Proteins examen finale Flashcards
1
Q
Co-évolution
A
Pathogènes acquiert des moyens d’échapper aux défenses de l’hôte qui doit réagir en renforçant son système de protection.
(cycle)
2
Q
Chez les vertébrés, le système immunitaire est caractérisé par sa (2):
A
- Spécificité: capable de distinguer des substances étroitement apparentées.
- Mémoire: se rappelle d’une exposition antérieure à une substance étrangère.
3
Q
ces cellules produisent des produisent les cellules sanguines dans la moelle osseuse (eryththro, lympho, thrombo -cytes)
A
Cellules souches hematopoïetiques
4
Q
Les cellules dendritiques role:
A
Détectent les pathogènes, en ingèrent certains et présentent des molécules du pathogène (antigène) à leur surface.
5
Q
Macrophages role:
A
recconait des anticorps.
Ingèrent les cellules infectées et les virus qui ont été marqués
et
se débarrasse aussi des cellules mortes.
6
Q
Lymphocytes T auxiliaires role:
A
Donnent les instructions aux autres cellules grâce aux cytokines.
7
Q
Lymphocyte T cytotoxiques role:
A
Détruisent les cellules infectées en leur envoyant des enzymes.
8
Q
Lymphocytes B role:
A
Usines à anticorps.
9
Q
Cellules tueuses naturelles (NK) role:
A
Tuent sélectivement les cellules infectées ou tumorales.
10
Q
Système lymphatique (4 composantes):
A
- Moëlle osseuse
- Rate
- Thymus
- Ganglions lymphatiques.
11
Q
La lymphe:
A
en connexion avec le sang et peut transporter différentes substances.
Contient des nutriments et des protéines qui exercent des fonctions défensives.
12
Q
Les immunoglobulines :
A
Superfamille incluant les anticorps, les molécules présentatrices de l’antigène, les molécules du CMH, molécules de liaisons etc.
Protéines complexes impliquées dans les phénomènes de reconnaissance, de liaison et d’adhésion des cellules. iIs sont indispensables pour visualiser et reconnaître les molécules.
13
Q
Les défenses de l’hôte se composent de 3 couches:
A
- Les défenses mécaniques/chimiques (peau, muqueuses): fonctionnent en continu, non
spécifique. - L’immunité innée: cellules et molécules du système immunitaire rapidement activées
(minutes à quelques heures) mais limitées, non spécifique. - L’immunité adaptative: principalement lymphocytes B et T (quelques jours), très spécifique
14
Q
Immunité innée(2):
A
Activée quand les défenses mécaniques/chimiques ont échoué
a) Cellules phagocytaires:
macrophages, neutrophiles et cellules dendritiques.
b) Système du complément: ensemble de protéines sériques (dans le sérum) qui peuvent se fixer directement aux surfaces microbiennes ou fongiques.
15
Q
3 voies d’activation du système du complément: activation de la protéine C3 du complément
A
- Voie classique: nécessite la présence d’anticorps liés à la surface du microbe (complexe Ag-Ac).
- Voie de la lectine: pathogène ont des parois cellulaires riches en mannose.
- Voie alternative: nécessite le dépôts d’une protéine C3 spéciale sur la surface microbienne
(C3 va déclencher plusieurs mécanismes.)
16
Q
mechanisme de C3
(commence par C3 se clive en C3a et C3b)
A
1) C3 se clive en C3a et C3b
2) C3b se lie au microbe et provoque l’opsonisation (favorise la phagocytose).
3) C3b se fixe sur une autre protéine du complément, C5 et la clive en C5a et C5b.
4) C5b fixe C6, C7, C8 et C9 pour former le Complexe d’attaque membranaire qui permet la lyse.
5) C3a et C5a fonctionnent comme agent chimiotactiques: attirent les neutrophiles et d’autres cellules phagocytaires.
17
Q
c) Les cellules tueuses naturelles mechanisme
:
A
Deviennent actives par l’interferon I
Ils recherchent les cellules infectées par un virus et les tuent.
Suivant le tuage, ils sécrètent l’interféron γ (IFN-γ) (qui est impliqué dans d’autres défenses antivirales).
18
Q
Immunité adaptative definition:
A
Reconnaissance hautement spécifique des substances étrangères (plusieurs jours ou semaines après contact): même les protéines qui diffèrent par un seul aa peuvent être distinguées.
