Plasmid Flashcards
Karakter Mendelian secara fisik terletak pada kromosom
Walter S. Sutton and Theodor Bovery
Menjelaskan asosiasi gen dengan kromosom tertentu dalam nukleus Drosophila
Thomas Hunt Morhan
Gambar skema konjugasi bakteri
- DNA kromosom
- Faktor F (Plasmid)
- Pilus
fase seksual pada E. coli K12, fag lisogenik juga dipelajari
Joshua Lederberg
The ability to mate is controlled by a factor (F)
W. Hayes, J. Lederberg, Cavalli, E. Lederberg
Rekombinasi resiprokal molekul DNA episom sirkuler dengan DNA kromosom
Allan Campbell
Plasmid adalah molekul DNA sirkuler ekstrakromosomal yang bereplikasi secara (1), berbeda dari DNA kromosom normal dan tidak penting bagi kelangsungan hidup sel dalam kondisi (2). (3) tidak lagi digunakan
Ada di (4) terkadang ada di (5) ( contohnya di 2-um-ring yeast (6))
- otonom
- nonselektif
- Episom
- Bakteria
- Eukariot organisme
- S. cerevisiae
Tipe plasmid
- Mampu melakukan konjugasi atau perkawinan
- Mengandung gen yang resistan terhadap antibiotik atau obat. Dikenal juga sebagai, sebelum sifat plasmid dipahami
- Mengandung gen yang mengkode kolisin, protein, yang dapat membunuh bakteri lain
- Memungkinkan pencernaan zat yang tidak biasa (toluena atau asam salisilat)
- Mengubah bakteri menjadi patogen
- Fertility-(F)plasmids
- Resistance-(R)plasmids
- Col-plasmids
- Degrative plasmids
- Virulence plasmids
- Ukuran plasmid
- Jenis plasmid toksin
- Jenis plasmid degradatif
- Jenis plasmid patogenesitas
- 1-300 kb
- ColE1 dari E. coli
- TOL dari Pseudomonas putida
- pTi dari A. tumefaciens
Keadaan plasmid di dalam bakteri
- Non-integratif (tidak menyisip di kromosom inang)
- Episom (menyisip di kromosom inang)
Syarat menjadi vektor
Ukuran kecil
Punya situs penyisipan
Gen penanda seleksi
Ori
Cara mengisolasi plasmid dari bakteri secara cepat
- Inokulasi dan pemanenan bakteri
- Lisis bakteri
- Netralisasi
- Pengumpulan DNA plasmid
- Pemeriksaan hasil
Konformasi DNA plasmid
DNA plasmid dapat muncul dalam lima konformasi berikut:
1. DNA utuh sepenuhnya dengan kedua untai tidak terpotong
2. DNA utuh sepenuhnya, tetapi terurai (superkoil dihilangkan)
3. DNA dalam jumlah kecil muncul setelah lisis alkali yang berlebihan; kedua untai tidak terpotong tetapi tidak berpasangan dengan benar, sehingga menghasilkan bentuk plasmid yang padat
4. DNA memiliki satu untai yang terpotong
5. DNA memiliki kedua untai yang terpotong hanya di satu tempat
- Supercoiled
- Relaxed circular
- Supercoiled denatured
- Nicked Open-circular
- Linearized
Urutan kecepatan DNA conformations di gel dari yang terlambat hingga yang tercepat
- Nicked open circular
- Linier
- Relaxed circular
- Supercoiled denatured
- Supercoiled
Lisis bakteri menggunakan
panas, deterjen (SDS atau Triton-114), alkali (NaOH)