Wykład 10 Flashcards
genom człowieka - ile genów?
20-30k
Ile % RNA alternatywnie składane?
60
Ile % białek w wyniku alternatywnego składania?
80
Ile liczy protezom człowieka
50-60k
ile % to powtarzalne DNA?
ponad połowa
Ile % to introny a ile exony?
odpowiednio 24 i 1
kolejność ile białek do jakiego procesu w %
Transkrypcja i translacja Metabolizm transport Replikcja Fałdowanie białek
Z czego składa się proteom i ile moze liczyc
z białek obecnych w danym momencie w komórce, od 20k do 100kk
Dwie struktywy Aminokwasowe
alfa helisa i beta kartka
Jakie aminokwasy są niepolarne?
Alanina, Valina, Leucyna, Izoleucyna, Prolina, Fenyloalanina, Tryptofan Metionina
Jakie aa są polarne?
Glicyna, Seryna, Treonina, Cysteina, Tyrozyna, Asparagina, Glutamina
Jakie aa są ujemnie naładowane?
Kw. asparaginowy i glutaminowy
Jakie aa są dodatnio naładowane?
Lizyna, arginina, histydyna
Jakie aminokwasy są endogenne?
asparaginian kw. asparaginowy glutaminian kw. glutaminowy glicyna alanina seryna prolina
Jakie aa są egzogenne?
Tyrozyna, Valina, Leucyna Izoleucyna Treonina Lizyna Arginina Histydyna Fenyloalanina Tryptofan Cysteina Metionina
Jaki koenzym warunkuje transaminacje?
PLP - fosforan pirydoksalu
Jakie dwa związki mogą podlegać transaminacji z udziałem PLP?
Glutaminian w ketokwas, a ketokwas w np. alanine
Aminokwasy glukogenne i przez co
glicyna seryna cysteina alanina
pirogronian
asparaginian przez szczawiooctan
histydyna, glutaminian, prolina, arginina, metionina, walina, treonina przez alfaketoglutaran
jakie aa są ketogenne i przez co
Lizyna i leucyna
przez acetylo-CoA
Jakie są cała ketonowe?
3-hydroksymaślan, acetooctan
Jakie aa są gluka i ketogenne?
Fenyloalanina, tyrozyna, izoleucyna, tryptofan
Co powstaje w skutek deaminacji?
amoniak
W skutek czego powstaje amoniak do cyklu mocznikowego?
Deaminacji oksydacyjnej L-glutaminianu
do czego odnosi się wskaźnik de Ritisa?
do aminotransferaz AspAT i AIAT (5-40 U/I)
Jaki enzym rozpoczyna cykl mocznikowy?
Syntetaza karbamoilofosforanowa
Co potrzeba zeby syntetaza karbamoilofosforanowa mogła dobrze działać?
2ATP, HCO3- i NH3
Opisz cykl mocznikowy
Karbamoilotransferaza ornitynowa dołącza karbamoilofosforan do ornityny i powstaje cytrulina, która w skutek dołączenia aspdraginianu w towarzystwie syntetazy argininobursztynianowej i ATP (do AMP + PPi) powstaje Argininobursztynian, który pod wpływem jednoimiennej liazy wydala fumaraz i powstaje arginina, która pod wpływem ARGININAZY wydala mocznik i staje się ornityną
Insulina - co zawiera prproinsulina, co pro insulina, gdzie powstaje insulina właściwa wewkom i jak wygląda
Preproinsulina posiada sekwencje sygnalną, pro insulina nie, posiada już odpowiednie mostki disiarczkowe i w aparacie golgiego jest odcinany peptyd C i zostaje pepty A(21aa) i B(30aa) z 3 mostki disiarczkowe - 2 między A i B(7-7;19-20), i jeden między A (6-11)
Co moze sie stan ze źle pofałdowanym białkiem?
Agregacja, degradacja, refałdacja
Zespół marfana
nieprawidłowe zwijanie fibryliny
Kolagen źle pozwijany
Wadliwa osteogeneza
Pigmentowe zwyrodnienie siatkówki
rodopsyna
Funkcja nukleoplamin
Angażują się w składanie nukleosomu
Funkcja chaperonin
wiążą niezwinięte białka i zapobiegają agregacji
Funkcja białka szoku termiczego
biorą udział w odpowiedzi na stres
Czym jest Poli-S-nitrozylacja?
