Bioénergétique (cours 7) Flashcards
Comment sont nommés les groupes phosphates chargés négativement ?
Alpha, bêta et gamma
Graces à quelles liaison l’ATP est-il riche en énergie ?
Liaisons phosphoanhydrides entre les groupes phosphate et le ribose
La réaction d’hydrolyse d’ATP est-elle exergonique ou endergonique ? Et à quoi sert elle ?
Exergonique
Fournit l’énergie nécessaire aux rx endergonique (qui consomment de l’énergie)
De quoi dépend la variation d’énergie libre et la spontanéité d’une réaction ?
De la concentration de chaque réactif
Qu’arrive-t-il aux réactions quand la charge énergétique augmente?
Rx qui produisent de l’ATP sont inhibées
Rx qui utilisent l’ATP sont activées
Que produit, l’oxydation de combustible métabolique (aa, glucose, acide gras) ?
Des cofacteurs réduits (NADH, FADH2)
Le transfert d’électron du NADH et FADH2 vers le O2 fait partie de quel type de rx ?
Exergonique
L’énergie libérée est utilisée pour la synthèse de l’ATP
Sous quelle forme est convertie l’énergie libre ?
Sous forme de gradient transmembranaire de protons
Ensuite utilisé pour synthèse d’ATP
Combien de protons et d’électrons, le FAD accepte-t-il?
2H (2 protons et 2 électrons)
Que peut accepter un NAD ?
Accepte un ion H- (sous forme d’hydrure, un proton avec 2 électrons)
Qu’est-ce que le potentiel redox ?
La tendance d’une substance a capté/accepter des électrons (à être réduite)
Quel est l’effet de la valeur d’E*’ ?
Plus E est élevée, plus la substance va agir comme oxydant (accepter électron)
Les électrons vont de quelle substance à quelle substance et pourquoi ?
Bon spontanément de la substance au potentiel redox le plus faible vers la substance au potentiel redox plus fort
Car dans un pot redox faible, les électrons on beaucoup d’énergie et eux ils veulent la perdre donc vont vers pot redox plus fort
(Transfert d’électron favorable dans direction où ils perdent de l’énergie)
Les électrons vont spontanément vers la substance avec E* le plus faible ou le plus fort ?
Vont vers la substance avec E le plus faible vers la substance aux E le plus fort
Que cause une grande différence des valeurs de E* ?
Plus la différence entre les valeurs de E* et grande, + un électron a tendance à passer d’une substance à l’autre, la variation l’énergie libre est grande
Que font les électron pendant leur transfert vers l’oxygène à chaque passage d’un complexe respiratoire ?
Une partie de l’énergie est mise en réserve pour éviter le gaspillage et génération d’un excès d’énergie
Comment se fait le transfert d’électron ?
En étapes: les complexes respiratoires
Où se trouvent les complexes respiratoires chez les eucaryotes et chez les procaryotes ?
Procaryotes: membrane plasmique
Eucaryotes: mitochondrie
Qu’est-ce que le NAD+ et qu’est-ce que le NADH ?
NAD+ oxydant
NADH réducteur
Qu’est-ce que la phosphorylation oxydative et où se produit elle ?
C’est la chaîne de transport d’électron et la synthèse d’ATP
Dans la membrane interne des mitochondries
La membrane interne de la mitochondrie, est-elle perméable ou imperméable? Et à quoi?
Imperméable aux ions et molécules non chargées
Sont transporté par transporteur d’ADP et d’acide gras à chaîne longue
Ou se produisent le cycle de Krebs et l’oxydation des acides gras ?
Dans matrice mitochondriale
La membrane externe mitochondriale est elle perméable ou imperméable ? Et à quoi ?
Perméable aux ions et petites molécules
Qu’est-ce qui génère la majorité des NADH et FADH2 ?
Par cycle de Krebs et bêta-oxydation
Chez la navette glycérol phosphate, par qui est converti le NADH en NAD+ et où ?
Par GPDc dans le cytosol
En quoi transforme le GPDc le DHAP ?
En GP
Que veut on dire par FMN ou ubiquinone peuvent former une structure semi-quinone ?
