fréquente dans les pays industrialisés

– Transmission verticale,
i.e. mère-enfant (via le placenta)

– Transmission horizontale: entre individus par les sécrétions corporelles (salive, sang, sperme, larmes, lait maternel, sécrétions du vagin et du col de l’utérus)

55
Q

CMV particularités (propriétés)

A

– Sensible aux désinfectants (virus enveloppé)

– Sensible à la chaleur (50 à 60°C pendant au moins 30 minutes), à des solvants lipidiques, au faible pH, aux rayons ultraviolets et aux cycles de congélation et de décongélation

– peut survivre pendant quelques jours à T ambiante à l’extérieur de son hôte

– Induit la cytomégalie (« grosse cellule »)

—> Changement du métabolisme cellulaire

• ⬆️ AMP cyclique
• ⬆️ perméabilité au Ca2+
• ⬆️ du Ca2+ intracellulaire libre = condition hypotonique = entrée d’eau pour ré-équilibrer

56
Q

Génome du cytomégalovirus humain

A

énorme -un des plus grands génomes viraux connus

Code pour:

• US2 et US11
Induisent le ERAD (« ER-associated degradation ») et cible le CMH/I pour la
dégradation protéosomale

• US3
Se lit à et inhibe la tapasin, ce qui cause la rétention de certains allèles du
CMH/I au réticulum endoplasmique

• US6
Bloque l’interaction des peptides et de l’ATP au TAP

• MCMV gp48
“Sorters” qui redirige le CMH/I du Golgi vers les lysosomes
(mécanisme de dégradation distinct du protéasome)

—> mécanismes pour bloquer la présentation antigénique

57
Q

Présentation antigénique mécanisme normale

A

Protéasome
• Gros complexe multi-protéinique qui dégrade des protéines endogènes en petits peptides

TAP
• « transporter for antigen processing »
• Transport ATP dépendant
• Cause la translocation des peptides dans la lumière du réticulum

TAPASIN
• Molécule accessoire qui optimise le
recrutement des peptides par le CMH/I

58
Q

Pathogénèse CMV

A

• Mécanisme de pathogénèse pas clair

• c infectées
– Monocytes et Macrophages
– c endothéliales
– c musculaires lisses
– c glandulaires

• Latent dans les monocytes sanguins

Inactivation du système immunitaire (CMH classe I)

• Cytomégalie cellulaire -> disruption des organes et tissus

59
Q

Traitements CMV

A

• Remèdes (inhibiteurs de la polymérase virale)
– Ganciclovir: un dérivé de l’acyclovir (analogue nucléasique)
– Foscarnet: un dérivé de l’acide phosphonoformique (empêche la polymérase virale de se lier au génome viral)

• Prévention
– Hygiène, condom
– Traitement préventif des femmes enceintes
– Retrait préventif si une femme travaille avec des enfants

60
Q

Feux sauvages & herpès génital
Étiologie et concepts

A

Étiologie: VHS-1 & VHS-2
—> Virus herpès simplex de type 1 ou 2

Concepts: Latence

61
Q

VHS symptomes

A

– Asymptomatique pour plusieurs

– Symptômes typiques bénins
• VHS-1 (Feux sauvages)
• VHS-2 (MTS /ITS)

– Complications sévères possibles (rare)
• Conjonctivite
• Cécité
• Encéphalite
• Méningite

—> 80 à 90% des adultes sont porteurs (VHS-1)
—> Propagation par contact direct

• 38% des gens ont des infections récurrentes

62
Q

VHS Cycle viral (Infection productive*)

A
  • Toujours le cas dans des cellules épithéliales (i.e. nos lèvres)
  1. Attachement aux récepteurs de la cellule hôte et entrée du virus par fusion.
  2. Transport nucléaire et réplication de l’ADN viral dans le noyau.
  3. Synthèse des protéines virales nécessaires à la réplication et à la formation des virions.
  4. Assemblage des virions et acquisition de l’enveloppe par bourgeonnement (golgi)
  5. Libération des virions dans le milieu extracellulaire pour infecter de nouvelles c
63
Q

Cycle viral (Latence neuronale*)

A

*Pas de réplication mais plutôt survie en tant qu’épisome dans des neurones

—> ADN se circularise dans les neurone
ne s’integre pas, ne se multiplie pas (reste épisomal)

64
Q

Concept: Latence HSV

A

• l’ADN viral reste présent dans les c nerveuses, mais il n’est pas transcrit en ARN viral ni traduit en protéines virales
—> sous forme de circularisation

