V.7 HT16 - Samling av alla föreläsningar Flashcards
Hur ser kollageners uppbyggnad ut?
28 olika proteiner, 45 subenheter/gener. Var tredje aminosyra är glycin. x,y - ofta prolin, Hydroxyprolin
Kollagenbiosyntes - hur går den till?
detsamma som för många proteiner. Men:
I ER sker modifiering. Det sätts på OH grupper. (viktigt för att hålla ihop kollagens tre kedjor.) Från –› Golgi –› ECM –› klyvs av propeptid. Leder till att kollagen kan gå ihop och bilda sin struktur. Cross linking - Fibril Assembly.
Prolin-hydroxylering
OH grupp sätts på Prolin. Viktiga ko-faktorer: O2, Fe2+, alfa-ketoglutarat, vitamin C (askorbinsyra)
4-hydroxyprolin är viktig för stabiliteten hos trippelhelix.
Prolin
Aminosyra. Viktig för stabiliteten hos kollagens trippelhelix. Dess sidokedja bildar en “cirkel” och “låser” - ger stabilitet.
Skörbjugg
Näringsbristssjukdom. Ger bl.a. svårläkta sår.
Beror bl.a. på att Vitamin C inte kan ingå i prolin-hydroxyleringen och därmed kan inte kollagenbildas.
Crosslinks - Crosslinking
kovalenta bindningar mellan kollagenmolekyler. Kan också ske inom kollagenmolekyler. Det stärker kollagen-fibriller. Gör kollagenfibrerna starka.
Kan också bidra till minskad elasticitet och sköra ben hos äldre.
Skillnaden Vätebindning - Crosslinks
Vätebindningen behövs för att skapa Kollagen i ER, för att binda ihop de tre subenheterna, bindningarna kan brytas, moduleras om etc.
Crosslinks är kovalenta bindningar för att stabilisera Kollagenfibrillerna.
Några viktiga kollagener
Kollagen I, Kollagen II, Kollagen III, Kollagen IV, Kollagen VII, Kollagen XVII
Kollagen I
Kroppens vanligaste protein; segt-tjockt. Mycket i starka vävnader. Bl.a. ben, senor Liknande struktur i Kollagen I , II, III
Kollagen III
Mer flexibla än kollagen I.
Bildar tunnare fibriller. Finns i bl.a. hud, kärl, lunga. Liknande struktur i Kollagen I , II, III
Kollagen II
Finns i brosk, ögats glaskropp. Liknande struktur i Kollagen I , II, III
Ben
“torka benet” - 70% kalciumfosfat 30% Organisk.
Av detta är: 2% celler, 98% ECM.
Av detta utgör Kollagen 1 : 90%, icke kollagen 10%.
Osteogenesis Imperfecta
Sjukdom. Beror på en mutation i kollagen 1. (finns olika varianter.) Denna mutation orsakar benskörhet, de går av lätt.
Senor
En ordnad kollagenstruktur. Mycket kollagen, ordnat och parallellt.
Brosk
Kollagen II, m.f. Finns på ytan av alla benändar. Funktionen är: Stötdämpning och att bilda en bra glidyta.
Kollagenfibrill
Kollagen II bildar tvärbundna heteropolymerer tillsammans med XI och IX. Två koll XI och två koll II “mikrofibriller” formar en kärna som omges av 10 “mikrofibriller”. Blå: koll II, gul: koll XI, röd: koll IX. De N-terminala domänerna av koll XI sträcker sig från de centrala “mikrofibrillerna” till ytan av fibrillen
Kollagen IV
“Basalmembran” - Basalmembran finns på följande ställen Epithelium, Endothelium, Muscle, Peripheral nervs, Fatcells.
Kollagen IV Struktur
Trippelhelix i centrala domänen. Har många avbrott i
Bildar ett flexibelt 2D-nätverk.
Laminin
Finns i basmembran, bildar ett nätverk,
“är ett cell adhesionprotein” Lamininer har 3 subenheter, alfa - 15 beta - 3 gamma - 3 . 15 varianter är kända.
