traduction 1 Flashcards
Quels sont les acteurs de la traduction ?
- L’ARNm (porte l’information)
- les ribosomes (machine à assembler les aa en protéines)
- ARNt (molécules qui transporte les aa au ribosome)
- les aa (éléments constitutifs des protéines)
Étapes de l’épissage alternatif ?
Un gène → pls ARNm diff → pls protéines diff mais toujours en ARNm = une protéine
Les ribosomes et les procaryotes sont la cible de quoi ?
De certains antibiotiques
Nombre de protéines et d’ARNr des bactéries et des eucaryotes ?
- Bactéries = 52 protéines + 3 ARNr
- eucaryotes = 83 protéines + 4 ARNr
Qu’est-ce que le Svedberg ?
De symbole S, c’est une unité de mesure du taux de sédimentation
Particularité du Svedberg ?
N’est pas additif : une particule formée de deux particules de 5S n’aura pas un coefficient de sédimentation 10S
Combien de ribosomes dans 1 cellule ?
~ 1 million
Grande sous-unité des ribosomes ?
Fixation des facteurs d’initiation, d’élongation et de terminaison de la traduction et formation de la liaison peptique (peptidyl transférase) entre deux aa
Petite sous unité des ribosomes ?
Décodage, fidélité et translocation
Que font les ARNt ?
Font le lien (= adaptateur) entre les codons de l’ARNm et les aa
Comment est ARN simple brin ?
De 60 à 95nt, il est replié sur lui memes même
Que possède la seconde boucle de l’ARNt ?
Possède en triplet de nucléoticles spécifique appelé anticodon
Par quoi est caractérisé chaque ARNt ?
Par son anticodon
À quoi est associé un anticodon donné ?
À 1 seul AA
Que porte l’extrémité 3’ de l’ ARNt ?
Porte le site d’attachement (sq consensus 5’CCA3’) à un aa spécifique dépendant de l’anticodon
comment s’apparient le codon et l’anti codon ?
de manière complémentaire et selon une orientation antiparallèle.
que contiennent les ARNt ?
des bases “rares” modifiées après la transcription :
- Pseudouridine
- Dihydrouridine
- Ribothymidine
- Inosine
ces bases contribuent à l’établissement de la structure 3D par des liaisons H inhabituelles
combien de types d’ARNt ?
en théorie, autant de types d’ARNt que de codons signifiant, soit 61
par quoi est catalysée la fixation de l’AA sur l’ARNt correspondant ?
par une enzyme l’aminoacyl-ARNt synthétase.
elle assure la spécificité de liaison entre l’ARNt et l’aa
on appelle cette étape l’aminoacylation
ARNt spécifique Phe ?
- Phe libre : ARNT^Phe
- Phe chargé : Phe-ARNt^Phe
quel est le brin codan ?
celui qui a la même séquence que celle de l’ARN (sauf T est remplacé par U dans l’ARN). c’est le brin non matrice. brin sens. orientation de même que le sens de la transcription (5’ -> 3’)
codon stop ?
UAA (ocre)
UAG (ambre)
UGA (opale)
combien de combinaison possible du code génétique ?
4^3 = 64
le code dégénéré ?
mis à part le tryptophane et la méthionine qui ne disposent que d’un seul codon, les 18 autres aa sont désignés par plusieurs codons. on dit que le code génétique est dégénéré ou redondant (codons synonymes)
codon d’initiation ?
- AUG : 83% (MET)
- GUG : 14% (Val)
- UUG : 3% (Leu)
le codon AUG code pour quoi ?
- formyl-méthionine (bactéries)
- méthionine (eucaryotes)
souvent enlevées à la fin de synthèse (protéase)
qu’est-ce qui détermine le cadre de lecture ouvert (ORF) ?
le premier nucléotide du premier code
notion de la phase de lecture ?
la traduction sera-t-elle équivalente quelque soit le brin d’ADN qui sera traduit et le codon lu
phases de lecture dans une séquence d’ARN ?
3 phases de lecture.
chaque séquence d’ARNm peut contenir a priori 3 phases de lecture décalées d’un nucléotide
à partir de quoi est lue la séquence des bases ?
à partir d’un point de départ fixe