Week 2 - DNA replicatie Flashcards
Wanneer gebeurt DNA-replicatie?
tijdens de S-fase in de celcyclus.
Definitie van DNA-replicatie
Met deze verdubbeling kunnen 2 exacte kopieën over de dochtercellen (ontstaan tijdens mitose) worden verdeeld.
Stappenplan: aanschakelen van een serie S-fase specifieke genen:
- de herkenning van een RIP door een geactiveerd ORC.
- het lokaal ontwinden van de helix door DNA helicase.
- DNA polymerase alpha-primase complex: maakt een begin RNA-primer.
- Clamp loader.
- Sliding clamp.
- Start van de replicatie.
Wat doet een clamp loader?
zorgt voor het laden van de sliding clamp
Wat doet een sliding clamp?
zorgt ervoor dat DNA polymerase aan de matrijsstreng vast blijft zitten.
Wat is een replication fork?
Het deel DNA dat vlak voor een bubbel is en nog in de helix opgewonden zit.
De opbouw van een DNA streng gebeurd in richting?
5’ –> 3’
De template streng wordt afgelezen in richting
3’ –> 5’
In welke richting maakt DNA een RNA-primer vast?
3’ –> 5’
Hoe werkt DNA-primase?
- aan enkelstrengs DNA wordt een RNA-primer vastgemaakt.
- er komen single-strand DNA-binding proteins die aan het deel zonder primer binden en beschermen.
- DNA-polymerase bindt de RNA-primer.
- de sliding clamp bindt zich aan de polymerase alfa.
- de polymerase vervangt de RNA-primer met DNA-primer en bouwt de rest van het DNA in tegen enkelstrengs DNA.
Wat zijn okazaki-fragmenten?
DNA-polymerase doet de DNA-replicatie in stukjes.
Wat doet DNA-ligase?
- de stukjes tussen okazaki fragmenten worden gevuld.
- fragmenten moeten aan elkaar worden gezet.
3 stappen van DNA-replicatie
- base selectie.
- proofreading.
- mismatch reparatie.
Wat is base selectie?
vormt het eerste mechanisme. Alleen een base die complementair is aan de base in de DNA-template streng kan worden ingebouwd.
Waar vindt base selectie plaats?
in het katalytische centrum. De handpalm van de polymerase.
