Mycoses Flashcards
Défintion
- micromycètes
- macromycètes
micromycètes
= levures et moisissures
macromycètes
= champignons macro
= Sporophores/Candisophores visibles
Caractéristiques mycètes
- Organismes eucaryotes
- Sans chlorophylle
- Porteurs de spores
- Nutrition par absorption et utilisent le carbone organique (Hétérotrophes)
- Reproduction souvent asexuée, rarement sexuée
- Leur paroi cellulaire contient typiquement de la chitine et des glucanes
- Elles sont pour la plupart saprophytiques
- moins de 0.5 % sont reconnus pathogènes
Mycose - définition
- infections fongiques touchant les animaux (dont l’Homme)
- peuvent être superficielles, profondes ou systémiques
Mycologie médicale - définition
discipline distincte de la microbiologie médicale qui consiste à
isoler et à caractériser des champignons pathogènes dans le but de caractériser l’origine mycologique ou non d’une pathologie
Histoire de la Mycologie médicale
- Époque d’Hippocrate
- Moyen âge en Europe
- Hippocrates: le père de la médecine, avait identifié des sujets atteints du muguet (Candida albicans)
- Moyen âge en Europe:
des enfants infectés par Trichophyton schoenleinii
(dermatophyte-Tinea)- Champignon attaquant le cuir chevelu, la peau lisse
et les ongles
Histoire de la mycologie médicale
- 20ième siècle
– Éclosion de Sporothrix schenckii (infections sous-cutanée) chez 3000 travailleurs miniers en
Afrique du Sud (1941-1944)
– 2ème guère mondiale: apparition de zones endémiques aux USA (Histoplasma capsulatum,
agent de l’Histoplasmose)
– Ère de la suppression immunitaire et des mycoses opportunistes nosocomiales (Candidoses et aspergilloses):
- Chimiothérapie (traitement du cancer)
- Maintenance des greffons (immunosuppression)
- VIH/SIDA (1981-)
- Maladies auto-immunitaires (Arthrite, Psoriasis, sclérose en plaques, M. inflammatoires
chroniques de l’intestin: Maladie de Crohn et rectocolite hémorragique)
Histoire de la mycologie médicale
- 21ième siècle
- Développement des tests de diagnostiques: tests de mise en culture spécifiques, tests de susceptibilités aux agents antimicrobiens, identification moléculaires (séquençage de gènes ou de séquences d’ADN: ADN ribosomal et ITS)
- Développement d’antifongiques: Azoles et échinocandines
- Avancés dans la compréhension du pouvoir pathogène fongique
– Fungal Genome Initiative: séquençage de plusieurs génomes de champignons pathogènes
de l’Homme.
– Génomique fonctionnelle fongique: Analyse de transcriptomes, de proteomes, secrétomes
3 façons de classer les pathogènes fongiques
- Critères morphologiques
- Taxonomie et phylogénie
- Manifestations cliniques (sites d’infection)
Classification morphologique des mycètes
= Basée sur la forme de la croissance végétative on distingue trois types de
morphologies
- Levures (Forme levuriforme) - Moisissures (champignons filamenteux) - Champignons dimorphiques (différencient à la fois des filaments et des levures)
Classification morphologique: Levures
- complexité
- reproduction
- Nom donné aux levures pathogènes humains
- forme la + simple
- se multiplie par bourgeonnement (Saccharomyces cerevisiae) ou par fission (Schizosaccharomyces pombe)
- levures pathogènes humains sont désignées par blastoconidies
Classification morphologique: moisissures
- cell filamenteuses et cylindriques reliées bout à bout
- cell de moisissures
= hyphe - avec ou sans septum
Mycélium
= masse de hyphes
Classification morpho: Pseudohyphes
- Morphologie associée aux levures et distincte
de la forme levure et la forme hyphale - Cellules levuriformes allongées et attachées
(en forme de collier)
Classification morpho: champignons dimorphiques
caractéristiques + 2 exemples de champignons pathos de ce type
- Le dimorphisme est une caractéristique de plusieurs champignons pathogènes comme Blastomyces et Histoplasma
- Filamenteux à ~ 25°C (dans l’environnement/sol)
Levures à 37°C température corporelle
(ATTENTION pas le contraire) - caractéristique d’identification de ces champignons au laboratoire.
