UA 5 Flashcards
Pourquoi on demande des analyses?
Contexte médical :
–Diagnostic :Confirmer ou exclure
–Pathologie = Évaluer le degré
–Thérapie= Monitoring (80% des demandes)
–Médecine préventive : Dépistage
Contexte d’une étude clinique :
–Criblage des sujets recrutés
–Protection des sujets inclus–Médicaments
*Efficacité
*Toxicité
*Innocuité
*Posologie
*Observance (compliance)
phase qu’il y a une source de variabilité dans les analyses
Aspect pré-analytique
*Aspect analytique
*Aspect post-analytique
Aspect pré-analytique
Classification des causes de la variabilité pré analytiquedes résultats d’analyses de laboratoire:
–Avant le prélèvement
–Pendant le prélèvement
–Après le prélèvement
Avant le prélèvement variabilité prévisible et imprévisible
- Variations prévisibles :
*Cycliques
*Ultradienne (sécrétion épisodique; < 20 heures)
*Circadienne (1 jour)
*Infradienne (> 3 jours)
*Circannuelle (1 an ±2 mois) - Variations imprévisibles (aléatoires) = aussi Biologique
*Intra-individuelle (à travers le même individu, on peut avoir un résultat différent selon le moment de la journée qu’on prend le résultat)
*Interindividuelle
Variabilité pré-analytique: Avant le prélèvement
*Variables reliées au patient
–Exercice
–Diète
–Stress
–Posture
–Etc.
Variabilité pré-analytique: Pendant le prélèvement
*Types d’échantillon
*Contenants et additifs
*Technique de prélèvement
Types d’échantillon: Sang
- sang total
- plasma
- sérum
Sang total
Présence d’un anticoagulant
plasma
–Sang total en présence d’un anticoagulant
- en urgence, on prend ça
- on va y retrouver toutes les protéines de la cascade de coagulation dans le plasma
–Centrifugation :
Fraction liquide (plasma)
*Fraction solide (cellules)
sérum
–Sang total que l’on fait coaguler
–CentrifugationFraction liquide (sérum)Sans les protéines de la coagulation
*Fraction solide (cellules et caillot)
- on retrouve pas les protéines de coagulation
- doit laisser 30 minutes pour que la coagulation se passe
autres éléments que le sang qu’on peut analyser
*Urine
*Autres liquides
–Céphalorachidien (LCR)
–Pleural
–Synovial
–Péricardique
–Ascite
–Etc.
*Autres matrices
–Selles
–Expectorations
qu’est-ce qu’on peut mettre dans un échantillon
- anticoagulant
- préservatifs
- additifs
anticoagulants exemple
–EDTA di-ou tri-potassique (acide éthylènediaminetétraacétique)
–Héparine de lithium
–Citrate de sodium
préservatifs exemples
–Fluorure de sodium (inhibiteur de la glycolyse) ( utilisé lorsqu’on fait un test de glucose et qu’on ne le fait pas analyser tout de suite)
–HCl6 N (acide chlorhydrique est un préservatif pour certaines analyses urinaires)
–Etc.
additifs
–Gel séparateur
–Activateur de la coagulation
–Etc.
