Thématique 1 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’un génome?

A

Info héréditaire d’un organisme encodé sous forme ADN dans chaque cellue

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Q

Quel est le monomère de l’ADN?

A

Nucléotides

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3
Q

Qu’est-ce qu’un nucléotide?

A

AcideDésoxyriboNucléique

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4
Q

De quelle façon se lie deux nucléotides?

A

Du carbone 5’ vers le carbone 3’

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5
Q

Quels sont les purines? Quels sont les pyrimidines?

A

Purines: A et G
Pyrimidines: C et T

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6
Q

Combien de pairs de bases chez l’humain?

A

3 milliards

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7
Q

À quoi sert la réplication de l’ADN?

A

Doubler le matériel génétique avant la division cellulaire

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8
Q

Quelles sont les 3 enzymes impliquées dans la réplication de l’ADN au tout début? Et leur fonction?

A

Gyrase: Relaxation de l’ADN enroulée

Hélicase: Déroule la double hélice

Protéine SSB: maintient la double hélice déroulée

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9
Q

Dans quel sens est possible l’addition de nouveaux nucléotides?

A

Dans le sens 5’ –> 3’

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10
Q

Qu’est-ce que le brin avancé vs brin retardé?

A

Brin avancé: l’addition 5’ –> 3’ se fait dans le sens de l’ouverture du brin d’ADN

Brin retardé: l’addition 5’ –> 3’ se fait dans le sens inverse à l’ouverture ce qui crée les fragments d’Okazaki

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11
Q

Après le rôle des premières enzymes quelles autres enzymes interviennent? Rôle?

A

Primase (ARN polymérase) : se lie au simple brin pour permettre à l’ADN polymérase de venir commencer son travail car elle ne peut que débuter sur un double brin

ADN polymérase III: Synthèse le nouveau brin d’ADN

ADN polymérase I: Remplace l’amorce d’ARN par de l’ADN

ADN ligase: lie les fragments d’Okazaki

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12
Q

Quelles sont les phases de la mitose?

A

Prophase: condensation de l’ADN, destruction membrane nucélaire, migration des centrioles vers les pôles, apparition du faisceau mitotique

Métaphase: Alignement des chromosomes à l’équateur de la cellule

Anaphase: Séparation des chromatides et migration vers les pôles

Télophase: les deux nouvelles cellules commencent à se séparer

Cytocinèse: 2 nouvelles cellules à 46 chromosomes

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13
Q

Qu’est-ce qu’un histone?

A

Potéine autour desquelles s’enroule l’ADN pour mieux se condesner –> ce nouveau complexe forme le nucléosome

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14
Q

Chromatide vs Chromatine

A

Chromatine: Fil d’ADN en forme relachée
Chromatide: chaque bras du chromosome métaphasique

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15
Q

Quel est le résultat de la méiose?

A

4 cellules à 23 chromosomes

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16
Q

Quel phénomène permet l’échange de matériel génétique entre les chromosomes?

A

Enjambement (peut créer un nombre infini d’enfants diff)

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17
Q

Qu’est-ce que l’ARNm?

A

Gabarit pour synthèse des protéines

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18
Q

Qu’est-ce que ARNt?

A

Transfert l’acide aminé aux peptides

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19
Q

Qu’est-ce qui compose 50% de la masse des ribosomes?

A

ARNr

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20
Q

Qu’est-ce qu’un promoteur?

A

Séquence d’ADN qui dicte site d’amorçage de transcription

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21
Q

À quoi sert la coiffe?

A

Ajoutée en 5’, augmente stabilité, intervient dans liaison avec ribosomes, permet sortie du noyau

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22
Q

À quoi sert la poly-A?

A

Ajoutée en 3’, augmente stabilité, permet sortie du noyau

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23
Q

Qu’est-ce que l’epissage?

A

Autre processus de la maturation de l’ARNm qui permet d’enlever les introns du transcrit primaire pour atteindre une ARNm mature (avec que des exons)

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24
Q

Où se fait la transcription?

Traduction?

