Wykład 14 Flashcards

1
Q

wiązania w nukleotydach

A

N-glikozycowe między rybozą a zasadą
estrowe między rybozą a resztą kwasu fosforanowego
wiązanie bezwodnikowe między resztami kwasu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

co jest podjednostką strukturalną NDA?

A

nukleotyd

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

jakimi wiązaniami są połączone nukleotydy w łańcuchu DNA

A

3-5 fosfodiestrowe

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Reguły Chargaffa

A

A + G = T + C

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Opisz krótko B-DNA, A-DNA, Z-DNA

A
B-DNA 
kształt pośredni, prawoskrętna
A-DNA
najszersza, prawoskrętna
Z-DNA
najwęższa, lewoskrętna
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Co opakowuje chromatynę?

A

histony

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Histony lizyno-bogate

A

H2A, H2B

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Histony arginino-Bogate

A

H3, H4

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Poziomy upakowania DNA

A
DNA
Nukleosomy
Solenoid (6/skręt)
Pętle (50/skręt)
Miniprążek
Chromosom
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Co to jest Tm?

A

Temperatura topnienia, w której dochodzi do utraty połowy helikalnej struktury

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

co ma większą temp. topnienia - dsDNA czy ssDNA?

A

dsDNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

rodzaje replikacji

A

Dyspersyjna
semikonserwatywna
konserwatywna

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

co to jest origin?

A

Miejsce w cząsteczce DNA, gdzie rozpoczyna się replikacja

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Co to jest replikon?

A

odcinek DNA, zawierający miejsce inicjacji replikacji oraz sekwencje fizycznie do niego przylegające

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

OriC

A

miejsce inicjacji replikacji E. Coli (245 pz)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

czym jest kompleks preinicjacyjny

A

widełki replikacyjne wyposażone w komplet białek replikacynych

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Helikaza DnaB

A

rozrywanie wiązań wodorowych za pomocą ATP

przyłączenie prymaty DnaG w OriC i inicjacji fragmentów okazaki

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

DnaC

A

funkcja przekaźnika ułatwiającego dołączanie Dna do ssDNA

aktywuje DnaB

19
Q

Białka SSb

A

stabilizują jednonaciowe DNA

20
Q

co to jest ARS?

A

autonomiczne replikujące się sekwencje drożdży - funkcjonalny odpowiednik OriC

21
Q

ABF1 i ORC

A

ABF1 - aktywator replikacji

ORC - białka inicjacyjne

22
Q

Co potrzeba di syntezy łańcucha DNA?

A

matryca, starter, dNTP, Mg2+, polimeraza

23
Q

Replikacja procarionta

co trzeba

A
topoizomeraza
helikaza
białka stabilizujące
prymaza
polimerazy DNA
ligaza DNA
24
Q

funkcja Topoizomerazy DNA

A

kataliza reakcji przecinania i łączenia polinukleotydowych łańcuchów DNA
usuwanie napięcia torsyjnego
u eukariota przepuszczalność jąder, utrzymywanie struktury chromatyny

25
Q

Co hamuje aktywność topoizomerjazy II? (bakteryjna gryraza)

A

nowoybiocyna (wiązanie ATP), kwas nalidyksowy, cyprofloksacyna (ponowne łączenie DNA)

26
Q

białka SSB

A

stabilizacja nici,

27
Q

odpowiednik SSB u Eucariota

A

białko replikacyjne A

28
Q

co syntezuje u bakterii startery?

A

Prymaza (potem Polimeraza III)

29
Q

co syntezuje u eukariota startery?

A

Polimeraza alfa (potem polimeraza delta

30
Q

co to jest prymasom?

A

kompleks białek zaangażowanych w replikacje DNA

31
Q

co się składa na prymasom?

A

helikaza, SSB, prymaza

32
Q

Aktywność 5-3, 3-5, funkcja
Polimeraza I
II
III

A
I 
3-5, 5-3, usuwa startery
naprawa DNA
replikacja
II
3-5, sprawdzanie poprawności, naprawa DNA
III 3-5, głowy enzym replikacyjny
33
Q

jaka aktywność może być opisana jako korekcyjna?

A

Aktywność 3-5 egznonukleazy

34
Q

co robią egznonukleazy 5-3?

A

usuwają startery, minery pirymidynowe

35
Q

jak idzie polimeraza?

A

5-3 (nowa nić)

36
Q

czym jest replikom?

A

kompleks białek zaangażowanych w replikację DNA (prymasom + kompleks polimerazy III)

37
Q
polimeraza 
alfa 
beta
gamma
delta
epsilon
A

alfa - replikacja, synteza starterów
beta - naprawa DNA
gamma - 3-5, replikacja mitochondrialnego DNA
delta, 3-5, główny enzym replikacyjny
epsilon - 3-5, replikacja i sprawdzanie poprawności syntezy DNA

38
Q

Czemu odpowiada polmeraza
I
II
III

A

alfa
epsilon
delta

39
Q

odpoco usuwa startery u eucariota?

A

FEN1, RNAza H

40
Q

Czy u eukariota istnieje replikom?

A

nie - fabryki replikacyjne

41
Q

jak są replikowane genomy bakteryjne?

A

dwukierunkowo

42
Q

czym są białka TUS?

A

pozwalają na wejście widełek replikacyjnycrh posuwających się w jednym kierunku, ale zatrzymuje widełki przesuwające się drugą stronę - w mechanizm włączona helikaza DnaB

43
Q

czym eukariota ma odpowiednik bakteryjnych sekwencji terminator owych oraz białek Tus

A

nie