T14. Estructura ARN Flashcards
Los ARN son cadenas de ribonucleótidos unidos por enlaces 5’-3’-fosflodiéster. Las diferencias de estos monómeros respecto a los del ADN son el -OH en el C2’ y la presencia de Us en lugar de Ts.
F
Las CADENAS de nucleótidos, tanto en el ARN como en el ADN van en sentido 5’-3’ lo que significa que los enlaces se producen entre el 3’-OH del primer nt y el 5’-PO4 del siguiente nt. Por tanto el ENLACE es 3’-5’
En el RNA abundan los nt modificados, es decir con bases nitrogenadas poco habituales, formadas por modificaciones de las bases comunes tras la transcripción
V
Cuando se aisla ARN es necesario tomar más medidas y precauciones que cuando se aisla ADN
V
Es más reactivo y más susceptible a la hidrólisis tanto enzimática como química –> se deben tomar muchas medidas como congelación rápida con N líquido, agua libre de RNAsas…
De entre los posibles apilamientos de bases, el que se da entre dos pirimidinas es el más fuerte
F
Es e que se da entre purinas, pues son más grandes (formadas por 2 anillos)
De entre los posibles apilamientos de bases, el que se da entre dos purinas es el más fuerte
V
Son las bases más grandes (2 anillos)
A diferencia de la estructura helicoidal que adopta el ADN, el ARNm no tiene una estructura tridimensional definida, puesto que se trata de moléculas de cadena simple
F
Los fragmentos de ARN de cadena simple adoptan estructuras helicoidales debido a interacciones por parcial apilamiento de bases nitrogenadas
El ARN ribosómico está formado por dos subunidades, la mayor, com más de 30 rARNs y la menor, con 20 ARNs
F
Los ARNs foman parte del RIBOSOMA, que es el que tiene 2 subunidades +de 30 y 20 es el nº de proteínas que contiene cada subunidad
El ARNr constituye el 80% del RNA celular
V
El rRNA 23S presenta un alto grado de conservación, es muy similar entre especies
F
Es el 16S
Un ribosoma (procariota) tiene 3 moléculas de rRNA: 5S, 16S y 23S
V
ARNr 16S tiene 4 dominios estructurales mientras que ARNr 23S tiene 6
V
La función de los diversos ARNr es catalizar la síntesis de proteínas gracias a su actividad peptidil-transferasa
F
Funciones del ARNr:
- Estabilizar el ribosoma
- Algunos tienen actividad peptidil-transferasa
Las regiones doble helicoidales son fragmentos de una misma cadena de ARN con secuencias complementarias que se orientan antiparalelamente formando puentes de hidrógeno entre sí.
V
En las regiones dobles helicoidales se cumple estrictamente la complementariedad de Watson y Crick
F
predominan los emparejamientos de Watson-Crick, pero también se dan otras asociaciones de bases (con cierta frecuencia G - U)
¡AQUÍ NO HABLAMOS DE PDH SI NO DE COMPLEMENTARIEDAD (A-U, C-G)!
Los emparejamientos A-C aparecen con relativa frecuencia en las regiones doble helicoidales del ARN
F
Son los G-U
La dihidrouridina es un nucleótido de U en el que este ha sido reducido
V
En la tiouridina el metilo del U ha sido sustituido por un azufre
F
El grupo ceto ha sido sustituido por un azufre (U no está metilado)
La inosina es la base nitrogenada de la hipoxantina, que se produce por desaminación de la adenina
F
La hipoxantina es la base nitrogenada de la inosina, que se produce por desaminación de la adenina
Tanto la metilguanosina como la isomenteniladenosina se producen por adición de grupos hidrocarbonados a las BN
V
La ribotimidina es un nucleótido que presenta una timina que ha sido glicosilada con una ribosa en posición 2’
F
Es un ribonucleótido que tiene T como base (los ARNs suelen tener Us no Ts)
Pseudouridina presenta U unido a la ribosa en a través de una posición inusual, por un carbono en vez del característico N
V
Los ARN presentan conformación A y no B porque el 3’OH impide la formación de hélices B
F
El 2’OH
Los pares de bases del A-ARN están menos inclinados respecto al eje helicoidal que los del A-ADN
V
El A-ARN se forma en entornos de elevada forma iónica mientras que el ARN-A’ solo aparece si la fuerza iónica es baja
F
Al revés
El ARN-A’ presenta una inclinación de los pdb respecto al eje de 10,6º y tiene 11 pdb por vuelta
F
12 pdb por vuelta
El ARN-A tiene 11 pdb por vuelta y dichos pdb se inclinan 15,5º respecto al eje helicoidal
V
En el ARN doble helicoidal las ribosas presentan un arqueo de tipo C3’-endo
V
En el ARN doble helicoidal las ribosas presentan un arqueo de tipo C3’-exo
F
C3’-endo