• Le virus ne se réplique pas activement et ne cause pas de symptômes

HSV:
• Présence d’au moins 18-27 miARN dans LAT (Latency-Associated Transcript)
—> miARN encodés dans genome du virus qui empechent sa propre réplication

—> ciblent les protéines virales:
• ICP0, ICP4 (molécules transactivatrices)
• ICP34.5 (facteur de virulence)

65
Q

Sortie de la latence HSV

A

Réactivation
• Stress
• Soleil (UV)
• Fatigue
• Changements hormonaux
• Dommage aux tissues (ex: morsure)
• Immuno-suppression (VIH)

—> Implication de ICP0 et/ou VP16, molécules transactivatrices
—> Modulée par des miRNA exprimés par les neurones

• Expression de protéines virales
• Réplication du virus
• Lyse cellulaire
• Présentation antigénique
Activation du système immunitaire

NB: Possible réactivation à partir du cerveau

66
Q

HSV remèdes et prévention

A

• Remèdes (inhibiteurs de la polymérase virale)
Traitement des symptômes et de l’infection active, mais inefficace pour
éradiquer le virus
(Acyclovir, Famvir, Valtrex, Zovirax, Valacyclovir)

• Prévention
– Hygiène
– Condom
– Éviter les contacts directs!

67
Q

Covid 19 étiologie et concept

A

Étiologie:
SRAS-CoV-2

Concepts: Épidémiologie

68
Q

SRAS définition et symptômes

A

SRAS-CoV-2
• Syndrome Respiratoire Aigu Sévère (SRAS)

Membre de la famille des coronaviruses
• Virus enveloppé à simple brin d’ARN positif

– Asymptomatique pour bien des gens
– Pneumonie atypique
– Symptômes:
• Grippe
• Perte d’odorat et du goût
• Mort

NB: Les coronavirus sont généralement bénins et responsables de 30-40% des rhumes

69
Q

Covid Caractéristiques

A

Temps d’incubation: 5 jours en moyenne (2-11)

Gens asymptomatiques: 5-80%!!!!

Parmi les gens symptomatiques:
• 15% sont hospitalisés
—> le tiers doit être dans une unité de soins intensifs

• Transmission pendant 0.5-2.5 jours avant les symptômes et jusqu’à des semaines après l’arrivée des symptômes

70
Q

Épidémiologie

A

discipline scientifique qui étudie les ennuis de santé dans les populations humaines, leur fréquence, leur distribution dans le temps et dans l’espace, ainsi que les facteurs influant sur la santé et les maladies de populations

71
Q

Mesure de propagation

A

Ro: Taux de reproduction (au début d’une pandémie)
—> Assume que tout le monde est susceptible

Rt: Taux de reproduction
(« over time ») car certains gens sont maintenant immunisés

• Sensible à :
- densité de la population
- démographie
- présence de symptômes rapportés aux autorités

Autres mesures de propagation
• Nombre de nouveaux cas d’infection
• Nombre de décès
• Nombre d’admissions dans les hôpitaux
• mutants
• Prévalence par 100 000 personnes

72
Q

Prévention & Traitements COVID

A

• Prévention
– Détection rapide
– Mesures de distanciation / confinement
– Lavage des mains
– Port du masque
– Réorganisation des pratiques de travail
– Vaccins contre la glycoprotéine S
– Déclins des anticorps neutralisants
– Variation antigénique
CBC (1 oct 2021)

• Remèdes
– Vaccins
– Merck molnupiravir (analogue ribonucléasique)

73
Q

Mécanismes non-immunologiques utilisés par des agents infectieux

A

• Dérégulation du cycle cellulaire
• Toxines alimentaires (botulisme, maladie du hamburger)
• Lésions hémorragiques (Ébola)
• Maturation des organites intracellulaires (listériose)
• Bioterrorisme (anthrax)

74
Q

Cancer du col utérin
Étiologie et concept

A

Étiologie: Virus du papillome humain (VPH)

Concept: Transformation & Immortalisation

75
Q

Origines de Maladies alimentaires

A

Bactéries

Virus

Parasites

Toxines

Prod. Chimiques

76
Q

Botulisme étiologie et concept

A

Étiologie:
Clostridium botulinum

Concept: Neurotoxines

77
Q

Historique du botulisme

A

Début XIXe siècle: augmentation du nombre de cas d’empoisonnement fatal par ingestion de nourriture avariée