19
Q
Immunité adaptative implique quelles composantes du système immunitaire?
A
Les lymphocytes (T et B) porteurs de récepteurs spécifiques à l’antigène: anticorps.
Les anticorps sont les immunoglobulines (Ig) du sang.
(
Anticorps
Molécules présentatrices de l’antigène
Certains récepteurs de facteurs de croissances
)
20
Q
que produit les Igs
A
les lymphocytes B
21
Q
Structure de Ig
A
Composées de 2 chaînes lourde identiques liées de manière covalente à 2 chaînes légères identiques
Double structure symétrique: H2L2.
entre chaque chaine, il y a un pount S.
Fragment impliqué dans la liaison de l’antigène = Fab.
(Ne peuvent lier l’antigène que lorsque les deux Fab sont présents.)
Fragment incapable de fixer l’antigène = Fc
\\// }Fab
. ll }Fc
22
Q
La région d’un antigène par lequel il entre en contact avec l’anticorps est appelé
A
épitope.
23
Q
CDR : role sur la reconaissance de l’antigène par l’anticorps
A
CDR est le section sur l’Ig qui est hyper variable qui va determiner la spécificité
24
Q
Fc role
A
peuvent se fixer sur des récepteurs spécifiques (FcR) exprimés par certaines cellules
ex: to celulle NK qui va provoquer l’apoptose sur le cellule (antigène) qui est lié au Fab de l’Ig.
25
IgA : structure et fonction
IgA - dimère
Rôle de défense au niveau des muqueuses. Abondant dans les sécrétions (larmes, lait, salive).
26
IgD : structure et fonction
IgD - monomère
Différenciation de cellules immunitaires.
27
IgE : structure et fonction
IgE - monomère
Impliquée dans réactions allergiques. Protection contre les parasites.
28
IgG : structure et fonction
IgG - monomère
Activation du complément, opsonisation.
29
IgM : structure et fonction
IgM - pentamère
Retrouvée à la surface des cellules B. Activation du complément.
30
Production des Ig mechanisme :
Par les lymphocytes B :
Les virus contiennent plusieurs protéines distinctes.
De nombreux lymphocytes individuels se lient à un antigène spécifique et se multiplient (Réponse polyclonale)
Pour neutraliser l’antigène ou lyser les bactéries, les Ig vont ensuite être libérées dans le milieu extracellulaire
31
so, to summarize (4 big steps d'après moi):
Lymphocyte B finds antigène and secretes Ig
Fab of Ig links to antigène
Fc of Ig links to cellule NK
Apoptose d'antigène
32
CMH definition
complexe majeur d’histocompatibilité
33
CMH de classe 1 role:
Ils servent a présenter l'antigène au lymphocyte T cytotoxique
Lymphocyte T cytotoxique va détruire la cellule infectée.
34
CMH de classe 2 role:
Ils présentent l’antigène aux lymphocytes T ((auxiliaires)) (helper).
Réaction immunitaire adaptative avec lymphocytes B, production de cytokines et soutien aux lymphocytes T cytotoxiques
35
5 étapes de la reconnaissance immunitaire du CMH I
(Find vid)
1. Acquisition de l’antigène:
- dans le cas d’une infection virale, correspond au processus infectieux (virion etc).
2. Destruction de l’antigène:
- la plupart du temps par le système ubiquitine protéasome (immunoprotéasome).
3. Livraison des peptides aux CMH I
4. Liaison des peptides aux CMH I.
5. Présentation des complexes peptides-CMH I à la surface.
36
4 étapes de la reconnaissance immunitaire du CMH II
(Find vid)
1. Acquisition de l’antigène:
par pinocytose, phagocytose, endocytose ou par l’intermédiaire d’un récepteur.
2. Destruction de l’antigène par la processus d'endocytose
3. Rencontre des peptides avec les CMH II
4. Présentation à la surface.
37
Cytokine rôle:
Regulaiton de la nature, l’intensité et la durée de la réponse immunitaire réponse immunitaire en se fixant sur des recepteurs spécifiques de cellules cibles.
