Traduction Flashcards
Que signifie synthèse des prot ?
Étape ultime expression d’un gène codant
Chaînes polypeptidiques polymérisées dans quel sens ?
NH2 -> COOH
Acteurs de la traduction ?
(Conservés + identiques)
- ribosomes : ne corrige pas ses erreurs
- ARNm
- ARNt
- autres prot
ARNt?
-forme de L à l’envers
-tige acceptrice d’AA en 3’
-traducteurs : AN -> AA
-tous identiques sauf sur qq séquences
-ils portent : •l’anti-codon
• l’AA correspond au codon qui sera reconnu par l’anti-codon
-nombreux nt atypiques résultant de modifs post-transcriptionnelles
-structure secondaire : en feuille de trèfle
-associés au même AA : iso-accepteurs
- se termine tjrs par «CCA» en 3’
Code génétique ?
- universel ( 20 AA pour 61 codons + codons STOP)
- dégénéré/redondant : différents codons codent pour le même AA
- NON ambigu : 1 codon code tjrs pour le même AA
- NON chevauchant : 1 base est lue 1 seule fois et appartient à 1 seul codon
Wobble ?
-Flottement possible entre 3e base codon et 1ère base anti-codon
But : réduire nombre ARNt nécessaires à traduction à moins de 40 aminoacyl-ARNt différents
1 codon -> ? 2 codons -> ? 3 codons -> ? 4 codons -> ? 5 codons -> ? 6 codons -> ?
1 ARNt 1 ARNt 1 ARNt 2 ARNt 2 ARNt 3 ARNt
ATTENTION : bien regarder les différents endroits du code génétique où peut apparaître le même AA
aminoacyl-ARNt ?
- enzymes aminoacyl-ARNt synthétases catalysent estérification = aminoacylation
- 1 aminoacyl-ARNt par AA
- couplage AA/ARNt = endergonique (besoin d’énergie, ATP)
- enzymes possèdent 2 spé essentielles : 1 pour AA et 1 pour ARNt correspondant
- peut corriger ses erreurs
2 AA non classiques ?
1) Sélénocystéine
- > STOP : UGA
- > pas d’état libre
- > anti-codon : UCA
2) Pyrrolysine
- > STOP : UAG
- > que chez certains procaryotes
ribosome ?
- ribonucléoprotéine présente dans toutes les ç
- ARNr + prot ribosomiques
- 2 sous-unités : 1 petite S et 1 grande L
1) chez procaryote
- >mesure 70 S
- > grande sous-unité = 50S (36 prot)
- > petite sous-unité = 30S (20 prot)
2) chez eucaryote
- > mesure 80 S
- > grande sous-unité = 60 S(49 prot)
- > petite sous-unité = 40 S(30 prot)
ARNm ?
1) chez procaryote
- > polycistronique = différents cadres de lecture = synthèse de différents polypeptides
- > extrémité 5’ reconnait séquence “RBS” : 8-10 nt en amont du codon d’initiation
- > bactérie (1% cas) : codon initiation GUG
2) chez eucaryote
- > TJRS monocystronique
- >ARNm mature = 1 seul cadre de lecture ouvert =ORF
- > 1 seule séquence codante CDS
Séquence de Kozak ?
- conservée
- permet aux ribosomes de distinguer les codons AUG d’initiation de tout autre codon AUG codant pour 1 Met
- fin 5’UTR/début initiation (contient site +1)
Initiation chez procaryote ?
-> 1er AA : N-Formyl-méthionine(F-Met) = généralement éliminé à la fin de la synthèse polypeptidique
1- IF3 se fixe sur petite s.u du ribosome et empêche de se combiner à grande s.u
IF1 se fixe sur site A : positionne correctement aminoacyl-ARNt d’initiation au nv site P
2-IF2 reconnait F-Met d’initiation
3-IF3 et IF1 se dissocient= recrutement grande s.u
GTP -> GDP + Pi = libération de IF2
Initiation chez eucaryote ?
-> reconnaissance codon initiateur AUG par ribosome portant aminoacyl-ARNt initiateur
1-complexe ternaire (eIF2 + Met) + petite s.u ribosome + eIF5/eIF3/eIF1A =complexe pré-initiation 42 S
2- complexe pré-initiation + ARNm + eIF4(se fixe sur coiffe) = complexe 48 S
3-positionnement complexe sur codon AUG initiateur
4-action hélicase, dissociation complexe initiation sauf eIF4, arrivée grande s.u = complexe 80 S
-> Poly A =très forte affinité pour eIF4 qui lui même interagit avec eIF4E = circulation ARNm
Elongation chez procaryote ?
- > synthèse prot par ajout d’AA à C-ter de la chaîne polypeptidique naissante
- > lecture ARNm par ribosome 5’ -> 3’
- > formation liaison peptidique (amide)
- > facteurs d’élongation : EFTU (lie site P) + EFTS + EFG
Terminaison chez procaryote ?
-> quand ribosome arrive au nv d’1 codon STOP dans site A = fin traduction
- RF1 : reconnait UAG et UAA
- RF2 : reconnait UGA et UAA
- RF3
Terminaison chez eucaryote ?
- > codon STOP apparait :
- eRF1 assure reconnaissance codon STOP + hydrolyse liaison entre prot synthétisée et ARNt présent sur site P
- eRF3 apporte GTP
chaque acteur repart dans 1 cycle de traduction tant que ARNm n’est pas détruit
polysome ?
- > différents ribosomes travaillent à la suite sur même ARNm circularisé = amplification synthèse
- > visible en ME
adressage et maturation chez eucaryote ?
-> prot devant atteindre même compartiment possèdent même séquence de 10 à 30 AA dans partie N-ter (cette séquence n’est pas présente dans la prot finale)
= séquence de signal d’adressage
Exemples de modifs co et post-traductionnelles d’1 prot dans le RE ?
- > glycosylation : addition covalente de résidus glucidiques sur chaîne peptidique
- > ponts dissulfures : stabilisent structures tertiaires et quaternaires des prot par prot dissulfure isomérase
- > repliement correct et assemblage sous-unités par prot chaperonnes du RE