technique de prélèvement sanguin
- mettre des gants
- choisir une veine de gros calibre
- appliquer le garrot pour faire gonfler la veine en le serrant modérément : si ne fonctionne pas, serrer le poing)
- désinfecter l’endroit de la ponction veineuse
- tenir l’aiguille avec un angle de 30˚ et piquer à 1 cm au dessous de la saillie veineuse
- desserrer le garrot
- remplir les tubes adéquatement
- assurer la bonne identification du tube immédiatement
hémolyse effet
fausse hyperkalémie et fausse hypocalcémie
on retrouve dans les rapports de laboratoire le niveau d’hémolyse qu’il y avait dans le prélèvement
Variabilité pré-analytique: Après le prélèvement
*Transport
*Prétraitement
*Entreposage
transport prélèvement
*Délais
–Commissionnaire
–Service de courrier
–Système de capsules envoyées
par pneumatique
*Température
–Glacière
–Ambiante (« chaud »)
–Réfrigérée (« froid »)
pO2 transport
diminue car O2 est consommé par les cellules sanguines
PCO2 transport
augmente car les cellules sanguines produisent du dioxyde de carbone
pH transport
diminue à cause du changement de pCO2 et glycolyse
cCa2+ transport
augmente parce que le changement du pH influence les liaisons entre les ions Ca2+ et les protéines
cglucose transport
diminue car glucose est métabolisé
cLactate transport
augmente à cause de la glycolyse
prétraitement des échantillons
*Centrifugation
–Vitesse (force) et température
*Prétraitement
–Séparation
–Aliquote
–Extraction
–Précipitation
aliquote
sépare le volume initial en plus petit
entreposage échantillon
*Court terme
= Température ambiante =20-24°C
*Moyen terme = Réfrigération = 2-8°C
*Long terme= Congélation = -20°C, -30°C, -80°C
erreur analytique
*Pour chaque mesure, même si elle est soigneusement faite, il y a une erreur associée inhérente avec la mesure–Personne ne peut toujours exactement mesurer la valeur vraie d’une quantité
*L’importance de l’erreur est due
–À la précision de l’appareil de mesure
–Au calibrage approprié du dispositif
*C’est différent d’une erreur ou d’une faute «brute» = non-respect des étapes d’une procédure
–Une faute brute est due à une application inexacte de l’appareil de mesure, telle que mal interpréterla mesure
–Les pratiques soigneuses exercées au laboratoire devraient éliminer la plupart des fautes
Exactitude
*L’exactitude d’une expérience est une mesure de la façon dont étroitement les résultats expérimentaux sont conformes à une valeur vraie ou admise
Inexactitude (biais):
–Différence entre la valeur obtenue et la valeur vraie(+ ou -)
–Exprimée en unité absolue ou en pourcentage
Précision
*La précision d’une expérience est une mesure de la fiabilité de l’expérience, ou comment l’expérience est reproductible
*Imprécision–Écart-type ou coefficient de variation calculé à partir des résultats obtenus
–Écart-type conserve les unités
–CV exprimé en %
Erreur Analytique =
Inexactitude + Imprécision
Interférences analytiques
*In vivo
–Interférence par une substance ou un facteur pré-analytique qui modifie la concentration in vivo de l’analyte
*In vitro
–Interférence par une substance qui perturbe la méthode analytique et qui donne un faux résultat
Interférences in vivo
–Tabagisme
*Le tabagisme augmente le taux de la carboxyhémoglobine (HbCO)
–Médicaments
*La prise d’acétaminophèneaugmente les niveaux de l’enzyme aspartateaminotransférase(AST)
–Drogues
*L’alcoolisme augmente les niveaux de l’alanine aminotransférase(ALT) et de l’AST
–Diète
*Repas entraîne l’augmentation du glucose et des triglycérides
*Aliments riches en sérotonine (banane, avocat, chocolat, etc.) entraînent une augmentation du 5-HIAA urinaire
–Menstruations
–Diminution de l’hémoglobine et du fer sérique
–Hémolyse
–Hémolyse intravasculaire cause l’augmentation du potassium
–Etc.
Interférences in vitro
- Spectrophotométriques (aspects)
*Hémolyse
*Ictère
*Lipémie - Chimiques
- Immunologiques
*Interférences des immunoessais
*Anticorps hétérophiles et HAMA (humananti-mouseantibodies) - Chromatographiques
*Co-migration (impossible de séparer la substance interférente)
Comment établir des valeurs de référence?
- hard way
- soft way
- no way
hard way
- meilleure façon entre hard way et soft way
- *Sélection a priori d’individus sains selon des critères d’inclusion et d’exclusion
*Détermine la concentration de l’analyte chez les individus sélectionnés (population normale)
*Valeurs de référence = Moyenne ±2 écart-types (si la distribution est normale) - prend 120 personnes par catégorie
soft way
*Utiliser les résultats des patients déjà emmagasinés dans les bases de données du laboratoire (LIS) pour établir les valeurs de référence
*Supposition : Très peu de résultats sont anormaux même chez les malades
*Supposition : Le nombre de malades est faible en comparaison du nombre de sujets sains (poids relatif des résultats anormaux est très faible)
no way
*Seuil consensus
*Pas de valeurs de référence = Absence = 0
–Xénobiotiques
- tout le monde utilise la même valeur
Comment déterminer qu’une analyse est utile pour le diagnostic?