A

Transcription: Noyau
Traduction: Cytoplasme

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25
Q

Combien de nucléotides composent un acide aminé?

A

série de 3 nucléotides

26
Q

Quel type de liaison permet de lier 2 acides aminés?

A

Liaison peptidique; cette liaison libère de l’eau

27
Q

Où se produit la traduction de l’ARNm en protéine?

A

Dans les ribosomes qui en avançant le long de l’ARNm permet aux ARNt de venir porter un acide aminé

28
Q

À quels endroits les protéines deviennent matures?

A

RE et appareil de Golgi

29
Q

Quels sont les modifications chimiques possibles lors de la maturation des protéines?

A

Glycosylation/Phosphorylation/Méthylation/Pont disulfures

30
Q

À quoi servent les modif dans la maturation des prots?

A

stabilité/adressage/solubilité/structure

31
Q

Quelles sont les différentes structures des protéines?

A

Primaire: enchaînement des AA
Secondaire: repliement structure primaire (hélice/feuillet)
Tertiaire: enchaînement des structure secondaire
Quaternaire: interaction avec d’autres protéines

32
Q

Quel est le principal mode de dégradation des protéines?

A

Protéasome –> protéine à éliminer sont étiquettées d’une ubiquitine qui les envoie au protéasome –> les peptides et AA de cette dégradation pourront être réutilisés

33
Q

Quelles sont les types de mutations possibles? (4)

A

Faux-sens: changement d’un codon
Non-sens: change un codon en codon stop
Silencieuse: changement de base qui ne change pas l’AA
Décalage du cadre de lecture: change complètement séquence d’AA par ajout/retrait d’une base

34
Q

Qu’est-ce qu’un polymorphisme?

A

Une mutation d’un ou plusieurs nucléotides qui se retrouve dans +1% de la population

35
Q

Qu’est-ce qu’une banque d’ADN génomique?

A

Petits fragments de clones de molécules d’ADN qui représente la totalité d’un génome

36
Q

Pourquoi fait-on une banque de plus petits fragments d’ADN?

A

Plus facile à manipuler qu’un gros génome. On coupe le génome pour l’analyser puis on reconstruit l’ADN à partir de ces fragments

37
Q

Qu’est-ce qu’une enzyme de restriction?

A

Protéine capable de couper l’ADN a/n d’une séquence de nucléotides spécifique (site de restriction)
*Ciseaux en biologie moléculaire

38
Q

Qu’est-ce qu’un palindrome?

A

Se lie pareil à l’envers… GGATCC –> CCTAGG

39
Q

Quels sont les deux types d’extrémité que peuvent engendrer l’enzyme de restriction?

A
  • Extrémité franche

- Extrémité cohésive (facilite ligation et oriente insertion)

40
Q

Pourquoi l’extrémité cohésive est plus ‘‘efficace’’ que l’extrémité franche?

A

Extrémité franche: la ligase lie les 2 brins lorsqu’ils se rencontrent presque par hasard

Extrémité cohésive: Les paires de bases s’attirent comme du velcro (ligase quand mm nécessaire)

41
Q

Qu’est-ce qu’un plasmide?

A

Plasmide: séquence d’ADN distincte qui a la capacité de réplication autonome et qui a la plupart du temps des gènes résistants aux bactéries (certaines). Sert de vecteur qui permet d’isoler des fragments d’ADN afin de les identifier

42
Q

Quels sont les principaux site rencontrés sur un plasmide?

A

Site de clonage
Sélection
Origine de la réplication

43
Q

Qu’est-ce qui caractérise le site de clonage?

A

La présence de palindromes uniques

44
Q

Qu’est-ce qui caractérise l’étape de sélection?

A

À cette étape, les bactéries sont mises à l’épreuve et seules celles contenant le plasmide avec le gène résistant vont survivre et accéder à l’étape de l’origine de la réplication

45
Q

Qu’est-ce qu’une banque d’ADNc?