Boudin noir - mise en garde par le gvmt

• 1822 identification du poison

• 1923 b renommée Clostridium botulinum

—> Botox: toxine botulique atténuée

Effets indésirables
• Paralysie non souhaitée de GR musculaires voisins à l’injection
• transitoire (<4 sem)
• désorientation spatiale
• vision double

78
Q

Définition botulisme

A

• Du latin botulinus « boudin »
• Maladie rare associée au genre Clostridium (le plus connu C. botulinum)
—> bactérie anaérobique
—> Toxine sensible à la chaleur ou à l’exposition prolongée à l’oxygène
—> Associé à la nourriture en conserve mal préparée et consommée froide
Attention aux boites de conserves gonflées et aux amateurs de confitures maison

Symptômes (due à la toxine, non la bactérie)
– Entre 6 heures et 10 jours après l’ingestion de la toxine botulique
– Sécheresse de la bouche
– Difficultés à avaler
– Élocution incompréhensible
– Vision double
– Vomissements
– Diarrhée importante
– Faiblesse musculaire généralisée (« bébé flasque »)
– Paralysie des muscles des membres et du tronc (en particulier respiratoires)

79
Q

Types de botulisme

A

• Botulisme alimentaire: Ingestion de nourriture

• Botulisme par blessure: Infection d’une plaie par Clostridium botulinum

Botulisme infantile majoritaire: Consommation de spores de bactéries (maturation des spores dans l’intestin)
—> Estomac moins acide que les adultes

USA: Moyenne de 110 cas annuellement
– Botulisme alimentaire: 25%
– Botulisme par blessure: 3%
– Botulisme infantile: 72%

80
Q

Concept: Sécrétion d’une neurotoxine dans botulisme

A

• Libération d’une neurotoxine qui inhibe la libération d’acétylcholine au niveau des jonctions neuromusculaires

—> bloque la transmission entre nerf et muscle
—> Cause une paralysie respiratoire et locomotrice
—> Possiblement mortel

• toxine se lie aux protéines SNARE
—> empêche la fusion des vésicules contenant l’acétylcholine avec la membrane cellulaire

81
Q

SNARES

A

Régulateurs du transport vésiculaire

—> famille de protéines essentielles dans le processus de fusion membranaire des vésicules (contenant des protéines ou des neurotransmetteurs) avec d’autres membranes cellulaires

82
Q

Botulisme: Considérations médicales

A

• Détection
– Électromyogramme (mesure l’activité électrique des muscles au repos et pendant leur contraction)
– Isolation de la b des selles ou d’une plaie
– Isolation de la toxine du sérum ou des selles et test chez la souris

• Remèdes (traitement de plusieurs semaines)
– Lavage gastrique
– Chirurgie pour enlever les b
– Respiration artificielle
– Antitoxine (anticorps)
– Antibiotiques

• Prévention
– Technique adéquate pour la préparation de conserves
– Éviter le miel aux jeunes enfants
– Consultation d’un médecin!

83
Q

Maladie du hamburger étiologie et concept

A

Étiologie:
Escherichia coli

Concept: Toxine d’un bactériophage

84
Q

Maladie du hamburger symptômes et cause

A

Syndrome du barbecue
• Nom officiel: Colite hémorragique (inflammation du gros intestin)

Symptômes
intox alim
– Quelques jours après la contamination
– Diarrhée, vomissement, crampes à l’estomac et fièvre
– Rarement fatal (jeunes enfants et personnes agées - Syndrome hémolytique et urémique (SHU)
-> insuffisance rénale, anémie et hémorragie interne)

Cause:

plus souvent causée par la souche 0157:H7 de la b E. coli
—> pas une souche endogène de notre système digestif

Provenance: système digestif et déjections de nombreux animaux, dont le porc, la volaille et surtout les produits du bœuf
—> contamination au dépeçage (+melangé dans viande hachée)

85
Q

Mode d’entrée des toxines Shiga (EHEC)

A

EHEC (Escherichia coli entérohémorragique)

• Sous unité A est la forme toxique
de Shiga dans le cytoplasme
—> Codée par un bactériophage
—> activation du phage par [fer] dans l’intestin & peroxyde d’hydrogène (réponse neutrophiles)

Inhibition de la synthèse des protéines via la digestion de sucres sur les ARNr
—> Mort des b commensales (i.e. flore endogène normale) = Prolifération du E coli pathogène
—> mort des c de l’hôte (endothelium intestinal: altère fct reins, syst. Digestif, CNS etc.)
—> Vasculitis (réponse inflammatoire détruisant les vaisseaux sanguins -> hémorragie)

