אפיגנטיקה

Question 1

אפיגנטיקה

Answer 1

שינויים שעוברים בתורשה ומשפיעים על פעילות הגנים מבלי לשנות את רצף הדנא

Question 2

תהליכים עיקריים באפיגנטיקה

Answer 2

מתילציה על הדנא
מודיפקציות עג היסטונים

Question 3

איפה דנא עובר בעיקר מתילציה

Answer 3

על גבי ציטוזין-C
ובעיקרי ברצפי
CpG

Question 4

מיהו הדי הנוקלאוטיד הכי פחות שכיח בגנום ?
מה הבעיה איתו?

Answer 4

CpG
הוא יחסית לא יציב ויכול לעבור דה אמינציה בקלות

Question 5

מה קורה ל-
C
כאשר עובר דה אמינציה

Answer 5

הופך ל-
U

Question 6

מה קורה ל-
C
ממותל
כאשר עובר דה אמינציה

Answer 6

הופך ל-
T

Question 7

כמה אחוז מרצפי
CpG
ממותלים

Answer 7

70%

Question 8

איפה ניתן לראות הרבה רצפי
CG?

Answer 8

בטפילים וברצפי דנא חוזרניים
CpG island

Question 9

CpG island

Answer 9

אזורים העשירים ברצפי
CG.
רובם אינם ממותלים.
מוגנים מאוד ממוטציות.
נמצאים בעיקר בפרומוטורים של
housekeeping genes

Question 10

מיהו האנזים המוסיף מתילציות על גבי הדנ”א?

Answer 10

DNA methyltrasnferases

Question 11

DNMT1\maintenance methlyas

Answer 11

בעת הכפלת הדנא לקראת חלוקה תאית-

אנזים הקורא את מתילציות
על גדיל ההורי המקורי ומבצע אותן על גדיל הבת החדש

Question 12

מתי נמצא- המי מתילציה?

Answer 12

בתאים מתחלקים

Question 13

DNMT3a/b

Answer 13

אנזים המוסיף קבוצות מתיל דה- נובו- מתילציות שלא היו בתא האב

Question 14

הוספת קבוצת מתיל לדנא נחשבת שינוי?

Answer 14

בין השינויים היותר יציבים בגנום

Question 15

הורדת קבות מתיל-

Answer 15

תהליך יותר קשה- מנגנון בכמה שלבים ולא על ידי אנזים אחד.
לוקח יותר אנרגיה מלבצע מתילציה

Question 16

מי מבצע את תהליך שמאפשר הורדת קבוצת מתיל?

Answer 16

TET1\2\3

Question 17

מה חיוני ל-
TET?

Answer 17

וויטמין
C

Question 18

כיצד ניתן להסיר קבוצת מתיל?

Answer 18

הוצאה של הבסיס הממותל לגמרי

הוצאה של
DNMT-1
ככה שתוך שתי חלוקות כבר לא יהיה גדילים ממותלים

Question 19

מה תפקיד מתילציה בפרומוטרים?
כיצד עושה זאת?

Answer 19

מעכבת את השעתוק של גנים.
מונעת קישור של פקטורי שעתוק לפרומוטור/מביאה חלבונים מעכבים את השעתוק של כנים.

Question 20

למה יכולה לגרום מתילציה באיזורים שהם לא הפרומוטור?

Answer 20

יכולה לעודד שעתוק/לעכב שעתוק

Question 21

כמה סוגים של היסטונים יש לנו בתוך הנוקלאוזום?

Answer 21

H2A
H2B
H3
H4

Question 22

איפה ההיסטונים עוברים מודיפקציות?

Answer 22

בזנב של ח”א שיוצא מתוך הליבה של הנוקלאוזום.

Question 23

איפה לרוב מתרחשים מוקדיפקיות על גבי הזנב של ההיסטונים?

Answer 23

על קבוצות ליזין

Question 24

למה לרוב גורמת אצטילציה בהיסטונים?

Answer 24

לשעתוק גנים-

לאצטיל- מטען שלילי, לדנא מטען שלישי.
נוצר דחייה בינהם והדנ”א נפתח

Question 25

למה לרוב גורמת מתילציה בהיסטונים?