Lamininer ser ut som “paraplyn” så cellytan, långa armar uppåt, korta armar ut (kan binda med andra)
cell adhesionprotein
proteiner som celler gillar att fästa till med receptorer.
Kollagen XVII
är ett membranprotein, receptor
Kollagen VII
är ett matrixprotein, båda ändarna av molekylen binder till basalmembranet, skapar “ordnar”. I dessa bågar kan fibrillära kollagen gå.
Epidermolysis bullosa
En sjukdom hudsjukdom. Kan bero på defekt kollagen VII. OCkså Defekt LN-332 , alltså en defekt laminin.
Muskel-dystrofi
förtvining av musklerna. Kan orsakas av en defekt LN alfa2-subenhet.
FN - Fibronektin
Ett viktigt celladhesion protein. Består av tre FN-I FN-II FN-III En repeterande enhet - kodas av en exon. Är en disulfid-dimär. Finns i löslig form i blodet. Och i ECM.
Universal Adhesion Motif - RGD
RGD - är en aminosyra motif som cller binder till.
Fibronektin - polymerisering
Regleras av celler. Sker på cellytor.
Kräver: integrin-bindning RhoA aktivitet vilket stimulerar myosin-dragning.
Då öppnas bindningsställen för andra fibronektin
Mikrofibriller
i EMC. Består av fibrillin-polymerer och associerade proteiner. Har en strukturell roll, skapar viss elasticitet. Reglerar TGF-beta BMP-7.
associerade proteiner kan bl.a. vara elastin + TGF-beta BMP-7
Elastin
Ger vävnader elasticitet. “fungerar som cross-linkade gummisnoddar” Kan dras ut till spänt, men sen krullar det sig tillbaks igen.
Elastin fibrer
Elastin polymeriserar till elastiska fibrer genom:
- bindning till mikrofibriller cross-linking (mha lysyl-oxidas)
Bildas embryonalt och tidigt ef. födsel.
Elastinsyntes finns vid skada.
Vart finns Elastin?
artärer (större), lunga, hud, ligament, elastiskt brosk.
Hur påverkas elastin när man blir äldre?
Elastin-fibrernas åldrande bidrar till:
lösare skinn, stelare kärl (höjt blodtryck), emfysem, svagare ligament.
Proteoglykaner
Undergrupp till glykoproteiner.
Proteiner med speciell typ av kolhydratkedjor kovalent kopplade till: serin.
Det som kopplas på är en s.k. GAG-kedja.
Aggrecan - HA i brosk
En proteoglykan. Binder vatten. Det är detta som skapar dämpning.
En ansamling
Aggrecan familjen
Aggrecan - brosk.
Versican - mångavävnader.
Neurocan - Hjärna.
Brevican - Hjärna.
Versican
proteoglykan. Finns i ex. huden, binder vatten precis som aggrecan, men inte lika mycket.
GAG
Glykosaminoglykan
Matrix-MetalloProteinaser (MMPs)
Det finns 24 st. I sin katalytiska yta har de ett 2+ Zink.
Tillsammans kan de bryta ner allt vi har i vårt ECM.
Reglering av Matrix-MetalloProteinaser (MMPs)
- biosyntes (gen-uttryck)
- proteolytisk aktivering
- lokalisation (var de finns, påverkar vad de bryter ned)
- inhibitorer (TIMP 1-4)
Cell junctions - definition
Anchoring junctions
Occluding junctions
Channel formin junctions
Signal relaying junctions
Anchoring junctions - definition
ett slags cellkoppling. Mekanisk koppling mellan celler och deras cellskelett till omkringliggande celler eller till EMC.
ex. Aktinfilament kopplingar:
cell-cell junctions, cell - matrix junctions ,
ex. Intermediärfilament kopplingar:
cell-cell (desmosom) , cell - matrix (hemidesmosomes)
Occluding junctions - definition
ett slags cellkoppling.
“Seals cells together that prevent even small molecules from leaking.”
ex. tight junctions (ryggradsdjur)
Channel forming junctions - definition
Mediates passage of chemical or electrical signals to adjacent cells.
ex. Gap junctions
Signal relaying junctions
neurala synapser