Mycoses Flashcards
1
Q
Défintion
- micromycètes
- macromycètes
A
micromycètes
= levures et moisissures
macromycètes
= champignons macro
= Sporophores/Candisophores visibles
2
Q
Caractéristiques mycètes
A
- Organismes eucaryotes
- Sans chlorophylle
- Porteurs de spores
- Nutrition par absorption et utilisent le carbone organique (Hétérotrophes)
- Reproduction souvent asexuée, rarement sexuée
- Leur paroi cellulaire contient typiquement de la chitine et des glucanes
- Elles sont pour la plupart saprophytiques
- moins de 0.5 % sont reconnus pathogènes
3
Q
Mycose - définition
A
- infections fongiques touchant les animaux (dont l’Homme)
- peuvent être superficielles, profondes ou systémiques
4
Q
Mycologie médicale - définition
A
discipline distincte de la microbiologie médicale qui consiste à
isoler et à caractériser des champignons pathogènes dans le but de caractériser l’origine mycologique ou non d’une pathologie
5
Q
Histoire de la Mycologie médicale
- Époque d’Hippocrate
- Moyen âge en Europe
A
- Hippocrates: le père de la médecine, avait identifié des sujets atteints du muguet (Candida albicans)
- Moyen âge en Europe:
des enfants infectés par Trichophyton schoenleinii
(dermatophyte-Tinea)- Champignon attaquant le cuir chevelu, la peau lisse
et les ongles
6
Q
Histoire de la mycologie médicale
- 20ième siècle
A
– Éclosion de Sporothrix schenckii (infections sous-cutanée) chez 3000 travailleurs miniers en
Afrique du Sud (1941-1944)
– 2ème guère mondiale: apparition de zones endémiques aux USA (Histoplasma capsulatum,
agent de l’Histoplasmose)
– Ère de la suppression immunitaire et des mycoses opportunistes nosocomiales (Candidoses et aspergilloses):
- Chimiothérapie (traitement du cancer)
- Maintenance des greffons (immunosuppression)
- VIH/SIDA (1981-)
- Maladies auto-immunitaires (Arthrite, Psoriasis, sclérose en plaques, M. inflammatoires
chroniques de l’intestin: Maladie de Crohn et rectocolite hémorragique)
7
Q
Histoire de la mycologie médicale
- 21ième siècle
A
- Développement des tests de diagnostiques: tests de mise en culture spécifiques, tests de susceptibilités aux agents antimicrobiens, identification moléculaires (séquençage de gènes ou de séquences d’ADN: ADN ribosomal et ITS)
- Développement d’antifongiques: Azoles et échinocandines
- Avancés dans la compréhension du pouvoir pathogène fongique
– Fungal Genome Initiative: séquençage de plusieurs génomes de champignons pathogènes
de l’Homme.
– Génomique fonctionnelle fongique: Analyse de transcriptomes, de proteomes, secrétomes
8
Q
3 façons de classer les pathogènes fongiques
A
- Critères morphologiques
- Taxonomie et phylogénie
- Manifestations cliniques (sites d’infection)
9
Q
Classification morphologique des mycètes
A
= Basée sur la forme de la croissance végétative on distingue trois types de
morphologies
- Levures (Forme levuriforme) - Moisissures (champignons filamenteux) - Champignons dimorphiques (différencient à la fois des filaments et des levures)
10
Q
Classification morphologique: Levures
- complexité
- reproduction
- Nom donné aux levures pathogènes humains
A
- forme la + simple
- se multiplie par bourgeonnement (Saccharomyces cerevisiae) ou par fission (Schizosaccharomyces pombe)
- levures pathogènes humains sont désignées par blastoconidies
11
Q
Classification morphologique: moisissures
A
- cell filamenteuses et cylindriques reliées bout à bout
- cell de moisissures
= hyphe - avec ou sans septum
12
Q
Mycélium
A
= masse de hyphes
13
Q
Classification morpho: Pseudohyphes
A
- Morphologie associée aux levures et distincte
de la forme levure et la forme hyphale - Cellules levuriformes allongées et attachées
(en forme de collier)
14
Q
Classification morpho: champignons dimorphiques
caractéristiques + 2 exemples de champignons pathos de ce type
A
- Le dimorphisme est une caractéristique de plusieurs champignons pathogènes comme Blastomyces et Histoplasma
- Filamenteux à ~ 25°C (dans l’environnement/sol)
Levures à 37°C température corporelle
(ATTENTION pas le contraire) - caractéristique d’identification de ces champignons au laboratoire.
