Nucleoside, Nukleotide & Nucleinsäure Flashcards

1
Q

Wie ist ein Nukleotid aufgebaut?

A
  • Purin- oder Pyrimidinbase
  • Pentose
  • 1 oder mehr Phosphatreste
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Q

Welche Nucleobasen unterschieidet man?

A
  • Adenin
  • Guanin
  • Cytosin
  • Uracil / Thymidin
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Q

Wie entsteht Uracil?

A

aus spontaner Desaminierung von Cytosin

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4
Q

Welche Basen entstehen aus dem katabolischen Stoffwechsels?

A
  • Orotsäure
  • Xanthin
  • Hypoxanthin
  • Harnsäure
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Q

Welche Basen gehören zu Pyrimidin-Derivate?

A
  • Uracil
  • Thymin
  • Cytosin
  • Orotsäure
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6
Q

Welche Basen gehören zu Purin-Derivate?

A
  • Adenin
  • Guanin
  • Xanthin
  • Hypoxanthin
  • Harnsäure
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7
Q

Wie lautet die Struktur von Nukleotiden?

A
  • N-Glycosidische Bindung zu N9 (Purinnukleotid) oder N1 (Pyrimidinnukleotid)
  • haben 3 und Einbuchstabencode
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8
Q

Wie werden Nukleotide der Purinbase und die der Pyrimidinbase bezeichnet?

A

Purinbasen = -osin
Pyrimidinbasen = -idin

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9
Q

Welches Nucleosid & Nucleotid gehören zu Adenin?

A

Nucleosid: Adenosin
Nucleotid: AMP (=Adenosin-5’-Monophosphat)

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10
Q

Welches Nucleosid & Nucleotid gehören zu Guanin?

A

Nucleosid: Guanosin
Nucleotid: GMP

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11
Q

Welches Nucleosid & Nucleotid gehören zu Uracil?

A

Nucleosid: Uridin
Nucleotid: UMP

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12
Q

Welches Nucleosid & Nucleotid gehören zu Thymin?

A

Nucleosid: Thymidin
Nucleotid: dTMP

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13
Q

Welches Nucleosid & Nucleotid gehören zu Cytosin?

A

Nucleosid: Cytidin
Nucleotid: CMP

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14
Q

Welches Nucleosid & Nucleotid gehören zu Hypoxanthin?

A

Nucleosid: Inosin
Nucleotid: IMP

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15
Q

Welches Nucleosid & Nucleotid gehören zu Xanthin?

A

Nucleosid: Xanthosin
Nucleotid: XMP

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16
Q

Wie ist eine DNA bzw. eine RNA aufgebaut?

A

zwischen Mononukleotiden liegt 3’,5’-Phosphodiesterbindung
(in RNA z.T. 2’,5’-Bindung)

17
Q

Hat DNA oder RNA gegen alkalische Hydrolyse eine bessere Stabilität?

A

DNA

18
Q

Wie ist eine DNA-Doppelhelix aufgebaut?

A
  • Anti-parallele Stränge
  • Rechtsgängige Doppelhelix
  • Basen zeigen in das innere & sind planar angeordnet
  • Zuckerphosphat-Rückgrat weist nach außen
19
Q

Wodurch wird die DNA stabilisiert?

A
  • Mg2+-Ionen & anderen Kationen
  • H-Brücken zwischen Basenpaare
  • Stacking-, van-der-Waals- & hydrophobe WW
20
Q

Wie sind die Basenpaare angeordnet in der DNA?

A
  • A mit T/U (2 H-Brücken)
  • G mit C (3 H-Brücken)
21
Q

Wie können Proteine die Basensequenz der B-DNA erkennen?

A

über kleine & große Furchen

22
Q

Was ist die Superspiralisierung?

A

geschlossene, ringförmige (Bakterien, MT) aber auch lineare DNA-Moleküle (Mensch)
-> DNA-Replikation & Transkription führen zur partieller Entwindung = Torsionsspannung
-> Lokale-Einzel oder Doppelstrangspaltung durch Topoismoerasen

23
Q

Wie viele Basentripletts (Codon) können wir kodieren?

A

4³ = 64

24
Q

Welches Basentriplett ist das Startcodon?

A

AUG = Met

25
Q

Welches Basentriplett ist das Stoppcodon?

A

UAG
UGA
UAA

26
Q

Welches Stoppcodon ist es bei Selenocystein?

A

UGA

27
Q

Wo treten überlappende Leserahmen auf?

A

bei Retroviren

28
Q

Woraus besteht ein Histon?

A

hat einen hohen Gehalt an basischen AS (Arg, Lys) zur Neutralisierung des polyanionischen Zuckerphosphats-Rückgrats
-> schaut aus wie Histonoktamer

29
Q

Nenne die 5 wichtigsten Histonproteine

A

H1
H2A
H2B
H3
H4

30
Q

Was ist ein Nucleosom?

A

DNA-Superhelix windet sich um die Histone
-> Schwanzdomäne ragen aus dem Nucleosomenkern
-> Interaktion der DNA zw. den Nucleosomen mit linker-Histonen H1

31
Q

Nenne die einzelnen Schritte wie aus einem Nucleosom ein Chromosom entsteht

A

1) DNA-Doppelhelix
2) Nucleosomen
3) 30nm-Fasern durch spiralförmige Aufwicklung -> 100fache Kondensation
4) Faltung zu Schleife = Chromatinschleifen
5) kondensiertes Chromatin
6) Chromosom = max. Kondensation

32
Q

Welches Ziel will man mit der Histonmodifikation erreichen?

A

Lokale Entfaltung des Chromatins für Replikation & Transkription und Rekrutierung chromatinbindender Proteine

33
Q

Wie schaut ein humanes Genom aus?

A
  • Geringere Gendichte als bei Prokaryonten
  • Kaum überlappende Gene
  • Aufbau der Gene aus Introns & Extrons
  • nahezu auschließlich monocistronische mRNA
34
Q

Wie kann man die RNA klassifizieren?

A

1) Codierende RNA
- mRNA der CDS ,ot 5’-cap & Poly(A)-Ende
2) Strukturelle/katalytische RNA
- rRNA
-snRNA
-snoRNA
3) RNA mit regulatorischer Funktion
- miRNA/siRNA
-Antisense-RNA

35
Q

Wie ist ein Transfer-RNA aufgebaut?

A
  • 70 bis 80 Nukleotide
  • Kleeblattartige Struktur bei max. Basenpaarung, aber L-Förmige 3D-Struktur
36
Q

Welche Aufgabe hat t-RNA?

A
  • Postranslationale Einführung von Pseudouridin, Inosin, Dihydrouridin
  • Beladung mit einer AS am konservierten CCA-3’-Ende des Akzeptoarms
  • Erkennung der Codons in der mRNA durch Basenpaarung mit dem Anticodon
37
Q

Wie lautet die Wobble-Hypothese?

A
  1. Position des Codons = 1. Position des Anticodons

-> Zahl unterschiedlicher tRNA des Menschen 48