Bases de la biochimie Flashcards by Carla Esni

Nomme 3 principes de la vie

Compartimentation
Réplication
Métabolisme

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Définit la compartimentation, réplication, métabolisme

c: contenir les composantes et les distinguer de l’environnement
r: traiter et transmettre des infos héréditaires à sa progéniture
m: capturer l’énergie et ressources matérielles en restant loin de l’éq thermodyn

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nomme qq caractéristiques de la vie

nature organique
haut degré d’organisation
préprogrammation
interaction
adaptation
reproduction
évolution

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c quoi les conditions qui ont mené l’histoire de la vie

on commence par bigbang (H,He), formation d’étoiles, et de la Terre
C O N H, forment l’atmosphère primitive, il forment les a.a. et des protéines
les protéines forment le procaryote primitif et l’eucaryote ancestral (vie)

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c’est quoi la phylogénie

c’est la combinaison des arches, des eucaryotes et des bactéries = arbre de la vie. Étude des liens entre les espèces.

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les principaux atomes qui composent l’humain

O 65%
C 18%
H 10%
N 3% (Ca, P)
Total 99%

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l’Adulte est composé de cmbn d’Atomes et d’eau

7 x 1027 atomes
60% eau

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nomme les éléments sans fonctions et toxiques

sans fct: Cs , Ti
too: Cd, Pb, Hg, As, radioactifs

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nomme 3 roles des ions et du gaz

ions: osmolarité, pH, PA
gaz: respiration, cofact, signaux

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nomme 3 roles des Mols simples et complexes

s: énergie, monomères, signaux
c: catalyse, monomères, transport

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nomme 3 roles des polymères et des Mols complexes

poly: reserve, structure, isolation
complx: isolation, métabolisme, protection

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c’est quoi le rapport complexité-système

plus la complexité entre les molécules augmente, plus elles seront dépendantes entres elles, plus les systèmes sont générés

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l’intégrité du vivant dépend de quoi

elle dépend de la communication et de la Collaboration des molécules différentes

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nomme les diffs liaisons chimiques

covalentes, ioniques, coordination, dipôles (L, VdW…), H

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les liaisons influencent quoi dans la chimie

la réactivité chimique

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définit la e-neg et sa fonction dans les liaisons chimiques

capacité d’un atome à attirer des e-
le type de liaison chimique dépend de la e-neg

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nomme les atomes qui font des liaisons coval

H, O, C, N, P, S

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comment les e- sont partagés en covalent

miss en commun d’une paire de e-
chaque atome fournis 1 e-

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définit liaison cov simple double

s: formée par 1 doublets d’e-
d: 2-3 doublets d’e-

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nomme les 5 gr O2 importants et où ils se trouvent

alcool: glu, a.a.
cétone: cétoses, métabolisme
aldéhyde: aldoses
a. carboxylique: a. gras, a.a.
ester: trigly

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nomme 5 gr N, S, P et où ils se trouvent

amine: a.a. , nuclot
amide: pept, prot, coA, péniciline, nylon
Thiol: Cystéine, coA
pontDiS: prot, cys
phosphate: prot, a.nuc, CoA, NAD/NADH, PhLip

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c’est quoi l’enthalpie d’une liaison

énergie qu’il faut fournir pour briser un lien

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les atomes en interaction se retrouvent où

dans un puit de potentiel. on y fournit de l’énergie pour briser les liens

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exo endo?

exo: enthalpie + que 0 (abs chaleur)
endo: enthalpie - que 0 (lib chaleur)

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l'énergie libre indique quoi

si la réaction peut avoir lieu, et son orientation

comment on calcule la valeur é d'un aliment

avec la calorimétrie, ou avec des données connues des protéines glucides lipides et alcools

définit la liaison de coord

liaison covalente ou les e- partagés proviennent slmt d'un seul atome dans l'interaction. l'autre atome = accepteur

donne un exemple de liaison de coordination

ligand + ion métal

caractérise les interactions dipôle-ion

solvatation: eau NaCl (dipôle-ion)

nomme les interactions dipôle-dipôle

permanent pemanent-induit instantané-instant/induit (London, VdW)

l'emplacement du ion détermine quoi

il peut créer des dipôles transitoires = instantanés il est pas uniforme

décris les liaisons H

faible, commune doublet e- et H dipole-dipole sensible à la position des atomes impliqués

les atomes qui participent au pont H sont de quelle nature

nucléophile (N,O) electrophile (H)

les liaisons H se trouvent où

ADN double hélice

les forces hydrophobes servent à quoi

nécessite h2o essentiel à la formation d'une bicouche lipidique

c quoi la relation lipide-volume

plus un agrégat lipidique est grand, plus le ratio surface/volume est petit

définit hydrophile

aime eau. gr polaires orientés dans l'eau

définit hydrophobe

aime pas eau. insoluble dans eau. lipophiles. (ex. benzène)

définit amphiphile

2 caractères hydrophiles/phobes (ex. membranes)

le caractère amphiphile du cholesterol permet quoi

solubiliser les graisses

3 caractéristiques des forces faibles

- se forment rapidement, transitoires - dépendent de l'orientation de la molécule - t++ les déstabilise

nomme les facteurs qui influencent le pKa

- e-negativité : plus il est ange plus il est capable de conserver la charge négative, plus il est acide - la résonance augmente acidité: la délocalisation de charges stabilise la molécule

le pouvoir tampon fait quoi

il permet à un pH d'être stable suite à l'ajout d'un acide/base

comment un solution devient tampon

si son pH s'approche du pKa

à quel pH le pouvoir tampon est max

pH = pKa

nomme des tampons dans le vivant et in vitro

viv: tampons phosphates, bicarbonates (7,4 pH) vitro: HEPES, PIPES, MOPS, TRIS

dans quelle cas le C est oxydé ou réduit dans la synthèse du glucose

ox: liaison C=O, charge + red: liaison C-H, charge -

nomme 3 caract.ristiques de la réduction du C

- gain e- - gain H - perd O

nomme 3 caractéristiques de l'ox du C

- perd e- - perd H - gain O

quand C-H augmente c quoi ? quand C-H diminue c quoi?

aug: redu diminue: oxyd

nomme 5 critères du calcul d'oxydation

1. élément + lui mm = 0 2. O2 = -2 3. H = +1 4. si on add degré ox = charge 5. calcul

diapo 86

c d a b

nomme un cas d'apparition de rad libres

le stress oxydatif (générer bcp d'oxydants)

c quoi un rad libre

porteur d'e- non apparié très réactif réagit avec biomols (remplir valence)

nomme deux espèces oxyd rad ou nn rad

ROS, RNS

nomme 2 caractéristiques des rads

plus réactifs que nn rad nn rad = rad

donne 4 rads oxydés

anion superoxide radical hydroxyle rad peroxyle rad alkoxyle

c quoi un antioxydant

agent qui ralentit initiation ou propag et/ou termine la chaine rad

nomme des antioxydants célèbres

carotenoids acide ascorbic, a-tacopherol SOD Vit C Thiol antiox Flavonoids

les antioxyd peuvent être...

des sources alimentaires, générés par notre corps

nomme les conséquences du stress ox

-proteines: maladies auto-immunes -a.nuc: mutations, cancer - lipoprot plasma: athérosclérose, maladies coronariennes - a.gras: inhibition