*Réponse: en étudiant ses caractéristiques!
*Les caractéristiques d’une analyse sont de deux ordres
1.Caractéristiques relevant exclusivement du test lui-même (caractéristiques intrinsèques)
*La Sensibilité(Se) et la Spécificité(Sp) sont des exemples d’indices qui dépendent des caractéristiques intrinsèques
2.Caractéristiques relevant du test lui-même etde la population à qui il est appliqué (prévalence de la maladie dans la population considérée)
*La Valeur prédictivepositive(VPP) et la Valeur prédictive négative(VPN) sont des exemples d’indices qui dépendent aussi de la population étudiée
sensibilité (Se)
la proportion de vrais positifs chez les malades
Se = VP/(VP+FN)
spécificité (Sp)
la proportion de vrais négatifs chez les non malades
Sp = VN/(VN+FP)
La valeur prédictive positive (VPP):
La probabilité que le sujet soit réellement malade sachant que son test est positif
VPP = VP/(VP + FP)
La valeur prédictive négative (VPN)
La probabilité que le sujet soit réellement indemne si son test est négatif
VPN = VN/ (VN+FN)
Rapport de vraisemblance
*Différents indices associant Se et Sp ont été proposés pour faciliter le calcul de la probabilité post test de maladie
*Le rapport de vraisemblance ou «likelihood ratio»
*Le rapport de la probabilité d’être malade sur la probabilité de ne pas l’être une fois que je connais le résultat du test
*Le rapport varie selon que le résultat du test diagnostique est positif ou négatif
*Rapport de vraisemblance positif
*Rapport de vraisemblance négatif
Rapport de vraisemblance positif (L+)
- Selon que le résultat du test diagnostique est positif
- L+ = Se / (1 – Sp)
- Idéalement L+ = infini
- Quand le test n’apporte aucune information; L+ = 1
- Plus le rapport de vraisemblance d’un test positif est élevé, plus il nous permet de
confirmer la maladie
Rapport de vraisemblance négatif (L-)
- Selon que le résultat du test diagnostique est négatif
*L- = (1 - Se) / Sp
*Idéalement L- = 0
*Quand le test n’apporte aucune information; L- = 1
*Plus le rapport de vraisemblance d’un test négatif est petit, plus il nous permet d’exclure la maladie
Odds ratio (OR)
- Synonymes:
- Rapport des cotes, rapport des chances ou risque
relatif rapproché - Si la probabilité qu’un évènement arrive dans le
groupe A est p, et q dans le groupe B, le
rapport des cotes est : voir diapo 76 UA 5
Si OR proche ou égal à 1
la maladie est indépendantedu groupe
Si OR supérieur à 1
la maladie est plus fréquente dans le groupe Aque dans le groupe B
Si OR bien supérieur à 1
la maladie est beaucoup plus fréquente dans le groupe Aque dans le groupe B
Si OR inférieur à 1
la maladie est moins fréquente dans le groupe A que dans le groupe B
Si OR proche de 0
la maladie est beaucoup moins fréquente dans le groupe A que dans le groupe B
Quelle analyse diagnostique choisir?
*Pour le dépistage,
*On recherche une analyse avec une haute sensibilité (Se)
*Pour confirmer un diagnostic,
*On recherche une analyse avec une grande spécificité (Sp)
Comment construire une courbe ROC
1.On fixe une valeur seuil (Fig. I)
2.On calcule la Seet Sp
3.On place le point sur la courbe ROC
4.On répète à partir d’une autre valeur seuil (Fig. II
1.Valeur seuil très élevée = tous les individus sont sains; Sp= 100%
2.Diminution du seuil = diminution de la Spet augmentation de la Se
3.Diminution du seuil = diminution de la Spet augmentation de la Se
4.Diminution du seuil = diminution de la Spet augmentation de la Se
5.Valeur seuil très basse = tous les individus sont malades; Se = 100%
6.Test parfait = Se = Sp= 100%
Aire sous la courbe ROC (AUROC)
*Permet d’évaluer l’intérêt diagnostique d’un test
*Test est informatif ou non
*Permet de comparer les performances diagnostiques de plusieurs tests biologiques
Comment déterminer si une différence significative (cliniquement) existe entre 2 résultats consécutifs?
