traduction 2 Flashcards
Comment est le code génétique par rapport aux nucléotides ?
Non chevauchant : un nucléotide n’entre dans la composition que d’un seul codon
Comment sont les codons dans le code génétique ?
Contigus : le code génétique est ponctué il n’y a pas de nucleotido entre deux codons qui n’entrerait pas dans la composition de l’un des deux
Qu’est-ce que la phase ouverte de lecture ou cadre ouvert de lecture (reading frame ou ORF) ?
C’est un séquence d’ARNm débutant par un codon START (ou initiateur : MET) et se terminant par un codon STOP
Comment on reconnaît les phases de lecture ouverte des protéines ?
S’ouvert par leur longueur
Qu’assure l’appareil de traduction ?
- La reconnaissance des triplets codants sur l’ARNm
- Le positionnement dos 2 aa consécutifs
- l’établissement d’une liaison covalente entre les 2 aa
De quoi va dépendre l’association entre le ribosome et l’ARNt ?
D’un mécanisme de reconnaissance par complémentarité de bases codon- anticodon
Qu’assure le mécanisme codon-anticodon ?
Assure la spécificité du code génétique lors de la traduction
Par quoi commence la traduction ?
Toujours au niveau d’un codon AUG
Par quoi se termine la traduction ?
Toujours au niveau d’un codon stop ( UAA, UAG, UGA)
Quelle est la séquence traduite en protéine ?
Seule la région correspondante à la séquence codante ou cadre ouvert de lecture (ORF) est traduite en protéine
Temps de traduction des aa chez les bactéries et chez les eucaryotes ?
- 20 aa /s (adaptation) chez bactéries
- 2 aa /s chez les eucaryotes
Étapes du mécanisme de la traduction ?
3 étapes :
- initiation
- élongation
- terminaison
Présence de la séquence shine-dalgarno ?
- Présente chez les bactéries
- absente chez les eucaryotes
Localisation de la séquence shine-dalgarno ?
Localisée (5/10 nucléotides) en 5’ en amont du codon initiateur
Complémentarité de la séquence shine-dalgarno ?
Complémentaire à de courtes séquences présentes dans l’ARN 16s de la petite sous unité du ribosome
Séquence de la séquence shine-dalgarno ?
Séquence canonique AGGAGGU mais rarement sous forme complète → en général sous forme partielle, comportant 4 à 6 nucléotides consécutifs de la séquence ci-dessus
Qu’est-ce que la séquence shine-dalgarno ?
= signal pour le début de la traduction et le choix de ORF
Que nécessite l’initiation de la traduction chez les bactéries ?
→ Nécessite 3 facteurs d’initiation :
- IF1
- IF2
- IF3
→ ARNt- fMET se positionne dans le site P
Que se passe-t-il pour le MET lié sur ARNt (ARNtf) pendant l’initiation de la traduction chez les bactéries ?
Il sera modifiée en formyl-Met par la methionyl- ARNt formyltransférase
C’est quoi les “facteurs d’initiation” (IF) ou de démarrage de l’initiation de la traduction chez les bactéries ?
Sont des protéines qui assistent le ribosome pour le démarrage de la traduction
Que permettent les “facteurs d’initiation” (IF) ou de démarrage de l’Initiation de la traduction chez les bactéries ?
Permettent à la machinerie cellulaire de reconnaître le bon codon de démarrage et de se caler ainsi sur le message à traduire
Que fait intervenir le démarrage de la traduction chez les bactéries ?
Ne fait intervenir que la petite sous- unité du ribosome, 30S (bactéries) et permet la formation du complexe ternaire entre :
- petite sous-unité 30S
- l’ARNm
- l’ARNt du premier coder (AUG)
Par quoi est enlevée la f-Met en fin de $ ?
Par une protées
Sites du ribosome ?
3 sites dans la grande sous-unité :
- A = aminoacyl-ARNt
- P = peptidyl-ARNt
- E = exit
Comment est l’ARNm procaryote ?
Polycistronique (plusieurs protéines)
Initiation interne de la traduction des bactéries à partir de quoi ?
De la séquence Shine-dalgarno
Initiation de la traduction chez les eucaryotes ?
Absence de la séquence shine-dalgarno mais présence de la séquence Kozak
Qu’est-ce que la séquence Kozak ?
C’est une séquence conservée que l’on trouve autour du codon de démarrage AUG
Consensus de la sq Kozak chez les vertébré ?
gccRccAUGG (R = purine A/G)
Sq Kozak chez d’autres espèces que les vertébrés ?
La sq kozak autour du codon de démarrage peut être différentes
- sq Kozak dans la région UTR 5’ (attention, le n’est pas le site de fixation des ribosomes à l’ARNm, donc rôle diff de la sq SD chez les bactéries)
GCC(A/G)(-3)CCA(+1)UGG (+4)
GCCRCCAU GG