• Mort cellulaire

86
Q

Induction de l’apoptose par Shiga

A

Cible c endothéliales et épithéliales

  1. Inhibition de la synthèse protéique : Blocage des ribosomes (ARNr 28S).
  2. Stress cellulaire : Activation des voies pro-apoptotiques (p53, caspases).
  3. Dommages mitochondriaux : Libération de cytochrome c, amplifiant l’apoptose.
  4. Signalisation inflammatoire : Renforcement via TNF-α et IL-1β.
87
Q

Hamburger détection remèdes prévention

A

• Détection
– Intoxication alimentaire
– PCR
– Essai de toxicité sur cellules Véro

• Remèdes
– Antibiotiques

• Prévention
– Conservation de la viande (frigo ou congélateur)
– Respect de la date d’expiration
– Hygiène (mains, assiette, ustensiles, planche à couper)
– Ne pas manger dans la même assiette où la viande crue à été déposée, ni avec les mêmes ustentiles
– Cuisson adéquate

88
Q

Listériose étiologie et concepts

A

Étiologie: Listeria monocytogenes

Concepts: Inhibition de la maturation des phagosomes
& Propagation par comètes d’actine

89
Q

Listériose c’est quoi? Et symptômes

A

Maladie rare
—> médiatisée par le cas de Maple Leafs - 2008 (23 morts)

• Taux de mortalité élevé de 20-40%
• Causée par Listeria monocytogenes (b gram +)
—> Associée aux viandes froides, viandes crus, produits laitiers, légumes, produits de la mer, pâtés non pasteurisés

• Symptômes possibles
– Durée: 7-10 jours
– Fièvre, douleur musculaire et vomissement
– Diarrhée
– Méningite (membranes autour du cerveau et la moelle épinière)
—> Maux de tête, cou raide, confusion, perde d’équilibre et convulsions
– Encéphalite
– Fausse couche
– Accouchement prématuré

90
Q

Maturation des phagosomes en phagolysosomes

A
  1. Formation du phagosome : Capture de la particule.
  2. Acidification progressive : Pompes à protons abaissent le pH.
  3. Fusion avec des vésicules endosomales : Acquisition d’enzymes lysosomales.
  4. Fusion avec le lysosome : Formation du phagolysosome, contenant des enzymes hydrolytiques et substances toxiques (ROS, NO).
  5. Dégradation : Digestion de la particule en fragments éliminés ou présentés comme antigènes.
91
Q

Dégradation des bactéries dans les phagolysosomes

A
  1. Acidification : Le pH bas active les enzymes hydrolytiques.
  2. Enzymes lysosomales : Protéases, lipases, nucléases détruisent les composants bactériens.
  3. Espèces réactives de l’oxygène (ROS) : Dégâts oxydatifs sur les membranes et ADN bactériens.
  4. Oxydes d’azote (NO) : Perturbent les processus bactériens essentiels.
  5. Peptides antimicrobiens : Endommagent les parois bactériennes.
92
Q

Évasion des phagosomes par Listéria

A
  1. LLO - Listériolysine O
    • S’assemble en pores
    • Permet l’entrée dans la c et la lyse du phagosome
  2. PLC - Phosphatidylinositol phospholipase C
    • Enzyme modifiant les lipides
    • Clivage de certains lipides du phagosome
    • Contribuent à la lyse du phagosome avant qu’il ne soit mature et dégrade la bactérie
93
Q

Bases moléculaires de la locomotion de listéria

A

protéine de surface de Listeria ActA: essentielle pour l’activation de l’actine.

—> ActA interagit avec la protéine Arp2/3 de l’hôte: créant des filaments d’actine à l’arrière de la b (queue d’actine)

—> queue d’actine/comètes d’actine utilisée pour se propulser comme un moteur moléculaire par force propulsive

—> dans cytoplasme et dans c voisines via des jonctions intercellulaires

94
Q

Pathogénèse de la listériose

A

varie en fct de l’état immunitaire de l’hôte,
• formes bénignes chez les individus sains
• formes sévères chez les personnes vulnérables - (femmes enceintes, nouveau-nés, personnes âgées et immunodéprimées)

Dissemination par voie sanguine : Après avoir survécu et se multipliant dans les cellules intestinales, Listeria peut se propager via le système lymphatique et la circulation sanguine, infectant divers organes comme le foie, la rate, les reins et le cerveau (dans les formes les plus graves de l’infection)