A

Banque d’ADNcomplémentaire (collection de molécules d’ADNc clonées, rassemblant tous les copies ADN de tous les ARNm d’un type cellulaire

46
Q

Qu’est-ce qu’un ADNc

A

ADN complémentaire (transcrite à partir d’une molécule d’ARNm mature; pas d’introns/pas tous les gènes)

47
Q

Quelle est la différence entre un plasmid d’une banque d’ADN génomique vs complémentaire?

A

Sur plasmide d’une banque d’ADNc, de chaque côté du site de clonage on retrouve un promoteur et une queue poly-A

48
Q

Quelle est la différence entre la transformation et la transfection?

A

Transformation: on introduit le plasmide dans une bactérie

Transfection: on introduit le plasmide dans une cellule eucaryote

49
Q

Quel est le vrai but de la transfection?

A

Étudier l’effet de l’expression d’une protéine pour en trouver la fonction

+ la protéine est présente, + ses fonctions s’expriment

50
Q

Qu’est-ce qu’une cellule pluripotente?

A

Cellules capables de former tous les types de tissus cellulaires et organes qui composent notre organisme mais pas à des tissus extra-embryonnaires comme placenta
(5 jours après fécondation)

51
Q

Qu’est-ce qu’une cellule Totipotente?

A

Peut donner naissance à un organisme complet (placenta + tissus organismes)

52
Q

Qu’est-ce qu’une multipotente?

A

Cellule qui peut former un nombre restreint de types cellulaires (de types semblables; comme cellule souche de la moelle –> GR, GB, plaquettes)

53
Q

Une cellule souche qui se différencie peut-elle redevenir une cellule souche plus tard?

A

T’es cave! Non évidemment

54
Q

Comment fonctionne le processus des souris transgéniques?

A

On insère un un gène dans une cellule reproductrice femelle (d’un niveau pluripotente). Quand les souris naissent certaines présentes le gène sur des parties seulement et d’autres qui auront le cellules insérées dans leur gamètes donc il y aura transmission totale du gène

55
Q

Quel est le principe de la puce à ADN (Micro-array)?

A

Basé sur l’hybridation de séquences complémentaires. On excite l’ADN avec des laser et selon la présence ou non du gène ils vont réagir au stimulus

56
Q

Qu’est-ce que la technique de PCR?

A

Polymerase Chain Reaction:
1: on fait chauffer pour dénaturer l’ADN en simple brin (90deg)

2: Hybridation (rebaisse la T; les sonde interviennet) les amorces se fixent
50-60 deg

3:Polymérisation (72deg, polymérase se pose sur amorce et ajoute nucléotides complémentaires)

–> création de brins de même longueur qui double à chaque cycle

*Permet d’obtenir, à partir d’un simple échantillon, une quantité d’ADN spécifique et de longueur définie

57
Q

Quels sont les ingrédients de la PCR?

A

ADN, 2 amorces, polymérase, thermocycleur

58
Q

Qu’est-ce que la migration sur gel?

A

Les plus petits gènes migrent plus rapidement que les grands! On peut donc discerner ceux qui ont des défauts.

59
Q

Quelles sont les étapes du western Blot?

A
  1. Dénaturation des protéines (chaleur + SDS(charge négative) défait les structures quaternaires, tertiaires et secondaires
  2. Migration sur gel (+ petites protéines vont plus loin)
  3. Transfert sur une membrane
  4. Bloquer la membrane
  5. Anticorps primaire (se lie à la protéine)
  6. Anticorps secondaire (se lie à l’anticorps et contient une enzyme réceptrice)
  7. Détection enzymatique (le substrat se lie au récepteur sur l’enzyme de l’anticorps 2 et crée une coloration
60
Q

Qu’est-ce que le clonage?

A

Multiplication naturelle (bouture) ou artificielle (Dolly) d’un être vivant en conservant son génome exact

61
Q

Comment s’est produit le clonage de Dolly?

A
  • On a retiré le noyau d’une egg cell d’un donneur
  • On a implanté la génétique (noyau) d’une cellule du donneur dans la egg cell
  • on a implanté l’embryon créé après les premières divisions cellulaires