Bases de la biochimie Flashcards

1
Q

Nomme 3 principes de la vie

A

Compartimentation
Réplication
Métabolisme

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Définit la compartimentation, réplication, métabolisme

A

c: contenir les composantes et les distinguer de l’environnement
r: traiter et transmettre des infos héréditaires à sa progéniture
m: capturer l’énergie et ressources matérielles en restant loin de l’éq thermodyn

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

nomme qq caractéristiques de la vie

A

nature organique
haut degré d’organisation
préprogrammation
interaction
adaptation
reproduction
évolution

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

c quoi les conditions qui ont mené l’histoire de la vie

A

on commence par bigbang (H,He), formation d’étoiles, et de la Terre
C O N H, forment l’atmosphère primitive, il forment les a.a. et des protéines
les protéines forment le procaryote primitif et l’eucaryote ancestral (vie)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

c’est quoi la phylogénie

A

c’est la combinaison des arches, des eucaryotes et des bactéries = arbre de la vie. Étude des liens entre les espèces.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

les principaux atomes qui composent l’humain

A

O 65%
C 18%
H 10%
N 3% (Ca, P)
Total 99%

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

l’Adulte est composé de cmbn d’Atomes et d’eau

A

7 x 1027 atomes
60% eau

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

nomme les éléments sans fonctions et toxiques

A

sans fct: Cs , Ti
too: Cd, Pb, Hg, As, radioactifs

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

nomme 3 roles des ions et du gaz

A

ions: osmolarité, pH, PA
gaz: respiration, cofact, signaux

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

nomme 3 roles des Mols simples et complexes

A

s: énergie, monomères, signaux
c: catalyse, monomères, transport

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

nomme 3 roles des polymères et des Mols complexes

A

poly: reserve, structure, isolation
complx: isolation, métabolisme, protection

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

c’est quoi le rapport complexité-système

A

plus la complexité entre les molécules augmente, plus elles seront dépendantes entres elles, plus les systèmes sont générés

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

l’intégrité du vivant dépend de quoi

A

elle dépend de la communication et de la Collaboration des molécules différentes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

nomme les diffs liaisons chimiques

A

covalentes, ioniques, coordination, dipôles (L, VdW…), H

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

les liaisons influencent quoi dans la chimie

A

la réactivité chimique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

définit la e-neg et sa fonction dans les liaisons chimiques

A

capacité d’un atome à attirer des e-
le type de liaison chimique dépend de la e-neg

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

nomme les atomes qui font des liaisons coval

A

H, O, C, N, P, S

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

comment les e- sont partagés en covalent

A

miss en commun d’une paire de e-
chaque atome fournis 1 e-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

définit liaison cov simple double

A

s: formée par 1 doublets d’e-
d: 2-3 doublets d’e-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

nomme les 5 gr O2 importants et où ils se trouvent

A

alcool: glu, a.a.
cétone: cétoses, métabolisme
aldéhyde: aldoses
a. carboxylique: a. gras, a.a.
ester: trigly

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

nomme 5 gr N, S, P et où ils se trouvent

A

amine: a.a. , nuclot
amide: pept, prot, coA, péniciline, nylon
Thiol: Cystéine, coA
pontDiS: prot, cys
phosphate: prot, a.nuc, CoA, NAD/NADH, PhLip

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

c’est quoi l’enthalpie d’une liaison

A

énergie qu’il faut fournir pour briser un lien

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

les atomes en interaction se retrouvent où

A

dans un puit de potentiel. on y fournit de l’énergie pour briser les liens

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

exo endo?

