Nutritionell metabolik - Kap 12

Question 1

Vad är metabolomik?

Answer 1

Metabolomik- Vetenenskapliga studier av kemiska processer som
involverar små molekyler eller metaboliter i en given cell, vävnad eller
organism. Systematiska studier av det unika fingeravtryck specifika
cellulära processer lämnar.

Metabolom- Alla små metaboliter i en cell, vävnad eller organism

Question 2

Vilken nivå är en metaboliter

Answer 2

de är molekyler

Exponering
Mikrobiota
Livsmedel
Läkemedel
Föroreningar
Strålning

Question 3

vad är det för skillnad på targeted och untargeted?

Answer 3

“Targeted” metabolomik
- Kvantifiering av
specifika metaboliter

“Untargeted” metabolomik
- Upptäcka biomarkörer,
relativa förändringar

Question 4

Vad finns det för utmaningar?

Answer 4

Utmaning: kontrollera, estimera och hantera variabilitet

Question 5

Pre-analytiska felkällor (före analysfasen)

Answer 5

• Val av rör
• Hanteringstid och temperatur
• Centrifugering
• Hanteringstid och temperatur
• Frysning
• Frys-tingings-cykler

Question 6

Provtagningsrelaterade faktorer

Answer 6

Blod
• Typ av prov (helblod, serum, plasma, torkat blod
• Tillsatser
• Hemolys
• Koaguleringstid
• Volym
• Korttidsförvaring och tid till analys
• Fördröjning från provtagning till analys
Urin
• 24-h, ”spot”, övernatt-urin, morgonurin, annat intervall
• Konserveringsmedel
• Centrifugering
• inkomplett uppsamling (24-h urin). PABA kan användas för att kontrollera

Question 7

Vad kan variation i provtagning ge?

Answer 7

försämrad datakvalite om behandlar olika

Question 8

Vilka frågor ska man ställa till sig själv angående proven?

Answer 8

1. Kan vi förutsäga provhistorik?

2. Kan vi korrigera för den?

Question 9

Hur presterar modellerna

med oberoende data?

Answer 9

• Temperatur: 98% korrekt klassade!
• Tid vid 22C: Signifikanta skillnader
mellan dagar för prep:
   - Samma dag
   - Nästa dag
   - Nästnästa dag

Question 10

Slutsatser

Answer 10

• Vi kan prediktera lagringstemperatur och lagringstid
• Förändringar (mätta med NMR) är till stor del reproducerbara
• Vi kan korrigera för dessa förändringar
• Vi kan alltså uppnå bättre datakvalitet MEN
• Ändå bättre att ha jämnare standard i provhanteringen
• Modelleringsresultat från större / mer diversa populationer?
• Reproducerbarhet med LC-MS-metabolomik?

Question 11

Through untargeted

metabolomics

Answer 11

We can accurately predict and
reflect dietary exposure
We can identify biomarkers of
dietary exposure

Question 12

Hur kan detta användas?

Answer 12

Man kan balansera in diet, gen och microflora och sen anpassa en ny diet utifrån dessa - utifrån vilken metabotyp personen är