7. Triage des prot. Flashcards
Où dans la cellule se passe la synthèse des protéines?
dans le cytosol
et 13 protéines (qui sont codés par l’ADN mitochondrial )=> dans la mitochondrie
Qù se passe la réplication de l’ADN et la synthèse de l’ARN?
ils se produisent dans le noyau et dans les mitochondries
quel est le principe de la cellule eucaryote ?
la séparation de l’expression du gène et la synthèse de la protéine
Qu’est-ce que la traduction?
c’est la traduction de la séquence d’ARNm en séquence d’ac.aminés
codon de 3 nucléotides => 1 acide aminé
A quoi sert la séquence de nucléotides dans une molécule d’ARNm?
elle dirige l’incorporation d’ac.aminés dans la protéine
Quelles sont les partie centrales de l’appareil pour synthétiser les protéines ?
les parties centrales sont les ARNt (= adaptateur pour la synthèse des protéines), ARNm (ARN codant les protéines) et les sous-unités ribosomiques
où sont produites les parties centrales de l’appareil de synthèse des protéines?
Sont issues du noyau
(sous-unités ribosomiques viennent plus précisément du nucléol)
Les constituants du ribosome pour les sous-unités s’assemblent où?
dans le nucléole
ARNr + protéines ribosomales importées
Comment les sous-unités du ribosome s’assemblent-elles au niveau de l’ARN?
la petite partie se pose sous l’ARNm au niveau du codon START puis la grande sous-unité se pose par dessus.
Fonction ribosomes
peuvent décrypter le message des ARNm
Comment une chaîne polypeptidique s’allonge t-elle ?
les ribosomes continuent de décrypter le message de l’ARNm du (AUG) jusqu’à arriver au codon STOP (UAG). Un codon de 3 nucléotides correspond à un acide aminé, donc chaque trois nucléotides un nouvel acide aminé est traduit, ce qui forme une chaîne.
A quel moment une chaîne peptidique atteint sa structure 3D ?
elle l’atteint dès qu’elle quitte le ribosome
le domaine se pliant au cours de la synthèse
Le repliement de la protéine est réalisé après la libération du ribosome
mitochondrie fonction
synthèse de l’ATP par phosphorylation oxydative
Noyau fonction
contient la chromatine; synthèse et traitement de l’ADN et l’ARN
Réticulum endoplasmique (RE) fonction
Synthèse de la plupart des lipides, synthèse des protéines de la distribution à de nombreux autres organelles de la membrane plasmique
Appareil de Golgi fonction
modification, tri et emballage des protéines et de lipides en vue de sécrétion ou livraison à d’autres organelles (vésicules)
Lysosomes fonction
dégradation intracellulaire, lieu de digestion de macromolécules
endosomes fonction
réception de la matière (extérieure), qui est située à l’extérieur de la cellule
peroxysomes fonction
oxydation de molécules toxiques
Cytosol fonction
contient de nombreuses voies métaboliques; synthèse des protéines
Comment les protéines sont-elles triées afin qu’elles soient importées dans les organelles correctes ?
les protéines doivent porter des “étiquettes spéciales” avec ” adresse de livraison” (= une séquence-signal)
Comment une protéine peut-elle être importée à travers la membrane, qui est normalement imperméable aux macromolécules hydrophiles comme les protéines?
3 diff. façons, besoin d’énergie
- à travers les pores nucléaires qui fonctionnent comme une porte sélective
- les transports transmembranaires en utilisant des protéines-translocateurs.
-
le transport vésiculaire
les vésicules sont chargées avec une cargaison de prot. du lumen d’un compartiment, tandis qu’elles sont coupées à partir de la membrane.
qu’est-ce que NLS ?
NLS est la fonction du peptide signal
c’est-à-dire que la protéine qui a cette séquence signal doit être transporter au noyau
qu’est-ce que MTS?
MTS signifie transport à la mitochondrie, c’est la fonction du peptide signal.
position: extrémité- N terminale
Qu’est-ce que SP?
c’est la fonction du peptide signal, cela veut dire que la protéine qui l’a doit être amenée au RE réticulum endoplasmique
position: Extrémité N-terminale (début de chaîne polypeptidique)
KDEL signifie?
que les protéines qui ont ce peptide signal doivent rester dans le lumen du RE
position de séquence : extrémité C-terminale (fin de la chaîne polypeptidique)
PTS signifie ?
c’est le nom du peptide signal, qui veut dire que la protéine contenant cette séquence doivent **être transportées au Peroxysome **
position séquence: extrémité C-terminale
Transport à travers pores nucléaires
des complexes de pores nucléaires agissent comme des barrières sélectives qui transportent certaines macromolécules activement d’un coté à l’autre.
Comment appelle-t-on les protéines de transport au niveau de la membrane nucléaire et membrane mitochondriale?
des protéines translocateurs
Comment fonctionnent les protéines translocateurs?
Elles contiennent des récepteurs qui reconnaissent les séquences de signaux spécifiques =>NLS (signal de localisation nucléaire) et NES (signale d’exportation nucléaire)
translocateurs de prot. dans membranes mitochondriales ( structure)
Les membranes mitochondriales contiennent des translocateurs qui ont un canal de translocation et un récepteur de peptide signal (=site de liaison) au niveau de la membrane externe.