A

exo: enthalpie + que 0 (abs chaleur)
endo: enthalpie - que 0 (lib chaleur)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

l’énergie libre indique quoi

A

si la réaction peut avoir lieu, et son orientation

26
Q

comment on calcule la valeur é d’un aliment

A

avec la calorimétrie, ou avec des données connues des protéines glucides lipides et alcools

27
Q

définit la liaison de coord

A

liaison covalente ou les e- partagés proviennent slmt d’un seul atome dans l’interaction.
l’autre atome = accepteur

28
Q

donne un exemple de liaison de coordination

A

ligand + ion métal

29
Q

caractérise les interactions dipôle-ion

A

solvatation: eau NaCl (dipôle-ion)

30
Q

nomme les interactions dipôle-dipôle

A

permanent
pemanent-induit
instantané-instant/induit (London, VdW)

31
Q

l’emplacement du ion détermine quoi

A

il peut créer des dipôles transitoires = instantanés
il est pas uniforme

32
Q

décris les liaisons H

A

faible, commune
doublet e- et H
dipole-dipole
sensible à la position des atomes impliqués

33
Q

les atomes qui participent au pont H sont de quelle nature

A

nucléophile (N,O)
electrophile (H)

34
Q

les liaisons H se trouvent où

A

ADN double hélice

35
Q

les forces hydrophobes servent à quoi

A

nécessite h2o
essentiel à la formation d’une bicouche lipidique

36
Q

c quoi la relation lipide-volume

A

plus un agrégat lipidique est grand, plus le ratio surface/volume est petit

37
Q

définit hydrophile

A

aime eau. gr polaires orientés dans l’eau

38
Q

définit hydrophobe

A

aime pas eau. insoluble dans eau. lipophiles. (ex. benzène)

39
Q

définit amphiphile

A

2 caractères hydrophiles/phobes (ex. membranes)

40
Q

le caractère amphiphile du cholesterol permet quoi

A

solubiliser les graisses

41
Q

3 caractéristiques des forces faibles

A
  • se forment rapidement, transitoires
  • dépendent de l’orientation de la molécule
  • t++ les déstabilise
42
Q

nomme les facteurs qui influencent le pKa

A
  • e-negativité : plus il est ange plus il est capable de conserver la charge négative, plus il est acide
  • la résonance augmente acidité: la délocalisation de charges stabilise la molécule
43
Q

le pouvoir tampon fait quoi

A

il permet à un pH d’être stable suite à l’ajout d’un acide/base

44
Q

comment un solution devient tampon

A

si son pH s’approche du pKa

45
Q

à quel pH le pouvoir tampon est max

A

pH = pKa

46
Q

nomme des tampons dans le vivant et in vitro

A

viv: tampons phosphates, bicarbonates (7,4 pH)
vitro: HEPES, PIPES, MOPS, TRIS

47
Q

dans quelle cas le C est oxydé ou réduit dans la synthèse du glucose

A

ox: liaison C=O, charge +
red: liaison C-H, charge -

48
Q

nomme 3 caract.ristiques de la réduction du C

A
  • gain e-
  • gain H
  • perd O
49
Q

nomme 3 caractéristiques de l’ox du C

A
  • perd e-
  • perd H
  • gain O
50
Q

quand C-H augmente c quoi ? quand C-H diminue c quoi?

A

aug: redu
diminue: oxyd

51
Q

nomme 5 critères du calcul d’oxydation

A
  1. élément + lui mm = 0
  2. O2 = -2
  3. H = +1
  4. si on add degré ox = charge
  5. calcul
52
Q

diapo 86

A

c d a b

53
Q

nomme un cas d’apparition de rad libres

A

le stress oxydatif (générer bcp d’oxydants)

54
Q

c quoi un rad libre

A

porteur d’e- non apparié
très réactif
réagit avec biomols (remplir valence)

55
Q

nomme deux espèces oxyd rad ou nn rad

A

ROS, RNS

56
Q

nomme 2 caractéristiques des rads

A

plus réactifs que nn rad
nn rad = rad

57
Q

donne 4 rads oxydés

A

anion superoxide
radical hydroxyle
rad peroxyle
rad alkoxyle

58
Q

c quoi un antioxydant

A

agent qui ralentit initiation ou propag et/ou termine la chaine rad

59
Q

nomme des antioxydants célèbres

A

carotenoids
acide ascorbic, a-tacopherol
SOD
Vit C
Thiol antiox
Flavonoids

60
Q

les antioxyd peuvent être…

A

des sources alimentaires, générés par notre corps

61
Q

nomme les conséquences du stress ox

A

-proteines: maladies auto-immunes
-a.nuc: mutations, cancer
- lipoprot plasma: athérosclérose, maladies coronariennes
- a.gras: inhibition