אפיגנטיקה Flashcards

1
Q

אפיגנטיקה

A

שינויים שעוברים בתורשה ומשפיעים על פעילות הגנים מבלי לשנות את רצף הדנא

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

תהליכים עיקריים באפיגנטיקה

A

מתילציה על הדנא
מודיפקציות עג היסטונים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

איפה דנא עובר בעיקר מתילציה

A

על גבי ציטוזין-C
ובעיקרי ברצפי
CpG

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

מיהו הדי הנוקלאוטיד הכי פחות שכיח בגנום ?
מה הבעיה איתו?

A

CpG
הוא יחסית לא יציב ויכול לעבור דה אמינציה בקלות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

מה קורה ל-
C
כאשר עובר דה אמינציה

A

הופך ל-
U

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

מה קורה ל-
C
ממותל
כאשר עובר דה אמינציה

A

הופך ל-
T

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

כמה אחוז מרצפי
CpG
ממותלים

A

70%

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

איפה ניתן לראות הרבה רצפי
CG?

A

בטפילים וברצפי דנא חוזרניים
CpG island

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

CpG island

A

אזורים העשירים ברצפי
CG.
רובם אינם ממותלים.
מוגנים מאוד ממוטציות.
נמצאים בעיקר בפרומוטורים של
housekeeping genes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

מיהו האנזים המוסיף מתילציות על גבי הדנ”א?

A

DNA methyltrasnferases

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

DNMT1\maintenance methlyas

A

בעת הכפלת הדנא לקראת חלוקה תאית-

אנזים הקורא את מתילציות
על גדיל ההורי המקורי ומבצע אותן על גדיל הבת החדש

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

מתי נמצא- המי מתילציה?

A

בתאים מתחלקים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

DNMT3a/b

A

אנזים המוסיף קבוצות מתיל דה- נובו- מתילציות שלא היו בתא האב

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

הוספת קבוצת מתיל לדנא נחשבת שינוי?

A

בין השינויים היותר יציבים בגנום

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

הורדת קבות מתיל-

A

תהליך יותר קשה- מנגנון בכמה שלבים ולא על ידי אנזים אחד.
לוקח יותר אנרגיה מלבצע מתילציה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

מי מבצע את תהליך שמאפשר הורדת קבוצת מתיל?

A

TET1\2\3

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

מה חיוני ל-
TET?

A

וויטמין
C

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

כיצד ניתן להסיר קבוצת מתיל?

A

הוצאה של הבסיס הממותל לגמרי

הוצאה של
DNMT-1
ככה שתוך שתי חלוקות כבר לא יהיה גדילים ממותלים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

מה תפקיד מתילציה בפרומוטרים?
כיצד עושה זאת?

A

מעכבת את השעתוק של גנים.
מונעת קישור של פקטורי שעתוק לפרומוטור/מביאה חלבונים מעכבים את השעתוק של כנים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

למה יכולה לגרום מתילציה באיזורים שהם לא הפרומוטור?

A

יכולה לעודד שעתוק/לעכב שעתוק

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

כמה סוגים של היסטונים יש לנו בתוך הנוקלאוזום?

A

H2A
H2B
H3
H4

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

איפה ההיסטונים עוברים מודיפקציות?

A

בזנב של ח”א שיוצא מתוך הליבה של הנוקלאוזום.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

איפה לרוב מתרחשים מוקדיפקיות על גבי הזנב של ההיסטונים?

A

על קבוצות ליזין

24
Q

למה לרוב גורמת אצטילציה בהיסטונים?

A

לשעתוק גנים-

לאצטיל- מטען שלילי, לדנא מטען שלישי.
נוצר דחייה בינהם והדנ”א נפתח

25
Q

למה לרוב גורמת מתילציה בהיסטונים?

A

יכולה לגרום לשעיתוק/הפסקת שעתוק-
תלוי היכן נעשתה ובאיזה היסטון

26
Q

האינזימים הפועלים על היסטונים- מתיל

A

יש הרבה מתיל טרנספרזות, והרבה אנזימים שמבצעים דה מתילאזות.
פעילות המתרחשת מהר

27
Q

מה ההבדל בין מודיפקציות מתיל על היסטונים לעומת דנ”א?

