Thématique 1 Flashcards
Qu’est-ce qu’un génome?
Info héréditaire d’un organisme encodé sous forme ADN dans chaque cellue
Quel est le monomère de l’ADN?
Nucléotides
Qu’est-ce qu’un nucléotide?
AcideDésoxyriboNucléique
De quelle façon se lie deux nucléotides?
Du carbone 5’ vers le carbone 3’
Quels sont les purines? Quels sont les pyrimidines?
Purines: A et G
Pyrimidines: C et T
Combien de pairs de bases chez l’humain?
3 milliards
À quoi sert la réplication de l’ADN?
Doubler le matériel génétique avant la division cellulaire
Quelles sont les 3 enzymes impliquées dans la réplication de l’ADN au tout début? Et leur fonction?
Gyrase: Relaxation de l’ADN enroulée
Hélicase: Déroule la double hélice
Protéine SSB: maintient la double hélice déroulée
Dans quel sens est possible l’addition de nouveaux nucléotides?
Dans le sens 5’ –> 3’
Qu’est-ce que le brin avancé vs brin retardé?
Brin avancé: l’addition 5’ –> 3’ se fait dans le sens de l’ouverture du brin d’ADN
Brin retardé: l’addition 5’ –> 3’ se fait dans le sens inverse à l’ouverture ce qui crée les fragments d’Okazaki
Après le rôle des premières enzymes quelles autres enzymes interviennent? Rôle?
Primase (ARN polymérase) : se lie au simple brin pour permettre à l’ADN polymérase de venir commencer son travail car elle ne peut que débuter sur un double brin
ADN polymérase III: Synthèse le nouveau brin d’ADN
ADN polymérase I: Remplace l’amorce d’ARN par de l’ADN
ADN ligase: lie les fragments d’Okazaki
Quelles sont les phases de la mitose?
Prophase: condensation de l’ADN, destruction membrane nucélaire, migration des centrioles vers les pôles, apparition du faisceau mitotique
Métaphase: Alignement des chromosomes à l’équateur de la cellule
Anaphase: Séparation des chromatides et migration vers les pôles
Télophase: les deux nouvelles cellules commencent à se séparer
Cytocinèse: 2 nouvelles cellules à 46 chromosomes
Qu’est-ce qu’un histone?
Potéine autour desquelles s’enroule l’ADN pour mieux se condesner –> ce nouveau complexe forme le nucléosome
Chromatide vs Chromatine
Chromatine: Fil d’ADN en forme relachée
Chromatide: chaque bras du chromosome métaphasique
Quel est le résultat de la méiose?
4 cellules à 23 chromosomes
Quel phénomène permet l’échange de matériel génétique entre les chromosomes?
Enjambement (peut créer un nombre infini d’enfants diff)
Qu’est-ce que l’ARNm?
Gabarit pour synthèse des protéines
Qu’est-ce que ARNt?
Transfert l’acide aminé aux peptides
Qu’est-ce qui compose 50% de la masse des ribosomes?
ARNr
Qu’est-ce qu’un promoteur?
Séquence d’ADN qui dicte site d’amorçage de transcription
À quoi sert la coiffe?
Ajoutée en 5’, augmente stabilité, intervient dans liaison avec ribosomes, permet sortie du noyau
À quoi sert la poly-A?
Ajoutée en 3’, augmente stabilité, permet sortie du noyau
Qu’est-ce que l’epissage?
Autre processus de la maturation de l’ARNm qui permet d’enlever les introns du transcrit primaire pour atteindre une ARNm mature (avec que des exons)
Où se fait la transcription?
Traduction?
Transcription: Noyau
Traduction: Cytoplasme
Combien de nucléotides composent un acide aminé?
série de 3 nucléotides
Quel type de liaison permet de lier 2 acides aminés?
Liaison peptidique; cette liaison libère de l’eau
Où se produit la traduction de l’ARNm en protéine?
Dans les ribosomes qui en avançant le long de l’ARNm permet aux ARNt de venir porter un acide aminé
À quels endroits les protéines deviennent matures?
RE et appareil de Golgi
Quels sont les modifications chimiques possibles lors de la maturation des protéines?
Glycosylation/Phosphorylation/Méthylation/Pont disulfures
À quoi servent les modif dans la maturation des prots?
stabilité/adressage/solubilité/structure
Quelles sont les différentes structures des protéines?
Primaire: enchaînement des AA
Secondaire: repliement structure primaire (hélice/feuillet)
Tertiaire: enchaînement des structure secondaire
Quaternaire: interaction avec d’autres protéines
Quel est le principal mode de dégradation des protéines?
Protéasome –> protéine à éliminer sont étiquettées d’une ubiquitine qui les envoie au protéasome –> les peptides et AA de cette dégradation pourront être réutilisés
Quelles sont les types de mutations possibles? (4)
Faux-sens: changement d’un codon
Non-sens: change un codon en codon stop
Silencieuse: changement de base qui ne change pas l’AA
Décalage du cadre de lecture: change complètement séquence d’AA par ajout/retrait d’une base
Qu’est-ce qu’un polymorphisme?
Une mutation d’un ou plusieurs nucléotides qui se retrouve dans +1% de la population
Qu’est-ce qu’une banque d’ADN génomique?
Petits fragments de clones de molécules d’ADN qui représente la totalité d’un génome
Pourquoi fait-on une banque de plus petits fragments d’ADN?