Answer 25

יכולה לגרום לשעיתוק/הפסקת שעתוק- תלוי היכן נעשתה ובאיזה היסטון

Question 26

האינזימים הפועלים על היסטונים- מתיל

Answer 26

יש הרבה מתיל טרנספרזות, והרבה אנזימים שמבצעים דה מתילאזות. פעילות המתרחשת מהר

Question 27

מה ההבדל בין מודיפקציות מתיל על היסטונים לעומת דנ"א?

Answer 27

בהיסטונים- הורדת מתיל נעשית מהר. בדנ"א- הורדת מתיל תהליך ארוך מכמה שלבים.

Question 28

מהי רמת המתילציה בין רקמות ותאים שונים בגוף?

Answer 28

ברקמות שונות ובין תאין שונים יש רמות מתילציה שונות על הגנום. כדי להשתיק תאים מסויימים

Question 29

ההבדל במתילציה בין רקמת עצב מסויימת בין שני אנשים שונים?

Answer 29

דומה

Question 30

מהן רמות המתילציות בזיגוטה/בלסטוציט בגנום?

Answer 30

מאוד נמוכות.

Question 31

מתי מתרחשת מחיקה של אפיגנטיקה מהדנ"א האהבי לעומת האימהי?

Answer 31

מיד בתחילת ההתפתחות יש מחיקה של המתילציות ממקור אבהי- על ידי מנגנון TET כמה ימים אחר כך מחיקה של המתילציות ממקור אימהי. מתרחש בזמן חלוקה תאית על ידי אי פעילות של DNMT-1

Question 32

האם ישנן מחיקות של כל המתילציות בהתחלת ההתפתחות העוברית?

Answer 32

יש כמה אזורים בגנום שככל הנראה לא עוברים מחיקה לחלוטין. שם יש נוכחות של חלבונים שמגינים על האיזור מאנזימים מוחקים.

Question 33

כיצד ניתן לייצר תאי iPS -induced pluripotent stem cells

Answer 33

מתן אינזמים המבצעים על הוספה/הורדה של מתילציות מסוימות.

Question 34

כיצד סביבה יכולה לגרום לשינוי אפיגנטי- מחקר דבורים

Answer 34

דבוריה- עובדת מקבלת גלי שמכיל מתיונין וחומצה פולית שמעודד מתילציה על פני הגנום. דבורה- מלכה מקבלת גלי אחר. כאשר הורידו לדבורים את DNMT3 לא התרחשה מתילציה והדבורות הפכו למלכות.

Question 35

השפעה של גן Agouti על עכברים-

Answer 35

צבע מטבוליזם

Question 36

עכברים בגודל תקין-

Answer 36

מתיל על גן Agouti כך שהוא לא מתבטא

Question 37

עכברים שמנים

Answer 37

אין מתיל על גן Agouti, הגן עובר יותר שעתוק

Question 38

אפיגנטקיה בין דורות של גן Agouti

Answer 38

אמא אגוטית, יש יותר סיכוי לצאצאים אגוטיים אמא לא אגוטית, יש יותר שהצאצאים שלה יהיו לא אגוטים, לאבא אין שום השפעה

Question 39

מה קורה אם נותנים לאמא עכברה שיש לה את הגן הפעיל , מזון שמכיל חומרים המעודדים מתילציה בזמן ההריון וההנקה?

Answer 39

יש פחות סיכוי לצאצאים אגוטיים- ניתן לעודד מתילציה על ידי תזונה

Question 40

מהם האתגרים במחקר אפיגנטי?

Answer 40

שינויים אפיגנטיים תלויים ברקמה שינויים אפיגנטיים יכולים להיות רלוונטיים לתאים מאוד ספציפיים עלות גבוהה

Question 41

מתילציה בסרטן-

Answer 41

בסרטן ניתן למצוא- מעט מתילציה בכל הגנום עליה במתילציה בפרומוטרים של tumor suppressor genes- לכן הם פחות מתבטאים ויש יותר פוליפרציה של תאים

Question 42

איזה תוצאות ראו בשוני במתילציה בין חולי סרטן לבריאים באוזרי ה CpG island?

