DNA Cloning Flashcards

1
Q

Enzim yang digunakan untuk
1. Pemotongan DNA secara spesifik
2. Penyambungan DNA secara spesifik

A
  1. Restriksi endonuklease
  2. Ligase
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
1
Q

Melastoma malabathricum
1. Toleran terhadap
2. Akumulator tinggi terhadap
3. Indikator
4. Asli

A
  1. asam + Al
  2. Al
  3. tanah asam
  4. hutan hujan tropis
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Pembentukan kultur in vitro M. malabathricum, lebih baik dalam (1) daripada dalam medium (2) (tanpa hormon pertumbuhan)

A
  1. MS
  2. NN
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Sintesis cDNA RT-PCR
1. cDNA MaMrp fragment
2. cDNA MaMfs fragment
3. cDNA MaMt2 fragment

A
  1. 640 bp
  2. 500 pb
  3. 300 pb
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

rRNA eukariot

A

28S
18S
5.8S
5S

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

rRNA Prokariot

A

23S
16S
5S

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Elusi fragmen DNA
1. Gel yang mengandung fragmen DNA sasaran dipotong di atas
2. DNA diisolasi dari

A
  1. UV
  2. Gel agarosa
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Construction of over-expression vector
pGWB5-MmCu/Zn-SOD-1

A

RB ~ NosP ~ NPT II ~ NosT ~ 35SP ~ MmCu/Zn-SOD-1 ~ GFP ~ NosT ~ 35S::HPT ~ LB

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Kepanjangan dari
1. Nos
2. NPT
3. GFP
4. HPT

A
  1. Nospaline synthase
  2. Neomycin phosphotransferase
  3. Green Fluoresceine Proteine
  4. Higromycine phosphotransferase
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

35SP

A

Promoter kuat 35 S CaMV (Cauliflower mosaic virus)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Tidak ada di tanaman dimasukkan untuk transkripsi SOD lebih cepat tanpa tanaman harus stress dan membuat SOD jadi ditranskripsi terus menerus

A

Promotor 35SP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Vektro rekombinan diperbanyak di

A

E. coli DH5a

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Heat shock transformation menggunakan lingkungan kaya kalsium yang disediakan oleh (1) untuk melawan tolakan elektrostatik antara (2).

A
  1. kalsium klorida
  2. DNA plasmid dan membran sel bakteri
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Heat shock transformation
Peningkatan suhu yang tiba-tiba menciptakan pori-pori di (1) dan memungkinkan (2).

A
  1. membran plasma bakteri
  2. DNA plasmid memasuki sel bakteri
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Competent cell

Prosedur
1. Inokulasikan kultur … ke dalam media LB dan inkubasi pada suhu … selama … dengan pengocokan kuat pada kecepatan …
2. Tuangkan … kultur yang tumbuh ke dalam … LB dalam labu berbentuk kerucut …. Panaskan kaldu hingga suhu …
3. Inkubasi pada suhu … dengan pengocokan pada kecepatan …
4. Pantau pertumbuhan secara teratur hingga … mencapai …
5. Setelah pertumbuhan yang sesuai tercapai, dinginkan kultur di atas …

A
  1. E. coli, 37C, 24 jam, 180 rpm
  2. 0,5 ml, 50 ml, 200 ml, 37C
  3. 37C, 180 rpm
  4. OD600, 0,35-0,4
  5. Es
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Prosedur lanjutan

  1. Pindahkan kultur ke tabung sentrifus autoklaf dan kumpulkan pelet sel dengan sentrifugasi pada … selama … pada suhu …. Buang supernatan
  2. Suspensikan kembali pelet sel dalam … larutan … dingin. Inkubasi sel yang disuspensikan kembali di atas es selama …
  3. Kumpulkan pelet sel dengan sentrifugasi pada … selama … pada suhu …
A
  1. 6000 rpm, 5 menit, 4C
  2. 20 ml, CaCl2 50-mM, 20 menit
  3. 6000 rpm, 5 menit, 4C
16
Q

Proses lanjutan

  1. Suspensikan kembali sel dengan … dingin. Jika diperlukan untuk menyimpan sel kompeten dalam jangka waktu lebih lama, suspensikan kembali sel dengan … dingin yang mengandung …
  2. Gunakan … sel kompeten yang telah disiapkan untuk transformasi
  3. Tuangkan sel kompeten ke dalam alikuot … dan simpan pada suhu … untuk penggunaan lebih lanjut
A
  1. 2,5 ml CaCl2 50-mM, 2,5 ml CaCl2 50-mM, 10% gliserol
  2. 100 mikroL
  3. 100 mikroL, -80C
17
Q

Genetic transformation of E. coli

  1. Ambil E. coli yang kompeten dari freezer -80C
    a. Gunakan sel … dalam banyak kasus
    b. Jika ingin memotong di situs enzim Xbal atau DAM lainnya, gunakan sel … yang kekurangan metilase Dam dan Dcm
  2. Nyalakan penangas air hingga …
  3. Masukkan sel yang kompeten ke dalam tabung … (Eppendorf atau yang serupa). Untuk mengubah konstruksi DNA, gunakan … sel yang kompeten. Untuk mengubah ligasi, gunakan … sel yang kompeten. Anda mungkin memerlukan lebih banyak atau lebih sedikit sel, tergantung seberapa kompetennya mereka
  4. Simpan tabung di atas …
  5. Tambahkan … DNA melingkar ke dalam sel E. coli. Inkubasi di atas es selama … untuk mencairkan sel yang kompeten
A
  1. a. DH5a
    b. SCS110
  2. 42C
  3. 1,5 ml, 50 mikroL, 100 mikroL
  4. es
  5. 50 ng, 10 menit
18
Q

Genetic transformation of E. coli (lanjutan)

  1. Masukkan tabung berisi DNA dan E. coli ke dalam air bersuhu … selama …
  2. Masukkan kembali tabung ke dalam es selama … untuk mengurangi kerusakan pada sel E. coli
  3. Tambahkan … (tanpa tambahan antibiotik). Inkubasi tabung selama … pada suhu …. (Tabung tidak dapat diinkubasi selama 30 menit, kecuali jika mencoba menumbuhkan DNA untuk ligasi yang lebih sensitif. Untuk ligasi, biarkan tabung selama 1 jam)
  4. Sebarkan sekitar … kultur yang dihasilkan pada pelat LB (dengan tambahan antibiotik yang sesuai - biasanya …) Tumbuhkan semalaman
  5. Pilih koloni sekitar … kemudian
A
  1. 42C, 45 detik
  2. 2 menit
  3. 1 ml LB, 1 jam, 37C
  4. 100 mikroL, Ampisilin atau Kanamisin
  5. 12-16 jam
19
Q

Vektor berbasis T-DNA MiniTi untuk tanaman

Vektor yang dilucuti: tidak menghasilkan tumor; dapat digunakan untuk meregenerasi tanaman normal yang mengandung gen asing

  1. Vektor biner: gen … yang diperlukan untuk mobilisasi dan transfer ke tanaman berada pada … yang dimodifikasi
  2. Terdiri dari urutan …, penanda yang dapat dipilih (…), dan … untuk penyisipan gen asing
A
  1. vir, pTi
  2. RB dan LB, resistensi kanamisin, polilinker