Virologie Flashcards
V/F Le virus est incapable de se répliquer sans une cellule hôte
V
Expliquer le lien avec la réplication du virus et son hôte
– Parasite intracellulaire obligatoire
– Utilise les constituants cellulaires pour se répliquer
– Possibilité d’introduire du matériel génétique viral dans les cellules et les transformer
La forme libre du virus s’appelle…
La forme libre du virus s’appelle virion ou particule virale
V/F Les virus peuvent infecter toutes formes de vie humaine ou animale seulement
F, les virus peuvent infecter toutes formes de vie
V/F les virus sont bcp plus petits que les bactéries et les cellules.
V, entre 40-400nm
Expliquer la nomeclature des virus et donner un exemple avec l’herpès labial (VHS-1)
Virus herpes humain 1
* Ordre: virales = Herpesvirales
* Famille: viridae = herpesviridae
* Sous-famille: virinae = alphaherpesvirinae
* Genre: virus = simplexvirus
Décrire la classification classique des virus
Basée sur des caractéristiques primaires et faciles à étudier:
– Le tropisme pour un organe ou un tissu (ex: virus de l’hépatite)
– Le vecteur (ex: virus transmis par les arthropodes ou arbovirus)
Décrire la classification moderne des virus
Selon:
– Le type d’acide nucléique
– La stratégie de réplication
– Type de capside
– Absence ou présence d’une enveloppe lipidique
Nommer les éléments de base de la structure virale
- capside
- enveloppe
- acide nucléique
Décrire la capside et ses rôles
- structure nucléique autour de l’acide nucléique = forme nucléocapside
- donne forme au virus
- Attribue le tropisme du virus pour la cellule
V/F pas tous les virus sont enveloppés
V
Décrire les enveloppes des virus
Constituée:
– D’éléments de la cellule hôte
– De protéines virales
V/F un virus nu est plus fragile qu’un virus enveloppé
F, virus enveloppés ne résistent pas beaucoup aux détergents et aux conditions extérieures
Nommer la façon la plus probable de contracter un virus enveloppé
préférentiellement transmis par contact direct et intime (ex: herpès ou VIH)
Nommer un exemple de virus nu
virus causant la diarrhée (norovirus (Norwalk), rotavirus)
V/F les acides nucléiques des virus peuvent être à la fois de l’ADN et de l’ARN
F, les virus contiennent soit de l’ADN ou de l’ARN (jamais les deux)
Décrire les acides nucléiques des virus
- code à 3, centaines de gènes selon virus
- ADN ou ARN
- mono ou bicaténaire
- ADN linéaire ou circulaire
- ARN peut être segmenté et polarité +/-
Décrire les 7 étapes du cycle viral
- Attachement (récepteurs spécifiques)
- Pénétration cellulaire
- Décapsidation (libération de l’acide nucléique)
- Réplication du génome viral
- Synthèse des protéines virales
- Assemblage et encapsidation des particules virales produites
- Libération des virions
Expliquer comment l’attachement du virus se fait sur la cellule hôte
liaison d’une protéine de surface virale à un récepteur spécifique de la cellule
Explique le tropisme viral
* H1N1 se lie à l’acide sialique des voies respiratoires
* VIH et le récepteur CD4 et CCR5 (co-récepteur)
* Parvovirus et l’antigène P des érythrocytes
Expliquer la pénétration et décapsidation des virus en distinguant le mécanisme pour les virus enveloppés vs nus.
- Virus enveloppés
– Fusion des membranes
– Endocytose - Virus non-enveloppés
– Mécanisme d’entrée peu connu, probablement par formation de pores
Décrire sommairement comment l’influenza, un virus enveloppé, pénètre la cellules et se décapside.
Acidification de l’endosome :
– Fusion des membranes et décapsidation nécessite un pH acide par la pompe M2 de l’influenza A
(Pompe M2 inhibée par l’amantadine)
Dans la réplication du génome viral, expliquer comment la transcription et la production de l’ARNm se fait pour un virus à ARN
- Virion contient une enzyme virale essentielle (ARN-dépendant-ARN-polymerase)
- Production du brin d’ARN complémentaire qui sert de gabarit pour la production du génome viral
Dans la réplication du génome viral, après l’étape transcription et la production de l’ARNm avec un virus à ARN, expliquer l’étape de traduction.
Traduction de l’ARNm en un long polypeptide
Dans la réplication du génome viral, expliquer comment la transcription et la production de l’ARNm se fait pour un virus à ADN
- Réplication dans le noyau (sauf les poxvirus)
- Utilisation des enzymes cellulaires pour la transcription
Quel virus à ADN ne traduit pas son génome viral dans le noyau de la cellule?
poxvirus
À quelle(s) étape(s) du cycle viral vient-on généralement introduire des antiviraux pour traiter les patients? donner des exemples
Réplication du génome viral (virus ARN) et Synthèse des protéines virales (virus ADN)
Ex: VIH et Hépatite C on fait des inhibiteurs à protéase qui clive la protéase (long polypeptide) viral
Dans le cycle viral d’un virus ADN, on peut intervenir a/n de la synthèse protéine virale pour contrôler la traduction virale. Expliquer la différence entre les ARNm précoce vs tardif.