15
Q
Classification taxonomique
A
- dépend de la présence/absence de reproduction sexuée (méiose) et des caractères morphologiques (présence de septum, cycle de vie et physiologie)
- utilise la phylogénie moléculaire/génétique
16
Q
Pourquoi la classification taxonomique est-elle importante pour le clinicien microbiologiste? (2)
A
- Susceptibilité aux agents antifongiques
- Pouvoir pathogène et transmissibilité
17
Q
Divisions de la classification taxonomique (5)
A
RÈGNE
fungi
SOUS-RÈGNE
dikarya
DIVISION
Ascomycètes
Basidioomycètes
Glomeromycota
ORDRE
Mucorale
Entomophtorale
GENRE
Candida, Aspergillus,
Cryptococcus, Malassezia
Mucor, Conidiobolus
**VOIR DIAPO 11
18
Q
Classification taxonimique: Ascomycètes
- % des champignons connus
- type morpho/apparence
- reproduction
- identification au labo
- exemples
A
- Représentent 75% des champignons connus
- Levures ou filamenteux
- Reproduction sexuée (ascospores) ou asexuée par bourgeonnement
(blastospores/levures) ou par production de spores (conidies) - Identifiés aux laboratoires cliniques par leurs propagules ou par tests génétiques dans le cas d’espèces qui ont une croissance lente ou inexistante.
- Exemples : Candida albicans, Aspergillus fumigatus, Fusarium, Penicillium, Alternaria, Blastomyces, Histoplasma,
19
Q
Classification taxonomique: Basidiomycètes
- reproduction
- apparence
- exemples
A
- Reproduction sexuée par formation des basidiospores (basidium) ou des conidies.
- Apparences: levures, filaments, capsules.
- Exemples : Cryptococcus neoformans, C. gattii, Schisophyllum commune, Trichosporon, Malassezia pachydermatis
20
Q
Classification taxonomique: Mucorales
- c’est quoi
- nom des cell
- reproduction
- exemples
A
- Forme primitive des champignons
- Cellules coenocytiques
- Formation de zygospores
- Exemples : Mucor spp, Rhizopus, Lichtheimia, Apophysomyce
21
Q
Classification basée sur la pathogénèse
- basée sur quoi
- types (5)
A
= basée sur les sites d’infections primaires
- Mycoses superficielles
- Mycoses cutanées
- Infections opportunistes systémiques
- Mycoses sous-cutanées
- Mycoses endémiques
22
Q
Sites d’infections primaires: Mycoses superficielles
- c’est quoi
- un exemple
- nom du mycète causant l’exemple
A
= problème surtout cosmétique
- Tinea versicolor : Infection de la couche supérieure morte kératinisée de l’épiderme
- Infections causées par Malassezia
23
Q
Sites d’infections primaires:
Mycoses cutanées
- causées par quoi?
- infections touchant quoi?
A
- Causées par des Dermatophytes
- Infections touchant la peau, les cheveux et les ongles
- Trichophyton tonsurans > T. rubrum > T. interdigitale >
Microsporum canis
24
Q
Sites d’infections primaires:
Mycoses opportunistes systémiques
- infections de quoi?
- infections par qui?
- infections touchant qui?
A
- Infections de tous les organes
- par des champignons environnementaux (Aspergillus fumigatus), ou des endosymbiontes commensaux/Mycobiota (Candida albicans)
- Infections touchant des patients dont le système immunitaire est compromis:
- – Porteurs de VIH
- – Patients immunosupprimés: transplantation d’organes, Chimiothérapies …
- – Nouveaux nés, femmes enceintes, …
25
Les mycoses opportunistes systémiques peuvent-elles toucher des personnes saines?
oui
comme certains cas de champignons dimorphiques
26
Sites d'infections primaires: mycoses sous-cutanées
- causées comment?
- causées par qui?
- Mycoses d’implantations (suite à des piqûres ou des traumatismes transcutanés)
- Causées par des champignons mélanisés
- Exemples: Sporothrix schenckii et Madurella mycetomatis
27
Sites d'infections primaires: mycoses endémiques
- caractéristique
- causent quoi?
- Champignons ayant une répartition géographique restreinte.
- Causant majoritairement des infections pulmonaires qui peuvent évoluer en infections
systémiques.
