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MMD1042 > Structure de la chromatine/épigénétique > Flashcards

Structure de la chromatine/épigénétique Flashcards

1
Q

Quelles sont les 3 caractéristique de la strucutre hélicoïdale de l’ADN

A
  1. Structure en double hélice
  2. Chaque chaine d’ADN est orienté de 5’ vers 3’
  3. Les brins sont antiparallèles et complémentaires liés par les paires de bases A-T et G-C
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Q

De quelle facon est organisée l’information génétique

A

Organisée en gène
Les gènes se trouvent organisés sur les chromosomes

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3
Q

À quel moment les chromosomes deviennent ils visibles

A

Lors de la mitose et de la cytocinèse; ils sont super condensé

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4
Q

Quel est la longueur de l’ADN dans le noyau

A

3 mètre d’ADN dans un noyau de 10 micromètres

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5
Q

Combien avons nous de chromosomes dans les cellules germinales et somatiques

A

Cellules germinales: haploïde
- 22 autosome
- 1 chromosome sexuel/gonosome (X ou Y)

Cellules somatiques: diploïdes
- 22 paires d’autosomes (chromosomes homologues)
- 1 paires de chromosomes sexuels/gonosomes (XX ou XY)
- 23 paires de chromosomes/46 chromosomes
- 6 millards de paires de bases
- 30 000 gènes

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6
Q

Définis le caryotype

A

Organisation des chromosomes homologes numérotés et placés en ordre selon une entente internationale, lorsque la cellule est en mitose et que les chromosomes sont condensés

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7
Q

Définis le chromosome

A

Longue structure en forme de filament composé d’ADN de séquence unique et associé à des protéines

Formé d’une seule longue molécule d’ADN linéaire fortement condensé pendant la division cellulaire

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8
Q

Que contiennent les chromosomes

A

Contiennent l’information génétique d’un individu sous forme de gènes (sauf l’ADN mitochondrial)

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9
Q

Définis centromère

A

Région qui unit les chromatides soeurs pendant la division et utilisé pour la ségrégation des chromatides vers les pôles de la cellule pendant la division cellulaire pour diriger de faon équilibrée les chromatides dans les deux cellules filles
PAS DE GÈNE

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10
Q

Définis le télomère

A

Séquence répétée de nucléotides au bout des chromosome qui permet de préserver le matériel génétique lors de la réplication de l’ADN

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11
Q

Définis l’interphase

A

Phase du cycle cellulaire pendant laquelle la cellule n’est pas en division (croissance cellulaire et réplication de l’ADN)

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12
Q

Définis le chromosome homologue

A

Une des deux copies d’un chromosome dans une cellule diploïde; une copie vient du père, l’autre de la mère

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13
Q

Définis un chromatide

A

Copie d’un chromosome répliqué et qui est ENCORE attaché à sa chromatide soeurs par son centromère lors de la division cellulaire

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14
Q

Définis la chromatine

A

Complexe formé d’ADN, d’histones et de protéines non-histones présent dans le noyau des cellules eucaryotes

La chromatine est le matériel composant les chromosomes, qui eux sont visibles pendant la divison cellulaire

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15
Q

Quel est le role de la chromatine

A

Permet le packing de l’ADN de 3m dans un noyau de 10 micromètres

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16
Q

De quoi sont composées les fibres de chromatine de 11nm et de 30nm

A

11nm: épaisseur de l’enroulement de l’ADN autour des histones
30nm: épaisseur de l’état NATUREL de l’ADN enrouée de protéines pendant l’interphase

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17
Q

Quelle est la longueur d’un chromosome déplié

A

5cm

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18
Q

Qu’est-qu’un nucléosome

A

unité de base d’organisation de la chromatine composé d’un segment d’ADN entouré d’un complexe protéique d’histones (histones H2A, H2B, H3, H4; en paires)

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19
Q

Quels sont les différents niveau de condensation de la chromatine

A

fibres de 11nm: épaisseur de l’enroulement de l’ADN autour des histones
fibres 30nm: épaisseur de l’état NATUREL de l’ADN enrouée de protéines pendant l’interphase

