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Paces quad 1 > La Transcription > Flashcards

La Transcription Flashcards

1
Q

Déf ADN ?

A

Support de l’information génétique

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Q

Déf génome ?

A

Ensemble d’ADN

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Q

Déf génotype ?

A

Somme des gènes portés par le génome

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4
Q

Déf phénotype ?

A

Somme des caractères morpho, physio, comportementaux visibles
Reflet du génotype mais dépend de l’expression sélective de certains gènes et pas d’autres

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5
Q

De quoi dépend la diversité des organismes vivants ?

A

Des protéines synthétisées

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6
Q

2 cellules ayant le même génotype peuvent ?

A

Présenyer des phénotypes différents

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7
Q

Pourcentage gènes impliqués dans fonction de maintenance/réplication/expression génome ?

A

20%

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8
Q

Pourcentage protéines impliquées dans signalisation ç et dans trasduction du signal ?

A

20%

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9
Q

Pourcentage des gènes impliqués dans activités bioch, enzymo, métaboliques ?

A

20%

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10
Q

Pourcentage gènes codent pour protéines / activités variées ?

A

40%

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11
Q

Déf transcription ?

A

Production d’ARN à partir d’ADN (1ere étape expression du génome)

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12
Q

À quoi aboutit ARN ?

A

À 1 copie d’ARN simple brin, identique en séquence à l’un des brins d’ADN et complémentaire à l’autre brin

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13
Q

Quels gènes sont transcrits et traduits ?

A

Gènes codants pour protéine

Séquences codantes de l’ADN

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14
Q

Quels gènes sont concernés par la transcription ?

A

La totalité du génome

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15
Q

Comment est l’ADN chez procaryotes ?

A

Majoritairement codant

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16
Q

Lecture d’un gène chez procaryotes

A

Non interrompue par séquences non-codantes

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17
Q

Comment est l’ADN chez eucaryotes ?

A

Majoritairement non codant

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18
Q

Comment est la séquence codante d’un gène chez eucaryotes ?

A

Souvent interrompue par séquences non codantes qui seront transcrites mais pas traduites = introns

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19
Q

Transcription chez l’Homme ?

A

Génome humain transcrit à 45%

2% sera traduit

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20
Q

(Eucaryotes supérieurs)

ADN hautement répété ?

A

10-15% du génome
Non codant
Séquences hétérochromatiques autour centromères
Motifs courts en tandem ou motifs plus longs (100-200 pb)

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21
Q

(Eucaryotes supérieurs)

ADN moyennement répété ?

A

30-40% génome
Majoritairement non codant
Dispersé

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22
Q

(Eucaryotes supérieurs)

ADN non répété ?

A 
Gènes qui codent pour protéines
Plusieurs copies (anciennes duplications)
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23
Q

Plus il y a de répétitions, plus l’organisme est ?

A

Complexe

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24
Q

Différence ADN/ARN ?

A

Sucre = ribose

Thymine -> uracile

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25
Q

Forme ARN ?

A

Molécule monocaténaire
Repliement (tige/boucle + épingle à cheveux) et formations de structures secondaires stables par auto-complémentarité intra-brin (GC=3LH / UA= 2LH)

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26
Q

ARN m ?

A

ARN messagers
2% total
Se forme au fur et à mesure du déplacement polymérase sur brin ADN matrice

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27
Q

ARN r ?

A

ARN ribosomiques

80% total

28
Q

ARN t ?

A

ARN transfert

15% total

29
Q

ARNsn ?

A

Petits ARN nucléaires

Surtout eucaryotes

30
Q

ARNsno ?

A

Petits ARN nucléolaires (nucléole)

Surtout eucaryotes

31
Q

ARNsi ?

A

Petits ARN interférents de la traduction

Surtout eucaryotes

32
Q

ARNmi ?

A

MicroARN

Surtout eucaryotes

33
Q

Transcription requiert ?

A
  • matrice d’ADN (qui sera transcrite en ARN)
  • ARN polymérase = ARN polymérase ADN dépendante
  • ribonucléotides triphosphates (NTP)
34
Q

Rôle ARN polymérase ?

A

enzyme qui polymérise le brin d’ARN
catalyse formation liaison Pdiester entre 3’OH libre du ribose du dernier nucléotide et phosphate α lié au C5’ du nouveau NTP = libération PPi

35
Q

Caractéristiques ARN polymérase ?

A
  • besoin d’1 matrice
  • pas besoin d’amorce
  • polymérisation 5’ -> 3’
  • utilise NTP / rNTP
  • pas d’activité exonucléase
  • moins fidèle qu’ADN pol (1 erreur toutes les 10^4 bases ajoutées)
  • élongation 5’ -> 3’
36
Q

Brin transcrit ?

A

Brin matrice / modèle / moins / anti-sens

Brin lu qui est complémentaire au brin d’ARN

37
Q

Brin codant ?

A

Brin plus / sens

Brin ayant la même séquence que le brin d’ARN

38
Q

ARN pol chez procaryotes ?

A

1 seule ARN polymérase

mais qui existe sous 2 formes chez E.Coli

39
Q

ARN pol procaryote de forme “core enzyme” ?

A

retrouvée chez E.Coli
4 sous unités : α2ββ’
- 2 α = détermine quel brin doit être transcrit
- 1 β = polymérisation
- 1 β’ = liaison à l’ADN + ouverture de la double hélice

40
Q

ARN pol procaryote de forme “holoenzyme” ?

A

retrouvée chez E.Coli

enzyme core + 5e sous-unité σ = pdt initiation de la transcription, reconnaît promoteur

41
Q

Déf unité de transcription ?