28
3 exemples de mycoses endémiques qui peuvent s'attraper ici
- histoplasmose
- Cryptococcus gatii
- Blastomycose
29
Quelques facteurs de risques à mycoses invasives (3)
```
transplantation
MPOC
cancer
diabète
HIV
```
30
Composantes d'une cell fongique à levure (7)
- Noyau avec membrane nucléaire
- Cytoplasme
- Mitochondrie
- Vacuole
- Réseau de transport vésiculaire : Réticulum
endoplasmique et Golgi
- Membrane plasmique
- Paroi cellulaire
31
Composantes d'une cell fongique à hyphe (10)
+ savoir les reconnaitre sur une photo (diapo 17)
- paroi est comment?
- noyau est comment?
- 3 structures qu'il n'y a pas dans les cell de levures
```
1- Septum avec le pore septal
2- Corps de Voronine (Woronin body)
3- Noyau avec nucléole
4- Réticulum endoplasmique
5- Mitochondrie
6- Membrane plasmique
7-Paroi cellulaire avec 3 couches:
Interne (chitine), intermédiaire (glucane)
et externe (mannane)
8- Vacuole
9- Golgi
10- Spitzenkorper
```
32
Quelle est la caractéristique de la membrane plasmique des cell fongiques?
présence d'érgosterol
| cholestérol fongique
33
Ergostérol
- Stérol spécifique des champignons et de certains protozoaires et absent
chez les cellules animales
- Constituant de la membrane
- Contribue à la régulation de sa fluidité
34
Différentes couches de la paroi cell de la cellule fongique
COUCHE EXTERNE
- mannanes
- protéines pariétales
COUCHE INTERMÉDIAIRE
- glucane
COUCHE INTERNE
-chitine
35
En plus des différentes couches de la paroi, qu'est-ce qu'il est possible de retrouver aussi dans la paroi? Quels champignons sont impliqués?
mélanine
| chez certains champignons filamenteux
aspergillus, altermaria
36
Paroi cell: Chitine
- c'est quoi
- % chitine dans paroi levures
- % chitine dans paroi champignons filamenteux
Microfibres insoluble du poly ß-(1→ 4)-N -acetylglucosamine polymère associés aux glucanes
2% = levures
6% = champignons filamenteux
37
Paroi cell: Glucanes
% masse de la paroi
58-60% de la masse de la paroi
38
Paroi cell: caractéristiques des mannanes
- Hémi-cellulose
- Composants majeurs des protéines pariétales (38–40% de la masse de la paroi)
- Antigène majeure de C. albicans
39
Paroi cell: protéines pariétales
- c'est quoi
- fonctions
protéines GPI associées à la chitine et au glucan
fonctions:
adhésines (attachement à l'hôte), biogénèse de la paroi
40
Différentes parois cell fongiques
voir diapo 19
voir diapo 19
41
Mycoses à l'étude (5)
```
Aspergillus sp
Cryptococcus
Blastomyces
Paracoccidioides sp
Candida sp
```
42
Aspergillus sp - Formes possibles (4)
- Aspergillomes pulmonaire et cérébrale
- Aspergilloses pulmonaires chroniques
- Infections superficielles : Sinus, otomycose (oreille), onychomycosis (ongles)
- Allergies
43
Cryptococcus
- conséquences (3)
- atteint qui? (2)
- Cryptococcus gattii
- Lésions cérébrales et pulmonaires, et Méningites
- Sujets sains et immunosuprimés
44
Blastomyces
- sévérité
- conséquences (3)
- Blastomyces dermatitidis
- Infection fatale
- Infections pulmonaires, lésions dermiques et
ostéomyélite
45
Paracoccidioides sp
- conséquences (2)
- Infection pulmonaire
| - Enflement des ganglions lymphatiques
46
Candida sp - Épidémio
- plusieurs types dont C. Albicans
- 4ième maladie nosocomiale la + commune
(associée à la contamination des instruments médicaux)
- morbidité et mortalité ++chez immunosupprimés
- hospitalisation couteuse
47
À quoi est associée la virulence des C.albicans? Expliquez.
La virulence de C. albicans est associée à son dimorphisme:
- Hyphes (37 degrés) dédiés à l’invasion et la colonisation des organes.
- Levures (30 degrés) associées à la dissémination de C. albicans.
48
Autre forme possible de C.albicans
nouvelle forme commensale retrouvée dans les intestins
49
4 façons de dx les mycoses
```
- Caractéristiques morphologiques :
Apparence en milieu de culture
- Examen microscopique: Patho-histologie
- Diagnostique moléculaire: ADN, PCR, séquençage
- Diagnostique sérologique: Anticorps
```
50
3 types de thérapies fongiques + explication de chaque
- Chimique : Trois grandes classes de molécules sont utilisées incluant les azoles,
les échinochandines et les polyènes.