—> bonne partie des symptômes est liée à la réponse immunitaire (fièvre, destruction de tissus)

95
Q

Listériose
Détection , remèdes, prévention

A

• Détection
– Culture à partir du sang ou du liquide cérébro-spinal

• Remèdes
– Antibiotiques

• Prévention
– Bonne technique de préparation, cuisson et manutention des aliments
– Lavage des légumes
– Campagne de prévention auprès des femmes enceintes et patients immunocompromis (éviter les pâtés non pasteurisés, les fromages mous)

96
Q

Fièvre hémorragique Ébola étiologie et concept

A

Étiologie: Virus Ébola

Concept: Virus émergents

97
Q

Virus d’évolution nouvelle définition

A

descendent de virus préexistants.

• résultent de mutations/recombinaisons entre des virus existants, causant des souches plus virulentes ou liées à la modification des conditions dans lesquelles elles ont existées pendant des millions d’années

Mécanismes d’émergence
– Évolution de novo d’un virus (nouveau variant viral)
– Passage d’un virus existant d’une espèce (hôte) à l’autre
– Dissémination large d’un virus à partir d’une petite population où il était originellement confiné

98
Q

Facteurs favorisant l’émergence de virus de Novo

A

Facteurs humains
• Santé Publique (matériel d’injection non stérile)
• Exploitation de la nature
• Flux de population humaine

Facteurs non humains
• Intempéries, variations climatiques

—> Plusieurs virus émergeant causent des fièvres hémorragiques attaquant les vaisseaux sanguins
Ex Ebola

99
Q

Ebola définition et symptômes

A

• Nommé après la rivière Ebola, lieu de la première épidémie en République
Démocratique du Congo

• Un des 30 virus qui causent de la fièvre hémorragique virale

• Taux variable de mortalité (>40-90%) selon la souche

• Symptômes
– Période d’incubation de 2 jours à 4 semaines
– Forte fièvre soudaine et faiblesse extrême
– Douleur musculaire, abdominale et à la tête
– Vomissement, diarrhée
– Lésions oropharyngealles et à la peau (liquéfaction de ces tissus)
– Nécrose, protéinuria (présence de protéines dans l’urine)
– Désagrégation de divers organes (reins, foie, cœur)
– Saignement interne et externe, souvent via le système digestif
– Choc cardiorespiratoire en 6-10 jours après l’apparition des 1er symptômes

—> plusieurs épidémies en Afrique et autres pays

100
Q

Premier épisode recensé d’Ébola

A

• Arrivée en 1976 d’un patient avec une fièvre à un petit hôpital du Zaïre

• Traitement contre la malaria par injection

• Mort du patient à la maison quelques jours plus tard

• Enterrement du patient selon les coutumes locales (vidange manuelle du sang par la famille, lavage des mains dans un bol commun)

• Mort subséquente des membres de la famille

• Entretemps, épidémie à l’hôpital liée à la mauvaise stérilisation et réutilisation de l’aiguille utilisée pour la malaria

• Mort de personnel médical

• Imposition d’une quarantaine dans la région jusqu’à tous ceux infectés meurent (taux de mortalité de 88% pendant cette épidémie)

101
Q

Ebola particularités

A

• Membre de la famille des Filoviridae (Filovirus)

• Incluant les virus Ebola et Marburg

• Virus enveloppé à ARN simple brin négatif

• De forme filamenteuse

• Infecte les primates (humains, singes et chauve-souris)

—> Plusieurs souches

102
Q

Origine et bassin d’Ébola

A

• 3 espèces de chauves-souris infectées mais sans symptôme (forêt équatoriale)
zoonotique

• Infection des singes par morsure ou excrément des chauves-souris

• Contamination des humains via la chasse au singe et le sang de leur proies

• Contamination des humains via la consomption de chauves-souris

103
Q

Bases moléculaires Ebola

A

Nucléocapside: ARN sb - et protéines NP (Nucléoprotéine), VP35, VP30, et L (polymérase virale)

Matrice: Protéines VP40 et VP24

Enveloppe: Glycoprotéine GP (facteur de virulence)

• Production de deux formes de la glycoprotéine GP via 2 cadres de lecture

1) forme sécrétée
—> Abondante durant l’infection
—> Se lie aux neutrophiles (cellules phagocytaires) et inhibe leur activation
—> Absence d’une réponse immunitaire efficace

