Stricture primaire des acide aminés Flashcards
Qu’est-ce qu’une structure primaire ?
Arrangement linéaire des aa dans lien peptidique
Qu’est-ce qu’une structure secondaire ?
Formation locale de structure 3D impliquant plusieurs aa
Qu’est-ce qu’une structure tertiaire ?
Assemblage de plusieurs structure secondaires en motifs protéiques formant la configuration native de la protéine
Qu’est-ce qu’une structure quaternaire ?
Assemblage de plusieurs polypeptides entre eux pour former une protéine fonctionnelle
Qu’est-ce qu’un lien peptidique ?
Liaison de 2 aa pour former un dipeptide
Le lien se trouve entre le groupement C=O du premier aa et le N-H du second
Quelle est la configuration la plus abondante (favorisée) chez les protéine et quelle est l’exception ?
Trans car évite l’encombrement stérique (plus étirée)
Exception: proline car chaîne lateral R forme un cycle
Quel serait un exemple atypique de lien peptidique ?
Le Gluthation
Lien peptidique entre le groupe carboxyle d’un carbone gamma (pas de chaîne latérale) et le groupement aminé d’un deuxième acide aminé
Carbone gamma au lieu de carbone alpha
Que peuvent faire les électrons autour d’un lien peptidique
Se déplacer pour partager les atomes uniformément
Que permet le carbone alpha quand il est situé entre deux plans peptidique ?
Permet leur rotation
Qu’est-ce qu’un angle phi ?
L’angle entre le N du groupement amine et le carbone alpha
Qu’est-ce qu’un angle psy?
L’ongle entre le carbone alpha et le carbone du groupement carboxy
Qu’est-ce qui est particulier chez la PROLINE par rapport à ses angles.
Les ongles autour des liaisons N et carbone alpha sont fixes à cause du cycle de la chaîne latérale
Qu’indique le graphique de RamaChadran ?
Indique les angles phi et psy qui ne causent pas d’encombrement sphérique et qui sont permis pour les aa d’une protéine
Par quoi sont définis, les diverses, structures secondaires, adoptées par les chaînes de polypeptide ?
Par les angles entre les plans de rotation
