Bio Mol Examen 2 Flashcards
Combien dARN polymérases existe chez les EUcaryotes?
trois (I, II, III)
Combien dARN polymérases existe chez les PROcaryotes?
un ( I )
C’est quoi le rôle de l’ARN polymérase I?
Il est un enzyme qui a comme rôle de synthétiser l’ARNr
C’est quoi le rôle de l’ARN polymérase II?
Il est un enzyme qui a comme rôle de synthétiser l’ARNm
C’est quoi le rôle de l’ARN polymérases III?
Il est un enzyme qui a comme rôle de synthétiser l’ARNt
Ou se trouve les régions promoteurs des ARN pol I, II et III
I : en amont du site d’initiation de la transcription (avant)
II : en amont du site d’initiation de la transcription (avant)
III : en aval du site d’initiation de la transcription (après)
Quel sont les facteurs transcriptionnels généraux qui aident aux ARN pols à trouver le site d’initiation de la transcription et d’initier le transcription
- Le TATA binding protein (TBP)
- Les facteurs associés à TBP (TATA-associated factors (TAF)
- Les facteur de transcription II (A à H) (TFIIA, TFIIB …..TFIIH)
Quels sont deux boites qui se retrouvent en amont de la boite TATA
Boite CCAAT et le boite riche en GC
Quel-est l’élément initiateur situé à proximité du site de démarrage de la transcription
Elément initiateur riches en pyrimidines (C et T).
Les facteurs de transcriptions sont des…
Protéines qui aident (ou pas) au polymérases de transcrire l’ADN en ARN
La régulation transcriptionnelle des eucaryotes dépend de deux grandes conditions:
Des séquences déterminées d’ADN (pour fixer des FT spécifiques)
et
(Les FTs doivent interagir avec le complexe de démarrage)
qu’est-ce qu’on appelle le technique effectuée pour étudier une interaction entre une région d’acide nucléique et des protéines (ou FT spécifique).
La technique du gel à (super) retardement.
C’est quoi un sonde d’ADN?
Une brin d’ADN que l’on hybride avec un brin complémentaire (qu’on veut observer).
On va souvent marquer le sonde avec de la fluoresence afin de l’observer.
Que nomme-t-on les deux brins décrit?
5’ - ATCGATCG - 3’
3’ - TAGCTAGC - 5’
5’ - ATCGATCG - 3’ : brin sens (codant)
3’ - TAGCTAGC - 5’ : brin anti-sens (Matrice)
Classer les trois en ordre croissant de quelle va migrer le plus loin dans le gel à super retardement.
Complexe sonde-protéine (marqué avec SYBR green)
Sonde libre (marqué avec SYBR green)
Complexe sonde-protéine-anticorps (marqué avec SYBR green)
plus loin
- Sonde libre (marqué avec SYBR green)
- Complexe sonde-protéine (marqué avec SYBR green)
- Complexe sonde-protéine-anticorps (marqué avec SYBR green)
moins loin
En ordre, c’est quoi les quatres étapes de maturation du préARN?
- Ajout du coiffe
- Clivage du site poly A (Priming)
- Ajout du queue poly adénylée (An)
- Épissage (Enlèvement des introns et des fois des exons par épissage alternative )
Est-ce que les introns sont tooujours entourées par des exons?
Ouep.
Est-ce que le coiffe est en position 5’ ou 3’ ?
5’. (Il y a aussi des méthyles qui s’ajoute en position 2’ sur les deux sucres terminales avant l’ajout de la coiffe)
Est-ce que le queue poly-A est en position 5’ ou 3’ ?
3’
C’est quoi la structure de la coiffe
C’est un 7-méthyl-guanylate - un ribose - triphosphate
Comment est-ajouté la coiffe (2 étapes)?
Sur quelle partie du Pol II va fixer l’enzyme qui va lier la coiffe?
Quelle est l’enzyme qui va lier la coiffe?
Quelle enzyme va catalyser l’ajout du méthyl?
- On crée un lien 5’ - 5’ en utilisant l’enzyme guanylate transférase, qui se fixe au domaine Ct de la Pol II (CTD – Pol II) et ajoute un GTP libérant le phosphate beta et gamma du GTP ainsi que le phosphate gamma au niveau 5’ de l’ARNm.
- La méthylation s’effectue par la suite par une méthylase qui ajoute des groupes méthylés en position 7’ sur la guanine, ainsi qu’en positions 2’ sur le pentose des deux premiers résidus riboses.
À quoi sert la coiffe? (2 fonctions)
1.La coiffe 5’ protègel’ARNm contre la digestion par des exonucléases
aussi,
- Il constitue un signal de reconnaissance par les ribosomes pour initier la traduction.
Comment est-ce que l’ARN pol II sait comment arrêter la transcription? (1 étape catalysé)
Aussi, comment est-ce que le polyadénylation se passe? (2 étapes avec un enzyme).
Donne aussi le role du queue poly-A.
Il va trouver le signal de clivage sur l’ARNm naissant (5’ - AAUAAA - 3’), située au bout 3’. Cette signal va signaler l’enzyme endonucléase CPSF (cleavage and polyadenylation specificity factor) qui va couper 1 à 3 nucléotides en aval du signal.
Le CPSF communique et recrute simultanément une autre enzyme, poly(A) polymérase (polyadénylate polymérase) qui polymérise le queue poly A au bout 3’ libre de l’ARNm
Cette séquence polyadénylée est par la suite accompagnée par une liaison d’une protéine PABP (poly(A)-binding protein) qui s’associe à tous les 10-20 nt et forme une structure à l’extrémité 3’ qui protège l’ARNm contre une digestion par l’activité des exonucléase 3’.
C’est quoi l’épissage?
Enlèvement des introns (et des fois des exons par épissage alternative)