A

בהיסטונים-
הורדת מתיל נעשית מהר.

בדנ”א- הורדת מתיל תהליך ארוך מכמה שלבים.

28
Q

מהי רמת המתילציה בין רקמות ותאים שונים בגוף?

A

ברקמות שונות ובין תאין שונים יש רמות מתילציה שונות על הגנום.
כדי להשתיק תאים מסויימים

29
Q

ההבדל במתילציה בין רקמת עצב מסויימת בין שני אנשים שונים?

A

דומה

30
Q

מהן רמות המתילציות בזיגוטה/בלסטוציט בגנום?

A

מאוד נמוכות.

31
Q

מתי מתרחשת מחיקה של אפיגנטיקה מהדנ”א האהבי לעומת האימהי?

A

מיד בתחילת ההתפתחות יש מחיקה של המתילציות ממקור אבהי- על ידי מנגנון
TET

כמה ימים אחר כך מחיקה של המתילציות ממקור אימהי.
מתרחש בזמן חלוקה תאית על ידי
אי פעילות של
DNMT-1

32
Q

האם ישנן מחיקות של כל המתילציות בהתחלת ההתפתחות העוברית?

A

יש כמה אזורים בגנום שככל הנראה לא עוברים מחיקה לחלוטין.

שם יש נוכחות של חלבונים שמגינים על האיזור מאנזימים מוחקים.

33
Q

כיצד ניתן לייצר תאי
iPS -induced pluripotent stem cells

A

מתן אינזמים המבצעים על הוספה/הורדה של מתילציות מסוימות.

34
Q

כיצד סביבה יכולה לגרום לשינוי אפיגנטי- מחקר דבורים

A

דבוריה- עובדת
מקבלת גלי שמכיל מתיונין וחומצה פולית שמעודד מתילציה על פני הגנום.

דבורה- מלכה
מקבלת גלי אחר.

כאשר הורידו לדבורים את
DNMT3
לא התרחשה מתילציה
והדבורות הפכו למלכות.

35
Q

השפעה של גן
Agouti
על עכברים-

A

צבע
מטבוליזם

36
Q

עכברים בגודל תקין-

A

מתיל על גן
Agouti
כך שהוא לא מתבטא

37
Q

עכברים שמנים

A

אין מתיל על גן
Agouti,
הגן עובר יותר שעתוק

38
Q

אפיגנטקיה בין דורות של גן
Agouti

A

אמא אגוטית, יש יותר סיכוי לצאצאים אגוטיים

אמא לא אגוטית, יש יותר שהצאצאים שלה יהיו לא אגוטים,

לאבא אין שום השפעה

39
Q

מה קורה אם נותנים לאמא עכברה שיש לה את הגן הפעיל , מזון שמכיל חומרים המעודדים מתילציה
בזמן ההריון וההנקה?

A

יש פחות סיכוי לצאצאים אגוטיים- ניתן לעודד מתילציה על ידי תזונה

40
Q

מהם האתגרים במחקר אפיגנטי?

A

שינויים אפיגנטיים תלויים ברקמה

שינויים אפיגנטיים יכולים להיות רלוונטיים לתאים מאוד ספציפיים

עלות גבוהה

41
Q

מתילציה בסרטן-

A

בסרטן ניתן למצוא-

מעט מתילציה בכל הגנום

עליה במתילציה בפרומוטרים של
tumor suppressor genes-
לכן הם פחות מתבטאים ויש יותר פוליפרציה של תאים

42
Q

איזה תוצאות ראו בשוני במתילציה בין
חולי סרטן לבריאים באוזרי
ה
CpG island?

A

ברקמה בריאה: כל הגנום יש רמות מתילציה גבוהות אבל באיי CpG יש ירידה במתילציה.

ברקמה סרטנית: בכל הגנום יש רמות מתילציה נמוכות, ואין שינוי ברמות המתילציה באיי CpG.

