Virologie Flashcards
Quelles sont les caractéristiques générales des virus ?
- Pas organisation ¢
- Un seul type a. nucléique (ARN/ADN)
- Constitué coque protéique contenant matériel génétique
- Se reproduisent à int ¢ vivante en détournant métabolisme à son profit
- Provoque synthèse nouvelles particules virales capables transférer a. nucléique viral aux autres ¢
- Pas capable produire É et ses propres prots et pas capable se répliquer indépendamment
Quels sont les types de classification des virus ?
Par structure (taille, MORPHOLOGIE, TYPE GÉNOME)
Caractéristiques (structure, MODE RÉPLICATION)
Maladie
Moyens transmission
¢ hôtes
Tissu/organe
Qu’est-ce qu’un virion ?
Particule virale infectieuse (durant période réplication)
Qu’est-ce qu’un virus ?
Particule inerte ds environnement (durant période latence)
Quelle sont les principales familles de virus à ADN ?
ADN simple brin sans enveloppe : Parvoviridiæ
ADN double brin sans enveloppe : Adenoviridiæ et Papovaviridiæ
ADN double brin enveloppé : Poxviridiæ, Herpesviridiæ et Hepadnaviridiæ
Quelles sont les principales familles de virus à ARN ?
ARN simple brin à polarité + sans enveloppe : Picornaviridiæ et Caliciviridiæ
ARN simple brin à polarité + enveloppé : Togaviridiæ, Flaviviridiæ et Coronaviridiæ
ARN simple brin à polarité - enveloppé : Rhabdoviridiæ, Filoviridiæ, Paramyxoviridiæ et Deltaviridiæ
Multiples brins ARN brin négatif : Orthomyxoviridiæ, Bunyaviridiæ et Arenaviridiæ
Produits ADN : Retroviridiæ
ARN double brin sans enveloppe : Reoviridiæ
Qu’est-ce que le génome viral ?
- Jamais ADN et ARN en mm temps
- Matériel génétique peut être bicaténaire ou monocaténaire
- A. nucléique peut être linéaire, circulaire ou segmenté (juste ARN) et peut être sens positif (5’ –> 3’) ou négatif (3’ à 5’)
- Gènes codant pr synthèse E nécessaire pr cycle réplication et pr détourner métabolisme ¢ hôte
Qu’est-ce que la capside ?
- Coque protéique entourant acide nucléique (nucléocapside)
- Structure déterminée par a. nucléique viral
- Presque masse totale virus
- Chaque capside composée sous-unités protéines (capsomères)
- Arrangement structural capsomères détermine morphologie capside (caractéristique type virus)
- Forme hélicoïdale (bâtonnet), icosaèdre (presque sphérique) ou non symétrique (bactériophages)
Quelles sont les propriétés de la capside ?
Très résistante (T°, acides, protéases, détergent, séchage)
Permet propagation rapide et survie ds pls conditions
Qu’est-ce que l’enveloppe virale ?
- Capside parfois recouverte enveloppe membraneuse
- Généralement constituée lipides, protéines et glucides
- Parfois acquis lors relâchement ¢ hôte –> arrache portion membrane ¢
- Peut aussi être partie membrane nucléaire (formation enveloppe avant sortie ¢)
- Rôle lors pénétration virus ds ¢
- Contient protéines origine virale
Quelles sont les propriétés de l’enveloppe virale ?
Peu résistante (acide, détergents, séchage, chaleur)
Pas besoin tuer ¢ pr se propager
Entraîne hypersensibilité et inflammation (immunopathologie)
Qu’est-ce que le tégument ?
Espace entre nucléocapside et enveloppe contenant E, protéines et mm ARNm qui facilite infection virale
Qu’est-ce que les spicules ?
Aussi appelés protéines d’attachement virales (VAP)
Complexes protéines/glucides formant bosses à surface enveloppe permettant fixation/pénétration ¢ hôte (peuvent servir identifier certains virus car source majeur Ag)
Quelles sont les particularité du cycle de réplication des virus à ADN ?
- Réplication ADN ds noyau ¢ hôte en se servant E virales
- Synthèse capside et autres protéines virales ds cytoplasme en utilisant E ¢ hôte
- Synthèse procapside (vide) puis insertion génome
- Virus peu complexe détourne ADN poly ¢ mais si + complexe, vont coder pr propre poly (+ sujette à mutations)
- Mm si ¢ infectées produits qté astronomique particules virales, seulement petite partie = réellement infectieuse à cause mutations/erreurs lors processus réplication
Quelles sont les étapes de la réplication des virus à ADN ?
