T13. Estructura DNA Flashcards
El ADN se encuentra de forma ADN-A en los seres vivos
Falso
Su forma predominante in vivo es la de ADN-B
Las bases nitrogenadas en el exterior de la doble hélice del DNA se encuentran perfectamente apiladas
FALSO
Estas están en el interior de la hélice y se encuentran parcialmente apiladas (debido al enrollamiento helicoidal)
Las bases nitrogenadas están en cadenas antiparalelas y se disponen en complementariedad entre si (formando puentes de hidrogeno)
VERDADERO
El ADN Z es levógiro
FACTS
La doble hélice de DNA tiene una n de 5 y una p de 34Å
FALSO
Tienen una n de 10.4 y giro de 36 grados
Pregunta pdh surcos
Debido a uniones sucesivas de C’s y G’s, la hélice tiene un giro sobreacentuado que puede producir puentes de hidrógeno bifurcados
FALSO
La hélice se vuleve acentuada por enlaces sucesivos de A-T, con los puentes de hidrógeno bifurcados ocurriendo únicamente entre estos pares de bases
Uno de los rasgos distinctivos de la hélice de ADN-A es que tiene un hueco axial en el núcleo de la hélice
VERDADERO
El ADN-A presenta una n y p significativamente más elevada que el ADN-B
FALSO
Tiene una n sololigeramente mayor (al ser más achatada)y tiene 11 residuos por vuelta, sin embargo la distancia es menor (p=28Å)
Los ARN y complejos ADN-ARN pueden en determinadas condiciones formar la estructura de ADN-B
FALSO
ADN C D Z
Los tríplex intermoleculares son una parte esencial de la estructura del ADN-H
FALSO
Los tríplex INTRAmoleculares, al menos 1 cadena de purina y pirimidina
EL ADN-Z se caracteriza por tener una estructura levogira y ser estable en ambientes salinos
VERDADERO
Las cargas positivas de las sales apantallan las cargas negativas del ADN, por lo que hay menos repulsión entre grupos fosfato .
Los tríplex intercadena de ADN son interacciones entre 2 o más triplex de ADN-H
FALSO
Los tríplex intercadena son uniones entre los oligonucleotidos del tríplex con secuencias diana de ADN duplex
La triple hélice intracadena se favorece a pH’s acidos ya que así los protones estabilizan a los grupos fosfatos (próximos entre si)
VERDADERO
Cuando una tercera cadena interacciona mediante pdh con un dúplex normal de ADN, se establecen puentes de hidrógeno Watson i Crick
FALSO
Se establecen puentes de hidrógeno Hoogsteen, igualmente complementarios.
El triplex antiparalelo se define por tener 2 cadenas de pirimidinas unida a 1 de purina, porlo tanto es menos estable
FALSO
Se caracteriza por tener 2 cadenas de purinas y 1 de pirimidina, las de purinas antiparalelas entre si. Más estable ya que antiparalelo>paralelo.
Los tríplex intramoleculares se forman cuando una cadena de purina/pirimidina se une al surco MAYOR de un dúplex de ADN
VERDADERO
Por puentes H Hoogsteen
DIFERENCIAS EMPAREJAMIENTOS PARALELA-ANTIPARALELA
Tanto en triplex paralelos como antiparalelos, la cadena central es una pirimidina
FALSO
Es una purina
En los tríplex antiparalelos, los puentes de hidrogeno Hoogsteen se forman entre las cadenas 5’ y 5’
FALSO
3’ y 5’ de la misma cadena (sobre ella misma)
En los tríplex paralelos, se forman puentes de hidrogeno entre la purina y la 3’ y puentes Hoogsteen entre la purina y el 5’
VERDADERO
La purina tiene orientación 3’-5’
Las secuencias con possibilidad de conformación de DNA H son poco frecuentes en el genoma
FALSO
Están ampliamente distribuidas en el genoma y suelen estar cerca de regiones implicadas en regulación génica.
TFO?