Classification taxonomique
- dépend de la présence/absence de reproduction sexuée (méiose) et des caractères morphologiques (présence de septum, cycle de vie et physiologie)
- utilise la phylogénie moléculaire/génétique
Pourquoi la classification taxonomique est-elle importante pour le clinicien microbiologiste? (2)
- Susceptibilité aux agents antifongiques
- Pouvoir pathogène et transmissibilité
Divisions de la classification taxonomique (5)
RÈGNE
fungi
SOUS-RÈGNE
dikarya
DIVISION
Ascomycètes
Basidioomycètes
Glomeromycota
ORDRE
Mucorale
Entomophtorale
GENRE
Candida, Aspergillus,
Cryptococcus, Malassezia
Mucor, Conidiobolus
**VOIR DIAPO 11
Classification taxonimique: Ascomycètes
- % des champignons connus
- type morpho/apparence
- reproduction
- identification au labo
- exemples
- Représentent 75% des champignons connus
- Levures ou filamenteux
- Reproduction sexuée (ascospores) ou asexuée par bourgeonnement
(blastospores/levures) ou par production de spores (conidies) - Identifiés aux laboratoires cliniques par leurs propagules ou par tests génétiques dans le cas d’espèces qui ont une croissance lente ou inexistante.
- Exemples : Candida albicans, Aspergillus fumigatus, Fusarium, Penicillium, Alternaria, Blastomyces, Histoplasma,
Classification taxonomique: Basidiomycètes
- reproduction
- apparence
- exemples
- Reproduction sexuée par formation des basidiospores (basidium) ou des conidies.
- Apparences: levures, filaments, capsules.
- Exemples : Cryptococcus neoformans, C. gattii, Schisophyllum commune, Trichosporon, Malassezia pachydermatis
Classification taxonomique: Mucorales
- c’est quoi
- nom des cell
- reproduction
- exemples
- Forme primitive des champignons
- Cellules coenocytiques
- Formation de zygospores
- Exemples : Mucor spp, Rhizopus, Lichtheimia, Apophysomyce
Classification basée sur la pathogénèse
- basée sur quoi
- types (5)
= basée sur les sites d’infections primaires
- Mycoses superficielles
- Mycoses cutanées
- Infections opportunistes systémiques
- Mycoses sous-cutanées
- Mycoses endémiques
Sites d’infections primaires: Mycoses superficielles
- c’est quoi
- un exemple
- nom du mycète causant l’exemple
= problème surtout cosmétique
- Tinea versicolor : Infection de la couche supérieure morte kératinisée de l’épiderme
- Infections causées par Malassezia
Sites d’infections primaires:
Mycoses cutanées
- causées par quoi?
- infections touchant quoi?
- Causées par des Dermatophytes
- Infections touchant la peau, les cheveux et les ongles
- Trichophyton tonsurans > T. rubrum > T. interdigitale >
Microsporum canis
Sites d’infections primaires:
Mycoses opportunistes systémiques
- infections de quoi?
- infections par qui?
- infections touchant qui?
- Infections de tous les organes
- par des champignons environnementaux (Aspergillus fumigatus), ou des endosymbiontes commensaux/Mycobiota (Candida albicans)
- Infections touchant des patients dont le système immunitaire est compromis:
- – Porteurs de VIH
- – Patients immunosupprimés: transplantation d’organes, Chimiothérapies …
- – Nouveaux nés, femmes enceintes, …
Les mycoses opportunistes systémiques peuvent-elles toucher des personnes saines?
oui
comme certains cas de champignons dimorphiques
Sites d’infections primaires: mycoses sous-cutanées
- causées comment?
- causées par qui?
- Mycoses d’implantations (suite à des piqûres ou des traumatismes transcutanés)
- Causées par des champignons mélanisés
- Exemples: Sporothrix schenckii et Madurella mycetomatis
Sites d’infections primaires: mycoses endémiques
- caractéristique
- causent quoi?
- Champignons ayant une répartition géographique restreinte.
- Causant majoritairement des infections pulmonaires qui peuvent évoluer en infections
systémiques.