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20
Q

Quels sont les histones formant le nucléosomes

A

viennent en paire
H2A
H2B
H3
H4

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21
Q

Quelle est la charge des histone et pourquoi sont elles chargées ainsi

A

Chargées POSTIVEMENT
- permet la solidité du nucléosome et la liaison avec l’ADN parce que l’ADN est chargée négativement

22
Q

Quelle est la longueur du segment d’ADN d’un nucléosome

A

147 pb

23
Q

Qu’est-ce qui forme le noyau protéique du nucléosome

A

Octamère formé de 2 copies de chaque histones: H2A, H2B, H3, H4

24
Q

À quoi sert l’histone H1

A

Permet de lier l’ADN pour forcer son rapprochement en entrant et sortant du nucléosome sur une trentaines de pb pour limiter leur mouvement et sceller le complexe nucléoprotéine
Permet de compacter l’ADN

25
Q

Combien de tour d’ADN est enroulé dans un nucléosome

A

environ 2 tour: 1,67 tours d’ADN

26
Q

Quels sont les deux niveaux de condensation de la chromatine et décris les

A

Hétérochromatine: zone plus condensée de la chromatine et donc peu accessible
- contient peu de gènes
- contribue à la répression des gènes
- ex: télomère et centromère

Euchromatine: zone plus lâche de la chromatine et donc plus accessible
- permet la transcription des gènes; contient des gènes

27
Q

À quels moments du cycle cellulaire retrouve t on l’hétérochromatine et l’euchromatine

A

Hétérochromatine: mitose et interphase
Euchromatine: interphase

28
Q

Quels sont les deux moyen que possède la cellule pour modifier l’état et la condensation de la chromatine

A
  1. Complexe de remodelage de la chromatine qui modifie la position de l’ADN enroulé autour des nucléosomes
  2. Modifications chimiques réversibles affectant les histones (méthylation, acétylation, phophorylation) et l’ADN (méthylation)
29
Q

Décris le complexe de remodelage de la chromatine

A

Modification de la position de l’ADN enroulé autour nucléosome permettant de donner lieu a une condensation ou une décondensation de l’ADN après un glissement des nucléosome
- la surface de 147pb couvertes par les histones ne changent pas

30
Q

Explique le fonctionnement du complexe de remodelage de la chromatine

A
  1. l’hydrolyse de l’ATP permet à un complexe de remodelage de déplacer l’ADN autour des nucléosomome et de la décondenser
  2. protéine liant l’ADN peuvent venir se fixer après le glissement pour exercer leur fonction
  3. complexe de remodelage utilisant l’ATP va reprovoqur le glissement des nucléosome pour modifier la position de l’ADN et la recondenser
31
Q

Quel élément est indispensable pour modifier la position de l’ADN autour des nucléosomes

A

énergie de l’ATP

32
Q

Comment l’énergie de l’ATP est-elle utilisée par le complexe de remodelage de l’ADN

A

Il faut plusieurs cycle d’hydrolyse pour permettre au nucléosome de faire un déplacement

33
Q

De quelle facon les modification chimiques réversibles affectant les histones ou l’ADN sont-elles héritables

A

La transmission de ces modification contribue à l’épigénétique

34
Q

Quelles sont les modifications chimiques réversibles possible affectant les histones et quelles parties des histones sont atteintes par ces modifications

A

Méthylation (condensation et décondensation)
Acétylation (décondensation)
Phosphorylation (décondensation)

Affectent la queue N-terminales des histones

35
Q

De quelle façon l’acétylation modifie t elle les histones et comment est-ce réversible

A

Ajout du groupement acétyle neutralise les charges positives des histones sur ls résidus de lysine (L) et d’arminien (A)
= DÉCONDENSATION DE LA CHROMATINE

Réversible: groupe acyle enlevé permet la condensation

36
Q

Quelles enzymes permettent l’ajouts et le retrait des groupes acétyles lors de l’acétylation

