Week 2 - Celorganellen en eiwitsortering

Question 1

Kunnen eiwitmoleculen de lipide lagen van membranen wel of niet passeren? En waarom wel/niet?

Answer 1

Niet, omdat de geladen aminozuren niet langs de ongeladen lipiden heen kunnen.

Question 2

Wat zijn de 3 transportmechanismen voor eiwitten?

Answer 2

• receptorbinding door signaalpeptide.
• Porie-eiwitten (translocator)
• Transport vesicles (membraan blaasjes).

Question 3

Hoe gaat een eiwit naar de nucleus?

Answer 3

1. Hij wordt gemaakt in het ER,
2. Gemodificeerd in het Golgi-apparaat,
3. Vervolgens door het golgi in een vesicle getransporteerd naar de nucleus

Question 4

Hoe kan een eiwit in de nucleus binden aan een kernporie (nuclear pore)?

Answer 4

Het eiwit bevat een signaalpeptide (NLS), die interactie aangaat met de receptor.

Question 5

Wat is een NLS?

Answer 5

Specifieke volgorde van aminozuren.

Question 6

Wat gebeurt er zodra een eiwit gebonden is aan een kernporie?

Answer 6

het porie-eiwit (translocator) verandert van vorm, zodat het getransporteerde eiwit de nucleus in kan.

Question 7

Wat gebeurt er zodra een steroïdhormoon aan een genregulatoreiwit koppelt?

Answer 7

1. Het verliest zijn aantrekkingskracht met het bedekkende eiwit.
2. Het NLS komt vrij en kan binden aan receptor in het kernmembraan.
3. Het genregulator eiwit kan zich vervolgens binden aan de enhancer en de transcriptie activeren.

Question 8

Waar bevindt het systeem van oxidatieve fosforylering?

Answer 8

Op de cristae (binnenmembraan) van het mitochondrium

Question 9

Wat doen chaperones?

Answer 9

Ontvouwen het eiwit en helpen het eiwit vervoeren door de porie.

Question 10

Wat doen ribosomen?

Answer 10

Maken eiwitten met behulp van mRNA, dit gebeurt vaak met meerdere ribosomen tegelijk.

Question 11

Waar zitten ribosomen?

Answer 11

Op het membraan van het ruwe ER.

Question 12

Weg van een eiwit naar het RER.

Answer 12

1. het mRNA met een speciale ER signal sequence wordt door een in het cytosol drijvende ribosoom herkent tijdens translatie.
2. het ribosoom bindt met ER signal sequence aan een receptor in het membraan van het ruwe ER.
3. tijdens de doorgaande eiwitsynthese wordt het eiwit door het membraan getransporteerd via een porie.
4. Het eiwit wordt in ontvouwen staat in het ER afgezet.

Question 13

Hoe worden eiwitten in het golgi-systeem gesorteerd en gemodificeerd?

Answer 13

Door er bijvoorbeeld suikers aan te zetten (glycosylering).

Question 14

Hoe vindt het transport van het EM-lumen naar het golgi plaats?

Answer 14

Voornamelijk door vesicles.

Question 15

Hoe worden vesicles gevormd?

Answer 15

Door clathrin-coating.

Question 16

Wat is clathrin-coating?

Answer 16

Clatherine (eiwit) bindt aan receptoren in het membraan van het ER-lumen

Question 17

Wat is budding?

Answer 17

Het membraan van het ER-lumen vormt een bolvorm en wordt uiteindelijk afgesnoerd.

Question 18

Stappenplan eiwittransport naar Golgi-systeem

Answer 18

1. vesicles transporteren ze.
2. budding vindt plaats.
3. clatherine laat los van receptoren en wordt teruggegeven aan cytosol.
4. de ongebonden receptoren worden hu herkent en getransporteerd naar het Golgi-systeem.
5. Daar versmelten ze aan de kern kant om gemodificeerd te worden.

Question 19

Waarom vindt de modificatie van eiwitten in het Golgi-systeem meestal plaats in de vorm van glyosylering?

Answer 19

Dit is nodig als het eiwit dat gemodificeerd wordt aan de buitenkant van een membraan wordt gebonden of daar terecht gaat komen.

Question 20

Welke 2 categorieën van secretie zijn er?

Answer 20

• constitutieve secretie.
• geïnduceerde secretie.

Question 21

Wat is constitutieve secretie?

Answer 21

• bijvoorbeeld albumine in de lever.
• Vindt continu plaats en wordt nauwelijks gereguleerd.