3 exemples de mycoses endémiques qui peuvent s’attraper ici
- histoplasmose
- Cryptococcus gatii
- Blastomycose
Quelques facteurs de risques à mycoses invasives (3)
transplantation MPOC cancer diabète HIV
Composantes d’une cell fongique à levure (7)
- Noyau avec membrane nucléaire
- Cytoplasme
- Mitochondrie
- Vacuole
- Réseau de transport vésiculaire : Réticulum
endoplasmique et Golgi - Membrane plasmique
- Paroi cellulaire
Composantes d’une cell fongique à hyphe (10)
+ savoir les reconnaitre sur une photo (diapo 17)
- paroi est comment?
- noyau est comment?
- 3 structures qu’il n’y a pas dans les cell de levures
1- Septum avec le pore septal 2- Corps de Voronine (Woronin body) 3- Noyau avec nucléole 4- Réticulum endoplasmique 5- Mitochondrie 6- Membrane plasmique 7-Paroi cellulaire avec 3 couches: Interne (chitine), intermédiaire (glucane) et externe (mannane) 8- Vacuole 9- Golgi 10- Spitzenkorper
Quelle est la caractéristique de la membrane plasmique des cell fongiques?
présence d’érgosterol
cholestérol fongique
Ergostérol
- Stérol spécifique des champignons et de certains protozoaires et absent
chez les cellules animales - Constituant de la membrane
- Contribue à la régulation de sa fluidité
Différentes couches de la paroi cell de la cellule fongique
COUCHE EXTERNE
- mannanes
- protéines pariétales
COUCHE INTERMÉDIAIRE
- glucane
COUCHE INTERNE
-chitine
En plus des différentes couches de la paroi, qu’est-ce qu’il est possible de retrouver aussi dans la paroi? Quels champignons sont impliqués?
mélanine
chez certains champignons filamenteux
aspergillus, altermaria
Paroi cell: Chitine
- c’est quoi
- % chitine dans paroi levures
- % chitine dans paroi champignons filamenteux
Microfibres insoluble du poly ß-(1→ 4)-N -acetylglucosamine polymère associés aux glucanes
2% = levures
6% = champignons filamenteux
Paroi cell: Glucanes
% masse de la paroi
58-60% de la masse de la paroi
Paroi cell: caractéristiques des mannanes
- Hémi-cellulose
- Composants majeurs des protéines pariétales (38–40% de la masse de la paroi)
- Antigène majeure de C. albicans
Paroi cell: protéines pariétales
- c’est quoi
- fonctions
protéines GPI associées à la chitine et au glucan
fonctions:
adhésines (attachement à l’hôte), biogénèse de la paroi
Différentes parois cell fongiques
voir diapo 19
voir diapo 19
Mycoses à l’étude (5)
Aspergillus sp Cryptococcus Blastomyces Paracoccidioides sp Candida sp
Aspergillus sp - Formes possibles (4)
- Aspergillomes pulmonaire et cérébrale
- Aspergilloses pulmonaires chroniques
- Infections superficielles : Sinus, otomycose (oreille), onychomycosis (ongles)
- Allergies
Cryptococcus
- conséquences (3)
- atteint qui? (2)
- Cryptococcus gattii
- Lésions cérébrales et pulmonaires, et Méningites
- Sujets sains et immunosuprimés
Blastomyces
- sévérité
- conséquences (3)
- Blastomyces dermatitidis
- Infection fatale
- Infections pulmonaires, lésions dermiques et
ostéomyélite
Paracoccidioides sp
- conséquences (2)
- Infection pulmonaire
- Enflement des ganglions lymphatiques
Candida sp - Épidémio
- plusieurs types dont C. Albicans
- 4ième maladie nosocomiale la + commune
(associée à la contamination des instruments médicaux) - morbidité et mortalité ++chez immunosupprimés
- hospitalisation couteuse
À quoi est associée la virulence des C.albicans? Expliquez.
La virulence de C. albicans est associée à son dimorphisme:
- Hyphes (37 degrés) dédiés à l’invasion et la colonisation des organes.
- Levures (30 degrés) associées à la dissémination de C. albicans.
