Wykład 1 - Enzymy Flashcards
Przez co jest zwiększona szybkość reakcji enzymatycznej?
Zmniejszenie energii aktywacji
Od czego zależny szybkość reakcji enzymatycznej?
Od stosunku stężenia substratu do enzymu
Czym strukturalnie jest większość enzymów?
Białkami
Co to są Rybozymy?
RNA posiadające właściwości enzymatyczne
3 cechy odróżniające enzymy od katalizatorów?
wysoka wydajność, specyficzność, zdolność do zmiany aktywności
Okres półtrwania reakcji kat. przez anhydraza węglanową?
5 sekund
Czym jest specyficzność określająca typ reakcji?
jeden enzym jedna reakcja
Czym jest specyficzność substratowa?
jeden enzym jeden substrat
Jak zbudowany jest enzym?
Apoenzym - część białkowa
Kofaktor - metale/niskocz. związki - koenzymy
= holoenzym - pełny układ katalityczny
Co to jest grupa prostetyczna?
Koenzymy łączące się z apoenzymym kowalencyjnie
Z jakim koenzymem i enzymem jest powiązana?
- B1
- B2
- B3
- B5
- B6
- B7
- B12
- B9, 11 ?
- Pirofosforan TPP, dehydrogenaza pirogronianowa
- Nukleotyd flawinoadeninowy FAD, dehydrogenaza bursztynianowi
- Dinukleotyd nikotyno-amidoadeninowy NAD, dehydrogenaza mleczanowa
- Koenzym A, kw pantotenowy, Karboksylaza acetylo-CoA
- Fosforan pirydoksalu PLP, fosforylaza glikogenowa
Biotyna, Karboksylaza pirogronianowa - 5-deoksyadenozynokobolamina, murarza metylomalonylowa
- tetrahydrofolian, kw. foliowy, synteza tymidylanowa
W jakim enzymie Zn2+?
Anhydraza Węglanowa
W jakim enzymie Zn2+?
Karboksypeptydaza
W jakim enzymie Mg2+?
Heksokinaza
W jakim enzymie Ni2+?
Ureaza
W jakim enzymie Mo?
Reduktaza azotanowa
W jakim enzymie Se?
proksydaza glutationowa
W jakim enzymie Mn2+
Dysmutaza ponadtlenkowa
W jakim enzymie K+?
Karboksylaza propionylo-CoA
Gdzie zachodzi kataliza?
Centrum aktywne enzymu
Cechy charakterystyczne centrum aktywnego?
Miejsce wiążące substraty i kofaktory,
Zajmuje stosunkowo małą część enzymu
Centra aktywne są zagłębieniami lub szczelina niedostępnymi dla wody
Jakie siły biorą udział w połączeniach substratów z enzymami? 4
Elektrostatyczne
Hydrofobowe
Siły Van der Waalsa
wiązania wodorowe
Czy aminokwasy w centrum aktywnym mogą pochodzić z różnych miejsc cząsteczki?
Tak
Modele E+S? (2)
Klucza i zamka
Indukowanego dopasowania
Czym zajmuje sie kinetyka enzymatyczna?
Pomiarami ilościowymi szybkości reakcji kat. przez enzymy i badanie czynników wpływających na szybkość reakcji
Jak jest mierzona szybkość reakcji enzymatycznej V?
mol produktu w ciągu 1 sekundy
Co to jest V?
Szybkość reakcji enzymatycznej
Czy enzymy wpływają na wartość stałej równowagi?
Nie, przyspieszają tylko jej osiągnięcie
Wzór na energie aktywacji
Delta G = Delta H - T * Delta S (Entalpia - Temp * Entropia)
Jakie jest G w reakcji egzoergicznej?
Mniejsze od 0
Jakie jest G w reakcji endoesgicznej?
Większe od 0
Co wytwarza w przebiegu reakcji enzym?
Stan przejściowy
Co robią enzymy?
Obniżają energie aktywacji
Co wpływa na szybkość reakcji? (6)
Temperatura, pH, E/S, Interakcje międzybiałkowe, Inhibitory i modulatory
W jakim przedziale temp. szybkość wzrasta ?
0-40 Celsj.
Co robi wzrost o 10 st. Cel.
Podwaja prędkość reakcji
Współczynnik temp. ?
Q10 = Vt +10/ Vt
Równianie Michaelisa-Menten
V = Vmax * [S] / Km + [S] V = Vmax/ Km/[S] +1
Co to jest stała michaelisa?
Stężenie substratu przy którym szybkość reakcji osiąga połowę Vmax
Na co pozwala wykres podwójnej odwrotności?
Jest to wykres Lineweavera-Burka i pozwala na wyznaczenie Vmax w miejscu przecięcia się z osią Y
Jak zbudowane są enzymy allosteryczne?
Dwa rodzaje centrów:
Centra aktywne
Centra regulatorowe
W jaki sposób enzymy allosteryczne oddziaływują ze substratem?
Kooperatywny
JAKI KSZTAŁT PRZYBIERA ZALEŻNOŚĆ V OD [S] DLA ENZYMÓW WYKAZUJĄCYCH DODATNIĄ KOOPERATYWNOŚĆ?
SIGMOIDALNY
Równanie Hilla?
V0/Vmax
Gdzie przyłącza się inhibitor kompetycyjny? jak się łączy?
Do centrum aktywnego, blokuje przyłączenie się substratu, konkuruje o miejsce (powinowactwo), nieodwracalnie
Czy substrat moze wyprzeć inhibitor kompetycyjny?
Tak, większym stężeniem
Wpływa na Km i Vmax
Km w górę, Vmax bez zmian
Przykład inhibitora kompetycyjnego?
Metotreksat
Co czego sie wiąże metotreksat?
Jest analogiem tetrahydrofolianu, koenzymu reduktazy dihydrofolianu
Kompetycyjne inhibitory dehydrogenazy bursztynianowej?
Malonian, szczawian, szczawiooctan
Inhibitor niekompetycyjny - gdzie?
Do centrum allosterycznego, niepodobny do substratu
Wpływ na Vmax i Km?
Km bez zmian, Vmax w dół.
gdzie się wiąże inhibitor akompetycyjny?
wiąże się tylko do enzym-substrat w centrum aktywnym. Nie powstaje produkt
Wpływ na Km i Vmax?
Oba w dół
Czym jest katal?
ilośc enzymu katalizujące 1 mol substratu w czasie 1 sekundy
Czym jest U?
Międzynarodową jednostka aktywności enzymatycznej - ilość enzymu, która w ciągu minuty przekształca 1 mikromol
Co to jest aktywność właściwa?
Liczba jednostek enzymu przypadających na 1 mg białka - MIARA CZYSTOŚCI ENZYMU.