Los PNA son parecidos a los ADN’s, pero intercambian las uniones entre fosfato-azúcar por poliamidas, por lo que su afinidad para formar tríplex es menor
FALSO
Su afinidad para formar tríplex intercadena con el ADN es mayor ya que …
Los cuadruplex de guanina se forman por cualquier guanina al mismo nivel que interaccione con otras 2 y es estimulada por cationes divalentes (que estabilizan el complejo)
FALSO
Se forman por Guaninas en DUPLEX DIFERENTES, ya que los puentes de hidrogeno entre ellas son de tipo HOOGSTEEN. Tienen que estar al mismo nivel y se estabilizan por cationes MONOVALENTES (que interaccionan con el O6 del hueco axial)
Los ADNi son resultado de la intercalación de dos dúplex de ADN ricos en Guanina, que al formar más puentes de hidrogeno se estabilizan mejor
FALSO
Se forman por interacciones de PdH Hoogsteen entre pares de citosinas (1 de ellas cargada). Son interacciones entre 2 cadenas de ADN doble antiparalelas.
El superenrollamiento del ADN crea tensión adicional, por eso es una conformación poco frecuente
FALSO
No se puede alejar mas de la verdad, es la estructura biológica del ADN y sirve para liberar tensión (pensar en cuerda del telefono)
La conformación de superenrollamiento es muy variable, pudiendose alargar o acortar según las circuntsancias
FALSO
El numero de vueltas en el superenrollamiento del ADN siempre es fijo, solo se puede modificar cortando antes una de las hebras.
En el ADN lineal, los extremos se encuentran fijados por proteínas, mientras que en el circular se encuentran fijados por autounión covalente
VERDADERO
EL emparejamiento de bases complementarias con geometría Watson y Crick no es exclusivo del ADN
Verdadero
La interacción con el surco menor que establecen muchos dominios proteicos de unión al ADN contribuyen a dar estabilidad al complejo, pero no participan en el reconocimiento específico de la secuencia diana
VERDADERO
En el surco menor las interacciones estabilizan el complejo
En el ADN-A la inclinación de los pares de bases es menor que en el ADN-B.
FALSO
En el ADN-A es 20grados más que en el B
En el ADN-H la cadena de homopirimidinas de la doble hélice establece simultáneamente puentes de H Watson y Crick y Hoogsten
Falso
No es una cadena de homopirmidinas. En el ADN-h, la cadena central es siempre de purinas
El superenrollamiento es característico de moleculas de ADN helicoidal lineal, ayuda a liberar la tensión acumulada
FALSO
Es característica del ADN circular, como en mitocondrias/cloroplastos, bacterias y virus
Cualquier secuencia de ADN es capaz de adoptar conformaciones de triple cadena (ADN-H)
Falso
Solo regiones de homopurina o homopirimidina
En todos los casos, la alquilación de bases de ADN ocasiona emparejamientos erróneos
Falso
El ADN circular se mide por 3 letras distintas a ADN lineal: l=numero de enlace, w=numero de torsión, T=numero de retorcimiento, producto de la suma de los otros 2
FALSO
T es el numero de torsión, las veces que la hebra da vueltas al eje duplex (analogo del paso de hélice p), W es el numero de retorcimiento, las veces que se da vueltas al eje duplex alrededor del eje de la superhélice.
El numero de veces que una hebra rodea a la otra en el ADN circulares igual al numero de torsión + el numero de retorcimiento
VERDADERO
L=T+W
El ADN superenrollado de forma plectonémica es la característica de la cromatina
FALSO
El solenoidal
El superenrollamiento plectonémico (estirado) carece de la compactación para ser usado en la cromatina
VERDADERO
Topoisomerasas: enzimas que se encargan de desenrollar las superhelices
FALSO
regulan su formación modificando el numero de ligazón
El valor L (numero de ligazón) es variable y continuamente modificado por las topoisomerasas
FALSO
Es un valor fijo, las topoisomerasas cortan enlaces para modificarlo
