Microbiologie M1 S3 (complet) Flashcards
Par quoi est provoqué une maladie infectieuse ?
Elle est provoquée par la multiplication et la prolifération, au sein d’un macro-organisme hôte, d’agents pathogènes vivant
Que traduit une maladie infectieuse ?
Elle traduit un déséquilibre dans la relation entre le micro-organisme bactérien concerné et son hôte
Qu’est ce que ce déséquilibre implique t-il ?
Des interactions basés sur :
- Le pouvoir pathogène et la virulence spécifiques de la bactérie
- Les mécanismes de défense immunitaire
Quelles sont les 3 phases d’évolution d’une maladie infectieuse ?
- L’incubation
- L’invasion
- La période d’état
Dans l’évolution d’une maladie infectieuse, à quoi correspond la phase d’incubation ?
L’incubation correspond au temps nécessaire à la bactérie pour proliférer et/ou selon le cas, produire une quantité suffisante de toxines permettant d’induire les signes cliniques de la maladie
Dans l’évolution d’une maladie infectieuse, à quoi correspond la phrase de l’invasion ?
L’invasion se caractérise par l’apparition des premiers signes cliniques peu spécifiques (ex : fièvre)
Dans l’évolution d’une maladie infectieuse, à quoi correspond la phase de la période d’état ?
Période pendant laquelle les signes cliniques caractéristiques se manifestent permettant d’établir un diagnostic plus précis et une prise en charge adaptée.
Quand parle-t-on d’épidémie ?
A
Lorsque la propagation de la maladie infectieuse se fait sous forme de poussées.
Quand parle-t-on de pandémie ?
Lorsque la propagation de la maladie infectieuse atteint un continent entier.
Quand parle-t-on d’endémie ?
Lorsque la propagation de la maladie infectieuse atteint une faible partie de la population, et que cette proportion varie peu avec le temps.
Quand parle-t-on de cas sporadiques ?
Lorsque les manifestations de la maladie infectieuse demeurent très individuelles.
Quelles sont les 2 modes de contamination des maladies infectieuses ?
- Mode de contamination direct
- Mode de contamination indirect
A quoi correspond le mode de contamination direct des maladies infectieuses ?
- Par contact (exemple MST, à partir d’une plaie)
- Par les voies respiratoires (particules émises en toussant, en éternuant ou en parlant)
- Par morsure ou par piqûre (peuvent être transmises par un animal)
A quoi correspond le mode de contamination indirect des maladies infectieuses ?
- Par la voie aéroportée (même principe que contamination par voie respiratoire : aliments, objets ou vêtements peuvent être souillés et contaminer indirectement)
- Par les voies digestives (par des entérobactéries : presque toujours indirecte : par l’eau, les aliments mais aussi le linge …)
Dans le cadre d’infections bactériennes, quelles sont les 3 types de relations possibles entre la bactérie et son hôte ?
- Les bactéries non pathogènes : n’entraînent jamais de maladie, sauf cas très particuliers
- Les bactéries pathogènes : responsables de l’apparition d’une maladie chez l’organisme colonisé, même si bonne santé
- Les bactéries opportunistes : ne provoquent pas de maladie tant que l’individu est bien portant, devient pathogène en cas de défaillance des défenses immunitaires
Définition pouvoir pathogène
On appelle pouvoir pathogène l’ensemble des éléments permettant à un micro-organisme de s’implanter, de proliférer et de provoquer une maladie dans un organisme hôte. Il correspond à la somme du pouvoir invasif et du pouvoir toxinique
Le pouvoir pathogène d’un micro-organisme contient 2 aspects, lesquels ?
- Pouvoir pathogène invasif
- Pouvoir pathogène toxinique
Définir pouvoir pathogène invasif
C’est la capacité que possède une bactérie à pénétrer et coloniser son hôte, il est en lien direct avec les caractéristiques physiologiques du micro-organisme (faculté d’adhérence, équipement enzymatique, constitution d’un biofilm)
Quels sont les 4 éléments déterminants pour initier le processus invasif ?
- La capacité d’adhérence (pili, glycocalyx)
- Equipement enzymatique
- Capacité à détourner ou à combattre les moyens de défense
- Constitution d’un biofilm
Dans le processus invasif, à quoi sert la capacité d’adhérence ?