1.Jugement et expérience des professionnels
2.RCV = « Reference Change Value »
3.SCL = « SignificantChange Limit»
RCV = Reference Change Value
RCV (%) = 2,77.√(CVa2+ CVb2)
CVa= Coefficient de Variation analytique
CVb= Coefficient de Variation biologique intra individuelle
*Consulter les tables de la variation biologique
SCL = Significant Change Limit
SCL = 2.ETdiff = 2,8.ETu ≈3.ETuSCL= 3.ETu
*ETdiff= Écart-type théorique de la différence
*ETdiff=√2.ETu2= 1,4.ETu
*ETu= ETanalytique usuel des 3-6 derniers mois
Un patient a effectué par erreur deux test de thyreostimuline (TSH) deux semaines de suite et a obtenu des valeurs de 1,4 mUI/L et de 2,6 mUI/L. Pourtant, il n’y a eu aucune modification à son état de santé et il ne prend aucune substance pouvant influencer le résultat.
Nommez 4 facteurs pouvant expliquer cette variation.
Plusieurs réponses possibles :
- Variation cyclique
- Variation biologique
- Contenant
- Technique de prélèvement
- Transport de l’échantillon
- Prétraitement
- Entreposage de l’échantillon
- Variabilité du test en soi (exactitude et précision)
Quelle est la différence entre un plasma et un sérum?
le sérum ne contient pas de protéines de coagulation
Veuillez définir les termes suivants : exactitude, valeur prédictive négative et sensibilité.
Exactitude : Décrit la différence entre la valeur obtenue et la valeur réelle.
Valeur prédictive négative : Probabilité qu’un sujet ayant un test négatif soit réellement non atteint de la maladie.
Sensibilité : Probabilité qu’un test soit positif chez un patient atteint de la maladie.
Dans un échantillon de sang, la valeur de glucose diminue ou augmente avec le temps? Pourquoi?
Il est attendu que la valeur de glucose diminue avec le temps puisque les cellules vivantes dans l’échantillon vont utiliser et métaboliser le glucose.
Plus un test de vraisemblance négatif est petit, plus il permet de confirmer la _____________ (absence/présence) de la maladie.
absence
Lequel ou lesquels des énoncés suivants sont vrais?
1- Sur une courbe ROC, l’ordonnée (axe vertical) correspond à la fraction des vrais négatifs et l’abscisse (axe horizontal) représente la fraction des faux positifs.
2- Pour le dépistage, une méthode à haute spécificité sera priviligiée.
3- Quand le test n’apporte aucune information, le rapport de vraisemblance positif est égal à 0.
a. 1 et 2
b. 1 et 3
c. 3
d. Tous les énoncés
e. Aucun énoncé
aucun
Lequel ou lesquels des énoncés suivants sont vrais ?
1- Sur une courbe ROC, la ligne diagonale représente un test d’apport important.
2- La méthode du Reference Change Value (RCV) dépend seulement du coefficient de variation analytique.
3- La méthode du Significant Change Limit (SCL) dépend de l’écart type analytique usuel des 3 à 6 derniers mois et de la variation biologique.
a. 1 et 2
b. 1 et 3
c. 3
d. Tous les énoncés
e. Aucun énoncé
aucun
qu’est-ce qu’on trouve sur l’axe vertical d’une courbe roc
sensibilité = VP
qu’est-ce qu’on trouve sur l’axe horizontal d’une courbe roc
1- spécificité = FP
Ultradienne
sécrétion épisodique; < 20 heures
Circadienne
1 jour
Infradienne
(> 3 jours)
Circannuelle
1 an ±2 mois