A

séquence d’ADN dirigeant la production d’un transcrit

promoteur + signal de terminaison

42
Q

Promoteur procaryote ?

A

En amont : promoteur sur brin codant de l’ADN

  • 35 = TTGACA
  • 10 =TATAAT= Boîte de Pribnow
43
Q

Déf initiation ?

A

reconnaissance et fixation de l’ARN polymérase sur le promoteur

44
Q

Étapes de l’initiation chez procaryote ?

A

1 : holoenzyme migre sur double brin d’ADN (interaction électrostatique = fixation non spécifique)
2 : facteur σ reconnaît promoteur (affinité très forte holoenzyme-promoteur) > complexe fermé ADN-ARN pol > enzyme englobe l’ADN de -40 à +20 >brins codant et matrice + site +1 déterminés
3 : ARN pol provoque fusion double hélice = rupture LH sur 12 pb = complexe ouvert

45
Q

Déf Site +1 ?

A

Premier nucléotide à transcrire

46
Q

(Transcription procaryote)

Avenir du facteur σ une fois le promoteur reconnu ?

A

au bout d’environ 10 nt transcrits, σ est phosphorylée > dissociation > forme Core enzyme

47
Q

(Transcription procaryote)

Régulation de la transcription ?

A

transcription de chaque gène est régulée de façon à apporter à la ç les prots en quantité nécessaire

48
Q

(Transcription procaryote)

Que permet utilisation de facteurs σ ≠ ?

A

reconnaissance de ≠ promoteurs

ç peut s’adapter à un signal environnemental particulier

49
Q

(Transcription procaryote)

Comment peut varier l’affinité du facteur σ pour le promoteur ?

A

nbreuses prots se lient aux promoteurs de façon à permettre l’activation ou la répression de la transcription
(spécifique de certains gènes)

50
Q

(Transcription procaryote)

Déf boucle ou bulle de transcription ?

A
  • Pendant l’élongation
  • Région où les 2 brins de l’ADN sont séparés et où le brin d’ADN modèle (ADN matrice) est apparié à la portion d’ARN en cours de synthèse
  • 12 à 17 pb chez E.coli
  • ARN pol déroule ADN devant elle et le ré-enroule derrière
  • provoque surenroulement positifs devant elle et négatifs en amont
51
Q

(Transcription procaryote)

Quels sont les systèmes de terminaison ?

A

Rho indépendante 50%
Rho dépendante 50%
Un gène donné ne peut en posséder qu’un

52
Q

(Transcription procaryote)

Comment repérer une terminaison “Rho indépendante”?

A
  • séquence répétée inversée autocomplémentaire (induit repliement en tige)
  • séquence de 6 A
53
Q

Déf protéine hexamèrique Rho ?

A

hélicase ARN/ADN, ATP dépendante

54
Q

(Transcription procaryote)

Terminaison Rho dépendante ?

A

courte séquence riche en pb G-C + plus U (épingle à cheveux) > stoppe progression ARN pol
Rho se fixe sur ARN (région d’environ 70 pb riche en C et pauvre en G = “Rho utilisation site” avant séquence “terminateur”) et permet la dissociation du complexe d’élongation

55
Q

Passage transcription/Traduction chez procaryotes ?

A

transcription non compartimentée dans un noyau
transcription couplée à la traduction
couplage possible car ARNm eucaryotes ne possèdent pas d’introns et sont donc directement traductibles en polypeptides

56
Q

Passage transcription/Traduction chez eucaryotes ?

A

les ARNm doivent d’abord être entièrement exportés du noyau vers le cytoplasme avant d’être traduits

57
Q

Expression des gènes chez procaryotes ?

A

Pls gènes peuvent être transcrits à partir d’un promoteur
> ARN polycistronique (ou monocistronique)
> obtention protéines ≠ à partir d’une même transcription initiale

58
Q

Expression des gènes chez eucaryotes ?

A

monocistronique

59
Q

Quels sont les 4 types d’ARN pol chez eucaryotes ?

A

ARNpol I, pol II, pol III et mitochondriale/chloroplastique

60
Q

(Transcription eucaryote)

Que transcrit ARN pol I ?

A

transcrit gènes de classe I :

ARN r 5,8S ; 18S et 28S à partir d’un pré-ARN r 45S

61
Q

(Transcription eucaryote)

Que transcrit ARN pol II ?

A

transcrit gènes de classe II :

synthétise ensemble des ARNm (= qui codent pour des prots) + petits ARN comme ARNsno

62
Q

(Transcription eucaryote)

Que transcrit ARN pol III ?

A

transcrit gènes de classe III :

ARN r 5S et ARNt + petits ARN comme ARNsno et ARNsn

63
Q

(Transcription eucaryote)

Que transcrit ARN mitochondriale/ chloroplastique ?

A

avec des mécanismes proches de ceux observés chez les procaryotes

64
Q

(Transcription eucaryote)

Acteurs transcription des gènes de classe II / pré-ARN messagers ?

A 
ARN pol II
brin d'ADN matrice
promoteur et gène eucaryote
protéines partenaires (facteurs de transcription)
NTP
65
Q

(Transcription eucaryote)

Déf ARNpol II ?

A

énorme complexe protéique de 550 kDa constitués de 12 sous-unités

66
Q

Contrairement aux procaryotes, les ARN pol chez les eucaryotes sont…?

A
  • incapables d’initier à elles seules la transcription
  • ont besoin de facteurs TRANS / facteurs de transcription qui reconnaissent séquences de l’ADN matrice appelées “CIS régulatrices”

Paces quad 1 (25 decks)

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