Structure des protéines Flashcards
Quelles est la structure primaire des protéines?
Structure covalente
-Séquence plus modifications covalente
Quelle est la structure secondaire des protéines?
Les éléments régulier de la structure de la chaine principales
-Hélice a, feuillet b, etc
Vrai ou faux
La structure secondaire peut inclure le désordre dans une protéine
Vrai
Vrai ou faux
Il est possible de prédire la structure secondaire à l’aide de la séquence
Vrai
Que représente la structure tertiaire des protéines?
Le repliement en trois dimensions de tous les atomes d’une chaine polypeptidique
-Arrangement des éléments de la structure secondaire, chaine latérales, site actif…
Vrai ou faux
La structure tertiaire est souvent arrangé en domaine
Vrai
Que représente la structure quaternaire?
l’arrangment en trois dimensions des différentes chaine polypeptidiques d’un oligomère ou complexe de protéines
Que sont les motifs ou superstructures secondaire?
arrangements simples regroupant quelques éléments structuraux, assemblés selon une géométrie précise et retrouvés fréquemment dans la structure de plusieurs protéines
Pour quoi le motif hélice-boucle-hélice est-il souvent utile?
Pour la liaison du Ca+
Vrai ou faux
Les motifs superhélice d’hélice a sont souvent des homodimères
Vrai
De quoi est formé les motifs clé grecque?
4 brins B
Donner un exemple de regroupement de plusieurs motifs
Baril B
Vrai ou faux
l’hélice a est souvent ampiphatique
Vrai
Est-il obligatoire pour les groupements amides des protéines membranaires de faire des ponts H entre eux?
Explique
oui, il sont dans un milieu hydrophobe donc ne peuvent pas faire de ponts H avec des molécules d’eau et pas de ponts H= défavorable
Vrai ou faux
Les protéines transmembranaires sont principalement des hélices a
Vrai
Comment pourrait-on expliquer des résidus d’une protéines transmembranaires qui ne forme pas des hélices a?
Il sont accessible à l’eau
Vrai ou faux
Les forces d’intercations entre les hélices d’une protéine transmembranaire sont plus fortes que pour les protéines globulaires
Faux
Les ______ sont souvent présentes dans les protéines transmembranaires, mais les interactions sont souvent _____
hélices amphipatiques, inversées
Comment est former le canal à potassium?
De 4 sous-unité identique avec un extérieur hydrophobe
Pourquoi très peu de protéines transmembranaires contiennent des feuillets B?
Parce que les feuillet B n’ont normalement pas de ponts H protéines-protéines aux extrémités ce qui n’est pas favorable dans une membrane
comment les feuillet B peuvent se positionner pour former une protéine transmembranaire?
En baril B quand elles se referment sur elles-mêmes.
Nombre pair de brins B
Par quoi est déterminé la structure tertiaire native d’une protéine?
Seulement par sa séquence primaire
Vrai ou faux
Nous devrions être capable de prédire la structure tertiaire d’une protéine à partir de sa séquence
Vrai
Que représente la structure native d’une protéine en terme d’énergie ?
Le minimum d’énergie globale, état le plus stable
Vrai ou faux
La conformation d’une protéine est une balance entre un très grand nombre de forces faibles qui peut être perturbée
Vrai
Par quoi peut être perturbé la conformation d’une protéine?
pH, T, liaison d’un ligand
Qu’est ce que les protéines métastables ont de particulier
Leur conformation ou leur affinité pour le ligand peut être changer par des facteurs environnementaux, leur activité est ainsi régulé
Vrai ou faux
la structure d’une protéine est plus conservée que sa séquence
Vrai
Vrai ou faux
Les mutation des protéines ont une sélection plus strictes que celles de l’ADN
Vrai
L’homologie de structure entre protéines peut être utilisée pour…
Identifier la fonction
Vrai ou faux
Certains acides aminés important pour la fonction d’une protéine change plus lentement que d’autres
vrai
Quelles informations peuvent être tirées à partir de l’alignement de séquences de protéines homologues?
- Portions plus conservées = Plus importantes pour fonction ou structure
- Identification des résidus catalytique
- identification de motifs de séquence fonctionnels
Vrai ou faux
Pour des protéines homologues, la séquence est plus fortement conservée que la structure
Faux, contraire
Vrai ou faux
Des protéines homologues ont presque toujours des insertions/délétions dans leur séquence quand on les compares
Vrai
