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Biochimie > Sem5 > Flashcards

Sem5 Flashcards

1
Q

Quels sont les séquences de bases d’une protéine?

A

Chaîne de 3 aminoacide diff

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Q

Comment appelle t’on les séquence d’amino acide dans une protéine? Cbm y’en a t’il ?

A

64 codons

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3
Q

Quels sont les deux aminoacides avec seulement un seul code?

A

ATG-> met
TGG -> Trp

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4
Q

Comment l’ADN devient un ARN?

A

Grâce à la transcription de l’ARN polymerase

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5
Q

Qu’est ce que l’ARN?

A

-La matrice pour la synthèse des protéines

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6
Q

L’ARN est un polymère linéaire composé de quoi?

A

Des nucleotides comme l’ADN

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7
Q

L’ARN forme une double hélice comme l’ADN?

A

Non car il ne possède qu’un seul brin

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8
Q

L’ARN a un groupe OH?

A

Vrai

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9
Q

Quels sont les bases de l’ARN
Lesqueles sont purines ou pyrimidine?

A

Purines: adénine et guanine

Pyrimidine: cytosine et uracil

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10
Q

Quel est le nom du nucleoside de l’Uracil?

A

Uridine

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11
Q

Qu’ajoute t’on à une base pour qu’elle devienne nucleoside ?

A

Deoxy-rybose pour ADN

Rybose pour ARN

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12
Q

Quelle processus ressemble à la transcription?

A

La synthèse de RNA est semblable à celle du DNA

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13
Q

Lors de la synthèse de l’ADN quelle est :
L’enzyme
Direction
Matrice
Nucleotides

A

Adn polymerase
5’->3’
ADN
dATP, dCTP, dGTP, dTTP

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14
Q

Lors de la synthèse de l’ARN quelle est :
L’enzyme
Direction
Matrice
Nucleotides

A

ADN polymerase
5’->3’
ADN
ATP CTP GTP UTP

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15
Q

Dans quelle sens va le brin codant de l’ADN?

A

5’->3’

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16
Q

Dans quel sens va le brin matrice de l’ADN

A

3’->5’

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17
Q

Dans quelle sens va l’ARN messager?

A

5’->3’

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18
Q

À quelle position relatives au 5’terminus sont les sites promoteurs de l’ARNmessager ?

A

TTGACA -> région -35 -> -35
TATAAT -> pribnow box-> -10

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19
Q

Ou débute l’ARN sur le brin codant de l’ADN?

A

Environ à +1 avec début en CAT

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20
Q

Comment l’ARN est traduit en protéine?

A

Grâce à tRNA comme adaptateur

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21
Q

De quoi un composé un ARN de transfert?

A

Un site d’attachement de l’aminoacide en 3’

Un site de reconnaissance de la matrice (anticodon)

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22
Q

Comment l’aminoacide est il attaché à l’ARNt?

A

Le groupe hydroxyde 3’ ou 2’ du ribose est lié à l’aminoacide par une liaison Ester

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23
Q

Comment l’ARN de transfert peut il être chargé avec un aminoacide?

A

Grâce à l’enzyme aminoacyl-tRNA synthétase

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24
Q

Comment les aminoacides sont connecté sur l’ARN de transfert ?

A

Grâce au ribosome

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25
Q

Quelles sont les deux sous unités du ribosome?

A

50 s et 30s

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26
Q

Quel sont les constituants du ribosome?

A

Protéines et RNA

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27
Q

Comment le ribosome sait à quelle position sur l’ARNm il doit commencer la traduction?

A

Au 1 et signal de départ (AUG-Met) après la séquence shine dalgarno

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28
Q

Quel est le signal d’initiation?

A

Shine dalgarno

29
Q

Shine-dalgarno est une région avec plusieurs base purine? Lesquels?

A

Vrai
AGGAGGU

30
Q

Comment le ribosome sait-il à quelle position sur le mRNA il doit terminer la traduction?

A

Grâce aux codons de terminaison

31
Q

Quels sont les codons de terminaison?

A

UAA / UAG / UGA

32
Q

Quel est la raison pour lequel UAA, UAG et UGA sont des codons de terminaison?

A

Aucun tRNA n’existent pour eux

33
Q

Que se passe t’il avec le RNA quand la protéine a été synthétisée et que le RNA n’est plus nécessaire?

A

Comme l’ARN n’ pas de groupe hydroxyde pour apporter de la stabilité, des réactions chimique séparé et dégradé les brins d’ARN grâce au phosphate

34
Q

Cbm d’aminoacide à l’insuline?
Quel est sa masse atomique en Dalton?

A

51
5808 Da

35
Q

À quoi sert l’insuline?

A

Protéine importante pour la régulation de la concentration en glucose

36
Q

Pk ne pouvait on pas utilisé l’insuline porcine et bovine chez l’humain?

A

Contiennent des mutations d’AA -> notre corps les dégrade

37
Q

Qui est quand a découvert l’insuline?