- Immuno-modulation: Vaccination (essais cliniques en cours pour un vaccin contre les
vaginoses fongiques causées par Candida albicans et C. glabrata.
- Immunothérapie: stimulation des défenses immunitaires contre les pathogènes fongiques
51
Thérapies antifongiques chimiques: azoles
- utilisation
- mode d'action
- utilisée contre quoi
- classes
- Les antifongiques les plus utilisés.
- Fongistatiques
(ne tue pas mais inhibe la croissance)
- Utilisés contres des infections systémiques et superficielles
- Différentes sous-classes:
- -- 1,2,3-Triazoles (Fluconazoles, itraconazole)
- -- Imidazole (ketoconazole, Clotrimazole)
52
Azoles
- cible cellulaire
- cible moléculaire
- Cible cellulaire: membrane plasmique
- Cible moléculaire: Les azoles inhibent la
biosynthèse de l’Ergosterol.
53
Thérapies antifongiques chimiques: Échinocandines
- utilisation
- mode d'action
- utilisée contre quoi
- classes
- Exemple de mycète populaire traité avec celui-ci
- Antifongiques administrés par intraveineuse.
- Fongicides.
- Utilisés contres des infections systémiques graves.
- Différent molécules:
- -- Caspofungin (Cancidas-Merck): Contre C. albicans, Aspergillus
- -- Micafungin (Mycamine, Astellas Pharma): Contre C. albicans
- -- Anidulafungin (Eraxis, Pfizer): Contre C. albicans
54
Échinocandines
- cible cellulaire
- cible moléculaire
- Cible cellulaire: Paroi cellulaire
| - Cible moléculaire: Inhibent la biosynthèse des glucanes
55
Thérapies antifongiques chimiques: Polyènes - Amphotéricine B
- utilisation
- mode d'action
- utilisée contre quoi
- classes
- Antifongiques administrés par intraveineuse ou par voie orale.
- Fongistatiques/Fongicides (concentration-dépendante)
- Toxiques, mais la formulation sous forme de liposome (AmBisome) réduit sa toxicité.
- Spectre antifongique large:
- ---Aspergillus fumigatus
- --- Candida albicsans, C. glabrata, C. krusei, C. lusitaniae
- --- Cryptococcus neoformans
- --- Fusarium oxysporum
56
Pourquoi la découverte/création d'antifongique est difficle?
comme les cell des mycètes ressemblent bcp aux cell des humains, il est difficile de trouver des thérapies qui ne sont pas toxiques pour l'humain
57
Polyènes
- cible cellulaire
- cible moléculaire
- Cible cellulaire: membrane plasmique
- Cible moléculaire: Les polyènes inhibent la biosynthèse de l’Ergosterol et forment des pores qui fragilisent la membrane
58
5 limites des thérapies fongiques
- Toxicité pour toutes les molécules connues
Pourquoi?
Ressemblance des cibles thérapeutiques due à la nature eucaryotique des cellules humaines et fongiques
- Les échinochandines sont insolubles.
- Nature fongistatique de certaines molécules (azoles): Problème de récurrence et résistance.
- Perte d’efficacité dans certaines niches acides (vagin et abcès)
- RESISTANCE
59
Résistances naturelles aux antifongiques est souvent du à quoi?
Biofilm
- Mode de vie sessile (attaché) liée à la contamination des dispositifs médicaux (Cathéters, Prothèses, Pacemakers)
- Levures, hyphes et pseudohyphes emballés
dans une matrice polysaccharidique qui
donne au biofilm une structure en 3D.
- Résistance à toutes les molécules : ~ 1000x
comparée aux cellules planktoniques
60
Tous les champignons sont-ils sensibles aux antifongiques?
non
ex: Candida krusei et C. auris (à tout), C. glabrata (azoles)
61
Résistances cliniques aux antifongiques
| 3 mécanismes
- Altération de la cible (Modifications génétiques)
- Altération de transport: Hyper-activation des transporteurs d’efflux ABC- et MFS
- ---ABC (ATP Binding Cassette) exigent de l’ATP pour l’efflux de drogues.
- --- MFS (Major Facilitator Superfamily) efflux passive de drogues.
- Aneuploïdies: Trisomie de certains chromosomes
= Duplication de fragments intra-chromosomiques contenant des transporteurs d’efflux de drogues (Cas de C. albicans)
