Proteins examen 2 Flashcards
Read AND UNDERSTAND P.10 and on of the powerpoints on Chap 5
NOW!!!
3 types de prot.
- Protéines fibreuses: collagène, kératine, élastine…
- Protéines globulaires: myoglobine, globulines,
immunoglobulines, enzymes… - Protéines membranaires: protéines de transport,
spectrine, recepteur de l’insuline..
Les 3 types de prot. sont classifiés selon quoi?
leurs structures
5 caractèristiques du prot. fibreuse
- Orientation parallèle à un axe
- Longues fibres ou grands feuillets
- Séquences répétitives au niveau de la structure primaire
- Bonne résistance mécanique
- Faible solubilité dans l’eau
La kératine α:
protéine fibreux chez tous les vertébrés supérieurs:
constitue les cheveux, cornes, ongles et plumes.
comment se polymérise les dimers de kératine en filaments de kératine?
chaines paralèles qui se lient ensemble en tetramers
ou bien
chaines anti-paralèles qui se lient ensemble en tetramers
structure d’un monomer de kératine α:
- Un domaine central hélicoïdal de type α
(300 résidus) - Domaines terminaux globulaires non-
hélicoïdaux variables selon le type de
kératine et le tissu.
structure de dimer de kératine α:
- 1 kératine de type I, acidique
- 1 kératine de type II, basique
5 types de liaisons qui stabilise le structure des protéines :
- Interactions hydrophobes
- Force de Van der Waals
- Ponts hydrogènes
- Liens ioniques
- Ponts disulfures (riche en cystéine)
La protéine la plus abondante du corps humain (1/4)
collagène
3 types de collagène
- Collagène I:
(os, tendons et peau) - Collagène II:
3 chaînes identiques (cartilage) - Collagène III:
3 chaînes identiques (vaisseaux sanguins)
collagène séquence primaire
- Gly – X –Y – Gly – X- Y - Gly
X: très fréquemment proline
Y: Hydroxyproline ou Hydroxylysine
structure de la collagène due au haut tenueur en Gly, Pro et hydroxyproline
- Formation d’une triple hélice beaucoup plus étirée
que l’hélice α normale
comment de Gly in collagen
33%
L’unité structurale de base est le tropocollagène formé de:
3 chaînes de collagène entrelacées
quelle aa est centrale dans le tropocollagene
gly cuz yer petit
quelle type de liaison stabilise la collagene
H
9 steps of collagen synthesis
1) (ADN en ARNm).
2) ARNm en pré-propeptide.
3) Hydroxylation de proline et lysine: RER.
4) Glycosylation: RER et Golgi.
5-6) Assemblage en procollagène (3 chaînes): Golgi.
7) Sécrétion: matrice extracellulaire.
8) Clivage des N et C terminaux: tropocollagène.
9) Fibres de collagène et pontage (cross-linking).
summed up:
{
- Modifiés
- Sécrétés dans la matrice extracellulaire
- Assemblage en fibres
}
L’élastine
– Peau
– Poumons (alvéoles)
– Parois des vaisseaux sanguins
Élastine aas prédominantes
- Prédominance de résidus non polaires :
– 33% Gly, 33% (Ala + Val), riche en Pro et lys.
Pourquoi est-ce que l’élastine est sécrétée dans la matrice extracellulaire :
(permet l’adhésion des constituants de la matrice extracellulaire).
Rôle de l’α-antitrypsine dans la dégradation
de l’élastine:
L’α-antitrypsine est une protéine du plasma importante qui inhibe l’élastase. (il Recouvre les poumons pour empêcher la dégradation de l’élastine.)
α-antitrypsine a besoin d’un ___ pour se fixer à l’élastase et l’inhiber.
α-antitrypsine a besoin d’un résidu methionine pour se fixer à l’élastase et l’inhiber.
effet du fumage sur l’inhibition de l’élastine
Fumer cause l’oxydation et l’inactivation du résidu methionine et donc rend l’α-antitrypsine impuissante à neutraliser l’élastase.
Soie d’arraignée
- Biomatériel léger, élastique et très
résistant. - Résistance mécanique comparable
aux meilleures fibres synthétiques. - Protéines sécrétées par les glandes
abdominales
– 6 types de protéines différentes
– 1 substance servant de colle. - Longues séquences répétitives: peu
ou pas de proline.
utilisé pour…
- Textiles.