Elle permet l’adhérence aux muqueuses et aux membranes cellulaires
Dans le processus invasif, à quoi sert l’équipement d’enzymes ?
L’existence d’enzymes chez les bactéries permet le franchissement des muqueuses et du tissu conjonctif, elles sont capables de s’attaquer à certains constituants de ces tissus (collagènes, acide hyaluronique, fibrine…)
A l’intérieur de quelles cellules, certaines bactéries peuvent elles se multiplier ?
- Soit des cellules épithéliales
- Soit des cellules phagocytaires (macrophages)
A partir de quoi est constitué le biofilm ?
Certaines bactéries sont capables de sécréter une substance réunissant les individus présents sur le même territoire et qui leur permet d’échanger les nutriments nécessaires à leur croissance
A quoi sert le biofilm ?
Il constitue une protection contre le système immunitaire de l’hôte et contre l’action des antibiotiques et autres antiseptiques
En fonction du pouvoir invasif des bactéries, quelles infections trouvent-t-on ?
- Infections localisées (réaction inflammatoire, formation d’une zone tuméfiée, présences de pus)
- Infections locorégionales (lorsque les bactéries gagnent le système lymphatique -> ganglions)
- Infections généralisées (lorsque les bactéries franchissent les ganglions et atteignent le sang –> c’est la septicémie)
Qu’est ce que la septicémie ?
C’est lorsque les bactéries franchissent les ganglions et atteignent le sang
Définir une toxine
Une toxine est une substance produite par un organisme vivant pouvant provoquer des lésions voire même la mort de l’organisme hôte
De quoi dépend le pouvoir toxinique ?
Le pouvoir toxinique des bactéries dépend directement de leur capacité à libérer leurs toxines dans le milieu
Quelles sont les deux types de toxines que l’on retrouve au sein du monde bactérien ?
- Endotoxines
- Exotoxines
Que sont les endotoxines ?
Molécules de nature mixte, qui appartiennent à la structure bactérienne. On les retrouve en particulier chez les bactéries à Gram négatif. Elles sont libérées au moment de la mort du micro-organisme
Quels sont les effets d’une endotoxine ?
Effets très variables (ex : impact sur la circulation sanguine, diarrhée, fièvre…)
Que sont les exotoxines ?
Elles se composent le plus souvent de deux parties appelées domaines :
- L’une permettant la liaison avec la cellule cible puis sa pénétration à travers la membrane
- L’autre étant responsable des effets pathogènes.
Elles sont sécrétées pendant que le micro-organisme est encore en vie
Comment les toxines peuvent elles agir ?
Elles peuvent agir : - de manière locale
- par voie sanguine
En fonction de la nature des cellules cibles, les exotoxines peuvent avoir différents effets. Lesquels ?
- Sur le système nerveux, on parle de neurotoxines
- Sur le système digestif, il s’agit d’entérotoxines
- Sur la cellule, ce sont des cytotoxines
Comment mesurer l’activité d’une toxine ?
Il existe plusieurs paramètres pour mesurer une toxine :
- DMI (dose minimale infectante)
- DMM (dose minimale mortelle)
- DL50 (dose capable de tuer 50% des hôtes d’une population infectée en un temps donné)
A quoi correspond la DMI ?
Dose minimale infectante, correspond à la dose minimum permettant l’apparition d’une maladie
A quoi correspond la DMM ?
Dose minimale mortelle, est la dose la plus faible entraînant la mort de l’hôte dans un temps donné
Définir virulence
La virulence traduit la quantité de bactéries nécessaires pour induire l’apparition d’une maladie chez un sujet
La DMI est à mettre en lien avec … ?
Pour mesurée la virulence, il faut utiliser la DMI et la mettre en lien avec le quorum sensing
Définir le quorum sensing
Il s’agit de la capacité des bactéries présentes dans un même milieu à synthétiser des molécules appelées “auto-inducteurs” qui attirent d’autres individus sur le même territoire
Que permet cette capacité de communication intra-cellulaire ?
