Semaine3 Flashcards
Qu’est-ce que l’ADN?
Long polymère (sucre et groupe photophore. Lié à ce squelette il y a des bases qui deviennent des monomères = nucleotides code pour information génétique
De quoi est composé les squelette sucre-phosphate?
Base
Ribose
Phosphate
Quelle est la différence entre le déoxyribose et le ribose? Dans l’ADN comment se nomme t’il?
On a enlever un oxygène
Acide déoxyribonucléique
Nomenclature du ribose ?
Carbone 1,2,3,4,5 (commence en haut et sens aiguille d’une montre)
Dans quelle direction on dessine l’ADN ?
5´->3´
Quels sont les différentes base de l’ADN?
-adénine
-Guanine
-Thymine
-Cytosin
Quelle molécule est commune à l’Adenine et la Guanine?
La purine
Quelle est la molécule commune à la thymine et la cytosine?
La pyrimidine
Quelle molécule est la plus grande entre la purine et la pyrimidine?
La purine
Qu’est la différence entre l’adénosine et l’adénine?
L’adénine est une base alors que l’adénosine est un nucleoside.
L’adénosine c’est une adénine avec un ribose dans l’ARN ou desoxyribose dans l’ADN
Quelle est la différence entre un nucleoside et un nucleotide?
Nucléoside:
- base azotée (purine ou pyrimidine) liée à un sucre (ribose dans l’ARN ou desoxyribose dans l’ADN)
Nucléotide:
-composé de trois éléments : un nucleoside auquel est ajouté un plusieurs groupes phosphate.
(Base azotée+sucre+ un ou plusieurs groupes phosphate))
Qu’est-ce qui est les briques de base de l’ADN et de l’ARN?
Les nucleotides
Quel est le nom du nucleoside avec la base Guanine?
Guanosine
Quelle est la différence entre les base Guanine et adénine
Les substituants sont un peu différent, il y a un oxygéne chez Guanine
Quel est la nucleoside de thymine?
Cbm a t’il d’atome d’oxygène?
Thymidine
Il a 2 atomes d’oxygène
Quel est le nom du nucleoside de la cytosine ? Cbm a t’il d’atome d’oxygène?
Cytidine
À 1 atome d’oxygène
Qu’est-ce qu’un nucleotide diphosphate?
Un nucleoside avec 2 phosphates
(Ribose ou deoxyribose+ base)
Par quelles liaisons sont liés les nucleotides?
Des liaisons phosphodiesters
Par quoi sont formés les liaisons phosphodiesters?
Les 3’-hydroxyles et les 5’-hydroxyles
Motif alternant résidus de sucre et de phosphate.
Squelette sucre-phosphate
Pourquoi écrit on une séquence ADN dans la direction 5’->3’?
Le polymère a une polarité
Cbm de nucleotides y’a t’il dans le génome humain?
3 milliards de paires de base
Quelle est la longueur de l’ADN?
30 cm étiré
Dans cbm de chromosomes sont organisé les 3 milliards de nucleotides?
Organisé en 23 chromosomes
Qui et quand a découvert l’ADN?
Friedrich Miescher en 1869
Comment Friedrich miescher a découvert l’ADN?
Il avait mis les nucleus des cellules leucocytes dans une solution basic et ensuite les faire précipiter avec une solution acide
Qui a découvert la structure chimique des nucleotides en 1940?
Alexander Todd
Quelle est le ratio A:T et G:C
Pk?
Proche de 1
Car 1 purine est complémentaire à un pyrimidine
Comment trouve t’on la structure tridimensionnelle d’une protéine?
Cristallographie par rayons X
(Cristaux/diffraction/ calcul structure)
Comment fait on les diffraction de rayons X?
Par une fibre d’ADN
Quelle est la structure de l’ADN?
Structure hélicoïdale
L’ADN se répète avec quelle longueur?
Unité de 3.4Å
Les bases irrégulières sont à l’extérieur de l’hélice?
Non sinon charge négatif des phosphores ferait un répulsion électrostatique
Ou se situe les squelettes sucre-phosphate dans l’ADN?
À l’extérieur, pas de répulsions électrostatique
Par quelles liaisons sont assemblées les paires de bases (G-C,A-T), purine-pyrimidine?