38
6 protéines dans la famille des cytokines :
- Les interférons
- Les interleukines (IL-)
- Les chémokines
- Les facteurs de nécrose tumorale (TNF)
- Les colony stimulating factors (CSF)
- Les facteurs de croissance de transformation (TGF)
39
Les cytokines peuvent agir sur beaucoup de cellules.
nomme les différentres types de synergies qui peuvent avoir lieu if(# de cytokines >=2) sur 1 cellule.
Redondance : 2 cytokines avec la même effet
Synergie : l’effet de 2 ou plusieurs cytokines peut être plus important qu’un simple effet additif.
Antagonisme: une cytokine peut bloquer l’effet d’une autre.
40
les 3 modes de fonctionnement des cytokines
- Autocrine: agissent sur la même cellule.
- Paracrine: sur les cellules à proximité.
- Endocrine: sur des cellules éloignées en passant dans la circulation
41
Les cytokines peuvent induire une cascade d’effets:
une cytokine peut stimuler la production d’autres cytokines.
42
Action du famille des cytokines hématopoïetique
Promouvoit la proliferation et la différentiation de cellule
43
Action du famille des interleukines
Variation d'actions selon l'interleukine et le type du cellule
44
Action du famille des interférons
Protéines antivirales
45
Action du famille des chemoleukines
(Migration, Adhésion et Activation) cellulaire
46
Action du famille des facteurs de nécrose tumorales
Régule l'inflammation et les réponses immunitaires
47
Action du famille des TGF
Régulation des cellules immunitaires
48
la liaison des cytokines competitif:
C'est possible que deux ou plus de cytokines ont les mêmes récepteurs.
49
Que font les cellules T auxiliaires?
Les lymphocytes T auxiliaires fournissent l’assistance aux cellules B pour produire des anticorps de haute affinité.
50
l y a 2 types de lymphocytes T auxiliaires en fonction de la réponse qu’ils déclenchent et des cytokines qu’ils produisent:
Th1 et Th2.
51
Th1 role
Les Th1 produisent notamment IFN-γ et IL-2 qui
permettent de protéger contre les pathogènes
intracellulaires (activation des cellules T
cytotoxiques, activation des macrophages...).
52
Th2 role
Les Th2 produisent notamment IL-4, IL-5, IL-10 et
IL-13 qui protègent contre les pathogènes
extracellulaires (production d’Ac par les cellules B,
réactions allergiques...).
53
common production de Th1 et Th2
Les cytokines GM-CSF et IL-3 sont produites par les deux et augmentent la production des globules blancs
(nécessaires quel que soit le pathogène).
54
IL-4 permet la différenciation de cellule T naive
en ___.
Th2 ce qui inhibe le prolifération de Th1
55
IL-12 permet la différentiation de cellule T naive
en __.
Th1 ce qui inhibe le prolifération de Th2
56
crosstalk = ____________________
Chaque cellule va répondre non pas à un signal unique mais à un profil complexe de molécules de signalisation
ex: les cytokines qui agissent ensemble ou séparémment
A, B, C ---> survive
A, B, C + D, E ---> division
A, B, C + F, G ---> differentiation
rien ---> DIE
57
La communication implique généralement (4):
- Une molécule de signalisation (extracellulaire).
- Un récepteur.
- Des transducteurs intracellulaires du signal.
et
- Des cibles.
58
Différents mécanismes de régulation (5):
- Séquestration du récepteur.
- Sous-expression et destruction du récepteur.
- Inactivation du récepteur.
- Inactivation de la molécule de signalisation.
- Production de protéines inhibitrice
59
2 types de signaux: (one w/3 sub ones)
Signaux contact-dépendants
et
Signaux de sécrétion
(
-Autocrine
-Paracrine
-Endocrine
)
60
signal de sécrétion Autocrine:
Amplifie une réponse en induisant de nombreuses cellules semblables à répondre de la même manière: réponse coordonnée.
Dans tous les cas, la molécule de signalisation doit se fixer à un récepteur: protéine qui lie une molécule et initie une cascade de signalisation.
61
signal de sécrétion Paracrine:
Dans l’environnement proche de la cellule. Rapidement captées, détruites ou immobilisées
Dans tous les cas, la molécule de signalisation doit se fixer à un récepteur: protéine qui lie une molécule et initie une cascade de signalisation.
62
signal de sécrétion Endocrine:
Exerce de multiples effets sur l’organisme en affectant de nombreux tissus
Dans tous les cas, la molécule de signalisation doit se fixer à un récepteur: protéine qui lie une molécule et initie une cascade de signalisation.
