La Transcription Flashcards

1
Q

Déf ADN ?

A

Support de l’information génétique

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Q

Déf génome ?

A

Ensemble d’ADN

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3
Q

Déf génotype ?

A

Somme des gènes portés par le génome

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4
Q

Déf phénotype ?

A

Somme des caractères morpho, physio, comportementaux visibles
Reflet du génotype mais dépend de l’expression sélective de certains gènes et pas d’autres

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5
Q

De quoi dépend la diversité des organismes vivants ?

A

Des protéines synthétisées

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6
Q

2 cellules ayant le même génotype peuvent ?

A

Présenyer des phénotypes différents

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7
Q

Pourcentage gènes impliqués dans fonction de maintenance/réplication/expression génome ?

A

20%

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8
Q

Pourcentage protéines impliquées dans signalisation ç et dans trasduction du signal ?

A

20%

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9
Q

Pourcentage des gènes impliqués dans activités bioch, enzymo, métaboliques ?

A

20%

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10
Q

Pourcentage gènes codent pour protéines / activités variées ?

A

40%

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11
Q

Déf transcription ?

A

Production d’ARN à partir d’ADN (1ere étape expression du génome)

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12
Q

À quoi aboutit ARN ?

A

À 1 copie d’ARN simple brin, identique en séquence à l’un des brins d’ADN et complémentaire à l’autre brin

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13
Q

Quels gènes sont transcrits et traduits ?

A

Gènes codants pour protéine

Séquences codantes de l’ADN

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14
Q

Quels gènes sont concernés par la transcription ?

A

La totalité du génome

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15
Q

Comment est l’ADN chez procaryotes ?

A

Majoritairement codant

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16
Q

Lecture d’un gène chez procaryotes

A

Non interrompue par séquences non-codantes

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17
Q

Comment est l’ADN chez eucaryotes ?

A

Majoritairement non codant

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18
Q

Comment est la séquence codante d’un gène chez eucaryotes ?

A

Souvent interrompue par séquences non codantes qui seront transcrites mais pas traduites = introns

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19
Q

Transcription chez l’Homme ?

A

Génome humain transcrit à 45%

2% sera traduit

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20
Q

(Eucaryotes supérieurs)

ADN hautement répété ?

A

10-15% du génome
Non codant
Séquences hétérochromatiques autour centromères
Motifs courts en tandem ou motifs plus longs (100-200 pb)

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21
Q

(Eucaryotes supérieurs)

ADN moyennement répété ?

A

30-40% génome
Majoritairement non codant
Dispersé

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22
Q

(Eucaryotes supérieurs)

ADN non répété ?

A
Gènes qui codent pour protéines
Plusieurs copies (anciennes duplications)
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23
Q

Plus il y a de répétitions, plus l’organisme est ?

A

Complexe

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24
Q

Différence ADN/ARN ?

