Nucleoside, Nukleotide & Nucleinsäure Flashcards
Wie ist ein Nukleotid aufgebaut?
- Purin- oder Pyrimidinbase
- Pentose
- 1 oder mehr Phosphatreste
Welche Nucleobasen unterschieidet man?
- Adenin
- Guanin
- Cytosin
- Uracil / Thymidin
Wie entsteht Uracil?
aus spontaner Desaminierung von Cytosin
Welche Basen entstehen aus dem katabolischen Stoffwechsels?
- Orotsäure
- Xanthin
- Hypoxanthin
- Harnsäure
Welche Basen gehören zu Pyrimidin-Derivate?
- Uracil
- Thymin
- Cytosin
- Orotsäure
Welche Basen gehören zu Purin-Derivate?
- Adenin
- Guanin
- Xanthin
- Hypoxanthin
- Harnsäure
Wie lautet die Struktur von Nukleotiden?
- N-Glycosidische Bindung zu N9 (Purinnukleotid) oder N1 (Pyrimidinnukleotid)
- haben 3 und Einbuchstabencode
Wie werden Nukleotide der Purinbase und die der Pyrimidinbase bezeichnet?
Purinbasen = -osin
Pyrimidinbasen = -idin
Welches Nucleosid & Nucleotid gehören zu Adenin?
Nucleosid: Adenosin
Nucleotid: AMP (=Adenosin-5’-Monophosphat)
Welches Nucleosid & Nucleotid gehören zu Guanin?
Nucleosid: Guanosin
Nucleotid: GMP
Welches Nucleosid & Nucleotid gehören zu Uracil?
Nucleosid: Uridin
Nucleotid: UMP
Welches Nucleosid & Nucleotid gehören zu Thymin?
Nucleosid: Thymidin
Nucleotid: dTMP
Welches Nucleosid & Nucleotid gehören zu Cytosin?
Nucleosid: Cytidin
Nucleotid: CMP
Welches Nucleosid & Nucleotid gehören zu Hypoxanthin?
Nucleosid: Inosin
Nucleotid: IMP
Welches Nucleosid & Nucleotid gehören zu Xanthin?
Nucleosid: Xanthosin
Nucleotid: XMP
Wie ist eine DNA bzw. eine RNA aufgebaut?
zwischen Mononukleotiden liegt 3’,5’-Phosphodiesterbindung
(in RNA z.T. 2’,5’-Bindung)
Hat DNA oder RNA gegen alkalische Hydrolyse eine bessere Stabilität?
DNA
Wie ist eine DNA-Doppelhelix aufgebaut?
- Anti-parallele Stränge
- Rechtsgängige Doppelhelix
- Basen zeigen in das innere & sind planar angeordnet
- Zuckerphosphat-Rückgrat weist nach außen
Wodurch wird die DNA stabilisiert?
- Mg2+-Ionen & anderen Kationen
- H-Brücken zwischen Basenpaare
- Stacking-, van-der-Waals- & hydrophobe WW
Wie sind die Basenpaare angeordnet in der DNA?
- A mit T/U (2 H-Brücken)
- G mit C (3 H-Brücken)
Wie können Proteine die Basensequenz der B-DNA erkennen?
über kleine & große Furchen
Was ist die Superspiralisierung?
geschlossene, ringförmige (Bakterien, MT) aber auch lineare DNA-Moleküle (Mensch)
-> DNA-Replikation & Transkription führen zur partieller Entwindung = Torsionsspannung
-> Lokale-Einzel oder Doppelstrangspaltung durch Topoismoerasen
Wie viele Basentripletts (Codon) können wir kodieren?
4³ = 64
Welches Basentriplett ist das Startcodon?
AUG = Met
Welches Basentriplett ist das Stoppcodon?
UAG
UGA
UAA
Welches Stoppcodon ist es bei Selenocystein?
UGA
Wo treten überlappende Leserahmen auf?
bei Retroviren
Woraus besteht ein Histon?
hat einen hohen Gehalt an basischen AS (Arg, Lys) zur Neutralisierung des polyanionischen Zuckerphosphats-Rückgrats
-> schaut aus wie Histonoktamer
Nenne die 5 wichtigsten Histonproteine
H1
H2A
H2B
H3
H4
Was ist ein Nucleosom?
DNA-Superhelix windet sich um die Histone
-> Schwanzdomäne ragen aus dem Nucleosomenkern
-> Interaktion der DNA zw. den Nucleosomen mit linker-Histonen H1
Nenne die einzelnen Schritte wie aus einem Nucleosom ein Chromosom entsteht
1) DNA-Doppelhelix
2) Nucleosomen
3) 30nm-Fasern durch spiralförmige Aufwicklung -> 100fache Kondensation
4) Faltung zu Schleife = Chromatinschleifen
5) kondensiertes Chromatin
6) Chromosom = max. Kondensation
Welches Ziel will man mit der Histonmodifikation erreichen?
Lokale Entfaltung des Chromatins für Replikation & Transkription und Rekrutierung chromatinbindender Proteine
Wie schaut ein humanes Genom aus?
- Geringere Gendichte als bei Prokaryonten
- Kaum überlappende Gene
- Aufbau der Gene aus Introns & Extrons
- nahezu auschließlich monocistronische mRNA
Wie kann man die RNA klassifizieren?
1) Codierende RNA
- mRNA der CDS ,ot 5’-cap & Poly(A)-Ende
2) Strukturelle/katalytische RNA
- rRNA
-snRNA
-snoRNA
3) RNA mit regulatorischer Funktion
- miRNA/siRNA
-Antisense-RNA
Wie ist ein Transfer-RNA aufgebaut?
- 70 bis 80 Nukleotide
- Kleeblattartige Struktur bei max. Basenpaarung, aber L-Förmige 3D-Struktur
Welche Aufgabe hat t-RNA?
- Postranslationale Einführung von Pseudouridin, Inosin, Dihydrouridin
- Beladung mit einer AS am konservierten CCA-3’-Ende des Akzeptoarms
- Erkennung der Codons in der mRNA durch Basenpaarung mit dem Anticodon
Wie lautet die Wobble-Hypothese?
- Position des Codons = 1. Position des Anticodons
-> Zahl unterschiedlicher tRNA des Menschen 48
