La flexibilité et la dynamique des protéines Flashcards
Vrai ou faux
Les protéines sont rigides
Faux
Quelle est l’échelle de temps des vibrations?
10^11-10^14 S^-1
comment peut-on décrire les mouvements locaux des protéines?
Rapide et non-corrélés
Vrai ou faux
Les mouvements moléculaires sont peu caractérisés
Faux, bien
Vrai ou faux
Plusieurs techniques peuvent être utilisées pour sonder les mouvements
Vrai
Quelle méthode permet de quantifié l’amplitude et l’échelle de temps d’un mouvement?
La RMN
Les mouvements locaux se produisent dans…
Toutes les protéines
Les mouvements plus larges sont…
Plus rares, plus spécifiques à une protéine et possèdent des échelles de temps variées
Vrai ou faux
les mouvements rapides sont moins spécifiques
Vrai
Vrai ou faux
Les mouvements rapides sont plus similaires entre les différentes protéines
Vrai
À quel niveau sont souvent importants les mouvements lents?
Su niveau fonctionnel
____, _____ et ______ des mouvements lents varient considérablement entre les différentes protéines
La présence, l’échelle de temps et l’amplitude
Quel est le rôle de la charnase?
Quel type de mouvement effectue cette protéine et pourquoi?
Catalyse la dégradation de l’ARN en éléments plus petits
Implique un mouvement de charnière au niveau du feuillet B pour positionner les boucles aux extrémités pour la catalyse
À quoi sert la protéine G?
Quel mouvement son domaine B1 effectue?
Petite protéine permettant le transfert d’informations à l’intérieur de la cellule
Mouvement lent corrélés dans le feuillet B
-> mvmt de flexion localisés du côté des interactions avec partenaires
Quel mouvement effectue l’ubiquitine?
fluctuation lente d’une boucle
Vrai ou faux
Les mouvements lents sont différent dans différentes protéines
Vrai
_____ et _____ des mouvements lents sont reliés à la fonction
La localisation et l’échelle de temps
De quoi dépend la population de chaque conformation d’une protéine?
la différence en énergie libre
Vrai ou faux
L’état fondamentale ne représente que la conformation la plus stable d’une population de conformation d’une protéine
Faux, correspond à un ensemble de plusieurs conformations :
- La majorité près de la conformation de plus basse énergie
- certaine près de la conformation activée
Par quoi autre que la réaction chimique peuvent être limité les vitesses de réaction d’un système?
Par les vitesses de changement conformationnel
Qu’arrive-t-il lorsqu’un enzyme a une trop grande ou un manque de flexibilité?
trop grande = enzyme instable
manque = Catalyse trop lente
