compo biochimiq ac nucléiq ADN 2 Flashcards
comment se fait la dénaturation de ADN ?
par rupture des liaisons hydrogènes entre les bases nucléiques des deux chaines complémentaires de l’ADN
comment est aussi appelée la dénaturation de ADN ?
la déshybridation
comment est obtenue la déshydratation (dénaturation) de ADN ?
avec des agents chimiques ou physiques, capables de déstabiliser les liaisons hydrogènes :
pH (+ NaOH), T, certains solvant, des concentrations ioniques élevées
comment est la dénaturation de l’ADN ?
réversible = renaturation
c’est quoi la renaturation de l’ADN ?
la réassociation des deux simples brins complémentaires
comment est aussi appelée la réassociation de l’ADN ?
hybridation des ADNs simple brin pour former la molécule double brins
c’est quoi la fusion de l’ADN ?
destruction des liaisons H entre bases azotées
À quoi correspond la température de fusion de ADN (Tm) ?
T correspondant à 50% de l’ADN sous forme simple tri et 50% sous forme double brin
autre nom pour température de fusion (Tm) ?
T de demi-dénaturation
de quoi dépend la Tm ?
de la composition en bases azotées (%GC)
Tm pour 0% de GC avec des AT < que avec 50% de GC et des AT
(nécessite plus d’énergie pour dénaturer si présence GC)
formule Tm ?
Tm = 2(A+T) + 4(G+C)
comment on calcul la Tm ?
en prenant que 1 seul des deux brins ADN
autre que la compo en bases azotées, de quoi dépend Tm ?
- de la longueur du fragment ADN (Tm de 15p bases < Tm 28p bases)
- de la présence de certains ions (Na+ ; Ca2+)
- du Ph de la solution
comment agissent les ions sur ADN ?
stabilisent la structure de ADN en neutralisant les charges - des groupes phosphates sur le squelette de ADN. (Na+ ; Ca2+)
le Ph sur ADN ?
pH trop bas (acides) peut déprotoner les bases de ADN, perturbant les liaisons H et réduisant la stabilité de la structure en double hélice
compactation de l’ADN ?
chromatine (=ADN-protéine)
structure molécule ADN au microscope électronique ?
en forme de collier de perle, suggère que ADN n’est pas libre dans le noyau mais complexé à d’autres molécules
protéases sur molécules ADN ?
= déstabilisation de la structure en collier de perle
que forme la chromatine (ADN-protéine) dans son organisation de base ?
forme la fibre nucléosomiques
ADN double brin + protéine -(compactation niveau 1 -> fibre nucléosomiques
qu’est-ce que le nucléosome ?
l’unité fondamentale de la chromatine qui se répètes toutes les 200 paires de bases (pb)
de quoi est formé le nucléosome ?
assemblage de 8 histones (protéines) (2 Foix : H2a ; H2b ; H3 ; H4) autour duquel s’enroule une proportion ADN double brin de 146pb + 54pb
combien de nucléosomes par C chez H ?
≈ 30 milions
c’est quoi les histones ?
des protéines très conservées chez les différents eucaryotes
protéines basiques riches en aa de types lysine ou arginine
que fait l’histone H1 ?
stabilise les nucléosomes
nucléosome + histones H1 ?
= chromatosome
rôle des histones ?
rôle majeur dans les C :
- dans compactation ADN (nucléosome)
- dans régulation de l’expression des gènes
c’est quoi le modèle Solénoïde ?
compactation niveau 2 :
la fibre nucléosomique se dispose selon un enroulement hélicoïdal pour donner la fibre chromatinienne
-> chaque tour contiendrait 6 à 8 nucléosomes
comment sont les nucléosomes dans la compactation 2 (fibre chromatinienne) ?
empilés les uns sur les autres grâces à l’histones H1
compactation niveau 2, on parle de quoi ?
de “super-super-hélice” -> obtention d’une nouvelle fibre plus épaisse (fibre chromatinienne)
diamètre ADN double brin ?
2 nm