2) forme longue
—> Incorporée dans les virions
—> Liaison aux cellules endothéliales via GP, qui se lie aux intégrines aVb3
—> Perturbation de l’endothélium vasculaire
—> Induction de la cascade de coagulation intravasculaire
—> Perte d’étanchéité = Hémorragie
—> Fièvre et inflammation induites par les cytokines

104
Q

Ebola détection remèdes prévention

A

• Détection
– Forte fièvre, fatigue extrême et saignement inexplicable
– ELISA, IF, PCR

• Remèdes
– Vaccin canadien/Merck
– « Ring immunity » 75-100% efficace
– Traitement avec des anticorps monoclonaux

• Prévention
– Bonne planification en cas d’épidémie
– Bonne technique de stérilisation et d’hygiène dans les hôpitaux
– Arrêt des coutumes funéraires
– Mise en quarantaine

Notes
- Problème d’acuité visuelle et de douleurs aux articulations chez les survivants
- Dissémination par les survivants via leur sperme, excrétions et salive

105
Q

Bioterrorisme concept et définition

A

Concept: Militarisation d’agents pathogéniques

—> dissémination délibérée de virus, de bactéries, de toxines ou d’autres agents dangereux dans l’intention de provoquer des maladies, de tuer des personnes ou des animaux ou de détruire des espèces végétales

106
Q

Concept: Militarisation d’agents pathogéniques

A

• Comparativement peu onéreux à l’achat et l’entretien

• Facile à produire

• Facile à disséminer

• Accessible aux groupes terroristes

• Deux types d’armes biologiques
1) Infligeant directement une maladie à l’humain (ex: anthrax)
2) Ayant un impact économique majeur (ex: Fièvre aphteuse / Foot and Mouth disease*
– i.e. contamination de la chaine alimentaire)
—> Dans les deux cas, les buts visés est de créer la panique et de ruiner l’économie locale
—> Dommages réels: Limités

107
Q

Limitations à la militarisation d’agents pathogènes

A

• Spécificité
– Comment tuer l’ennemi sans tuer ses propres troupes ou sa population?

• Transport
– Comment amener sans danger l’agent infectieux au lieu désiré?

• Préservation
– Comment entreposer l’agent dans un contexte militaire?
En laboratoire, les bactéries et les virus sont conservés à -20°C et -80°C

• Modes de dissémination
– Distribution par explosion (bombe) risque de détruire l’agent
– Vents dans le bon sens et taux d’humidité dans le cas d’aérosols
– Effet de dilution dans le cas de propagation dans l’eau

• Dose minimale requise

• Expertise requise pour la manutention et la préparation des stocks

• Bref: Implication d’un état nécessaire pour la production, la préservation et un nombre suffisant de doses

108
Q

Catégories d’agents pathogenes pour militarisation

A

• catégorie A
—> Facile à transmettre et disséminer (aérosols), taux de mortalité élevé
Ex. anthrax, botulisme, peste noire, Ebola

• catégorie B
—> Moins facile à disséminer et faible taux de mortalité

• catégorie C
—> Pathogène émergent pouvant être génétiquement modifiés avec une disponibilité, une production et une dissémination facile

109
Q

Anthrax

A

(maladie du charbon -> gros abcès cutanés)

– Aussi nommé Bacille du charbon (Bacillus anthracis)
– Facilement transféré
– Facile d’obtention et à produire
– Transmission de spores par aérosol
– Hautes doses requises pour infecter (effet géographiquement limité)
– Entrée via microblessures
– Haut taux de mortalité (90-100%) – via septicémie

110
Q

Mode d’action d’anthrax

A

Toxine de 3 composantes

PA: « protective antigen »
LF: « lethal factor »
EF: « edema factor »

• PA est requis pour l’internalisation de LF et EF

• EF convertit l’ATP (source d’énergie) en AMP cyclique

• LF inactive MAPKK par clivage, perturbant ainsi plusieurs voies de signalisation:
• Prolifération cellulaire
• Différention cellulaire
• Inflammation

Cible préférentielle: macrophages : induction de l’apoptose

Tue généralement l’individu

111
Q

Antitoxines: Bases moléculaires

A

• Anticorps contre l’une des chaines des toxines

• Version soluble des récepteurs, i.e. compétition avec les toxines

• Inhibiteurs dominants-négatifs bloquant l’entrée des toxines dans la cellule, leur translocation dans le cytoplasme ou leur maturation

• Petites molécules analogues des substrats, i.e. compétition pour les sites actifs des toxines (criblages à haut débit de banques de réactifs chimiques)

• Et bien sûr les antibiotiques dans le cas des bactéries