Analisis Tanaman Transgenik 1 Flashcards
Tanaman transgenik
1. Regenerasi tunas dari kalus … : tunas transgenik …
2. Setiap tunas berasal dari sel yang berbeda disebut …
- resisten higromisin, putatif=dugaan
- Klon independen
Analisis tanaman transgenik
1. Gen sasaran diwariskan dan stabil
2. Gen sasaran diekspresikan
- Analisis integrasi dengan PCR, analisis southern = DNA, analisis stabilitas gen
- Analisis ekspresi gen = qPCR (quantitative), analisis nothern, analisis western
Analisis integrasi transgen
1. PCR
-Lokasi primer: promotor dan internal gen target
-Analisis kualitatif
-Jumlah gen sisipan tidak diketahui
Analisis integrasi transgen
2. Hibridisasi southern (menggunakan pelacak)
- Analisis kuantitatif > ada atau tidak ada signal hibridisasi
- Jumlah gen sisipan diketahui
Hibridisasi southern
1. Yang dilacak
2. Pelacak
- DNA
- DNA
Hibridisasi nourthen
1. Yang dilacak
2. Pelacak
- RNA (mRNA)
- DNA
Analisis ekspresi gen secara kuantitatif memerlukan gen standar yaitu
House keeping gene seperti actin dan ubiquitin
Hibridisasi western
1. Yang dilacak
2. Pelacak
- Protein hasil ekspresi gen
- Antibodi dari protein sasaran
Transfer DNA pada membran menggunakan teknik vacuum blotting urutan susunannya dari atas
Buffer
Gel agarose
Membran nylon
Plastik kedap
Papan porus