syrabasjämnvikter (Per Jamth) kap 3

Question 1

Vad är en ligand?

ge några exempel

Answer 1

En molekyl som binder till ett protein (i detta fall). Kan vara; DNA, RNA, protein, liten molekyl…)

Om två molekyler binder till varandra så är den ena molekylen ligand till den andra.

Question 2

De flesta av dessa interaktioner följer i princip samma enkla mekanism, vad är detta för mekanism?

Answer 2

P + L PL

P= protein
L = ligand 
PL= protein-ligand komplex

Protein som binder en ligand beter sig matematisk på samma sätt som ett … som binder en proton

[PL] = [P]tot[L]/(Kd+[L])

Question 3

De flesta av dessa interaktioner följer i princip samma enkla mekanism, vad är detta för mekanism?

Answer 3

P + L PL

P= protein
L = ligand 
PL= protein-ligand komplex

Protein som binder en ligand beter sig matematisk på samma sätt som ett … som binder en proton

[PL] = [P]tot[L]/(Kd+[L])
kd värde = den [L] som krävs för att hälften av P ska binda L

Question 4

Vad är Kd värdet?

Answer 4

den [L] (koncentration ligand) som krävs för att hälften av Proteinet ska binda Liganden.

Question 5

Vad är Kd värdet?

Answer 5

jämvikts- eller dissociationskonstanten .

- den [L] (koncentration ligand) som krävs för att hälften av Proteinet ska binda Liganden.

Question 6

Vad är Kd värdet?

Answer 6

jämvikts- eller dissociationskonstanten .
- den [L] (koncentration ligand) som krävs för att hälften av Proteinet ska binda Liganden.

Enligt definitionen blir Kd-värdet lågt om bindningen är stark och tvärt om. Kd-värdet är ett direkt mått på bindningsstyrkan.

Question 7

Vad är Kd värdet?

Answer 7

jämvikts- eller dissociationskonstanten .
- den [L] (koncentration ligand) som krävs för att hälften av Proteinet ska binda Liganden. Visar ligandkoncentration där hälften är bunden.

Enligt definitionen blir Kd-värdet lågt om bindningen är stark och tvärt om. Kd-värdet är ett direkt mått på bindningsstyrkan.

Question 8

vad är specificitet?

Answer 8

förmåga att kunna skilja en molekyl från en annan

Question 9

Skillnaden på progesteon och testosteron

Answer 9

Det enda som skiljer dessa är att
Progesteron: har CH3 grupp

Testosteron: har OH grupp

Så testosteron binder steroider bättre.

Question 10

Vad gör myoglobin?

Answer 10

Myoglobin finns i musklerna och binder syrgas.

Myoglobin binder O2, Mb + O2 MbO2
bindningen följer en “normal” mättnadskurva.

Question 11

Vart är mättnadstrycket högre, i lungor eller vävnader?

Answer 11

I lungorna har vi högre mättnadstryck/syrgastryck än vad vi har i vävnaderna.

Myoglobin är nästan alltid mättad med syrgas i vävnaderna. Bindningen är stark, Mb är i princip med O2 hela tiden.