- Attachement par fixation spécifique virus sur ¢ hôte
- Pénétration virus ds ¢ et décapsidation
- Transport ADN ds noyau
- Biosynthèse (précoce et tardive)
- Migration protéines virales et procapside vers noyau pr joindre ADN synthétisé
- Assemblage nouveaux virus
- Transport nouveaux virus le long RE vers membrane plasmique
- Libération nouveaux virus par lyse ¢ (contre-productif), bourgeonnement ou exocytose (enveloppe formée avant sortie)
Qu’est-ce que la phase éclipse ?
Décapsidation virus aboli effets infectieux et la rend non identifiable (termine après assemblage virus)
Qu’est-ce que la phase latente ?
Période durant laquelle virus infectieux extra¢ n’est pas détecté (entre décapsidation et libération virus)
Quelles sont les particularités de l’étape de pénétration ?
- Interaction entre pls spicules et récepteurs ¢ initient internalisation virus (dépend structure virus et type ¢)
Virus sans enveloppe : par endocytose (invagination transportant virus + autres mol ds ¢) ou viropexie (structures hydrophobiques capsides exposées après adhésion et permet passage virus à travers membrane)
Virus enveloppés : par fusion membrane (fusion pH neutre) ou endocytose (pH non neutre et enveloppe détruite)
Quelles sont les particularités de l’étape de déshabillage?
Virus sans enveloppe : processus peut être initié dès attachement récepteurs par acidité environnement ou protéases contenues ds endosomes/lysosomes
Virus enveloppé : enveloppe retirée lors pénétration puis décapsidation ds site réplication génome (noyau/cytoplasme)
Quelles sont les sous-étapes de l’étape de biosynthèse ?
a) Transcription précoce (faite par ADN poly ds noyau) et trad ARNm et synthèse E requises pr réplication ADN viral et protéines se liant aux a. nucléiques (cytoplasme)
b) Réplication ADN viral (noyau) et prod protéines virales (cytoplasme)
c) Traduction tardive (noyau) et synthèse protéines structurales (cytoplasme)
Quelles sont les particularités de l’étape de biosynthèse ?
- Certains virus ADN sont autosuffisant pr initier réplication
Gènes immédiats : code pr protéines immédiates (protéines requises pr prendre contrôle)
Gènes précoces : code pr protéines non structurales (E requises pr réplication, protéines associées ADN)
Gènes tardifs : code pr protéines structurales (capside, spicules)
Comment se fait la synthèse de protéines virales ?
- Liaison ribosome et ARNm par tête 5’ ou loop spéciale ARN
- Traduction ARNm séparés pr protéines individuelles
- Monopolisation ribosomes pr aug qté ARNm viral traduit ce qui contribue à cytopathologie virus
- Parfois modifs post-traductionnelles sont nécessaires (phosphorylations pr activation/inactivation protéines)
Quelles sont les particularités de l’étape de l’assemblage des virions ?
- Débute qd qté suffisante protéines structurelles
- Virion comprend structures permettant faire liens nécessaires entre molécules pr permettre structure finale
- Mécanismes pr s’assurer que toutes parties sont là
Virus enveloppés : spicules emmenés à membrane ¢ et provoquent bourgeonnement
Comment le virus se propage-t-il ?
- Relâchement extra¢ (responsable nouvelles infections)
- Utilisation ponts entre ¢
- Fusion ¢ ensemble pr former ¢ géantes (syncytium)
- Transmission verticales lors division ¢ (rétrovirus)
Qu’est-ce que la période d’incubation ?
- Asymptomatique ou symptômes non spécifiques
- Infection virale contrôlée par protection hôte si ø symptômes
- Symptômes causés par dommages tissus et effets systémiques causés par virus et réponse SI
- Symptômes peuvent durer durant convalescence (temps que corps répare dommages)
Courte : premier site infection = tissu ciblé (symptômes caractéristiques maladie)
Longue : virus doit passer par autres sites et se répliquer avant atteindre tissu ciblé
Qu’est-ce que qui est particulier avec le moyen de réplication des virus à ARN avec transcription inverse ?
- Code pr sa propre poly (transcriptase inverse) car permet transformer ARN en ADN
- Pas moyen de répliquer ARN
Quelles sont les étapes de réplication des virus à ARN avec transcription inverse ?