» ARNm précoce: Code des protéines qui régularisent la réplication virale et la transcription de l’ADN viral
» Transcrit tardif: Code des protéines structurelles virales
Décrire l’étape d’assemblage et d’encapsidation dans le cycle virus
Généralement, inclusion virale (portion limitée de cell.)
- Permet d’obtenir une concentration très élevée localisée de protéines et acides nucléiques virales
- Protège les composantes virales du système immunitaire
Expliquer les différents mécanismes de libération des virions
– Mort cellulaire
– Bourgeonnement à partir de la membrane
– Exocytose
Pourquoi est-il important de connaître le cycle viral?
Permet de connaître les cibles thérapeutiques et développer des tx
Nommer des cibles thérapeutiques “spécifiques” pour les antiviraux.
– Polymérases
– Protéases
– Neuraminidase (influenza)
Nommer d’autres mécanismes des antiviraux qui ne ciblent pas une étape précise du cycle viral.
– Interféron-alpha, imiquimod: stimule le système immunitaire à éliminer l’infection
– Anticorps monoclonaux (SARS-Co-V2): interfère avec la signalisation/récepteurs nécessaires à la réplication virale/à l’inflammation associée
Définir la pathogénèse
Interaction entre le virus et l’hôte dans une série d’étapes pour conduire à la maladie
Le tropisme dépend de…
- Récepteur qui permet l’attachement
- Élément génétique qui favorise l’expression des gènes viraux qui peuvent être spécifiques à certains tissus
Nommer les facteur de l’hôte qui influence la pathogénèse
– Statut immunitaire: déficit congénital, VIH, traitements immunosuppresseurs…
– Femme enceinte et son fœtus
Décrire sommairement une pathogénèse virale
– Entrée
– Réplication locale
– Dissémination
– Tropisme tissulaire
– 2e réplication tissulaire
– Dommage cellulaire
– Réponse immunitaire
Nommer les méthodes de transmission d’un virus
- aérienne
- gouttelette
- fécale-orale
- percutanée
- muqueuse
- transplacentaire (verticale)
- arbovirus
Donner des exemple de virus transmis par voie aérienne
- Variole
- SARS-CoV-2
- Rougeole
Donner des exemple de virus transmis par gouttelette
- Influenza
- Coronavirus
- Variole simienne
Donner des exemple de virus transmis par voie fécale-orale
- Norovirus
- Rotavirus
Donner des exemple de virus transmis par voie percutanée
- VIH
- Hépatite B, C
Donner des exemple de virus transmis par contact de muqueuses
- VPH
- VIH
- variole simienne
Donner des exemple de virus transmis par voie transplacentaire
- Zika
- CMV
- rubéole
Nommer des arbovirus
- Dengue
- Zika
- Virus du Nil Occidental
V/F il est possible de garder des virus en culture dans des mileux artificiels
F
À quel moment est-il idéal de prélever un spécimen de virus pour détecter des virus au labo?
le plus tôt possible au début de la maladie
Nommer des milieux idéaux de conservation du spéciemen pour le transport vers le labo
- UTM (universal transport media)
- Hanks
- Eau moléculaire, saline en cas de pénurie (analyse par TAAN)
Nommer des méthodes d’études des virus
- microscope électronique
- détection antigénique
- culture cellulaire
- biologie moléculaire
- sérologie
Décrire les avantages et inconvénients de la miscroscopie électronique pour l’etude des virus
- cède place graduelle à bio moléculaire
- permet ID sommaire avec formes caractéristiques
- Technique de référence qui nécessite expertise
La détection antigénique est une technique immunologique qui utilise l’enzyme …
Enzyme immunoassay (EIA)
Pour quels virus peut-on utiliser la détection antigénique en clinique?
Virus respiratoires majoritairement:
– VRS
– Influenza
– Rotavirus
– Coronavirus
Décrire les avantages et inconvénients de la détection antigénique
- Avantages:
– Rapide et facile d’utilisation
– Peu coûteux - Désavantages: Moins sensible et spécifique
Qu’est-ce que l’immunofluorescence?
méthode de détection antigénique qui nécessite expertise supérieure à EIA
Expliquer sommairement comment la culture cellulaire permet d’ID des virus
Plusieurs lignées cellulaires
– Pas de lignée cellulaire universelle = Inoculation sur plusieurs types de cellules différentes
– Effets observés
* Tropisme cellulaire
* Vitesse de croissance
* Effet cytopathique caractéristique à un type de virus
– Identification finale par immunofluorescence
Pourquoi la culture cellulaire est proscrite?
- SARS-Co-V-2
- bcp de contamination
Nommer des techniques de biologie moléculaire pour analyser des spécimen de virus
– Techniques d’amplification d’acides nucléiques (TAAN) = PCR (polymerase chain reaction)
– Sondes, micropuces…
Nommer les avantages des techniques bio moléculaires
– Diagnostic viral plus rapide
– Méthodes spécifiques
– Multiplex : Possibilité de détecter plusieurs virus dans un même prélèvement et une même réaction
Quels sont les types de résultats que l’on peut avoir avoir la bio moléculaire?
- Quantitatif: lorsque la charge virale est requise pour le suivi du traitement
- Qualitatif
Expliquer le principe des test PCR
Utilisation des certaines enzymes, amorces spécifiques et de la T° pour amplification exponentielle du matériel générique