63
2 types de recepteurs:
Membranaire (molécule de signal = ligand)
et
Intracellulaire (molécule de signal = petit molécule hydrophobe)
64
Une fois que les récepteurs membranaires sont activés, ils peuvent modifier l’activité des enzymes intracellulaires telles que (5):
Des enzymes modifiant des protéines:
- Kinases (PKA, PKC, PKG)/phosphatase.
- acétylase/déacétylase.
Des enzymes modifiant des lipides:
- Phospholipases (PLCβ ou γ).
- phosphatidylinositol kinase (PI3K).
Des enzymes modifiant des nucléotides:
- cyclases/phosphodiestérase.
65
3 classes principales de récepteurs cellulaires de surface.
- Les récepteurs couplés à un canal ionique.
- Les récepteurs à activité enzymatique associée.
- Les récepteurs couplés aux protéines G.
(also Precepteur tyrosine kinase et Recepteur sérine/thréonine kinase under #2)
66
Récepteurs couplés à un canal ionique.
Impliqués dans la transmission rapide des signaux au travers de la synapse entre deux cellules électriquement excitables
67
Récepteurs à activité enzymatique associée
Peuvent posséder une activité enzymatique intrinsèque (dans le cytoplasme) ou lorsqu’ils lient un ligand, développent une activité enzymatique.
Classé selon :
-le type d’effecteur (kinase, phosphatase...).
-Cible (serine/thréonine, tyrosine, histidine).
- Type de relation entre le récepteur et l’enzyme.
68
Récepteurs tyrosine kinase (RTK) :
Très fréquents pour les principales
hormones peptidiques...
69
Récepteurs sérine/thréonine kinase.
Se lient à une 40aine de protéines humaines dont TGF-β (transforming growth factor): type de cytokine.
Phosphorylent le groupement OH de sérines ou thréonines.
- Dimérisation après fixation du ligand.
- Phosphorylation.
- Recrutement et phosphorylation de Smad 2 ou Smad 3.
- Se lie à Smad4, puis lecomplexe ainsi formé se rend jusqu’au noyau et agit sur la transcription.
70
2 Récepteurs à activité enzymatique associée.
Récepteurs tyrosine kinase (RTK)
et
Récepteurs sérine/thréonine kinase
71
Récepteurs couplés aux protéines G (RCPG).
Forment la plus grande famille de récepteurs membranaires de la surface cellulaire (1500 récepteurs différents).
Élaboration de signaux intracellulaires par l'intermédiaire d'une GTPase hétérotrimérique
Ligands très variés ex: pjoton for eyes, everything you smell...
72
Que signifie le G dans protéine G
GTP
73
RCPG recepteur de protéine G:Le transfert du signal jusqu’à son action se déroule en 4 étapes.
1ère étape: activation du récepteur (le ligand se
fixe au RCPG et l’active).
2ème étape: l’activation déclenche l’action
(fixation d’une molécule de GTP). Échange d’un GDP pour un GTP. Dissociation en 2 groupes: d’un côté α-GTP, de l’autre β-γ.
3ème étape: les deux groupes vont agir
ensemble ou séparément et modulent ainsi
l’activité de nombreux effecteurs (effecteurs
primaires: enzymes, ou canaux ioniques qui
vont contrôler la concentration intracellulaire
des 2nd messagers).
4ème étape: L’hydrolyse du GTP termine la signalisation et
induit la trimérisation.
Dans certains cas, il y a une étape en plus:
intervention de protéines régulatrices des
protéines G (RGS) qui aident à arrêter la réponse
couplée aux protéines G.
74
Lors de l'action du RCPG, que fait le second messager AMPc?
Le second messager (AMPc) va activer
une protéine kinase AMPc dépendante
(PKA, effecteur secondaire) qui pourra
ensuite agir sur une protéine cible et la
modifier, ce qui aura pour effet de
changer le comportement de la cellule.
75
Les protéines G peuvent avoir plusieurs fonctions différentes(4).
- Les G s sont stimulantes.
- Les G i/o sont inhibitrices.
- Les G q agissent sur les phospholipases C.