Autre forme possible de C.albicans
nouvelle forme commensale retrouvée dans les intestins
4 façons de dx les mycoses
- Caractéristiques morphologiques : Apparence en milieu de culture - Examen microscopique: Patho-histologie - Diagnostique moléculaire: ADN, PCR, séquençage - Diagnostique sérologique: Anticorps
3 types de thérapies fongiques + explication de chaque
- Chimique : Trois grandes classes de molécules sont utilisées incluant les azoles,
les échinochandines et les polyènes. - Immuno-modulation: Vaccination (essais cliniques en cours pour un vaccin contre les
vaginoses fongiques causées par Candida albicans et C. glabrata. - Immunothérapie: stimulation des défenses immunitaires contre les pathogènes fongiques
Thérapies antifongiques chimiques: azoles
- utilisation
- mode d’action
- utilisée contre quoi
- classes
- Les antifongiques les plus utilisés.
- Fongistatiques
(ne tue pas mais inhibe la croissance) - Utilisés contres des infections systémiques et superficielles
- Différentes sous-classes:
- – 1,2,3-Triazoles (Fluconazoles, itraconazole)
- – Imidazole (ketoconazole, Clotrimazole)
Azoles
- cible cellulaire
- cible moléculaire
- Cible cellulaire: membrane plasmique
- Cible moléculaire: Les azoles inhibent la
biosynthèse de l’Ergosterol.
Thérapies antifongiques chimiques: Échinocandines
- utilisation
- mode d’action
- utilisée contre quoi
- classes
- Exemple de mycète populaire traité avec celui-ci
- Antifongiques administrés par intraveineuse.
- Fongicides.
- Utilisés contres des infections systémiques graves.
- Différent molécules:
- – Caspofungin (Cancidas-Merck): Contre C. albicans, Aspergillus
- – Micafungin (Mycamine, Astellas Pharma): Contre C. albicans
- – Anidulafungin (Eraxis, Pfizer): Contre C. albicans
Échinocandines
- cible cellulaire
- cible moléculaire
- Cible cellulaire: Paroi cellulaire
- Cible moléculaire: Inhibent la biosynthèse des glucanes
Thérapies antifongiques chimiques: Polyènes - Amphotéricine B
- utilisation
- mode d’action
- utilisée contre quoi
- classes
- Antifongiques administrés par intraveineuse ou par voie orale.
- Fongistatiques/Fongicides (concentration-dépendante)
- Toxiques, mais la formulation sous forme de liposome (AmBisome) réduit sa toxicité.
- Spectre antifongique large:
- —Aspergillus fumigatus
- — Candida albicsans, C. glabrata, C. krusei, C. lusitaniae
- — Cryptococcus neoformans
- — Fusarium oxysporum
Pourquoi la découverte/création d’antifongique est difficle?
comme les cell des mycètes ressemblent bcp aux cell des humains, il est difficile de trouver des thérapies qui ne sont pas toxiques pour l’humain
Polyènes
- cible cellulaire
- cible moléculaire
- Cible cellulaire: membrane plasmique
- Cible moléculaire: Les polyènes inhibent la biosynthèse de l’Ergosterol et forment des pores qui fragilisent la membrane
5 limites des thérapies fongiques
- Toxicité pour toutes les molécules connues
Pourquoi?
Ressemblance des cibles thérapeutiques due à la nature eucaryotique des cellules humaines et fongiques - Les échinochandines sont insolubles.
- Nature fongistatique de certaines molécules (azoles): Problème de récurrence et résistance.
- Perte d’efficacité dans certaines niches acides (vagin et abcès)
- RESISTANCE
Résistances naturelles aux antifongiques est souvent du à quoi?
Biofilm
- Mode de vie sessile (attaché) liée à la contamination des dispositifs médicaux (Cathéters, Prothèses, Pacemakers)
- Levures, hyphes et pseudohyphes emballés
dans une matrice polysaccharidique qui
donne au biofilm une structure en 3D. - Résistance à toutes les molécules : ~ 1000x
comparée aux cellules planktoniques
Tous les champignons sont-ils sensibles aux antifongiques?
non
ex: Candida krusei et C. auris (à tout), C. glabrata (azoles)
Résistances cliniques aux antifongiques
3 mécanismes
- Altération de la cible (Modifications génétiques)
- Altération de transport: Hyper-activation des transporteurs d’efflux ABC- et MFS
- —ABC (ATP Binding Cassette) exigent de l’ATP pour l’efflux de drogues.
- — MFS (Major Facilitator Superfamily) efflux passive de drogues.
- Aneuploïdies: Trisomie de certains chromosomes
= Duplication de fragments intra-chromosomiques contenant des transporteurs d’efflux de drogues (Cas de C. albicans)