A

Banting et Best en 1921

38
Q

Qui et quand a produit de l’insuline humaine dans des bactéries Escherichia coli? Grâce a quelle technologie?

A

Genentech en 1978 grâce à la technologie de l’ADN recombinant

39
Q

Comment faut on l’expression recombinante de l’insuline?

A
  1. Isolation du matériel génétique
  2. Synthèse de l’ADN
  3. Insertion dans un vecteur
  4. Transfert dans l’hôte
40
Q

Qu’est ce qu’on isole et comment isole t’on du matériel génétique?

A

ADN génomique
ARNm

41
Q

Comment s’appelle la synthèse de l’ADN qui code pour l’insuline

A

-cADN

42
Q

Qu’utilise t’on pour l’insertion comme vecteur?

A

-plasmide

43
Q

Quel est le fameux hôte lors du transfert dans l’hôte?

A

Une bactérie

44
Q

Qu’est ce que la transcription inverse ?

A

Lorsque l’enzyme d’un virus se sert des 4 dTP pour passer de l’ARN en ADN complémentaire

45
Q

Quelle est la fonction de l’ADN polymerase?
Quelle est sa matrice?
Et ses nucleotides?

A

La duplication de l’ADN
ADN
dATP, dCTP, dGTP, dTTP

46
Q

Quelle est la fonction de l’ARN polymerase ?
Et sa matrice?
Et ses nucleotides?

A

La synthèse de l’ARM messager
ADN
ATP CTP GTP UTP

47
Q

Quelle est la fonction de la transcriptase inverse?
Sa matrice?
Ses nucleotides?

A

Synthèse de l’ADN
ARN
dATP, dCTP, dGTP, dTTP

48
Q

Au même titre que l’ADN polymerase et l’ARN polymerase, la transcriptease inverse est également un polymerase?

A

Oui

49
Q

Lors de la synthèse de l’ADN du gène d’insuline, le DNA complémentaire est spécifique à ce gène?

A

Faux cDNA de plusieurs gènes

50
Q

Lors de la synthèse de l’ADN complémentaire, cbm de copies du gènes de l’insuline peut être fait en 25 cycles?

A

10^6 copies

51
Q

Qu’est ce que le plasmide?

A

Adn circulaire composé d’environ 4000 nucleotides qui peut se répliquer de façon autonome dans la bactérie

52
Q

Que contient l’ADN genomique?

A

Tous les gènes de la bactérie

53
Q

Qu’est ce qui permet au plasmide de se répliquer?

A

L’origine de réplication

54
Q

Les mutations de plasmide peut rendre les bactérie résistante aux antibiotiques? Citer exemple

A

Vrai z.b résistance ampocillin

55
Q

Comment pourrait on insérer l’ADN de l’insuline dans un plasmide?

A

Grâce au enzyme de restriction qui sépare le plasmide et rend les extrémités cohésives ou sticky-end

56
Q

Est ce que les gènes de l’insuline peuvent se liguer dans un plasmide grâce au blunt end du gène de l’insuline?

A

Non

57
Q

Comment pourrait on lier le plasmide et le gène de l’insuline?

A

Introduire des sites de restriction dans le gène de l’insuline par PCR

58
Q

Après PCR du gène de l’insuline grâce a quoi peut on y créer des stocks end?

A

Grâce au enzyme de restriction

59
Q

Comment s’appelle l’insertion d’un gène dans un plasmide?

A

DNA ligase

60
Q

Comment peut on injecter le plasmide dans les bactéries?

A

Pipetter le plasmide, le mettre avec bactérie, chauffer à 42ºc, ajouter nutriment .

Les bactéries se dupliquent avec le plasmide modifié

61
Q

Toute les bactéries se duplique avec le plasmide modifiés? Si non comment peut on identifier les bactéries qui contiennent le plasmide?

A

Non, on ajoute de l’ampicilline (antibio) pour que seule les bactéries avec plasmide modifié survivent

62
Q

Les bactéries sans plasmide expriment une protéines en plus?

A

Non c’est celle avec plasmide qui contienne la protéine formée et résistante à l’antibio

63
Q

Comment peut on purifier la protéine recombinante?

A

Chromatographie

64
Q

Quelles sont les 3 méthode de chromatographie différente? Par quelle principe de séparation?

A

Par gel-filtration (taille)
Par échange d’ions (charge)
D’affinité (affinité spécifique)

65
Q

Comment fonctionne la chromatographie d’affinité ?

A

Bille avec des groupes chimiques ex glucose
La protéine avec affinité pour le glucose s’y accroche également

66
Q

Comment fonctionne l’expression de protéines recombinante avec un tag? (Dans chromatographie d’affinité)

A

Le tag est un gène ajouté derrière le gène codant. L’insuline lié au TAG et peut également se lier à une autre parties

67
Q

Quel protéine peut se lier au tripeptide glutathione

A

La protéine GST

68
Q

Lors de la purification par chromatographie d’affinité à quoi sert l’enzyme?

A

Séparer insuline et tag car le GST tag s’accroche au bille de glutathione et le reste fuit

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