- Les G 12/13 agissent sur les canaux ioniques
76
combien de variations possibles pour une protéines G trimèriques
23 types de sous-unités α,
6 types de sous-unités β
et
12 types de sous-unités γ
77
Voie de l'adénylate cyclase
- Dégradation de glycogène en glucagon/adrénaline lors d'un hypoglycémie
- Le glucagon et l’adrénaline se lient à 2 RCPG différents mais les deux interagissent et activent la même protéine Gs qui active l’adénylate cyclase. (((Adénylate cyclase (quantité d'AMPc) ∝ Gs - GTP)))
- De là, l'intervention de Gs ou Gi va permettre un contrôle précis du taux d’AMPc au besoin.
78
sections de l'adénylate cyclase (3)
Transmembranaire
- pour permettre l'ancrage dans le membrane
2 Domaines cytosoliques:
-activité catalytique et régulatrice.
79
protéine kinase AMPc dépendante (PKA) est activé par la liaison de ____
l'AMPc
80
PKA inactive est un tétramère
composé de
deux sous-unités régulatrices (R) et de deux sous- unités catalytiques (C).
chaque sous-unité R se lie au site actif d’une ss-unité C et l’inhibe. (donc, pas de fonction quand c'est together (inactive) )
81
Chaque sous-unité R possède deux sites
distincts de liaison à l’AMPc :
CNB-A et CNB-B.
Intéraction coopérative: liaison d’un AMPc à CNB-B facilite la liaison du deuxième AMPc sur CNB-A.
82
Quand liaison des 4 AMPc sur les sous-unités régulatrices (R)
Changement de conformation qui permet de libérer les sous-unités catalytiques (C) et d’enlever l’inhibition. Les sous-unités C vont pouvoir aller phosphoryler d’autres protéines.
83
AMPc effet à long terme:
regulation des gènes qui contiennent une séquence d’ADN appelée l’élément de réponse à l’AMPc (CRE)
84
Augmentation de Ca2+ cytosolique par les RCPG
Ca2+ a un rôle essentiel dans la régulation de nombreux signaux.
RCPG peuvent agir sur la concentration de Ca2+.
Taux de Ca2+ maintenu dans la cellule grâce à des pompes
ATPases qui fonctionnent en continu.
not reall a q ik
85
La plus importante voie de transduction du signal qui se traduit par une élévation de Ca2+ implique l’activation de RCPG d’une phospholipase C.
La phospholipase C activée génère deux seconds messagers importants à partir du phosphatidylinositol (lipide des membranes)
Le groupe inositol qui se trouve toujours dans le cytosol, peut être
phosphorylé/déphosphorylé à différentes places par des kinases/phosphatases pour former du phosphatidylinositol 4,5- biphosphate (PIP2)
C’est cette molécule qui va subir l’action de la phospholipase C qui va causer la clivage en...
- DAG
et
- (IP3)
86
a) Effets de l’IP3
Les RCPG qui activent la phospholipase C induisent une
augmentation de Ca2+ cytosolique même si les ions Ca2+ sont absents du milieu extracellulaire.
Si ions Ca2+ non présents, alors libération de Ca2+
par le canal Ca2+ dépendant de l’IP3 présent dans la membrane du RE (Liaison de l’IP3 entraîne l’ouverture du canal)
87
b) Effets du DAG
DAG reste associé à la membrane plasmique: va activer une famille de protéines kinases, les PKC
PKC va phosphoryler certains facteurs de transcriptions qui vont activer la division cellulaire.
88
Complexe Calmoduline-Ca2+
La liaison du Ca2+ sur quatre sites de la calmoduline (interaction coopérative) donne un complexe qui interagit avec de nombreuses enzymes et protéines et module leurs activités.
Régule la phosphodiéstérase de l’AMPc en mettant fin à son activité.
89
Oxyde nitrique (NO)
Diffuse localement dans les tissus proches: des cellules endothéliales aux cellules musculaires lisses voisines, et provoque le relâchement musculaire.
L’effet du NO passe par le messager secondaire GMPc, formé par un récepteur intracellulaire du NO exprimé dans les cellules musculaires lisses.
90
Les protéines G monomériques (small GTPases) (6)
-Arf: formation de vésicules.
-Rab: ciblage et fusion des vésicules.
-Ran: transport nucléaire.
-Ras: transduction des signaux de facteurs de croissance.
