ARN non-codant Flashcards
Qu’est-ce qu’un ARN non-codant
ARN fonctionnel qui est rancir mais pas traduit en protéine
Quelles sont les 2 classifications de l’ADN dans le génome
Séquence utiles correspondant au gènes
- 10/20% du génome - 1,5/2% exons
Séquences intergéniques (inutile/junk)
- 80/90% du génome
- large portion sont des séquences répétées
Quelle est le % du génome transcrit, le nombre de gène qui codent pour une protéine et le nombre de long ncRNA et de miRNA
70% du génome est transcrit en ARN
30 000 gènes codent pour protéines
150 000 lncRNA
400 à 600 miRNA
Quels sont les types de ncRNA qui régulent l’expression des gènes
miRNA
siRNA
lncRNA
Quelles sont les ARN d’interférence (RNAi)
miRNA
siRNA
Qu’est-ce qui distingue les miRNA des lncRNA
miRNA: moins de 200 nucléotides
lncRNA: plus de 200 nucléotides
Comment les miRNA, les siRNA et lncRNA agissent sur l’ADN
- régulent l’expression des gènes au niveau transcriptionnel, post-transcriptionnel et au niveau de l’épissage du pré-ARNm
- participent à la formation de l’hétérochromatine, de la modification des histones, du ciblage de la méthylation et du silençage des gènes
- jouent un role dans diverses pathologies comme le cancer
- impliqués dans des phénomène épigénétiques
Qu’est-ce que l’épigéntiques
Changement dans l’expression des gènes sans changer la séquences d’ADN; transmissible de facon hériditaires
- role dans l’établissement maintien du type cellulaire (du type de tissu)
Quelle est le role des ARN d’interférence (iRNA = miRNA et siRNA) et comment fonctionnent ils
Joue un role dans la défense des cellules contre les séquences nucléotidiques parties (virus ou transposons)
iRNA est un processus biologiques dans lequel les molécules d’ARN inhibent l’expression ou la traduction des gènes en neutralisant l’ARNm ciblées
siRNA synthétiques introduit dans les cellules peuvent inhiber de manière sélective et robuste l’expression des gènes d’intérêt spécifique
Décris les miRNA (longueur, chez quel organisme, fonction, ciblage, conservation)
- séquence de ARNnc environ 22 nucléotides
- se trouvent chez la plupart des mammifères, certains virus, plantes
- réguler l’expression des gènes au niveau post-transcriptionnelle
- cible 60% des gènes humains
- sont conservés entre les espèces illustrant leur fonction importante
Quel est le role de la plupart de miRNA et comment se fait se role
La plupart des miRNA inhibe l’expression génique des ARNm
Les miRNA fonctionnent via l’appriement de bases avec les séquences complémentaire au sein de la molécule de ARNm cibles
Quelles sont les 3 fonctions des miRNA
Permettent de silenciées les molécules d’ARNm ciblées (auxquelles elles sont appariées) de 3 facons
- Clivage de la molécule d’ARNm en deux
- Déstabilisiation de l’ARNm par clivage de la queue poly-A: incite les nucléaires à dégrader l’ARNm
- Réduction de l’efficacité de la traduction des ARNm en protéines: ralenti/bloque la synthèse protéique par le ribosome
Lors que la biogenèse des miRNA quels brins sont formés et comment
miRNA: brin guide
miRNA*: brin passager
Étape du DINCING: Dans le cytoplasme, pré-miRNA est modifié par dicter qui couple l’épingle à cheveux de la tige boucle (endonucléase) pour donner 2 complexes de miRNA de 22 nucleotides de long
Décris brièvement le mécanisme d’action rendant les 2 brins de miRNA fonctionnels
- Les miRNA s’associent à une protéine Argonaute (Ago) qui choisi un seul brin (brin guide)
- D’autres protéines + Ago et le miRNA forment le complexe RISC (RNA-induced silencing complex/complexe miRNA ribonucléoprotéine)
- Dans ce complexe, miRNA et sa cible de ARNm interagissent
Pourquoi la protéine Ago est-elle indispensable au complexe RISC
Permet de lier le mRNA mature pour que ce dernier puisse guider RISC vers le bon ARNm cible
Quels sont les 5 mécanisme d’actions du complexe RISC pouvant agir sur ARNm
- Appariement étendu (presque parfait) du miRNA sur ARNm pour cliver l’ARNm en deux (SLICING) par la protéines Ago
- Appariement pas extensif (imparfait/partiel/réduit - 8 nucléotides) du miRNA sur l’ARNm et séquestration dans des P-Bodies
- Ago ne coupe pas l’ARN mais inhibe la traduction qui va être déstabilisée
- les ARNm vont être séquestrés dans des structures cytosoliques appelées P-Bodies (Processing bodies) où a lieu la dégradation des ARNm
- P-Bodies: structure dynamique qui contient l’enzyme Dcp1 (décaping enzyme) et des enzyme de dégradation des ARNm - miRNA partiellement complémentaire peuvent inhiber l’initiation de la traduction de l’ARNm cible en se liant au début du ARNm
- miRNA partiellement complémentaire peuvent accélérer la déadénylation (dégradation de la queue Poly-A) et entrainer la dégradation précoce du ARNm
- miRNA peuvent parfois provoquer la modification des histones et la méthylation de l’ADN des sites promoteurs qui affectent l’expression des gènes cibles
Qu’est-ce qu’un P-Body
Structure cytosolique qu permet de dégrader les ARNm dont la traduction est inhibée via des enzymes comme la Dcp1 et des enzymes de dégradation des ARNm
Qu’y a t il de spéciale abec la protéine Ago2
Permet de cliver directement l’ARNm cible chez l’humain
Résume les étapes de la biogenèse
- Transcription du miRNA par l’ARN polymérase II + maturation ( donne le pri-miRNA)
- Cropping: complexe Drosha (enzyme)/Pasha (DGCR8 - reconnaissance) =mircoprocessueur; clive le pri-miRNA pour donner des pré-miRNA avec 2 extrémité 3’ non apparié
- Export: exportine-5 permet export des pré-miRNA à l’extérieur du noyau par reconnaissance des extrémités 3’ (dépendant de RAN-GTP)
- Dicing: protéine Dicer clive la tige boucle des pré-miRNA pour former deux miRNA (guide et passager)
- Association du brin guide de miRNA par Ago et formation du complexe RISC
Qu’est-ce que le complexe RISC
RNA-induced silencing complexe
Complexe miRNA ribonucléoprotéine
- contient des enzymes dont Ago qui s’associent au miRNA et qui permettent d’agir sur la molécule de ARNm
Combien de nucléotides contiennent les lncRNA
plus de 200 nucléotides
Quelles sont les 4 caractéristiques des lncRNA
- exprimés plus faiblement que les gènes codants pour des protéine
- Expression remarquablement spécifique à certains types de tissu
- Enrichis dans le noyau
- Montre une faible conservation se séquences même si certains le sont
Comment sont définis les gènes des lncRNA
Définis par leur position relative au gènes situés à proximité; régulent l’expression des gènes codants; n’agissent pas sur la synthèse protéique
