Stoffe Flashcards

1
Q

Woraus besteht Biochemie? (6)

A

Struktur: Funktionelle Gruppen

Reaktivität: Stoffeigenschaft

Stoffliche Umwandlung: Prozess

Regulation: Änderung

Wechselwirkung (WW): Interaktion

Katalyse: Umsetzung

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2
Q

Bindungstypen

A

Kovalente Bindung

Elektrostatische/ionische WW

Wasserstoffbrücken Bindung (WBB)

Van der waals Kräften (VdW)

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3
Q

Kovalente Bindung

A

Die bindungslänge ist definiert

Stärkster Bindungstyp

Kaum variabel

Bsp H-CH3

200-500 kJ/mol

Iris: Bildet sich wenn sich zwei benachtbarte Atome ein Eklektonenpaar teilen =Einfachbindung. Oder zwei Paare= Doppelbindung

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4
Q

Elektrostatische/ionisierende WW

A

Abstoßend oder anziehend

Kraft steigt distanzabhängig: D x r^2 (D= Dielektrizitätskonstante) -> cloulomb Gesetz

-> sinkt mit steigendem Abstand.

WW im Wasser schwächer, Vakuum als Ausgangsmedium
-> WW von Medium abhängig

Bsp: NaCl-lösung

Stärke als WBB

10 -30 kJ/mol

Iris: Kraft ist Distanzabhämgig und sinkt mit steigendem Abstand.

Ist D groß, ist die Wechselwirkung schwach

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5
Q

WBB

A

Wasserstoffbrücken Bindung

Donor + Akzeptor

(1nm = 10Å : bindungslänge)

Der Winkel ist schräg, da abhängig von den “elektronenwolken”(Miky Mouse Ohren): bei wasser!!!
-> Distanz und winkelabhängig

Wie ionische WW

Bsp: H3C-OH-OH2

10-30 kJ/mol

Iris: Wasserstoffbrücken haben das bestreben, eine gestreckte Form anzunehmen, sodass Donor, Wasserstoff und Akzeptor auf einer Linie sind.
4-20 KJ mol

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6
Q

VdW

A

Van der waalskräfte

Dipol geht von delta+ -> delta-

Massepotential: Abstand, kontaktverhältnis

Je größer die Distanz, desto schwächer die Wirkung

Stärke wird aufsummiert (Gekko,Klettverschluss)

Schwach

Bsp. Ar-Ar

1-4 kJ/mol

Iris: Durch unsymetrische Ladungsverteilung innerhalb eines Atoms

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7
Q
  1. HS der Thermodynamik
A

Energieerhaltungssatz:
Die gesamtenergie (U) eines Systems und seiner Umgebung sind konstant.
Energie kann weder erzeugt noch vernichtet werden.

  • U: Potential, Wirkmächtigkeit, Größe
  • System: Innen
  • Umgebung: Universum
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8
Q
  1. HS der Thermodynamik
A

Ein spontaner Prozess verläuft immer in Richtung größtmöglicher Unordnung im Universum.

  • spontan: von alleine (Papier und Feuer-> Flammen
  • Unordnung: Anzahl energetisch äquivalenter Möglichkeiten W, in der die Komponenten eines Systems angeordnet werden können (Entropie).
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9
Q

Unordnung

A

Entropie:
S = k_B ln(W)

  • Einheit [J/K]
  • k_B: Bolzmann-Konstante
  • S= schlampig (? gizem)
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10
Q

Wärmegehalt

A

Freie Enthalpie G:
DeltaG = delta H -T×deltaS

  • H: Enthalpie, Hitze, Energie, die aufgewendet wird
  • G: gibbsche Energie/freie Enthalpie->(Hitze)gehalt
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11
Q

Exergoner Vorgang

A

DeltaG < 0

  • Spontaner verlauf
  • Freie Energie ist kleiner als 0
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12
Q

Endergoner verlauf

A

DeltaG > 0

  • spontane Rückreaktion
  • Freie Energie größer als 0
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13
Q

Hydrophober Effekt

A

Wassermoleküle gruppieren sich um gelöste apolare (hydrophobe) Stoffe
-> zusamenlagerung der gelösten moleküle, umschließen mit wassermolekülen,u
Umschließenden Oberfläche wird geringer-> Entropie Gewinn, da mehr freie wassermoleküle

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14
Q

Wasserliebend

A

Polar

Hydrophil

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15
Q

Wasserabstoßend

A

Apolar, hydrophob

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16
Q

Sowohl wasserliebend als auch wasserabstoßend

A

Amphiphil

-> Micellen, Bilayer -> Ausbildung durch hydrophoben Effekt

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17
Q

pH

A

pH = -log[H+]

Mit pH Wertänderung von 1 änder sich [H+] um 10ner Pontenz

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18
Q

säuredissoziationskonstante

A

pK(a) = -logK(a) = pK_s

  • Je 0,5 protoniert/deprotoniert
Niedriger pK(a): mehr protonierte Form
Und andersherum
19
Q

Wozu dient ein Protonengradient?