-Rho: régulation du cytosquelette d’actine.
-Sar: formation vésiculaire.
91
Exemple de Ras (le small GTPase)
Cycle des GTPases:
Ras sous forme inactif
GEF (GDP -->GTP)
Ras sous forme actif
GAP (GTP -->GDP)
92
nombre de chromosomes
Chez l’Humain, 46 chromosomes différents (23 paires)
93
chromatine definition:
Chromatine = ADN + protéines
94
nucléosome structure
constitué de 8 protéines histones (2 × H2A,H2B, H3, H4) et d’ADN double brin (147 nucléotides).
(2 dimères H2A-H2B et un tétramère H3-H4.)
95
Nucléosome =
ADN + ADN internucléosomique + octamère d’histones
96
compaction du nucléosome
ADN en chromatine par la condensation de 1/3 de sa taille initiale
97
H1 rôle
- induire un plus grand resserrement de l’ADN entre les nucléosomes
et
- permettre une plus grande protection de l’ADN.
98
solénoïde/ZigZag compaction
40X
99
Quelles sont les modifications post-traductionnelles au niveau des queus d'histones
acétylation, méthylation, phosphorylation et ubiquitination.
100
protéine HP1 role
ils se fixent aux queues modifiées et induisent la
condensation ou la décondensation.
(ex: méthylé = condensation)
101
Comment l'HP1 peut se compacter plus?
en se liant au HP1s qui sont around
102
boucles de chromatine:
Niveau supérieur de condensation qui sert a introduire une scaffold pour que la chromatine peuvent former des boucles sur celui-ci.
Les chromatines vont se lier aux scaffolds par une S/MAR
(big loop = expression de gêne)
103
SMC:
permet la formation de chromatine en « pack ».
Deux molécules d’ADN condensée (chromatides) et réunies par un centromère.
104
condensine vs cohesine
condensine condense l'ADN
cohésine lie les deux chromatides soeurs
105
niveaux de condensations (5)
Molécule d’ADN nue.
Nucléosomes.
Solénoïde ou zigzag (30nm).
Ajout des protéines de structureCondensée 1000×.
Structure en boucle et
chromosome mitotique
Condensé 10 000×
106
Primase role
faire des amorces d'ARN pour l'ADN pol
107
ou-provient-t-il les phosphates qui sont requiert pour l'ADNpol à ajouter un nt
nt-TP --> nt-MP
108
ADNpol (main) étapes (3)
- La dissociation du pyrophosphate va provoquer l’ouverture de la main et la translocation du nucléotide ajouté: le site actif(paume) de la polymérase est ainsi libre pour recevoir un nouveau dNTP
- Le nucléotide entrant s’apparie avec la première base disponible de la matrice (brin original)
-Cette interaction provoque la fermeture des doigts de la polymérase autour du dNTP apparié
(repeat)
109
direction de l'ADNpol
5' --> 3'
110
Pour remplacer les amorces ARN, une enzyme, _______ reconnaît et enlève la presque totalité de chaque
amorce.
la RNase H
111
ADN ligase role
remplacer les trous ou les amorces étaient par de l'ADN en utilisant l'ATP.
112
quelle enzyme provoque la séparation des brins?
L’ADN hélicase, catalyse la séparation des
deux brins d’ADN en utilisant l'ATP
(peut aller de 5' --> 3' ou de 3' --> 5'. réplication bidirectionnelle)
113
Les protéines stabilisatrices du brin monocaténaire(SSB). RÔLE
keeps the ADNsb libre pour l'ADNpol après avoir été séparé par l'ADN hélicase
114
topoisomérase role
sur-enroulement (elastic band thing) enlevé par les ADN topoisomérases qui agissent sur l’ADN double brin situé devant la fourche de réplication
115
L’ADN Pol δ vs l’ADN Pol ε
L’ADN Pol δ synthétise le brin discontinu
et
l’ADN Pol ε synthétise le brin continu
Des anneaux coulissants augmentent la processivité de ces ADN polymérases.
116
L’ADNpol α/primase : role
L’ADN Pol α/primase est spécifiquement impliquée dans l’initiation des brins d’ADN neufs: après que la primase a synthétisé l’amorce ARN, l’ADN Pol α s’y fixe et commence la synthèse de l’ADN
L’ADN Pol α a une très faible processivité.