Par des liaisons hydrogène
Comment une structure de l’ADN aussi régulière est capable de s’accommoder si les bases à l’i gerieur sont si différentes?
Structure régulière car G-C et A-T sont de la même longueur. Cela maintient une distances constante entre les deux brins d’ADN
Cbm vaut l’énergie d’une liaison hydrogène?
1-5kcal/mol
Quel est le sens d’enroulement de la double hélice du DNA?
-droite
Dans l’ADN qu’est-ce qui est à l’intérieur et à l’extérieur?
Les bases sont à l’intérieur et les phosphates et les deoxyribose à l’extérieur
À cbm de nucleotides la structure hélicoïdale se répète? Quelle longueur environ?
Tout les 10 nucleotides donc 34 Å
Quelle est le diamètre de l’hélice?
20Å
Quelle est la dimensions des liaisons d’hydrogène?
2.8 à 3.0 Å
Quelles est la distance moyen des des sucres?
11Å
Quelle est la longueur d’une double helice avec deux brins de 100 nucleotides?
3.4 X 100 = 340 Å = 34 nm
Pk l’ADN répète un sillon plus grand et l’autre plus petit?
C’est la position des riboses qui l’influence. Accroche aux Azote à l’extrémité les deux regardent vers le bas et donc ce sillons sera plus petit
Quelle copying machanism parle Watson et Crick ?
La structure ADN propose un stratégie pour copier le matérialisme génétique. Si on connaît un brin on connaît le brin complémentaire.
Cbm de matrices peut former la séparation de deux brins?
2 matrices
Avec 2 matrices cbm de nouvelles double hélices peuvent être synthétisées?
2 nouvelles doubles hélices
Comment est ce que les brins de la double hélice peuvent être séparé?
Chaleur
Acide (pH)
Comment Mattew Meselson et Franklin Stahl on vérifier si l’hypothèse que la séquence d’un brin de la double hélice permet de déduire la séquence de l’autre brin est correcte?
- Marquer l’ADN de bactérie parental avec l’isotope 15N
- Transférer les bactéries brusquement dans un milieu avec 14N
3.analyser la distribution de 15N et 14N
- Grâce à la centrifugeuse et le chlorure on trouve le poid de l’ADN, et plus les génération avançais plus on trouvait du 14
Grâce à quelle énergie les brins sont dissociés par des enzymes dans les cellules?
Hélicase
Les bases forment des doubles hélices absorbant moins de lumière que les brins séparés?
Vrai
À quelle longueur d’onde l’a sorption de la lumière est maximale?
260nm
Est-ce que la dénaturation de l’AD. est réversible?
Oui on peut revenir en arrière avec l’hélice dénaturée grâce a l’hybridation et la renaturation
Comment s’appelle quand des brins complémentaires séparés peuvent se lier ?
L’hybridation
Grâce à quelle enzyme l’ADN est répliqué?
L’ADN polymérisé
Quelles réactifs sont necessaire pour la réplication de l’ADN?
-matrice
-amorcé de l’ADN
-deoxinucleotides 5’-triphophate
-ADN polymérase
Cbm d’erreurs est-ce que la DNA polymerase fait?
1 erreurs pour 10^8 etape
Quelle autre fonction l’ADN polymerase a ?
Proof-reading, corrigé les fautes
Quels sont les 3 étapes de la séquence de l’ADN pour copier des séquences de l’ADN au laboratoire avec l’ADN polymerase?
- Hybridisation de l’amorce
2.polymerase, nucleotide - Dénaturation (T= 94°C)
Comment peut on produire de plus grandes quantité d’ADN?
Grâce à l’amplification des séquences de l’ADN par la «polymerase chain réaction» (PCR)
Quelles sont les étapes d’amplification des séquences d’ADN? (PCR)
- Dénaturation
- Hybridation
- Élongation
Chaque cycle multiplie comment les copies d’ADN?
2 ^ cycles
Cbm de bases codent les groupent des aminoacides?
3
Cbm de triplets de bases différentes sont possibles?
4^3=64
Le code génétique est universel?
Presque
Quelle est la différence entre le DNA et le RNA?
Le sucre:
ADN: deoxyribose
ARN: ribose
Les bases:
ADN : thymine
ARN: uracil
Est-ce que le RNA stocke aussi des informations comme les génomes?
Seulement quelque virus qui attaque le RNA (comme le VIH)