Polimorfismos Flashcards
Diferencia entre polimorfismo y mutación
Polimorfismo presente en 1% de la población
Características de los polimorfismos
- Variante común de un gen (alelo)
- Se heredan
- Variaciones de la secuencia de DNA (bases nitrogenadas) en un locus de un cromosoma
Objetivo del proyecto del genoma humano
Identificar polimorfismos de un solo nucleotido
¿Qué causan los polimorfismos en regiones no codificantes?
INTRONES
Afectan la funcionalidad del gen
Pueden o no ser reconocidos por reguladores
¿Qué ocurre con los polimorfismos en regiones codificantes?
Exones
* No siempre alteran la secuencia de aminoácidos
¿En cuántos pares de bases coinciden y en cuántos difieren dos personas no relacionadas?
99%
20 millones
Huella genética individual
Combinación de secuencias en los alelos que se heredan es única.
Función de los polimorfismos
Relacionan individuos
Prueba de paternidad
Polimorfismos silientes
- No se expresan
- No cambian la traducción del producto protéico (código genético)
- Codon que codifica un aa es cambiado por otro que codifica el mismo aa
Polimorfismo siliente neutro
Secuencia que varia en regiones no codificantes
No aporta una “ventaja”
Polimorfismos no silientes
- Se expresan
- Varian lectura del código genético
- Alteran codones, cambian aa
Importancia de los polimorfismos
Pueden dar una ventaja a la población que los presente
Divergencia genética
Polimorfismo que se vuelve más común
SINES
Elementos dispersos cortos
-500 pb
No codifican
LINES
Elementos dispersos largos
+500 pb
Codifican
SNP
Polimorfismo de un solo nucleótido
* Cambia un solo nucleotido o pb
* Más frecuente
* Mayor probabilidad de mutación
* Deleción, inserción o sustitución de bn
* Alteran cantidad y actividad de una proteína
SNP regulador
- En potenciador, promotor y silenciador
- Efecto funcional sobre la expresión génica
- Modifica la velocidad de expresión
- Permite o no expresión
SNP estructurales
Altera traducción del RNAm → splicing o estabilidad RNA (cola de poliA)
Degradación rápida por moficación de 5´UTR y 3´UTR
SNP codificantes
Alteran la proteína
Sinónimos → cambio de codon, pero codifica para mismo aa
No sinónimos → cambio de codon que codifica para distinto aa
Aplicación clínica de los SNP
Terápia génica
RFLP
Polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción
* Se evidencian mediante el uso de enzimas de restricción → Cortan determinada secuancias de DNA
* Sin un SNP afecta el sitio de restricción de una enzima se evidencia el polimorfismo
Homocigoto
Cambio en el patrón de restricción en ambas cadenas
Heterocigoto
Diferentes alelos en un locus
Aplicación clínica de la PCR-RFLP
- Padre hereda patología o no a su hijo
- Determinar la fuente de una muestra de DNA → sospechoso
- Determinar mutación en una familia
- Determinar el estado de enfermedades genéticas
VNTR
Polimorfismos con número variable de repeticiones continuas
* Repetición tándem
* En regiones intrónicas
* Heredables
* La cantiadad de repeticiones determina la variabilidad de los alelos de un mismo locus
Tandem
Secuencia corta de DNA que se repite consecutivamente
Polimorfismo más confiable para identificación
VNTR
Se repite mucho en poblaciones
Polimorfismos del cromosoma Y
- Solo secuencias de herencia paterna
- Repeticiones AC teloméricas
Polimorfismo del cromomsoma Y ejemplos
Cáncer de próstata y pene
Marcadores polimorficos mitocondriales
- Secuencias de herencia materna
- Tasa de mutación alta → Hipervariabilidad
Polimorfismos de proteínas
- Identificación de secuencias de aa
- Variación de la estructura de una proteína → altera afinidad pero no acción en el sustrato
Aplicaciones de los polimorfismos
- Prueba de paternidad
- Arbol genialógico
- Identificación de sospechoso
- Identificación post mortem
- Suseptibilidad a enfermedades
Aplicación de SNP
Diferencias en la respuesta a un fármaco por citocromo P450 → riesgo a padecer un efecto adverso
Tipo de polimorfismo que altera a los receptores de glucosa
Codificante
Haplotipos
SNP en estrecha proximidad que se heredan en conjunto
HapMap
- Ubicación de los haplotipos
- Distribución entre individuos y poblaciones
- Dilucidar las interacciones entre multiples genes y los factores de estilo de vida en trastornos multifactoriales
- Variación en la respuesta a fármacos
- Predicción de predisposición a enfermedades