Plus facile à manipuler qu’un gros génome. On coupe le génome pour l’analyser puis on reconstruit l’ADN à partir de ces fragments
Qu’est-ce qu’une enzyme de restriction?
Protéine capable de couper l’ADN a/n d’une séquence de nucléotides spécifique (site de restriction)
*Ciseaux en biologie moléculaire
Qu’est-ce qu’un palindrome?
Se lie pareil à l’envers… GGATCC –> CCTAGG
Quels sont les deux types d’extrémité que peuvent engendrer l’enzyme de restriction?
- Extrémité franche
- Extrémité cohésive (facilite ligation et oriente insertion)
Pourquoi l’extrémité cohésive est plus ‘‘efficace’’ que l’extrémité franche?
Extrémité franche: la ligase lie les 2 brins lorsqu’ils se rencontrent presque par hasard
Extrémité cohésive: Les paires de bases s’attirent comme du velcro (ligase quand mm nécessaire)
Qu’est-ce qu’un plasmide?
Plasmide: séquence d’ADN distincte qui a la capacité de réplication autonome et qui a la plupart du temps des gènes résistants aux bactéries (certaines). Sert de vecteur qui permet d’isoler des fragments d’ADN afin de les identifier
Quels sont les principaux site rencontrés sur un plasmide?
Site de clonage
Sélection
Origine de la réplication
Qu’est-ce qui caractérise le site de clonage?
La présence de palindromes uniques
Qu’est-ce qui caractérise l’étape de sélection?
À cette étape, les bactéries sont mises à l’épreuve et seules celles contenant le plasmide avec le gène résistant vont survivre et accéder à l’étape de l’origine de la réplication
Qu’est-ce qu’une banque d’ADNc?
Banque d’ADNcomplémentaire (collection de molécules d’ADNc clonées, rassemblant tous les copies ADN de tous les ARNm d’un type cellulaire
Qu’est-ce qu’un ADNc
ADN complémentaire (transcrite à partir d’une molécule d’ARNm mature; pas d’introns/pas tous les gènes)
Quelle est la différence entre un plasmid d’une banque d’ADN génomique vs complémentaire?
Sur plasmide d’une banque d’ADNc, de chaque côté du site de clonage on retrouve un promoteur et une queue poly-A
Quelle est la différence entre la transformation et la transfection?
Transformation: on introduit le plasmide dans une bactérie
Transfection: on introduit le plasmide dans une cellule eucaryote
Quel est le vrai but de la transfection?
Étudier l’effet de l’expression d’une protéine pour en trouver la fonction
+ la protéine est présente, + ses fonctions s’expriment
Qu’est-ce qu’une cellule pluripotente?
Cellules capables de former tous les types de tissus cellulaires et organes qui composent notre organisme mais pas à des tissus extra-embryonnaires comme placenta
(5 jours après fécondation)
Qu’est-ce qu’une cellule Totipotente?
Peut donner naissance à un organisme complet (placenta + tissus organismes)
Qu’est-ce qu’une multipotente?
Cellule qui peut former un nombre restreint de types cellulaires (de types semblables; comme cellule souche de la moelle –> GR, GB, plaquettes)
Une cellule souche qui se différencie peut-elle redevenir une cellule souche plus tard?
T’es cave! Non évidemment
Comment fonctionne le processus des souris transgéniques?
On insère un un gène dans une cellule reproductrice femelle (d’un niveau pluripotente). Quand les souris naissent certaines présentes le gène sur des parties seulement et d’autres qui auront le cellules insérées dans leur gamètes donc il y aura transmission totale du gène
Quel est le principe de la puce à ADN (Micro-array)?
Basé sur l’hybridation de séquences complémentaires. On excite l’ADN avec des laser et selon la présence ou non du gène ils vont réagir au stimulus
Qu’est-ce que la technique de PCR?
Polymerase Chain Reaction:
1: on fait chauffer pour dénaturer l’ADN en simple brin (90deg)
2: Hybridation (rebaisse la T; les sonde interviennet) les amorces se fixent
50-60 deg
3:Polymérisation (72deg, polymérase se pose sur amorce et ajoute nucléotides complémentaires)
–> création de brins de même longueur qui double à chaque cycle
*Permet d’obtenir, à partir d’un simple échantillon, une quantité d’ADN spécifique et de longueur définie
Quels sont les ingrédients de la PCR?
ADN, 2 amorces, polymérase, thermocycleur
Qu’est-ce que la migration sur gel?
Les plus petits gènes migrent plus rapidement que les grands! On peut donc discerner ceux qui ont des défauts.
Quelles sont les étapes du western Blot?
- Dénaturation des protéines (chaleur + SDS(charge négative) défait les structures quaternaires, tertiaires et secondaires
- Migration sur gel (+ petites protéines vont plus loin)
- Transfert sur une membrane
- Bloquer la membrane
- Anticorps primaire (se lie à la protéine)
- Anticorps secondaire (se lie à l’anticorps et contient une enzyme réceptrice)
- Détection enzymatique (le substrat se lie au récepteur sur l’enzyme de l’anticorps 2 et crée une coloration
Qu’est-ce que le clonage?
Multiplication naturelle (bouture) ou artificielle (Dolly) d’un être vivant en conservant son génome exact
Comment s’est produit le clonage de Dolly?
- On a retiré le noyau d’une egg cell d’un donneur
- On a implanté la génétique (noyau) d’une cellule du donneur dans la egg cell
- on a implanté l’embryon créé après les premières divisions cellulaires