- Attachement spicules aux récepteurs spécifiques hôte
- Pénétration par fusion membranes virales et ¢
- Décapsidation et libération 2 brins + ARN viral identiques et E virales ds cytoplasme
- Transcription ARN viral en ADN par transcription inverse et formation ADN bicaténaire + dégradation ARN origine
- Pénétration ADN viral ds noyau et intégration à chromosome ¢ hôte sous forme provirus (peut se répliquer indéfiniment avec ADN ¢ hôte sans former nouveaux virus) grâce à protéine intégrase
- Biosynthèse par transcription provirus menant à prod 2 types ARN (génome pr nouveaux virus et code pr synthèse protéique)
- Maturation
a) Synthèse protéines virales, capside, E et protéines enveloppe par protéases
b) Migration certaines protéines virales vers membrane plasmique hôte - Assemblage virions ds cytoplasme
- Libération virus par bourgeonnement (acquisition enveloppe avec spicules pr infecter ¢ adjacentes)
Quels sont les déterminants des maladies virales ?
- Résultat infections virales déterminés par nature interaction virus-hôte
- Réponse immunitaire = meilleure traitement mais peut contribuer pathogenèse virus
Nature maladie
- Organe cible
- Porte entrée virus
- Accès virus organe cible
- Tropisme organe virus (atteinte sélective certains tissus)
- Permissivité ¢ à réplication virale
- Activité pathogénique
Sévérité maladie
- Habileté cytopathologique virus
- Statut immun (naif ou immunité)
- Compétence SI
- Immunité primaire virus
- Taille virus inoculé
- Délai avant résolution infection
- État santé général
- Nutrition
- Autres maladies influençant statut immun
- Composition génétique
- Âge
Qu’est-ce que la pathogenèse virale ?
- Virus peut se répandre par sang (virémie) et système lymphatique
- Réplication virus ds macrophages, ¢ sanguins ou foie –> accélération infection
- Peuvent atteindre SNC par sang, méninges, LCR, neurones, migration macrophages infectés
- Destins possibles à infection virale –> échec infection, infection entraîne lyse ¢ (force corps à faire autres ¢ = risque mutation) ou infection persistante
Quels sont les déterminants de la pathogenèse ?
Interaction virus - organe cible
- Inhibition synthèse protéique/ADN
- Altération membrane
- Formation syncytium
- Destruction cytosquelette
Activité cytopathologique virus
- Toxicité protéines virales
Réponses protectives hôte
- Induction inflammation
- Immunosuppression
Qu’est-ce qu’un infection persistance et quels sont les types ?
Réplication sans mort ¢
Chronique : productive et non lytique
Latente : pas synthèse virus
Récurrente : période latente et ensuite prod virus
Transformante : immortalisation
Quels sont les types de ¢ pouvant être infectés ?
Non permissives : possèdent pas éléments essentiels à réplication virale (comme ¢ permanentes)
Semi-permissives : possèdent pas tout matériel nécessaire (réplication inefficace)
Permissives : possèdent tous éléments nécessaires pr réplication complète
Quels sont les deux types d’infections virales ?
Lytique
Non lytique
Qu’est-ce qu’une infection lytique ?
- Réplication virus tue ¢ cible
- Certains virus endommagent ¢ et prévient réparation en inhibant synthèse macromol ou produisant E dégradantes/toxiques
- Réplication virus et accumulation produits viraux peuvent endommager lysosomes = mort ¢
- Certaines infections peuvent déclencher apoptose (arrêt prod virale) –> virus codent parfois pr méthodes inhibant apoptose
- Certains virus peuvent induire fusion ¢ (syncytium fragile et susceptible lyse à cause endommagement lysosomes par accumulation produits viraux) pr aider propagation tout en échappant aux Ac
- Causer changements importants ds ¢ hôte (aberrations chromosomiques et dégradation)
- Corps inclusions ds noyau et cytoplasme = changement membrane ou chromosomes et peuvent indiquer sites réplications
Qu’est-ce qu’un infection lytique ?
Persistante : ¢ ø tuée par virus (libérée par exocytose ou bourgeonnement)
Latente : virus infection ¢ n’ayant pas matériel nécessaire à transcription gènes viraux mais certains stimuli peut activer et permettre réplication virale
Qu’est-ce qu’un virus oncogénique ?
- Certains virus à ADN et rétrovirus peuvent établir infections persistantes pouvant stimuler croissance incontrôlée ¢ causant transformation et immortalisation ¢
- Activation gènes stimulant croissance, suppresion inhibiteurs croissance (p53 et RB) et synthèse ADN, prévient apoptose
- Immortalisation ¢ semi-permissives
- Codent parfois pr protéines oncogènes