Celui-ci est remplacée par l’ADN Pol δ ou l’ADN Pol ε qui sont très processives.
117
comment l'anneau coulissant va se fixer au ADNpol?
Les anneaux se fixent à des poseurs(clamp loader) et à une molécule d’ATP.
Le complexe anneau coulissant-poseur-ATP se fixe sur la molécule d’ADN double brin.
L’hydrolyse de l’ATP provoque le dégagement du poseur.
L’ADN polymérase peut alors se fixer à l’anneau coulissant et à la molécule d’ADN
118
when does réplication start in mitose
La réplication commence lors de la phase S de l’interphase
119
where does the fourche de réplication start?
Des séquences spécifiques vont initier la
réplication: origines de réplication.
Les eucaryotes ont plusieurs origines de
réplication sur chaque chromosomes.
120
Un complexe protéique (protéines initiatrices) se forme au niveau du séquence de l'origine de réplication. Ce qui permet...
la reconnaissance de l’origine de réplication, (liaison à l'ADN)
l'ouverture de l'ADN
et
le démarrage de la réplication.(Recrutement de protéines)
121
ORC:
origin recognizing complex permet:
Formation d’un complexe pré-réplicatif : 2 protéines (helicase loading proteins, Cdc6 et Cdt1) s’assemblent sur un complexe ADN-ORC. Une ADN hélicase va s’assembler avec la molécule d’ADN, Cdc6 et Cdt1:
Les protéines kinases Cdks vont déclencher le passage de la phase G1 à S.
Dissociation de Cdc6 et Cdt1 (par phosphorylation), activation de l’hélicase.
Déroulement de la molécule d’ADN et fixation des protéines et des enzymes de réplication.
Phosphorylation de ORC (empêche la formation de nouveaux complexes préréplicatifs).
((((formation du complexe pré-réplicatif.))))!!!!
122
que fait-on about la last fragment d'Okazaki?
Stratégie des télomérases:
Les extrémités des chromosomes eucaryotes sont appelées les télomères. Cette structure est utilisée comme une nouvelle origine de réplication grâce au recrutement
d’une enzyme, la télomérase.
La télomérase synthétise de l’ADN à partir d’ARN pour ajouter des répétitions télomériques en 3’ des extrémités chromosomiques.
123
la limite de hayflick
Une population de cellules fœtales humaines se
divise entre 40 et 60 fois, puis entrent dans une phase de sénescence
Chaque cycle mitotique raccourci la longueur des télomères jusqu’à ce que la division deviennent impossible. C’est alors que la cellule atteint la limite de Hayflick
124
Un facteur de transcription (FT) est :
une protéine qui se fixe sur une séquence spécifique de l'ADN: il contrôle le flux (la vitesse) de la transcription d'un gène. Ils activent ou inhibent le recrutement de l'ARN polymérase sur des gènes spécifiques6
125
Séquence promotrices
région sur l'ADNg que l’ARN polymérase se fixe, contiennent des séquences spécifiques (élements de réponse) qui lient les FT et recrutent l’ARNpol.
126
Séquence amplificatrice (enhancer):
région sur laquelle les FT se lient et activent la transcription.
127
Séquence opérateur (operator):
région proche d’un promoteur sur laquelle se fixe un répresseur.
128
Répresseur:
protéine qui empêche la fixation de l’ARN polymérase sur le promoteur
129
action des facteurs de transcriptions générales
-Le TFIID se fixe sur une séquence particulière: la TATA box (dans le promoteur).
- TFIIA et TFIIB se fixent sur TFIID.
- TFIIF fixe l’ARN polymérase II et le complexe se fixe sur les autres protéines.
- TFIIE et TFIIH viennent compléter le complexe de pré-initiation.
- Phosphorylation de l’ARNpol II et début de la trancription
130
ADN sous forme B
contient des petits et des grandes sillons
131
petit vs grande sillons
petit (moins riche en information)
grande (plus riche en information)
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4 motifs structuraux sont présents dans les protéines liant l’ADN.
Le motif hélice-coude- hélice (HTH).
Le motif en doigt de zinc: une hélice α et deux feuillets Β antiparallèles.
La glissière à leucine: hélice α avec un arrangement régulier de leucines qui interagissent avec un autre polypeptide
L’hélice-boucle-hélice (dimère).