Modyfikacja kowalencyjna grup tiolowych przez tlenek azotu
monoubikwityncja
regulacja funkcji histnoów
multiubikwitynacja
endocytoza
inne sposoby ubikwitynacji
degradacja w proteosomie, udział w naprawie DNA
Co składa się na gramicydynę
prolina, fenyloalanina, leucyna, ornityna, Valina
Hemoproteiny
porfina izoporfina
Co ma chlorofil w środku?
Magne
Co ma hem w środku?
Żelazo 2+
Hemoproteiny
Mioglobina
Hemoglobina, płodowam sierpowata, karboksyhemoglobina, methemoglobina
Mioglobina struktura
3-rzedowa, typowe białko globularne
ile % identycznej sekwencji w Mb iHb
18
Jaki kształt wiązania O2 do mioglobiny?
hiperboliczny
Jaki kształt wiązania O2 do hemoglobiny?
sigmoidalny
co z powinowactwem HB do tlenu kiedy ph do góry
wzrasta
Co robi BPG, z czym się wiąże, kiedy i po co
Obniża powinowadztwo Hb do O2, wiąże się tylko do napiętej formy Hb , produkowany przez erytrocyty, żeby łatwiej oddać
HbA1, HbA2
Obydwie prawidłowe, druga stanowi do 3% u dorosłych
HbF
płodowa, większe powinowactwo do tlenu
Hemoglobiny embrionalne o właściwościach podobnych jak HbF
Gower 1 i 2
Portland
Co to jest HbA1c
kiedy się ją sprawdza
HbA z przyłączoną nieenzymatyczne, trwale cząsteczką glukozy do N-końcowych łańcuchów globiny
sprawdza się nią skuteczność leczenia cukrzycy
Jaka jest norma dla HbA1c? co to są HbA1a i b
4-6%
produkty przejściowe , zasady Schiffa
Jaka jest norma dla wszystkich form likowanej Hb?
6-8%
Hb nieprawidłowe
HbS - zmiana hydrofilowego kwasu glutaminowego na walne - lepkie miejsca - zaburzenia kształtu, anemia sierpowata
HbM - histydyna na tyrozynę, żelazo na 3+ zamiast 2+, co nazywamy Methemoglobiną
Typu Cheasepeake - zbyt mało tlenu transportuje - hipoksja
Typu Lepore - talasemia
Hb nieprawidłowe nie wywołujące Zaburzeń
Bristol, Sydney, Hikari, Milwaukee
budowa mikrofilamentów
podwójna helisa aktyny
budowa mikrotubul
alfa i beta tubuliny, tworzą dimery, a te tworzą włókna
Keratyna jest białkiem …
fibrylarnym
Kolegaen jest …
Potrójna helisą
Co charakteryzuje kolagen?
co 3 aa to glicyna, 30% pozostałych to prolina/hydroksyprolina
Budowa miozyny
Dwie głowy i długi ogon, głowy wiążą ATP
Co porusza miozyna wzdłuż włókien fblamentówych?
hydroliza ATP
Dystrofia mięśniowa Duchenne’a
związana z chromosomem X, mężczyźni chorzy - zanik mięśni.
DMB - postaw lekka, DMD - wózek, łózka, 30 lat śmierć
Co powoduje dystrofię łagodną?
duża delecja, ramka ok
co powoduje DMD?
mała delecja, ramka zmieniona
Pląsawica huntingtona
zmiany degeneracyjne mózgu
poślizg polimerazy - CAG wiele razy.
więcej niż 35 - przy podziałach się zwiększa
W kolejnych pokoleniach może się pogorszać
Różnice Chemotrypsyny, trypsyny i elastyna
Chemotrypsyna - Ser 189
trypsyna - Asp 189
Elastyna - Val 226 i The 216
Proteaza HIV, jakie miejsce aktywne?
Phi-Pro, miejsce aktywne to Arg ***
Inhibitory proteazy HIV
Norvir, Inviraza
Czy kinazy tyrozynowe są związane z nowotworzeniem?
Jak się aktywują i jaki jest szlak sygnałowy?
Tak
Nieaktywny enzym, następnie dimeryzacja, następnie autofosforylacja i aktywacja, dalej molekuły sygnałowe, wiązanie i ich fosforylacja, na koniec aktywacja molekuł sygnałowych i ich szlaków
Co robią inhibitory TK?
Przykład
blokują miejsce wiązania ATP, hamują transfer P w szlaku sygnałowym
GLEEVEC
Z czym związana jest kinaza PERK?
ze stresem siateczkowym
W jakim szlaku wywoływana jest apoptoza komórek? *** związane z kinazą perk
UPR