Biochimie Flashcards
Biocatalyseur
Liaison spécifique du substrat
Abaisse énergie activation
Accélère vitesse Rx
Holoenzyme
enzyme + cofacteur
Enzyme (simple)
uniquement des acides aminés
Apoenzyme
Partie protéique de l’holoenzyme, inactive sans cofacteur
Apoenzyme + cofacteur
Holoenzyme
Types de cofacteur
ion métallique ou coenzyme
Si concentration enzyme cte, quelle est l’effet sur la vitesse initiale d’une augmentation concentration substrat?
Vitesse initiale augmente
Qu’est-ce que la Km?
Mesure de l’affinité
Concentration de substrat pour atteindre Vmax/2
Propriété de l’enzyme
+ Km est élevé, …
Plus il faut de substrat pour avoir Vmax/2
+ Km est bas, …
Plus l’affinité avec le substrat est grande
Vmax = …
Qd molécules d’enzymes saturés de substrat
Si concentration substrat en excès, quelle est l’effet sur la vitesse initiale d’une augmentation concentration enzyme?
Vmax directement proportionnelle à concentration d’enzymes, donc augmente.
Mécanisme de contrôle enzymes
Modifie quantité ou modifie efficacité
Augmentation quantité enzymes = …
Induction
Diminution quantité enzymes =
Répression
Enzymes constitutives
Pas sujettes à régulation
Mécanismes qui contrôlent l’efficacité des enzymes
Allostérie
Modification covalente
Vitesse de l’allostérie et modif cov.
Instantannée pour allostérie
Rapide pour modif cov
Vitesse induction/répression
long terme
Allostérie
Peut être positif ou négatif
Réversible
Se fixe sur site allostérique et modifie conformation site catalytique
Modif covalente
Tout ou rien
Réversible
Modifie structure primaire : nécessite enzyme pour lier ou briser le lien avec exemple groupement phosphate
Augmentation glycogène synthase (glycogénogenèse hépatique)
INSULINE
Diminution glycogène phosphorylase (glycogénolyse)
INSULINE
Diminution glycogène synthase (glycogénogenèse hépatique)
GLUCAGON, ADRÉNALINE, glycogène
Augmentation glycogène phosphorylase (glycogénolyse)
GLUCAGON, adrénaline
Hexokinase (glycolyse)
Augmentation: INSULINE
Diminution: GLUCAGON
Phospohofructokinase (glycolyse)
Aug: INSULINE, AMP
Dim: CITRATE, ATP, GLUCAGON
Pyruvate kinase (glycolyse)
Aug: INSULINE
DIm: GLUCAGON
Pyruvate déshydrogénase (pyruvate vers acétyl CoA)
Aug: Insuline, NAD+, ADP
Dim: NADH, acétyl CoA, ATP
Pyruvate carboxylase (néoglucogenèse)
Aug: GLUCAGON, adrénaline, acétyl CoA
Dim: INSULINE
Fructose-1,6-bisphophatase (néogluc)
Aug: GLUCAGON, adrénaline, glucocorticoides
Dim: Insuline
Glucose-6-phosphatase (néogluc)
Aug: GLUCAGON, adrénaline, glucocorticoides
Dim: insuline
Glucose-6-phosphate déshydrogénase (voie des pentoses)
Aug: INSULINE
Dim: pas de contrôle
Acétyl CoA carboxylase (lipogenèse)
Aug: insuline, citrate
Dim: acyl CoA, glucagon
Acide gras synthase (lipogenèse)
Aug: insuline
Dim: pas contrôle
HMG CoA réductase (cholestérogenèse)
Aug: insuline
Dim: glucagon, cholestérol, mévalonate
Inhibiteur compétitif
Compétition pour site actif
+ il y a substrat, - inhibiteur se lie site actif
Km augmente (car enzyme semble avoir - affinité avec substrat)
Atteint Vmax plus tard
Inhibiteur non-compétitif
Se lie de façon irréversible Diminue le nbr enzymes actives Vmax diminue Km inchangée Peut agir au site actif (si spécifique à enzyme) ou ailleurs: sur enzyme (si pas spécifique): modifie structure tertiaire
Où déversé sucs pancréatiques? Contiennent quoi?
Dans duodénum, contiennent enzymes digestives + bicarbonate
Enzymes des suc pancréatique
Trypsine et autres enzymes protéolytiques
Qu’est-ce que la trypsinogène?
Proenzyme suc pancréatique (précurseur trypsine)
Modif structure primaire rend enzyme active : modif irréversible
Pourquoi stocker les enzymes du suc pancréatique sous forme de proenzymes?
Empêcher auto-digestion pancréas
Enzymes chargées digestion glucides? (3)
Amylase, saccharase et lactase
Substrats et produits amylase
Substrats: maltose
Produit: glucose
Substrats et produits saccharase
Substrat: saccharose
Produit: glucose + fructose
Substrats et produits lactase
Substrat: lactose
Produits: glucose et galactose
Sérum
coagulé
Plasma
anticoagulé
Enzymes pancréatite aigue
Amylase et lipase
Enzymes cytolitique (hépatite)
AST et ALT
Enzymes cholestase
GGT et ALP
Si enzyme GGT élevé, mais pas ALP, à quoi est due augmentation?
Alcool
enzyme ALP pour quelles atteintes? (2)
Choléstase et atteinte osseuse
Enzyme présente myocarde
Troponine I et T
Carburants du muscle cardiaque
Acides gras ++++, glucose, lactate
Où se passe glycolyse?
cytosol
Où se passe oxydation pyruvate en acétyl Co A?
mitochondrie
Où se passe Krebs?
mitochondrie
Substrats, produits et enzymes pour pyruvate vers acétyl CoA
Substrats: pyruvate, NAD+
Produits: CO2, NADH et acétyl CoA
Enzymes: pyruvate déshydrogénase avec coenzymes: lipoate, TPP et FAD
Rx Krebs: alpha cétoglutarate vers succinylcholine CoA, quelle est l’enzyme?
Alpha cétoglutarate déshydrogénase avec coenzymes FAD, TPP et lipoate
RX Krebs: malate vers oxaloacétate, quelle enzyme?
Malate déshydrogénase