Recombinación VDJ Flashcards
Segmentos génicos necesarios
- V → Variable
- D → Diversity
- J → Joining
Segmento que solo recombina para cadenas pesadas
D
Otros mecanismos de recombinación
- Adición de nucleótidos P y M
Unión de segmentos V, D y J
BCR → Forma cadena pesada
TCR → Forma cadena beta/delta
Unión de segmentos V y J
BCR → Cadenas ligeras
TCR → Cadena alfa/gamma
¿Qué es necesario para formar un gen único en cada cadena?
- RAG 1/2 → Sinápsis de los segmentos, ruptura de ADN.
- Reparación del ADN → Ku70/80, ADN PK, Artemis, exonucleasa, TdT.
- Únión de ADN → Ku70/80, ADN-PK, ADN ligasa IV, XRCC4)
RSS
Secuencias señal de recombinación
Separan cada secuencia señal V, D o J
No codificante
Partes → Heptamérica, 12 (1 giro) o 23 (2 giros) y nanomérica.
Regla 12/23
Durante la recombinación los genes junto a un RSS de 12pb solo se pueden unir a uno de 23pb.
Pasos de la recombinación para formar la cadena pesada y la cadena beta
- Reconocimiento del RSS y Escisión de una hebra: RAG1/2 reconoce y corta RSS.
- Formación de horquillas de ADN: Se forman horquillas de ADN en los extremos de los segmentos V, D y J, mientras que las secuencias de señal generan extremos romos.
- Ligadura de los extremos de señal: Las proteínas Ku70/Ku80 estabilizan los extremos romos. ADN ligasa IV, junto con XRCC4, une los extremos romos de las secuencias de señal, cerrando estas uniones → Plásmido.
- Escisión de la horquilla (secuencia codificante): Artemis, activada por ADN-PKcs, abre las horquillas en los extremos de los segmentos V y J, generando extremos salientes que contribuyen a la diversidad (3´saliente).
-
Adición de nucleótidos P: Los extremos salientes pueden actuar como sustratos para la ADN polimerasa, creando nucleótidos palindrómicos (P) en la unión
codificadora. - Ligadura final: La ADN ligasa IV, junto con XRCC4, une los extremos de señal (romos) para completar la reparación de las secuencias de señal a veces con la adición de nucleótidos aleatorios por ADN pol λ o ADN pol μ, incrementando la diversidad.
- Recorte de exonucleasa: Las exonucleasas recortan nucleótidos de los extremos del ADN en las uniones V-D y D-J, generando más diversidad en las cadenas pesadas.
- Adición de nucleótidos N: TdT agrega nucleótidos no contemplados (N) a las uniones codificadoras de los genes de la cadena pesada, aumentando la variabilidad.
-
Ligadura y reparación: La ADN ligasa IV, en conjunto con XRCC4, une los extremos
codificadores de los segmentos V, D y J,
completando la recombinación.
¿Qué ocurre después de la formación de la cadena pesada?
BCR → V preB → pre BCR
TCR → Pre cadena alfa → pre TCR
* Si se une con cadena pesada o beta, la célula prolifera.
* Variación aleatoria de cadenas → se recombina V y J para generar una cadena ligera o alfa
* Prueba de autorreactividad
Mecanismos de diversidad
- Diversidad combinatoria
- Adición de nucleótidos P
- Recorte de exonucleasa
- Adición de nucleótidos N
Tipo de Ig qué es un BCR inmaduro y por qué
IgM
Su región constante esta inmediatamente después de los segmentos VDJ recombinados
Tipo de Ig que desarrollan los BCR maduros
IgD
Por sitios poliadenilación membranales
No altera especificidad para Ag
Por qué ocurre el cambio de clase
- Citocinas
- LinT
- Se secretan isotipos
- IgA, IgE o IgG son receptores de membrana de LinB