FMN: peut garder un électron avec lui pendant que le centre Fe-S transporte l’électron qui lui a été envoyé au next centre Fe-S
Ubiquinone: reçoit un seul électron et attend le deuxième
Quelles autres enzymes reçoit l’ubiquinone mis à part les électrons du complexe 1 et le FADH2 des multiples enzymes du complexe 2 ?
Enzyme de membrane mitochondriale interne
Les plus importants sont SDH de cycle de Krebs
GGPD de navette glycérol P
Acyl CoA déshydrogénase de bêta oxydation
Que fait le cytochrome c ?
Transporte les électrons du complexes 3 à 4
Ces électrons sont consommés pour la réduction d’O2
Que comporte le centre redox du complexe 4 ?
Des groupements hèmes et des ions de cuivre
Qu’arrive-t-il à l’énergie du transport d’électron ?
L’énergie des électrons du NADH et FADH2 (bas E*) est utilisée pour pomper des protons vers l’espace intramembranaire. Donc l’énergie libre des e est transformée en un gradient de protons qui servira à la synthèse d’ATP
Grossomodo, que se passe-t-il dans la CTÉ ?
Oxydation du NADH, transport d’électron, pompage des protons, création d’un gradient électrochimique et consommation d’O2
Que fait l’ATP synthase ?
Synthétise l’ATP à partir du gradient électrochimique des protons
Comment se fait la conversion la conversion d’énergie de synthèse d’ATP ?
Par changement de conformation des sous-unités
En quoi est transformé l’énergie chimique des réactions redox ?
En force protomotrice puis en mouvement mécanique d’un moteur rotatif pour finir à nouveau sous forme d’énergie chimique sous forme d’ATP
Qu’est-ce que P/O
Nombre de phosphorylation d’ADP/O2 réduit
Combien d’ATP génère le NADH et FADH2 pendant l’oxydation du glucose dans la chaîne de transport d’électrons ?
NADH: 2,5 ATP
FADH2: 1,5 ATP
D’où proviennent les cofacteurs NADH et FADH2 ?
D’oxydation de combustibles métaboliques (aa, glucose, acide gras)
Que font les NADH ?
Collecte des électron des glucose et acide gras
Que sont les centres fer-soufre ?
Des micros chemins pour les electrons
Qu’est-ce qui différencie l’ubiquinone des centres fer-soufre et FMN ?
Fe-S et FMN sont des transporteurs fixes aux protéines du complexe 1
Ubiquinone est un transporteur soluble et qui se transporte librement dans la membrane grâce a sa queue hydrophobe
Qu’ont les cytochromes comme cofacteurs ?
Des protéines hèmes
Qu’ont en commun les cytochromes b, c1 et Fe-S ?
Sont tous des transporteurs d’un électron
Quelle est la différence entre le cytochrome c et b ?
Cytochrome b a une chaîne latérale hydrophobe
Cyt c est situé dans IM et est lié de façon covalemente à sa protéine
Que contient le centre redox du complexe 4 ?
Des ions de cuivres et groupes hème
Combien d’électrons faut-il pour réduire un oxygène ?
4
Un passage de 4 électrons permet le transport de cmb de protons ?
4
Plus la valeur de E* est grande …
Plus sa capacité d’accélérer les électrons est grande
Que fait la navette glycérol phosphate ?
Transfert les électrons du NADH à la coenzyme Q
Que se passe-t-il dans la navette malate ?
Malate déshydrogenase transforme l’OAA en malate et oxyde le NADH en NAD+
Entre dans matrice mitochondriale
Malate déshydrogénase 2 retransforme le malate en OAA
OAA ne peut pas sortir de mitochondrie donc par transaminase devient de l’aspartate
Ou se produit le cycle Q ?
Dans le complexe III
Que se passe-t-il dans le cycle Q ?
Ubiquinone donne un e a ISP et un e a cytochrome b
2 protons sont pompés vers IM
Ubiquinone se déplace dans autre position pour recevoir l’é de cyt b
ISP donne son é à cyt c1 qui va le donner à cyt c
2ème ubiquinone donne 2 é
Le cyt b donne son électron a la semi quinone
Combien d’électron peut transporter le cytochrome c du complexe 3 à 4 ?
1