Elle permet une adaptation collective de l’espèce bactérienne face aux conditions du milieu : orientation vers les substrats les plus favorables, apparition de spores
Définir capacité mutagène
La capacité mutagène des bactéries, en lien avec leur capacité de transmission “horizontale” d’informations génétiques par le biais de fragments d’ADN extra-chromosomiques (plasmides), constitue également une spécificité de leur pouvoir pathogène par adaptation collective de l’espèce face aux conditions du milieu
Que signifie TIAC ?
Toxi-infections alimentaires collectives
Quelles sont les TIAC les plus fréquentes ?
- Campylobacter
- Salmonella
- Yersinia
- Staphylococcus aureus (staphylocoque doré)
- Clostridium perfringens
- Bacillus Cereus
- Listeria monocytogenes
Quelles sont les caractéristiques du campylobacter ?
- Bacilles spirales ou incurvés
à Gram négatif - Capsulé
- Mobile
- Non sporulés
- Bactéries micro-aérophiles et mésophiles
pH optimal de croissance neutre - Aw > 0,93
- Sensible à la chaleur
Quel est le mode de contamination du campylobacter ?
Alimentaire (volaille crue, lait cru et eau par défaut de chloration)
Quels sont les signes cliniques du campylobacter ?
- Diarrhée sanglante
- Douleurs abdominales
- Céphalées
- Vomissements
Pendant combien de temps pouvons nous observer les signes cliniques du campylobacter ?
3 à 6 jours
Quel est le réservoir naturel des salmonelles ?
En tant qu’enterobactéries, le réservoir naturel est le tube digestif de la plupart des animaux (mammifères, dont l’homme…)
Quelles sont les caractéristiques de la salmonella enteritidis ?
- Bacille à gram négatif
- Mobile (flagelles péritriches)
- Bactérie aéro-anaérobie facultatif
- Mésophile (croissance entre 20 et 45 degrés)
- Sensible à la pasteurisation
- Neutrophile
- Survie jusqu’à Aw = 0,35
- Entérobactérie
En fonction du milieu, combien de temps peuvent survivre les salmonelles ?
- En milieu sec : plusieurs semaines
- En milieu humide : plusieurs mois
Quelle est la température optimale de développement de la salmonelle ?
30°C
De quoi est capable la salmonelle ?
Elle est capable de fermenter le glucose (fermentation alcoolique)
Comment s’effectue la contamination pour les salmonelles
Par l’eau, les aliments (oeufs, produits laitiers à base de lait cru, charcuterie ou viandes peu ou pas préparées thermiquement), porteurs sains
Quels sont les deux types de salmonelles que l’on distingue en fonction de la gravité des pathologies ?
- Les salmonelloses majeurs
- Les salmonelloses mineures
De quoi sont responsables les salmonelloses majeurs ?
Elles sont strictement humaines, responsables des fièvres typhoïde, paratyphoïdes et de nombreuses entérocolites
De quoi sont responsables les salmonelloses mineures ?
Elles sont les plus fréquentes, responsables de gastro-entérites banales, parfois épidémiques en cas de TIAC
Qu’est ce que les salmonelles sécrètent ?
- Des entérotoxines, responsables des troubles digestifs (diarrhée)
- Une fois détruites, des molécules toxiques responsables de fièvre, et de troubles divers
Quels sont les signes cliniques en cas de la salmonelle ?
Diarrhée, parfois fièvre et frissons, vomissements, déshydratation, altération de l’état général
Quelles sont les caractéristiques de la yersinia ?
- Bacille à gram négatif
- Mésophile (entre 20 et 45°C)
- Neutrophile
- Psychrotrophe (basses températures, proche 0°C)
- Bactérie ubiquiste
En matière de pathologie humaine quelles sont les 2 souches importantes du yersinia ?
- Yersinia pesti
- Yersinia enterocolotica
De quoi est responsable la yersinia pestis ?
Elle est responsable de la peste, est une des maladies les plus destructrices de l’histoire de l’humanité. Transmise par morsure de rats ou de puces, se manifeste par une infection grave évoluant en septicémie.
Pas de traitement, mortelle.
De quoi est responsable la yersinia enterocolotica ?
Elle est responsable de TIA en lien avec son pouvoir invasif
Quelles sont les moyens de contamination de la yersinia enterocolotica ?
- Alimentaire : viande, notamment porcine, mal préparée thermiquement, lait cru ou en poudre, fruits de mer, eau contaminée.
