Métabolisme - mitochondrie Flashcards
mitochondria est une usine de
atp
la mitochondrie controle quoi
l’expression des gènes dans le noyau
énumère des rôles de la mitochondrie
- cycle a.citrique et phospho oxydative
- métabo urée
- ++ voies biosynth
- oxyd de lipides
- prod d’esp réact de O2
- entrepot Ca
- ctrl apoptose
- roles dans imm innee
2 composantes distincts de la mitochondrie
matrice
espace interstitiel
les mitochondries sont..et..
dynamiques et polymorphes
elles peuvent être hyperfusionnées ou fragmentées
CAC: c quoi les voies d’entrée du cycle de Krebs
glycolyse, pyruvate, glutamine, oxydation, acétylCoA…
CAC: l’enzyme pyruvate déshydrogénase est inhibée par quoi
NADH
CAC: nom et coenzyme de E1
-pyruvate déshydrogénase
-thiamine pyrophosphate TPP
CAC: nom et coenzyme de E2
-dihydrolipoamide
-acide lipoique
-CoA
CAC: nom et coenzyme de E3
-dihydrolipoamide déshydro
-FAD NAD
CAC: le TPP attaque pyruvate pour faire quoi
intermed qui subit une décarboxylation irrévérsible
CAC: le lipoamide fait quoi
coenz particulier.
transfert 2C de tpp
2C à CoA
oxydored en pedant e- au FAD et NAD
CAC étape 1: clé?
oui
CAC étape 1: react et prod
R: acétylCoA + oxaloacét
P: citrate
CAC étape 1: catalysée par quoi? reversible?
- par transférase
- irreversible
CAC étape 1: inhibiteurs
citrate
ATP
NADH
AcétylCoA
CAC étape 1: cmmt on exporte citrate
ans cytoplasme et ca génère actétCoA (biosynthèse lipides)
CAC étape 2: R et P
R: citrate
P: cis-aconitate (ou itaconate)
P2: isocotrate
CAC étape 2: catalysée par
lyase (isomérisation du citrate en isocitrate)
CAC étape 3: clé?
oui
CAC étape 3: R et P
R: isocitrate
P: oxalosuccinate
P2: a-cétoglutarate
CAC étape 3: réalisée comment (enzyme)
oxydoréductase
isocitrate déshydrogénase
(inhibée par NADH)
CAC étape 4: clé?
oui
CAC étape 4: R P
R: a-céta;oglutarate
P: succinyl-CoA (hème)
CAC étape 4: enzyme et inhib
oxydoreductase
a-cétoglutarate déshydro
décarbox oxydative , pyruv déshydro
(inhib succinylCoA NADH)
CAC étape 5: enzyme
ligase, succCoA
succCoA=succinate
CAC étape 6: R P
R: succi + fumarate
P: ubiquinone (tyrosine) + ubiquinol
CAC étape 6: enzyme
oxydored (chaine trnspr e-)
CAC étape 7: R P et enzyme
R: fumarate (urée)
P: Maltate
enz: lyase
CAC étape 8: R P enz
R: maltate
P: oxaloacétate
enz: oxydored prod NADH (gluconeogenese)
CAC: parle de la thermodynamic de Krebs
- e1-8 s’annulent
- e1 3 4 clé et irrevers
-e 2 5 6 7 éq - on perd C (6C à 4)
CAC: on génère quoi avc quoi
NADH =ATP
3 atp, 1 nadh, 2 atp, 1 fadh
38 ATP théorique
CAC: régulateurs
Ca, ATP, SuccinylCoA, NADH (inh 3 enz: citrate synthase, isocitrate déshy, a-cétoglut déshyd)
amphibolique veut dire quoi
à la fois catabolique et anabolique
CAC: c quoi les 6 roles de krebs
- synth hème
- participation active dans élimin a.a (urée)
- gluconéogenèse
- synth a.gras
- synth cholesterol
- synth a.a.
