Proteómica 2.4 Flashcards

recuerda poner como funciona

1
Q

Cual es la técnica utilizada para la purificación de proteínas, tambien aplicado a metabolómica (asilar metabolitos) *fase liquida.

A

Cromatografía de Intercambio Iónico

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2
Q

Explica esta técnica de purificación de proteínas

A

Aplicada a gases o liquidos, se basa en tecnología de intercambio ionico: avienta corriente electrica & registra espectro de absorvancia de la luz, para identificar moléculas pequeñas.

*cromatografo-alcohol.

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3
Q

Tipos de Cromatografía de Intercambio Iónico

A
  • *iones
    *exclusión tamaño (identifica proteínas presentes por absorvancia, y las separa por peso molecular)
  • afinidad (membrana que es afin a ciertas moleculas de interés- carga negativa o positiva )
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4
Q

Se puede acoplada a cromatografia de gases, es para metabolitos que no conocemos.

A

Espectometría de masas

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5
Q

Etsudiantes quieren identificar biomarcadores tempranos para cancer de colon, lo quieren hacer hacer mdiienco el cnjunto total de metabolitos en una muestra de sangre. ¿cual es la metodología ma sporpiada para identificar los metabolitos?

A

Espectometría de masas acoplada a cromatografía de gases

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6
Q

Técnica
Usa una reacción antigeno anticuerpo, se acoplan a un cromogeno/sustancia que cambia de color. Sumamante especifica para proteínas particulares como las SPIKE.

A

Elisa

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7
Q
A

PCR

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8
Q

Tecnica que utiliza la unión de Anticuerpos monoclonales a Antígenos en placa.

A

Elisa

*colorimetrico

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9
Q

Permite identificación de proteínas base a su masamolécular finidad por anticuerpos. usa gel de acrilamida.

A

Western blot

*acrilamida

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10
Q

Se puede acoplada a cromatografia de gases, es para metabolitos que no conocemos.

A

Espectometría de masas

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11
Q

Tecnica que se basa en afinidad antigeno anticuerpo que permite analizar varias proteínas en paralelo.

A

Micorareglos

Va a utilizar anticuerpos primarios en una matriz. Determinas a la parla asuencia o presencia de varias proteónas que hibridan a la vez.

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12
Q

Malditof

A

Con un laser indica diferente coloración dependiendo el metabolito y su espectro de absorvancia.

forma de
espectometria de masas acoplada cromatografo de gases.

Combinación de fase liquida Y fase gaseosa.
la proteínas estan a la misma carga en el campo elétrico. No hay variaciones en carga.

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13
Q

IMG

A

gráfico M/Z
por Malditof

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14
Q

Tecnicas para validación de otras tecnicas o ausencia y presencia de patogenos

A

ELISA , WESTERN BLOT; MICROARREGLOS

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15
Q

Caracterización de proteínas

A

M = masa
Z = carga elétrica

m/z= punto isoelétrico

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16
Q

Técnicas para caracterizar proteínas

A

Basadas en gel & computacionales

*usas espectometrias para ver que hay “mineria de datos” es proceso mas amplio, si solo quieres un resultado usas las técnicas de caracterización gel mas espeficio (sabes que buscas)

17
Q
  • Electroforesis en gel de poliacrilamida (identifica M)
  • Electroforesis el gel bidimencional (2Dpage-en poliacrilamida identifica Z & M)
A

Basadas en Gel

proteínas mas pesadas hasta arriba

18
Q

Permite identificar proteínas en base a su carga y masa elétrica basada en gel

A

2D page

19
Q

Metodo para conocer la secuencia de aminoacidos de una proteína, los marca & separa de la cadena peptídica con trisina.

A

Secuenciación edman

Consistia en fragmentar una proteína en 50-60 aminoácidos, a traves de proteasas (tripsina). Se les marcan con diocionalato.

20
Q

Cuantificación de proteínas en tejidos vivos/estudios dinámicos
usando isotopos radioactivis

A

ICAT, SILCO, ITRAQ

21
Q

Marca a la cisteína con diferentes isotopos radioactivos (carbonos).
IMG

carbono diferente a carbono 14

A

ICAT

cada isotopo da diferentes espectros de absorvancia, presencia a ousencia de proteínas. al analizar con espectometría de masas, relación M/Z.

22
Q

Fase previa de gel de acrilamida (2D-page), una vez que las proteinas estan identificadas/separadas por m/z. Tomas las proteínas con caracteristicas comunes. Despues Marca a la cisteína con diferentes isotopos radioactivos

A

SILAC

SILCOuarcANEEEE

23
Q

ICAT masivo & paralelo

A

ITRAQ

Nos permite hacer los mismo que ICAT, utilizando diferentes isotopos radioactivos de manera masiva. diferenciar varias muestras.

24
Q

Técnicas de proteomica estrutural tridimensional

A
  • Cristalografía de rayos X
  • Resonancia magnética nuclear
25
Q

Involucra a las Proteínas en forma cristalina expuestas a un rayo x, por un patron de bifracción de la luz pueden determinar su estructura proteíca.
su estructura tridimencional de proteínas

A

Cristalografía de rayos X

*la más estudiada.

26
Q

Base de datos de proteínas

A

UNiprot

27
Q

Aplica campo magnetico que hace resonar a los atomos presentes en la molécula, se termina las partes por millon de los atomos y distribución espacial.
su estructura tridimencional de proteínas

A

Resonancia Magnética Nuclear