Week 2 - Regulatie genexpressie

Question 1

Hoe zijn onze DNA-moleculen onderverdeeld?

Answer 1

Over 22 chromosomen, plus nog 2 geslachtchromosomen.

Question 2

Uit wat bestaat een chromosoom?

Answer 2

Opgebouwd uit een chromatine, een verbinding van DNA en histoneiwitten.

Question 3

Wat bevat een chromosoom?

Answer 3

Informatie over de regulatie van genexpressie

Question 4

Wat is RNA-polymerase I?

Answer 4

transcriptie van de meeste rRNA genen.

Question 5

Wat is RNA-polymerase II?

Answer 5

eiwit-coderende genen (mRNA), zorgt voor transcriptie van genen.

Question 6

Wat is RNA-polymerase III?

Answer 6

tRNA en sommige rRNA genen.

Question 7

Waar moet je genexpressie controleren als eerst/belangrijkst?

Answer 7

Bij transcriptie

Question 8

Hoeveel ATP kost transcriptie?

Answer 8

2 ATP per basenpaar

Question 9

Wat doet een promotor?

Answer 9

Ze bepalen waar en in welke richting de transcriptie plaatsvindt. Ze zijn 100bp lang en zitten aan het begin van een gen.

Question 10

Wat doet een enhancer, waar zitten ze & wat versterken ze?

Answer 10

Bepalen hoe vaak de transcriptie start. Ze zitten overal behalve op de promotor en ze versterken transcriptie.

Question 11

Wat doen algemene trancriptiefactoren?

Answer 11

Ze herkennen de promotor aan de TATAA-box die zich op -30bp bevindt. Ze zorgen ervoor dat RNA-polymerase UU op de goede plek bindt en koppelt.

Question 12

Waarbij zijn algemene transcriptiefactoren betrokken?

Answer 12

alle eiwit coderende genen.

Question 13

Wat doen specifieke transcriptiefactoren?

Answer 13

Ze herkennen de enhancer sequentie (binden hieraan) en ze activeren RNA-polymerase II.
- Ze zijn alleen bij genen met specifieke enhancers.
- Het zijn genregulator eiwitten.

Question 14

Hoe dichter de enhancer bij de promotor ligt, hoe … er een transcript wordt gemaakt, want…

Answer 14

vaker, want lus-vorming.

Question 15

Wat is de Sonic Hedgehog Expressie (SHH)?

Answer 15

is een groei- en differentiatiefactor die door de cel uitgescheiden wordt en is belangrijk voor de ontwikkeling van de hand.

Question 16

Wat gebeurt er bij SHH?

Answer 16

Door de mutatie gaat de repressor functie verloren en krijg je repressie aan de verkeerde kant van het ontwikkelende handje. Kan leiden tot meervingerigheid.

Question 17

ZRS als repressor/activator…

Answer 17

ZRS = repressor aan duimkant
ZRS = activator aan de pinkkant

Question 18

Wat zijn zinkvingers?

Answer 18

Het stabiliseert de eiwitvouwing.
(Kunnen aan ongeveer 2 basenparen binden. Door bepaalde alfa-helixen kunnen verschillende basen in het DNA worden herkend)

Question 19

Hoe vormen zinkvingers?

Answer 19

De meeste eiwitten gaan in de grote groef liggen. Daarna steekt er een aminozuur naar binnen en deze bindt aan specifieke basen d.m.v. waterstofbrugvorming.

Question 20

Wat doen steroïdhormomen?

Answer 20

ze kunnen vrij in de circulatie zitten en gemakkelijk door het celmembraan heen komen.

Question 21

Wat gebeurd er als een steroïdhormoon bindt aan een kernreceptor?

Answer 21

Hij verandert van vorm waardoor hij actief door eiwitten het celmembraan in kan worden getransporteerd.

Question 22

5 kenmerken van kernreceptoren

Answer 22

• grote familie zinkvinger eiwitten
• homo- en heterodimeren
• specifiek DNA respons element (waardoor ze als receptor dienen)
• activering door ligand binding.
• targets voor (niewe) geneesmiddelen

Question 23

Hoeveel zinkvinger eiwitten hebben wij als mens?

Answer 23

339

Question 24

Waarom kan een steroïdhormoon direct door het celmembraan heen?

Answer 24

het is een sterk lipofiel molecuul.

Question 25

Op welke 6 manieren worden genregulatie eiwitten aangestuurd?

Answer 25

• weefselspecifieke expressie.
• fosforylering/defosforylering
• het vormen van homo-heterodimeren
• interacties met cofactoren
• lokalisatie in de cel (cytosol/kern)
• kernreceptoren: ligand binding

Question 26

Wat doet een ligand?

Answer 26

is een molecuul dat aan een ander, doorgaans groter molecuul kan binden, zoals een signaalmolecuul aan een membraaneiwit. Een ligand kan alleen een binding aangaan met een specifiek doelmolecuul (meestal een eiwit of nucleïnezuur).