- Reconstruction
ligamentaire.
- Régénération des nerfs.
SPIDER GOAT
Protéines globulaire structure:
- Hydrosolubles:
- Résidus hydrophobes (Val, Leu, Ile, Met, Phe): dans le cœur.
- Résidus polaires chargés (Arg, His, Lys, Asp, Glu): en surface ou à l’intérieur, et sont impliqués dans la catalyse ou la liaison à un substrat.
Quels 2 types de protéines font majoritairement les prot. globulaires?
Majoritairement des enzymes et des protéines de transport.
pourquoi l’Hb est dite une hétérotétramère?
Puisqu’il a..
- 2 ss-unités α
- 2 ss-unités β
L’hème:
L’hème est le groupement qui fixe l’O2.
- Groupement formé par:
– Un anneau hétérocyclique organique à doubles
liaisons conjuguées dite porphyrine.
– Un atome de fer liant la porphyrine.
-A permis le passage de la vie anaérobie à la vie aérobie.
3 types de heme biologiquement important:
- l’hème b: le plus commun (celui de l’hémoglobine et de la myoglobine)
- l’hème a: dans la cytochrome c oxydase (complexe IV)
- l’hème c: dans le cytochrome c
- La chaîne de Mb a 3 fonctions importantes:
– Forme une cavité hydrophobe pour recevoir l’hème
(motif globine).
– Forme une cavité qui facilite la liaison entre l’hème
et l’O2.
– Protection de l’ion ferreux contre l’oxydation (par
l’O2).
is heme a protein?
nope, just fixes to them
deux parties de la Mb
Partie protéique: la globine
Groupement prosthétique (attaché à la protéine): l’hème
pour la Mb, l’ ion Fe (II) de l’hème forme 6 liaisons:
– 4 avec les N de la porphyrine.
– 1 avec le N de His F8 (histidine
proximale, hélice F).
– 1 avec l’O2
que va faciliter lie l’O2 à l’aide d’une liaison H au heme du Mb?
Résidu His E7 (histidine distale) lie l’O2 au heme.
quand-libère-t-il l’O2 du myoglobine?
Quand manque d’O2 dans les muscles: oxymyoglobine relâche l’O2.
cause de l’affinité de Mb > Hb:
P50 de la myoglobine est très faible (2 torr): toujours saturée
P50 de l’hémoglobine est plus forte (26 torr): sensible aux variations de la concentration d’O2.
(Phénomène de coopérativité de l’Hb)
l’Hb transporte :
Transporte l’O2, mais aussi le CO2 et le NO (vertébrés)
Sauf les poissons de l’antarctique
3 types d’Hb
– Hb A α2β2 (Hb adulte dite normale)
– Hb F α2γ2 (Hb fœtale)
– Hb S α2S2 (Hb anémie falciforme)
Entre chaîne α et chaîne β d l’Hb:
contacts hydrophobes
2 états structuraux d’Hb:
- R: oxyhémoglobine.
- T: désoxyhémoglobine.
( - État T (tendu) affinité moins grande pour l’O2 causé par 2,3BPG
- État R (relâché) affinité plus grande pour l’O2 )
ph diminue(+acide), affinité de l’Hb pour l’O2 ________
diminue
- 2-,3-biphosphoglycérate: formé à partir de ___
1, 3-BPG (métabolite de la glycolyse).
HbF affinité pour l’O2 ___ HbA affinité pour l’O2
HbF affinité pour l’O2 > HbA affinité pour l’O2 pour faciliter le transfert d’O2 de la mère au bébé
Protéines membranaires 3 classes:
3 classes:
- Protéines intrinsèques.
- Protéines ancrées dans la membrane par des lipides.
- Protéines extrinsèques (extracellulaires ou cytosoliques).
types d’aas sur les prot. membranaires intrisèques
Aa hydrophobes: ancrent la protéine dans la bicouche.
Aa polaires: à l’extérieur de la bicouche ou forment des
canaux ioniques.
2 types de protéines ancrées dans la membrane
Protéines ancrées dans le feuillet externe: Moins nombreuses
Protéines ancrées dans le feuillet interne: via un acide gras.
Les protéines extrinsèques ont une laiason faible avec:
- Têtes polaires des phospholipides membranaires.
- Portions hydrophiles des protéines intrinsèques.