A

Ajout: Histone acétyle transéfrase
Retrait: Histone déacétylases

37
Q

De quelle façon la phophorylation modifie t elle les histones et comment est-ce réversible

A

Ajout de groupement phosphate sur les résidus de serine, thréonine et tyrosine qui augmente les charges négatives sur les histones, qui empêchent l’enroulement de l’ADN autour des histones
= DÉCONDENSATION DE LA CHROMATINE

Réversible: retrait des groupement phosphate pour la condensation

38
Q

Quelles est la conséquences de la phosphorylation des histones

A

Le groupement phosphate de l’ADN interagit moins fortement avec les histones + car ils contiennent des charges négatives aussi

39
Q

Quelles sont les deux enzymes permettant la méthylation et sur quels résidus des histones

A

Méthylation de la lysine (L)
- enzyme: protéine lysine méthyltransérase (PKMT)

Méthylation de l’arginine
- enzyme: arginine transferase

40
Q

Quelle augmentation cause la méthylation

A

augmente l’hydophobicité

41
Q

De quelle façon la méthylation modifie t elle les histones et comment est-ce réversible

A

Ajout de groupe méthyle à la lysine ou l’argine qui provoque la condensation ou la décondesnation de la chromatine
= répression ou transcription des gènes

Réversible: lorsque les groupes méthyle sont enlevés

42
Q

Donne 2 exemples de méthylation et leur effet

A

Triméthylation de l’histone H3 sur la lysine 4 (H3K4me3): augmente la transcription
- régulée à la hausse dans l’hypocampe après un conditionnement contextuel de la peur chez les rats

Diméthylation de l’histone H3 sur la lysine 9 (H3K9me2): répression du gène
- régulée à la hausse après un conditionnement à la peur

43
Q

Décris la méthylation de l’ADN et comment c’est réversible

A

Méthylation des cytosines de l’ADN qui augmente la condensation de l’ADN et donc diminue l’accessibilité au gènes = répression de la transcription

Réversible: retrait des groupes méthyle de la cytosine

44
Q

Quels sont les CpG islands et comment agissent-ils sur les promoteurs

A

Régions riches en C et G en amont de promoteurs
- méthylation des cytosines condense l’ADN et fait en sorte que les promoteurs sont réprimés

45
Q

Qu’est-ce que l’épigénétiques

A

Changement héritables de l’expression des gènes ou phénotypes sans changement de la séquence d’ADN

46
Q

Quelles modification de la chromatine peuvent transmis par épigénétique et comment les nomme-t-on

A

Méthylation des cytosines

Modification chimiques réversibles affectant les histones

Ce sont les MARQUES ÉPIGÉNÉTITQUE

47
Q

Comment la méthylation des cytosines est transmises aux cellules filles

A

Par les méthylases de maintien qui après la réplicaiton de l’ADN vont copier le patron de méthylation du vieux brin sur le nouveau brin

48
Q

Qu’est-ce que étudie l’épigénétique

A

Étudie comment l’environnement et l’histoire individuelle influent l’expression des gènes via des modification (marque épigénétique) réversibles ou transmissibles d’une génération à l’autre sans altération/changement des séquences nuclotidiques de l’ADN

49
Q

Quels peuvent être les effets des marques épigénétiques

A

Joue un role dans le développement du cancer, le vieillissement et la longévité

Explique pourquoi en vieillissant de vrais jumeaux ne vont plus se ressembler

50
Q

Quel facteur peut entraine des marques épignétiques et quels sont ses effets sur la progéniture

A

Le style de vie comme l’Activité physique
- modifie entre autre l’épigénie des cellules reproductrice et peuvent avoir un effet sur la santé des générations futures (risque de maladies: obésité, infertilité)

51
Q

Quel est le lien entre nourrisson et épigénétique

A

Nourrisson qui ont peut été touché par les soignâtes montrent une plus grande détresse infantile associée à leur épigénétique

MMD1042 (31 decks)

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