Comment fonctionnent les translocateurs de la membrane externe de la mitochondrie?
un précurseur de la protéine mitochondriale avec son peptide signal se présente à la mitochondrie en liant sont peptide signal au récepteur du peptide signal. Puis translocateur bouge pour ouvrir la voie à la protéine à travers membrane interne. Prot. arrivée dans matrice mitochondriale. Protéine se plie et perd signal peptide. (clivage par enzyme) => protéine finale pliée.
Que font les protéines sans péptid signal ?
Elles restent dans le cytosol.
Que font les protéines ayant un peptide signal?
Elles sont envoyées vers leurs organelles respectives, selon leur peptide signal.
RAPPEL : NLS => noyau / MLS => mitochondries (par translocateurs) /PTS=> peroxysome (par translocateurs)
A quel moment est-ce que le peptide signal du RE est-il reconnu?
Il est reconnu lors de la synthèse de la protéine par les récepteurs. Ainsi aussi pour autres peptides signaux.
Que se passe-t-il lorsqu’un peptide signal pour le RE est reconnu?
le peptide signal du RE dirige le peptide en cours de synthèse vers la membrane du RE. Ce qui donne lieu a une chaîne de ribosomes sur la membrane du RE. la protéine est synthétisée et rentre directement dans le Lumen du RE.
Dans quel état se trouve le translocateur avant, pendant et après liaison avec peptid signal?
il est inactif, ensuite devient actif et redevient inactif.
Comment se passe la translocation des protéine à travers membrane RE?
les ribosomes se placent au niveau de la surface de la membrane pour pouvoir synthétiser les protéines de l’ARNm. les protéines synthétisées se lient directement au site de liaison du récepteur avec leur peptide signal. Ensuite la peptidase clive le peptide signal et libère protéine mature. Le translocateur se ferme. le peptid signal se trouve dans la membrane du RE. La protéinese trouve dans le Lumen.
Que se passe-t-il, lorsque le péptide signal pour le RE émerge du ribosome au début de la synthèse de la chaîne polypeptidique ?
Le signal dirige le ribosome au translocateur à la membrane du Réticulum endoplasmique.
Comment une protéine transmembranaire est-elle intégrée dans la membrane du RE?
la chaîne polypeptidique contient un séquence d’arrêt de transfert le long de sa chaîne. Lorsque le translocateur arrive à son niveau, le transfert s’arrête à ce moment. le translocateur change de place et laisse la protéine dans la membrane. le segment hydrophobe (séquence d’arrêt de transfert) est dans la membrane et le reste se trouve à l’intérieur du Lumen du RE et à l’éxterieur.
Qu’est-ce qui différencie les protéines qui rentrent dans le noyau, les mitochondries et les peroxysomes à celles qui rentre dans le RE?
Elles sont fixées au début de la synthèse de peptide à la membrane du RE. Et au cours de la synthèse peptidique, elles sont déplacées par les translocateurs dans le Lumen du RE.
Pourquoi dit-on “réticulum endoplasmique rugueux”?
Car il porte une multitude de ribosomes à sa surface.
RE structure
le RE est constitué d’un réseau membranaire étendu. De plus, des parties de sa membrane est en continuité avec la membrane externe du noyau. Les tubes et les sacs sont tous reliés les uns aux autres.
Fonction du RER
il assemble et transporte les protéines destinées aux organelles du système endomembranaire et au membrane plasmatique et à la sécrétion.
Comment se forment les vésicules de transport?
La bicouche lipidique forme un bourgeon, ce bourgeon/ vésicule rempli de contenu à transporter (ex. protéines) se détache et voyage vers l’organelle cible. Puis il fusionne avec le compartiment cible.
Comment le RER transfère les protéines vers d’autres organelles?
par le billet du transport vésiculaire
matériel transporté par les vésicules sont ?
- matériau du lumen (protéines solubles)
- des constituants de la membrane (lipides et protéines transmembranaires)
Lors de quel transport le peptide signal est séparé et décomposé, après que la prot. a atteint le compartiment cible ?
Lors du transport à la mitochondrie et transport au RE
Est-ce que lors du transport au peroxysome le peptide signal est-il séparé et décomposé, après que la prot. ait atteint son compartiment cible?
non
D’où viennent les ribosomes ?
du nucléole, et de la matrice mitochondriale
Où fonctionnent les ribosomes ?
- Dans le cytosol => ribosomes libres
- sur surface du RER => ribosomes liés
- dans matrice mitochondriale => ribosomes mitochondriaux
quel est l’organelle cible des protéines synthétisées par ribosomes libres qui ont un signal peptide NLS?
noyau et le mécanisme de transport est à travers les pores nucléaires
ex: prot. nucléaires = histones, prot. chromatine, polymérase ARN et ADN,…
quel est l’organelle cible des protéines synthétisées par ribosomes libres qui ont un signal peptide MTS?
mitochondrie. mécanisme de transport : par translocateurs
ex: ATP-synthase…
quel est l’organelle cible des protéines synthétisées par ribosomes libres qui ont un signal peptide PTS?
Peroxysomes
mécanisme de transport: translocateurs
ex: oxydase, catalase, peroxydase
quel est l’organelle cible des protéines synthétisées par ribosomes libres qui n’ont aucun signal peptide?
reste dans Cytosol
les diff. destinations de prot. synthétisée sur RER?
réticulum endoplasmique, appareil de golgi, endosome tardif et lysosome, vésicules de sécrétion constitutives et la membrane plasmique
Comment sont transportées les prot. pliées dans lumen du RER?
elles sont transportées par le système endomembranaire