A

Als energiespeicher

20
Q

Beispiel für Entropie getriebenen Prozess

A

Feuer an Papier halten-> Papier geht in Flammen auf

21
Q

Was bedeutet:

DeltaG = deltaH _system - T×deltaS_system < 0

A

Exergoner prozess, läuft spontan ab

22
Q

Was bedeutet DeltaG in BC?

A

Gibbsche freie Energie-> wärmegehalt

23
Q

Formel für pH

A

pH = -log×[H+]

-> bedeutet 10x mehr H+ bei pH6 vgl zu pH7, 100x mehr H+ zu pH5

Kann verändert werden durch:

  • Temperatur
  • Ionenstärke
  • Mikroumgebung( zb durch Ladungsstabilisierung durch andere Stoffe)
24
Q

Was ist wenn pH = pK_s?

A

[H+] = [OH-]

25
Q

Puffer

A

Im pufferbereich verändert sich das verhältnis pH=pK_s über einen längeren Zeitraum nur geringfügig.
Reines wasser verändert den pH sofort, abr mit aceton/Essig in bestimmtenpH-Bereich kaum veränderung.

HA + H2O H3O+ +A-

K_s = [H+] = [A-]/[HA]

pK_a = -logK_a
pH = -log[H+]
-> logK_a = log[H+] + log([A-]/[HA])
-> pH = pK_a + log([A-]/[HA])

Wenn pK_a =pH, dann log=1
Bei 10×[HA] =[A-] -> log = -1

Puffer: pH = pK_a +/- 1

Zb aminogruppen

26
Q

Wieso sind nur ein paar Elemente relevant für unseren Körper? Bzw was macht diese Elemente aus?

A

Bioverfügbarkeit und löslichkeit

Grundelemente (96%)
Mengenelemente (3%)
Spurenelemente (<0,1%)

27
Q

Beispiele für Molekülklassen

A

Aminosäuren
Kohlenhydrate Proteine
Lipide

BC: betrachten des Aufbaus und der Eigenschaften

28
Q

Entropie

A

S - Unordnung

29
Q

Enthalpie

A

H - Wärmegehalt

30
Q

Wie fkt. ein Puffer?

A

pH-Wert ändert sich nur unmerklich bei Säure/base-Zugabe

Puffer = Säure + Säure-Anion

  • es entsteht ein GGW, das sich bei Säure/Basen-Zugabe ausgleicht

Puffer: zB Essigsäure + H20 EssigSäure-Anion + H30+

31
Q

Henderson-Hesselbach-Gl

A

Puffergelichung

beschreibt ein Säure-Base-Gleichgewicht einer teilweise dissoziierten, also schwachen Säure oder Base in wässriger Lösung

pH = pKs + log[A-]/[HA]

32
Q

Die funktionellen Gruppen

A

siehe Bild

33
Q

Was sind Resonanzstrukturen?

A
  • Darstellung realistischer Bindungsverhältnisse
  • kovalente Bindungen
  • elektronen können über mehrere Atome verteilt werden
34
Q

Was ist eine elektrostatische WW

A

anziehende Kraft zwischen zwei ungleichgeladene Atome

Salze we NaCl

35
Q

Warum ist Wasser ein Lösungsmittel für so viele biologische Moleküle?

A
  • biolog. Moleküle haben polare Eigenschaften
  • Wasser sehr polar
  • kann mit anderen polaren Molekülen konkurrieren
  • schwächt WBB und elektrostatische WW
  • O-Atom Akzeptor
  • H-Atom Donor
36
Q

Auswirkungen vieler vdW WW

A

Gesamtinteraktion zwischen zwei sehr großen Molekülen stabilisieren

vdW-WW an Grenzfläche

37
Q

Wenn die meisten Proteine einer Zelle von Wasser umgeben sind, welche funktionelle Gruppe erwarten Sie an der Oberfläche ienes wasserlöslichen Proteins?

A

Polare funktionelle Gruppen und geladene Aminosäuren

unpolare Seitenketten aggregieren sich zum Zentrum des Proteins

38
Q

Wenn der 1. HS der Thermodynamik wahr ist, wie können biologische Prozesse ablaufen?

A
  • Energie in versch. Formen
  • Wärme, chemische Energie
  • Energiespeicherung in chem. Bindungsenergie
  • Nutzung zur Arbeitsverrichtung
39
Q

Wie können Zellen exisitieren wenn der 2. HS der Thermodnamik

A

Entropie im lokalisierten System erniedrigt

Entropieerhöhung eines größeren Systems

Universum

40
Q

Beispiel Entropie-getriebener Prozess

A

Mischen von zufälligen Atomen

Mischen verschiedener Gase

41
Q

∆G = ∆H_system -T∆S_system < 0

A

Änderung der freien Energie muss negativ sein, damit eine Reaktion spontan verläuft

Nur unter diesen Umständen kann die Gesamtentropie ansteigen

42
Q

Bedeutung von ∆G in der Biochemie

A
  • Gibbs freie Energie
  • Änderung der freien Energie
  • gibt an ob Prozess spontan oder nicht spontan verläuft
  • negativ – spontan
  • positiv – nicht spontan
43
Q

Welche thermodynamischen Änderungen der freien Energie begleiten die Proteinfaltung?

A

Kombination