- Tellurique : crudités mal lavées
- Fécale-orale : interhumaine ou de l’animal à l’homme
Quels sont les signes cliniques de la yersinia enterocolotica ?
Diarrhée
Fièvre
Douleurs abdominales (très localisées, surtout chez l’enfant, au niveau de la fosse iliaque droite : peut être confondue avec appendicite)
Complications rares
Quelle est le traitement de la yersinia enterocolotica ?
Traitement préventif (respect des règles d’hygiène)
Quelles sont les caractéristiques du staphylococcus aureus ?
- Coque à Gram positif
- Immobile
- Aéro-anaérobie
- Mésophile (20 à 45°C) ou psychrophile (inférieur à 20°C)
- Neutrophile
- Halophile
- Aw basse : 0,83
- Bactérie ubiquitaire, commensale de la sphère ORL chez l’homme
Quelles toxines sécrètent le staphylococcus aureus ?
Différentes toxines dont
Entéroxine thermorésistante responsable de TIAC
Quel est le mode de contamination du staphylococcus aureus ?
Alimentaire (plats préparés, eau, lait cru et dérivés) ++ après manipulation : mains sales, peau infectée, narines, cheveux
Surnommée la maladie des buffets
Quels sont les signes cliniques du staphylococcus aureus ?
- Céphalée
- Mal-être intense
- Vomissements puissants et incontrôlés (en jets)
- Parfois diarrhée aqueuses incolore
- Principal facteur d’infection nosocomiale
Quel traitement pour staphylococcus aureus ?
Traitement avant tout préventif : respect des règles de l’hygiène, lavage des mains, port de la charlotte, du masque bucco-nasal …
Quelles sont les caractéristiques du clostridium perfringens ?
- Bacille anaérobie strict
- Sporulé et capsulé
- Immobile
- Mésophile (entre 20 et 45°C)
- Neutrophile (tolérant à des variations de 5 à 8)
- Aw > 0,97
- Bactérie tellurique et ubiquiste
Quelle est la voie de contamination du clostridium perfringens ?
Voie alimentaire : plats en sauce, surgelés par non-respect des couples temps, température (spores activées par la cuisson, lors du refroidissement -> germination et donc multiplication rapide dans la viande)
Quels moyens de prévention contre le clostridium perfringens ?
- Contrôle des denrées d’origine animale
- Hygiène rigoureuse du personnel et des locaux
- Consommation immédiate de la viande après cuisson ou respect des conditions de maintien en température (>+63°C) ou de refroidissement rapide (passage à +10°C en moins de 2h puis stockage à 3°C)
- Respect des règles de décongélation et une gestion stricte des restes alimentaires
Quels sont les signes cliniques du clostridium perfringens ?
- Diarrhée glairo-sanglante profuse mais de courte durée aqueuse, souvent importante
- Accompagnée de douleurs abdominales
- Avec ou sans fièvre
- Sans vomissement
Quelles sont les caractéristiques de la bacillus cereus ?
- Bacille à Gram positif
- Mobile
- Aéro-anaérobie
- Mésophile
- Sporulée
- Halotolérant
- Aw > 0,95
Quel est le pouvoir pathogène du bacillus cereus ?
C’est un germe saprophyte pathogène opportuniste qui produit deux types de toxines
Quelles toxines sont produites par le bacillus cereus ?
- Une toxine thermostable émétisante
- Une entéroxine très thermosensible
Quel est le mode de contamination du bacillus cereus ?
Alimentaire : riz cuit, salades, certaines épices, lait (caillé), parfois viande de volaille
Quel est le surnom du bacillus cereus ?
La maladie du restaurant chinois
Quels sont les signes cliniques du bacillus cereus ?
Différents selon la toxine :
- Avec souche émétisante : nausées et vomissements
- Avec souche diarrhéigène : diarrhée aqueuse et massive
Quel est le traitement du bacillus cereus ?
Pas de traitement spécifique, moyens de prévention
Quels sont les moyens de prévention du bacillus cereus ?
- Consommation rapide après cuisson ou refroidissement rapide puis stockage adapté
- Epluchage, lavage des végétaux
- Stérilisation des épices
Quelles sont les caractéristiques de la listeria monocytogenes ?