43
Q

Decitabine

A

תרופה לסרטן.

במבנה שלה דומה לציטוזין.
מוכנס לדנא ומונע מתילציה.
בנוסף
האנזים
DNTM
נקשר אליה חזק.
מונע מהאנזים לבצע מתילציות בדנ”א.
וגם גורם לדגרדציה של
DMNT-1

44
Q

הזדקנות ואפיגנטיקה-

A

ישנם שינויים אפיגנטקים ברקמה התלויים בהזדקנות.
לפי השינויים ניתן לדעת אם אדם מזדקן מהר יותר/לאט יותר

45
Q

מה קורה בחתמה גנומית באוזרים שהם אימפרינטג שאומרים לעבור השתקה
בתאי זרע
בשלב השכפול?

A

בתאי הזרע שני האללים יהיו ממותלים

46
Q

מה אומר החתמה אימהית?

A

שהאלל של האמא עובד- דה אקטיבציה
ומה שמתבטא זה האלל האבאהי

47
Q

מהיכן מתבטא הגן
IGF-2?

A

רק מהאלל האהבי

48
Q

מהיכן מתבטא הכן
H19?

A

רק מהאלל האימהי

49
Q

מה תפקידו של
imprinting center reign -ICR

A

איזור השולט לאן אינהנוסרים יקשרו- לאיזה פרומוטור יקשרו

50
Q

מה קורה במידה וחלבון
CTCF נקשר
לאיזור
imprinting center reign (ICR

היכן מתרחש?

A

מונע מהאינהנסור להיקשר לפרומוטור של
IGF-2

, ולכן האינהנסר יקשר לפרומוטור של
H19 וישעתקו.

באלל האימהי

51
Q

מה קורה במידה ויש מתילציה על
ICR?

היכן קורה?

A

, ה- CTCF
לא קושר
את
ICR
, ואז האינהנסר יכול להיקשר לפרומטור של
IGF2 וישעתקו.

מתרחש באלל האבהי

52
Q

תיאוריה שאומרת על הבדל בין גנים שמגיעים מהאבא לעומת אמא

A

תאוריה

גנים שמגיעים מהאבא- קשורים לגדילה
פעולות אינסנקטיביות

גנים שמגיעים מהאמא-
קשורים להפסקת גדילה.
- higher functions

53
Q

ניסוי בו לקחו 2 עכברים עם 2 אללים אבהיים או שני אללים אימהיים:

A

שני העכברים מתו בלידה, ובניתוח של גופם ההבדל העיקרי היה במוח-
שני אללים אימהיים
: frontal cortex ענק וההיפותלמוס קטן.

שני אללים אבהיים:
frontal cortex קטן וההיפותלמוס ענק.

54
Q

תוצאות מחקר של
חולדות
שטיפלו מאוד בצאצאים

לא טיפלו בצאצאים

A

צאצאים שלא טופלו-
רמות גבוהות של קורטיזול
HP axes
יותר מופעל.

סבלו יותר מחרדה

התנהגו ככה לצאצאים שלהם

55
Q

מהי הסיבה לשונות בין העכברים בהקשר של קורטיזול?

A

בעכברים המוזנחים-
עליה במתילציה בפרמוטור של הגן לקולטן של קורטיזול
בהיפוקמפוס.

מוביל לכך שהיה פחות ביוטי של הקולטן בהיפוקמפוס.

המוח לא מקבל את הסיגנל להפסיק הפרשת קורטיזול

56
Q

מה ראו כאשר לקחו צאצאים של אמא מזניחה
ושמו אותה אצל אמא מטפלת?

A

ו שהייתה ירידה במתילציה של הפרומוטור בגן לרצפטור לקורטיזול

57
Q

מה ראו במחקר של
אנשים לאחר המוות?

A

אצל אנשים שהתאבדו
וסבלו מהזנחה בילדות
לעומת אנשים שהתבאבדו

היה יותר מתילציה בקולטן לקורטיזול בהיפוקמפוס