Características del ADN Flashcards
¿Cómo se forman los ésteres?
Ácido + alcohol (dan un éster + agua)
¿Cuál de las siguientes características es falsa?
a) El punto de fusión de NaCl es de 590°C
b) La energía que proporciona un puente de hidrógeno es 20 veces menor a la que proporciona un enlace covalente
c) las moléculas hidrofílicas son solubles en agua
d) Las moléculas de agua polares se agrupan alrededor de iones y moléculas polares
e) Todas son correctas
a) El punto de fusión de NaCl es de 590°C
R=
El punto de fusión de NaCl es de 801°C
¿Qué originan las diferencias en la electronegatividad atómica?
- Distribución electrónica asimétrica
- Polaridad molecular
Medidas de un enlace de hidrógeno y el enlace covalente entre un oxígeno y un hidrógeno cuando se unen 2 moléculas de agua
Enlace de hidrógeno: 0.28 nm
Enlace covalente entre un oxígeno y un hidrógeno: 0.104 nm
Diferencia entre una purina y pirimidina estructuralmente
La purina tiene 2 anillos cíclicos y la pirimidina solamente tiene 1
¿Qué es un nucleósido?
Base + Azúcar
Tipo de enlace que une al azúcar con la base
Enlace N-glucosídico
Diferencia entre el ADN y ARN estructuralmente
El ADN tiene un hidrógeno en el carbono 2’ y el ARN tiene un grupo hidroxilo en el carbono 2’
¿Qué es un nucleótido?
Base + Azúcar + Fosfato
Diferencia entre el ADN y ARN estructuralmente
El ADN tiene un hidrógeno en el carbono 2’ y el ARN tiene un grupo hidroxilo en el carbono 2’
En un nucleótido, ¿por qué se enumeran a los carbonos del azúcar con “prima”?
Porque el anillo de la base nitrogenadan también se enumera
¿Qué es el ATP?
- Principal nucleótido existente en células
- Transporta energía en sus enlaces anhídrido de ácido
Fosfato inorgánico
Ion estable formado a partir del ácido fosfórico
¿Cómo se forma un éster de fosfato?
Alcohol + Fosfato
¿Cómo se forma un anhidrído ácido?
Ácido carboxílico + Fosfato
Fosfato + Fosfato = -O-P-P
¿Dónde se lleva a cabo la polimerazación del ADN?
En el extremo 3’ a partir de dNTPs
¿Cómo se da el enlace fosfodiéster en el ADN?
Ocurre entre la posición del carbono 3’ del primer nucleótido con el carbono 5’ del nuevo nucleótido
Fuerzas de van der Waals
Se dan entre 2 átomos que muestran una débil interaccion de enlace debido a sus cargas eléctricas fluctuantes, sin embargo, 2 átomos se repelen si se acercan demasiado
Número de puentes de hidrógeno que tienen los pares de bases nitrogenadas en el ADN
Adenina - timina = 2
Citosina - guanina = 3
¿Qué bases nitrogenadas son purinas y cuáles son pirimidinas?
Purinas: adenina y guanina
Pirimidinas: citosina, timina y uracilo
Forma más estable y frecuente de las bases nitrogenadas
a) Ceto
b) Enol
a) Ceto
Postulado de Erwin Chargaff de acuerdo a la bases nitrogenadas
“La proporción de purinas es igual a la de pirimidinas”
¿Por qué la estructura del ADN no sería posible si se cambiara la desoxirribosa por una ribosa?
Por el oxígeno extra haría que las fuerzas de van der Waals sean muy próximas entre si
¿Cuáles son las características falsas sobre los descubrimientos de Watson y Crick del ADN?
a) Ambas cadenas helicoidales está enrollada alrededor del mismo eje
b) El azúcar es paralelo a la base que se une
c) Las bases están en el interior de la hélice y los fasfatos en el exterior
d) Los planos de las bases son perpendiculares al eje de la fibra
e) Ambas cadenas siguen hélices diestras
f) Los grupos fosfato están unidos por enlaces 3’, 5’ a la β-D-desoxirribofuranosa
g) Todas son correctas
b) El azúcar es paralelo a la base que se une
R=
El azúcar es perpendicular a la base que se une
¿Cada cuántos Amstrongs hay un residuo en una cadena de ADN?
3.4 A
Medida del ángulo que hay entre los residuos adyacentes en la misma cadena
36°
Distancia que hay entre un átomo de fósforo del eje de la doble hélice de ADN
10 A
¿Cuáles son las características veraderas sobre las variaciones estructurales del ADN?
a) El ADN es muy flexible
b) La conformación de un nucleótido se ve afectada por la rotación de diferentes enlaces
c) El surco mayor mide 30 A
d) Las purinas se encuentran estables únicamente en la conformación anti
e) El surco menor mide 13 A
f) La conformación más común que adopta el ADN es la doble hélice dextrógira
g) Una vuelta completa de la doble hélice de ADN mide 34 A
h) Todas son correctas
a) El ADN es muy flexible
b) La conformación de un nucleótido se ve afectada por la rotación de diferentes enlaces
f) La conformación más común que adopta el ADN es la doble hélice dextrógira
g) Una vuelta completa de la doble hélice de ADN mide 34 A
R=
El surco mayor mide 22 A
Las pirimidinas se encuentran estables únicamente en la conformación anti
El surco menor mide 12 A
¿Qué conformación del ADN, según Watson y Crick, es la más estable en condiciones fisiológicas?
a) Z
b) A
c) B
c) B
Características de la conformación A del ADN
- Dextrógira
- 11 pares de bases por vuelta
- Surco mayor estrecho y profundo
- Surco menor menos profundo
- Tiene apareamiento híbridos de hebras ADN-ARN, además de complejos enzima-ADN
- Forma deshidratada
- Tiende a cristalizarse
Características de la conformación Z del ADN
- Levógira y apariencia de zigzag
- 12 pares de bases por vuelta
- Presente en segmentos ricos con GCs (guanina-citosina) o que tengan bases modificadas por metilación
- Poco frecuente
- Posiblemente esté implicado en la regulación de la transcripción
- Purinas en conformación syn y pirimidinas en conformación anti
- Surco mayor poco aparente
- Surco menor más angosto y profundo
Medida del diámetro de todas las conformaciones del ADN
A: 26 A
B: 20 A
C: 18 A
Número de pares de bases por cada vuelta de la hélice de todas las conformaciones del ADN
A: 11
B: 10.5
C: 12
Número de pares de bases por cada vuelta de la hélice de todas las conformaciones del ADN
A: 11
B: 10.5
C: 12
Sitio de plegamiento del azúcar de todas las conformaciones del ADN
A: C-3’ endo
B: C-2’ endo
C: C-2’ endo (pirimidinas) y C-3’ endo (purinas)
Elevación de la hélice por cada par de bases en todas la conformaciones del ADN
A: 2.6 A
B: 3.4 A
C: 3.7 A
Conformación del enlace glucosídico de todas la conformaciones del ADN
A: anti
B: anti
C: anti (pirimidinas) y syn (purinas)
Estructuras inusuales en el ADN
Cualquier secuencia nucleotídica que presenta irregularidades locales (inclinaciones o ángulos) diferentes; por ejemplo, 4 adeninas seguidas producen una curvatura moderada
Ángulo de curvatura que generan 6 adeninas seguidas
18°
Regiones palindrómicas
Secuencia de ácidos nucleicos bicatenarios con simetría doble
Regiones repetidas en espejo
Secuencia simétrica dentro de cada cadena, que se pueden superponer
Formas que pueden formar las regiones palindrómicas
Horquillas y estructuras cruciformes