- Bacille à Gram +
- Mobile
- Psychrotrophe
- Aéro-tolérant
- Neutrophile Halotolérant
- Aw jusqu’à 0,80
- Sensible à la chaleur, auxotrophe (vitamines B + certains acides aminés)
- Bactérie ubiquiste
Quel est le réservoir de la listeria monocytogenes ?
Réservoir animal, elle fait partie de la flore commensale de nombreuses espèces chez qui elle produit un germe pathogène opportuniste
Quel est le mode de transmission de la listeria monocytogene ?
Alimentaire : produits à base de lait cru, charcuteries, végétaux mal lavés, poissons fumés, coquillages crus
Quel est le surnom de la listeria monocytogene ?
La maladie des frigos
Lors d’infection par listeria monocytogene, quelle transmission est possible ?
Transmission placentaire possible
Quel traitement peut permettre d’écarter le risque d’infection par listeria monocytogène ?
Le traitement thermique (pasteurisation, cuisson) permet d’écarter le risque sauf si la contamination a lieu après la préparation
Quel traitement en cas d’infection par listeria monocytogène ?
On peut administrer un traitement antibiotique lors de cas confirmés, mais les mesures préventives sont essentielles
Quelles mesures préventives contre la listeria monocytogène ?
- Eviter les aliments à risque
- Procéder à des traitements préalables avant consommation
- Adopter des mesures d’hygiène rigoureuses
- Avoir un mode de conservation adapté
Quelles sont les TIAC moins fréquentes mais particulièrement dangereuses ?
- Escherichia coli (E-coli)
- Clostridium botulinum (botulisme)
Quelles sont les caractéristiques de l’escherichia coli ?
- Colibacille mobile
- Aéro-anaérobie facultatif
- Entérobactérie
Quel est le surnom de l’escherichia coli ?
La maladie du hamburger
Quel est le mode de contamination de l’escherichia coli ?
Alimentaire : viande (bovine ++) contaminée consommée crue ou peu préparée thermiquement
Quels sont les signes cliniques de l’escherichia coli ?
- Diarrhée de gravité variable
- Douleurs abdominales (crampes)
- Populations fragiles (notamment enfants -de moins de 10 ans) : syndrome hémolytique urémique (hémolyse et insuffisance rénale réunies)
Quel est le traitement le plus efficace de l’escherichia coli ?
Le traitement préventif (prévention et respect des règles d’hygiène)
Quelles sont les caractéristiques du clostridium botulinum ?
- Sportes thermorésistantes
- Toxine la plus puissante connue
- Bactérie tellurique
La toxine produite est responsable de quelle maladie ?
Le botulisme
Quel est le mode de contamination du clostridium botulinum ?
Alimentaire : jambons artisanaux, conserves “familiales” insuffisamment stérilisées
Quels sont les signes cliniques du clostridium botulinum ?
- Blocage de la transmission neuromusculaire -> paralysies motrices et sécrétoires
- Signes digestifs secondaires
Quel cas est particulier ?
Helicobacter pylori
Quelles sont les caractéristiques de l’helicobacter pylori ?
- Bacille à gram négatif
- Mobile
- Indépendant des TIAC
- Impliqué cependant dans l’apparition de gastrites et d’ulcères pouvant dégénérer en cancers gastriques
En dehors des bactéries, de quelles origines peuvent être les TIAC ?
- D’origine virale
- Dues à des mycobactéries
- Dues à des algues
En cas de TIAC, qu’est ce qui est obligatoire ?
En cas de TIAC, les médecins et les responsables d’établissements de restau co ou à caractère social ont l’obligation d’effectuer une déclaration obligatoire (DO)
Que signifie DO ?
Déclaration obligatoire
Qui peut faire une DO ?
- Les médecins
- Les responsables d’établissements de restau co ou à caractère social
- Des consommateurs “victimes”
- D’autres personnes en ayant connaissance
Auprès de quel organisme se fait la DO ?
Auprès de l’agence régionale de santé (ARS) et/ou Direction départementale de la protection des populations (DDPP)
Que signifie ARS ?
Agence Régionale de Santé
Que signifie DDPP ?
Direction Départementale de la Protection des Populations