Les forces maintenant la structure des protéines Flashcards
Quel type de liaisons est la plus forte dans les protéines?
covalente
Combien de temps dure une liaison covalente par rapport à la vie de la protéine?
toute sa vie, à part le pont disulfures
À quoi est équivalent la stabilité structurale typique d’une protéine?
20-60kj.mol-1
somme de seulement quelques interactions non-covalentes
La stabilité d’une protéine est…
une balance délicate entre plusieurs contributions énergétiques faibles
Quel type d’interactions comprennent la majorité des forces entre molécules?
charge-charge
Les forces électrostatiques contribuent sur de ____ distances
longues -> distance entre deux charges
Les forces électrostatiques (augmentent ou diminuent) dans l’eau
diminuent
Vrai ou faux
l’ensemble de plusieurs charges partielles sont assez fortes pour stabiliser un ion chargé enfoui dans le coeur hydrophobe d’une protéine
Vrai
Pourquoi les charges partielles sont comprises dans les forces électrostatiques malgré que leur charge soit plus faible?
Parce qu’elle sont beaucoup plus nombreuses
Le pont hydrogène est une liaison chimique _____, de type ____
non-covalente
dipole-dipole
qu’est ce qu’implique un pont hydrogène?
2 atomes électronégatifs
Un hydrogène entre les 2 atomes électronégatifs
Vrai ou faux
Les ponts hydrogènes constituent des interactions principalement électrostatiques
Vrai
Vrai ou faux
L’énergie d’un pont H peptide-peptide est supérieur à un pont H peptide-eau
Faux, similaire
Vrai ou faux
l’énergie totale reliée à la formation d’un pont H est nettement favorable
Faux, très petite car les groupements peptides sont généralement solvatés
Avec quoi les peptides font-ils des ponts H à :
- la surface
- l’intérieur de la protéine
surface : H2O
Intérieur : peptide, chaine latérale, H2O enfoui
Vrai ou faux l’absence de pont hydrogène n’est pas défavorable
Faux
Définir force de van der waals
Somme des forces d’attractions et de répulsion entre deux entités autre que les forces de liaison covalente, les force électrostatiques et les forces de pont H
Qu’arrive-t-il lorsque deux atomes sont proximaux créant une force de van der waals?
redistribution de la densité électronique
-> Faible attraction entre atome
Vrai ou faux
Les forces de van der waals impliquent tous les atomes
Vrai
Vrai ou faux
Les forces de van der waals ont une contribution totale très importante
Vrai
Vrai ou faux
Les forces de van der waals sont toujours attractives
Faux, répulsive à de très faibles distances
Vrai ou faux
Les groupements hydrophobes sont des forces physiques comprennant des groupements hydrophobes
Faux, pas force physique -> phénomène d’interactions
Qu’arrive-t-il lorsqu’un groupements hydrophobe est présent dans l’eau?
un groupement hydrophobe ne peut pas former de ponts hydrogènes
avec l’eau
• réduction du nombre de ponts hydrogènes pour l’eau environnante.
∘ énergétiquement non favorable
• pour compenser, les molécules d’eau deviennent plus ordonnées et
forment de meilleurs ponts hydrogènes
∘ cause une légère augmentation de l’enthalpie (non favorable)
∘ cause une importante diminution de l’entropie (non favorable)
Les interactions hydrophobes sont le résultat…
Pourquoi?
du système qui minimise les pertes d’énergie
Groupement hydrophobes s’assemblent
- > Minimise l’exposition à l’eau
- > Augmentation des ponts H pour l’eau
- > augmentation de la mobilité de l’eau