Hème: role et modifications
role de transport de O2 CO2 (Hb)
contient Fe
modifie niveau oxyd pour devenir cofact oxydored
Hème: quelles protéines contiennent l’hème
hémoprotéines
fam de porphyrines , base de porphine
Hème: ou a lieu la synth d’hème
mitochondrie
cytosol
mitochondrie
Hème: étape 1
-condens glycine et succinylCoA = décarboxylation
-ALA formé
-modulée par qt hème prod
Hème: étape 2
condens de 2 ALA donne porphobilinogène (pyrrole)
Hème: étape 3
former tétrapyrrole.
-) ammoniac
pas ecr hème car pas ecr fer
chaines lat pyrr trop polaires
Hème: étape 4
acétate deviennent des méthyles (décarboxyl)
Hème: étape 5
propionates deviennent vinyles par décarbox oxy
Hème: étape 6
oxyd modifie atomes azote
Hème: étape 7
Fe + azote (coordination)
Cycle Urée: ca sert à quoi
éliminer en urée les gr aminés des a.a.
Cycle Urée: c quoi 3 procédés du métabolisme
désamination
- transamination: enlever amine pour le placer sur une autre molécule
- déasmin oxydative: enlève gr aminé en ion ammonium
Cycle Urée: désamin ox génère quoi
NADPH et ammonium NH4 (doit être éliminé en urée)
Cycle Urée: en 3 étapes
- CO2 et PO4 sur NH4. carbamyl phosphate. add sur ornithine. NH3..mitoch
- arginine. son élimin. forme urée
- ornithine d’hydrolyse d’Arginine revient dans le cycle
OXPHOS: cmbn de complexes
5
1: recoil e- de nadh
2: recoit e- de succinate
3: transporte P+
4: reduct O2 en h2o
5: atp mitochondrie
OXPHOS: on trouve quoi à l’intérieur des complexes
des cofacteurs d’oxydoréductase
OXPHOS: le transport des complexes permet quoi
permet aux p+ d’aller contre le gradient pour produire ATP
les crêtes mitochondriales permettent quoi
enzymes proches des substrats = max accumulation de p+
OXPHOS: atp synthase représente quoi
un moteur qui utilise H+ pour fabriquer atp
OXPHOS: le rotor de atp synthase est composé de…
hélices alpha et peut lier les protons
OXPHOS: 1 tour du rotor génère quoi
3 atp
OXPHOS: définit L T O
L: faible liaison des substrats et produits (atp sort)
T: liaison forte (synth atp)
O: pas de liaison (relâche atp)
OXPHOS: séquence L T O
T O L T O L….
FERMENT: la fermentation produit quoi
du lactate
FERMENT: le muscle au repos a quoi comme entrants
glucose - pyruvate - acetyl CoA
FERMENT: le muscle au repos a quoi comme prods
Krebs: nadh-atp-nad+
FERMENT: le muscle en action a quoi en moins
acetyl CoA
Krebs
ATP
O2
NAD+
FERMENT: comment on obtient nadh en action
à partir du pyruvate
FERMENT: 2 types
- respiration mitochondriale (O2, cmplx4)
- nonmitoch (consomm par enzymes)
répHypox: il s’agit de quoi
réponse transcriptionnelle couplée d’un contrôle de trad de arnm spécifiques
répHypox: hypnotique peut être 2 trucs
généralisée
locale
répHypox: cause du manque d’oxygène
-ex physique
-bloc vaisseau
-inflamm,infect
-cancer
-intox
répHypox: comment on compense le manque d’O2 dans les cellules
anaérobie: cells ont un flux glycolitique. on produit moins de ATP, mais on en consomme plus.
répHypox: c quoi l’enzyme sensible au O2
prolyl hydoxylases PH
répHypox: fct du PH
modif post-trad
hsydorxylation (-OH) d’un reds prolyl
répHypox: c quoi le facteur de transcription
HIF
répHypox: 2 types de rép et leurs généralitées
-normoxie: HIF pas ds cells, module pas expres genes
-hypoxie: PH inhibées. besoin O2 pour hydroxyde substrat. HIF pas besoin de dégrader.
répHypox: comment le HIF fct sans o2
PH inhibé
HIF induit
HIF entre dans noyau et transcrit gènes de survie
répHypox: nomme 2 genes du HIF
-GLUT1: aug entrée gluc
-GAPDH, hexokin, aldol, enol: stimules angiogenèse, proinflamm, EPO