Question 22

Wat is geïnduceerde secretie?

Answer 22

wordt gereguleerd

Question 23

d.m.v. wat vindt eiwitafbraak plaats?

Answer 23

proteasomen, lysosomen en autofagosomen.

Question 24

Wat is de turn over van eiwitten?

Answer 24

Het proces van aanmaak en afbraak van eiwitten. Deze is constant actief.

Question 25

Wat zijn proteasomen?

Answer 25

klenie organellen in het cytoplasma wat zorgt voor afbraak van eiwitten. Ze hebben de vorm van een garenklos (cilinder).

Question 26

Wat is ubiquitine?

Answer 26

Eiwitten die van structuur zijn veranderd, worden herkend door enzymen en gelabeld met ubiquitine. Deze worden herkend door proteasomen. Vervolgens wordt het eiwit van het klosje gehaald en gereduceerd tot aminozuren.

Question 27

Wat gebeurt er als eiwitvouwing fout gaat?

Answer 27

Chaperones (bij het ER) kunnen niet binden en er wordt ubiquitine gebonden. Er ontstaat een stressrespons.

Question 28

Wat gebeurt er als de proteasomen verkeerd gevouwen eiwitten niet kunnen afbreken?

Answer 28

De proteasomen worden aggresomen die zich ophopen in de cel.

Question 29

Kenmerken van cystische fibrose (CF)

Answer 29

Is een erfelijke aandoening (1:30 is drager), waarbij een kleine deletie heeft opgetreden in het DNA en het eiwit van dat gen niet goed gevouwen kan worden.

Question 30

Waarom is het essentieel dat de intracellulaire vesicles enzymen bevatten met een zuur pH-optimum?

Answer 30

omdat deze alleen actief zijn in het lysosoom.

Question 31

Hoe worden enzymen in de lysosomen vervoerd?

Answer 31

Ze worden vervoerd door het Golgi-systeem in vesicles. Die worden afgesneden uit het membraan van het Golgi-systeem en fuseren met het membraan van een lysosoom.

Question 32

Wat is fagocytose?

Answer 32

Een structuur uit extracellulaire ruimte (bijv. bacterie), wordt ingesloten door het plasmamembraan.

Question 33

Wat is endocytose?

Answer 33

stoffen uit de extraceullaire ruimte worden opgenomen.

Question 34

Hoe werkt endocytose?

Answer 34

receptoren binden in het celmembraan aan signaaleiwitten, zoals LDL. Het receptoreiwit gaat mee naar binnen, maar wordt later weer teruggeplaatst op het membraan.

Question 35

Wat gebeurt er zodra een early endosome gevormd wordt?

Answer 35

Deze fuseert met lysosoom, waar de afbraak van start gaat.

Question 36

Wat is autofagie?

Answer 36

er worden structuren van buiten de cel opgenomen, maar er worden intracellulaire structuren omsloten met een membraan.

Question 37

Wat vormt er bij autofagie? en wat gebeurd er vervolgens?

Answer 37

een autofagosoon, Deze wordt naar lysosomen vervoerd. Daar versnelt de autofagosoom met lysosoom en start de afbraak.

Question 38

Waarom worden bij de ziekte van Pompe, de cellen niet afgebroken?

Answer 38

er is bij de modificatie in het enzym dat glycogeen afbreekt een fout opgetreden. Het enzym wordt niet getransporteerd naar de lysosomen of komt daar wel maar is niet werkzaam.

Question 39

Wat is het gevolg van de ziekte van Pompe?

Answer 39

glycogeenstapeling in de lysosomen. Dit beschadigt spiercellen en dus wordt de hele spier aangedaan. De structuur van de hartspieren raakt verstoort.

Question 40

Wat is RME?

Answer 40

is een vorm van endocytose, waarbij een receptor aan het plasmamembraan bindt. Hierbij vindt een verandering van het membraan plaats, waardoor clathrine aan de receptoren kan binden.

Question 41

Stappenplan RME.

Answer 41

1. de receptoren hebben onderlinge affiniteit en klitten samen.
2. er wordt coated vesicle gevormd.
3. vervolgens laat het clatherine los.
4. Het vesicle met de receptoren komt terecht in een endosoom.
5. het endosoom splitst de receptoren en het opgenomen deeltje (receptoren weer uitgescheiden d.m.v. exocytose).
6. de stoffen komen na fusie van endosomaal en lysosomaal membraan in het lysosoom en worden daar afgebroken.