A

Sucre = ribose

Thymine -> uracile

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25
Forme ARN ?
Molécule monocaténaire Repliement (tige/boucle + épingle à cheveux) et formations de structures secondaires stables par auto-complémentarité intra-brin (GC=3LH / UA= 2LH)
26
ARN m ?
ARN messagers 2% total Se forme au fur et à mesure du déplacement polymérase sur brin ADN matrice
27
ARN r ?
ARN ribosomiques | 80% total
28
ARN t ?
ARN transfert | 15% total
29
ARNsn ?
Petits ARN nucléaires | Surtout eucaryotes
30
ARNsno ?
Petits ARN nucléolaires (nucléole) | Surtout eucaryotes
31
ARNsi ?
Petits ARN interférents de la traduction | Surtout eucaryotes
32
ARNmi ?
MicroARN | Surtout eucaryotes
33
Transcription requiert ?
- matrice d’ADN (qui sera transcrite en ARN) - ARN polymérase = ARN polymérase ADN dépendante - ribonucléotides triphosphates (NTP)
34
Rôle ARN polymérase ?
enzyme qui polymérise le brin d'ARN catalyse formation liaison Pdiester entre 3'OH libre du ribose du dernier nucléotide et phosphate α lié au C5' du nouveau NTP = libération PPi
35
Caractéristiques ARN polymérase ?
- besoin d'1 matrice - pas besoin d'amorce - polymérisation 5' -> 3' - utilise NTP / rNTP - pas d'activité exonucléase - moins fidèle qu'ADN pol (1 erreur toutes les 10^4 bases ajoutées) - élongation 5' -> 3'
36
Brin transcrit ?
Brin matrice / modèle / moins / anti-sens | Brin lu qui est complémentaire au brin d'ARN
37
Brin codant ?
Brin plus / sens | Brin ayant la même séquence que le brin d'ARN
38
ARN pol chez procaryotes ?
1 seule ARN polymérase | mais qui existe sous 2 formes chez E.Coli
39
ARN pol procaryote de forme "core enzyme" ?
retrouvée chez E.Coli 4 sous unités : α2ββ' - 2 α = détermine quel brin doit être transcrit - 1 β = polymérisation - 1 β' = liaison à l'ADN + ouverture de la double hélice
40
ARN pol procaryote de forme "holoenzyme" ?
retrouvée chez E.Coli | enzyme core + 5e sous-unité σ = pdt initiation de la transcription, reconnaît promoteur
41
Déf unité de transcription ?
séquence d'ADN dirigeant la production d'un transcrit | promoteur + signal de terminaison
42
Promoteur procaryote ?
En amont : promoteur sur brin codant de l'ADN - 35 = TTGACA - 10 =TATAAT= Boîte de Pribnow
43
Déf initiation ?
reconnaissance et fixation de l'ARN polymérase sur le promoteur
44
Étapes de l'initiation chez procaryote ?
1 : holoenzyme migre sur double brin d'ADN (interaction électrostatique = fixation non spécifique) 2 : facteur σ reconnaît promoteur (affinité très forte holoenzyme-promoteur) > complexe fermé ADN-ARN pol > enzyme englobe l'ADN de -40 à +20 >brins codant et matrice + site +1 déterminés 3 : ARN pol provoque fusion double hélice = rupture LH sur 12 pb = complexe ouvert
45
Déf Site +1 ?
Premier nucléotide à transcrire
46
(Transcription procaryote) | Avenir du facteur σ une fois le promoteur reconnu ?
au bout d'environ 10 nt transcrits, σ est phosphorylée > dissociation > forme Core enzyme
47
(Transcription procaryote) | Régulation de la transcription ?
transcription de chaque gène est régulée de façon à apporter à la ç les prots en quantité nécessaire
48
(Transcription procaryote) | Que permet utilisation de facteurs σ ≠ ?
reconnaissance de ≠ promoteurs | ç peut s'adapter à un signal environnemental particulier
49
(Transcription procaryote) | Comment peut varier l'affinité du facteur σ pour le promoteur ?
nbreuses prots se lient aux promoteurs de façon à permettre l'activation ou la répression de la transcription (spécifique de certains gènes)
50
(Transcription procaryote) | Déf boucle ou bulle de transcription ?
- Pendant l'élongation - Région où les 2 brins de l'ADN sont séparés et où le brin d'ADN modèle (ADN matrice) est apparié à la portion d'ARN en cours de synthèse - 12 à 17 pb chez E.coli - ARN pol déroule ADN devant elle et le ré-enroule derrière - provoque surenroulement positifs devant elle et négatifs en amont
51
(Transcription procaryote) | Quels sont les systèmes de terminaison ?
Rho indépendante 50% Rho dépendante 50% Un gène donné ne peut en posséder qu'un
52
(Transcription procaryote) | Comment repérer une terminaison "Rho indépendante"?
- séquence répétée inversée autocomplémentaire (induit repliement en tige) - séquence de 6 A
53
Déf protéine hexamèrique Rho ?
hélicase ARN/ADN, ATP dépendante
54
(Transcription procaryote) | Terminaison Rho dépendante ?
courte séquence riche en pb G-C + plus U (épingle à cheveux) > stoppe progression ARN pol Rho se fixe sur ARN (région d'environ 70 pb riche en C et pauvre en G = "Rho utilisation site" avant séquence "terminateur") et permet la dissociation du complexe d'élongation
55
Passage transcription/Traduction chez procaryotes ?
transcription non compartimentée dans un noyau transcription couplée à la traduction couplage possible car ARNm eucaryotes ne possèdent pas d'introns et sont donc directement traductibles en polypeptides
56
Passage transcription/Traduction chez eucaryotes ?
les ARNm doivent d'abord être entièrement exportés du noyau vers le cytoplasme avant d'être traduits
57
Expression des gènes chez procaryotes ?
Pls gènes peuvent être transcrits à partir d'un promoteur > ARN polycistronique (ou monocistronique) > obtention protéines ≠ à partir d'une même transcription initiale
58
Expression des gènes chez eucaryotes ?
monocistronique
59
Quels sont les 4 types d'ARN pol chez eucaryotes ?
ARNpol I, pol II, pol III et mitochondriale/chloroplastique
60
(Transcription eucaryote) | Que transcrit ARN pol I ?
transcrit gènes de classe I : | ARN r 5,8S ; 18S et 28S à partir d'un pré-ARN r 45S
61
(Transcription eucaryote) | Que transcrit ARN pol II ?
transcrit gènes de classe II : | synthétise ensemble des ARNm (= qui codent pour des prots) + petits ARN comme ARNsno
62
(Transcription eucaryote) | Que transcrit ARN pol III ?
transcrit gènes de classe III : | ARN r 5S et ARNt + petits ARN comme ARNsno et ARNsn
63
(Transcription eucaryote) | Que transcrit ARN mitochondriale/ chloroplastique ?
avec des mécanismes proches de ceux observés chez les procaryotes
64
(Transcription eucaryote) | Acteurs transcription des gènes de classe II / pré-ARN messagers ?
``` ARN pol II brin d'ADN matrice promoteur et gène eucaryote protéines partenaires (facteurs de transcription) NTP ```
65
(Transcription eucaryote) | Déf ARNpol II ?
énorme complexe protéique de 550 kDa constitués de 12 sous-unités
66
Contrairement aux procaryotes, les ARN pol chez les eucaryotes sont...?
- incapables d'initier à elles seules la transcription - ont besoin de facteurs TRANS / facteurs de transcription qui reconnaissent séquences de l'ADN matrice appelées "CIS régulatrices"