Answer 42

ברקמה בריאה: כל הגנום יש רמות מתילציה גבוהות אבל באיי CpG יש ירידה במתילציה. ברקמה סרטנית: בכל הגנום יש רמות מתילציה נמוכות, ואין שינוי ברמות המתילציה באיי CpG.

Question 43

Decitabine

Answer 43

תרופה לסרטן. במבנה שלה דומה לציטוזין. מוכנס לדנא ומונע מתילציה. בנוסף האנזים DNTM נקשר אליה חזק. מונע מהאנזים לבצע מתילציות בדנ"א. וגם גורם לדגרדציה של DMNT-1

Question 44

הזדקנות ואפיגנטיקה-

Answer 44

ישנם שינויים אפיגנטקים ברקמה התלויים בהזדקנות. לפי השינויים ניתן לדעת אם אדם מזדקן מהר יותר/לאט יותר

Question 45

מה קורה בחתמה גנומית באוזרים שהם אימפרינטג שאומרים לעבור השתקה בתאי זרע בשלב השכפול?

Answer 45

בתאי הזרע שני האללים יהיו ממותלים

Question 46

מה אומר החתמה אימהית?

Answer 46

שהאלל של האמא עובד- דה אקטיבציה ומה שמתבטא זה האלל האבאהי

Question 47

מהיכן מתבטא הגן IGF-2?

Answer 47

רק מהאלל האהבי

Question 48

מהיכן מתבטא הכן H19?

Answer 48

רק מהאלל האימהי

Question 49

מה תפקידו של imprinting center reign -ICR

Answer 49

איזור השולט לאן אינהנוסרים יקשרו- לאיזה פרומוטור יקשרו

Question 50

מה קורה במידה וחלבון CTCF נקשר לאיזור imprinting center reign (ICR היכן מתרחש?

Answer 50

מונע מהאינהנסור להיקשר לפרומוטור של IGF-2 , ולכן האינהנסר יקשר לפרומוטור של H19 וישעתקו. באלל האימהי

Question 51

מה קורה במידה ויש מתילציה על ICR? היכן קורה?

Answer 51

, ה- CTCF לא קושר את ICR , ואז האינהנסר יכול להיקשר לפרומטור של IGF2 וישעתקו. מתרחש באלל האבהי

Question 52

תיאוריה שאומרת על הבדל בין גנים שמגיעים מהאבא לעומת אמא

Answer 52

תאוריה גנים שמגיעים מהאבא- קשורים לגדילה פעולות אינסנקטיביות גנים שמגיעים מהאמא- קשורים להפסקת גדילה. - higher functions

Question 53

ניסוי בו לקחו 2 עכברים עם 2 אללים אבהיים או שני אללים אימהיים:

Answer 53

שני העכברים מתו בלידה, ובניתוח של גופם ההבדל העיקרי היה במוח- שני אללים אימהיים : frontal cortex ענק וההיפותלמוס קטן. שני אללים אבהיים: frontal cortex קטן וההיפותלמוס ענק.

Question 54

תוצאות מחקר של חולדות שטיפלו מאוד בצאצאים לא טיפלו בצאצאים

Answer 54

צאצאים שלא טופלו- רמות גבוהות של קורטיזול HP axes יותר מופעל. סבלו יותר מחרדה התנהגו ככה לצאצאים שלהם

Question 55

מהי הסיבה לשונות בין העכברים בהקשר של קורטיזול?

Answer 55

בעכברים המוזנחים- עליה במתילציה בפרמוטור של הגן לקולטן של קורטיזול בהיפוקמפוס. מוביל לכך שהיה פחות ביוטי של הקולטן בהיפוקמפוס. המוח לא מקבל את הסיגנל להפסיק הפרשת קורטיזול

Question 56

מה ראו כאשר לקחו צאצאים של אמא מזניחה ושמו אותה אצל אמא מטפלת?

Answer 56

ו שהייתה ירידה במתילציה של הפרומוטור בגן לרצפטור לקורטיזול

Question 57

מה ראו במחקר של אנשים לאחר המוות?

Answer 57

אצל אנשים שהתאבדו וסבלו מהזנחה בילדות לעומת אנשים שהתבאבדו היה יותר מתילציה בקולטן לקורטיזול בהיפוקמפוס