Maturation des ARNm Flashcards
Entre les eucaryotes et les procaryotes, quels ARN doivent être maturés par modification
Eucaryotes
Différence entre l’emplacement des ARNm des eucaryotes et des procaryotes
eucaryotes: dans le noyau
procaryotes: dans le cytoplasme
Où se fait la transcription et maturation des ARN des eucaryotes
Dans le noyau
Où se fait la traduction des eucaryotes
dans le cytoplasme (après transport)
Où se fait la transcription des procaryotes
cytoplasme
Où se fait la traduction des procaryotes
cytoplasme
3 étapes de la maturation de pré-ARN
addition de la coife en 5’
épissage des introns
polyadénylation
Rôle de l’ARN polymérase dans la maturation des ARN eucaryotes
recrute des protéines impliquées dans la maturation de l’ARN
Comment est ce que l’ARN polymérase recrute des protéines pour la maturation
Par sa queue hyperphosphorylée
Quelle enzyme ajoute la coiffe CAP à l’ARN polymérase
capping enzyme (CE)
Où se trouve la coiffe CAP avant d’être placée sur l’ARNm
Sur la queue hyperphosphorylée de l’ARN polymérase
Quand est-ce que la coiffe CAP de l’ARN polymérase est ajoutée
après que l’ARN polymérase aie synthétisé environ 25 nucléotides
À quel extrémité de l’ARN est-ce que la coiffe est ajoutée
5’
Molécules se trouvant sur la coiffe CAP
7-méthyl-guanosine
Fonction de la coiffe CAP sur l’ARN
Stabilité (protection contre exonucléases)
Facilite export vers cytoplasme
Stimule traduction
Pourquoi est ce que la CAP protège contre les nucléases
Car elle permet une liason inhabituelle 5’ vers 5’ au début de l’ARN, ce qui résiste contre la digestion 5’ vers 3’ des nucléases
2 facteurs de clivage qui sont portés par la queue hyperphosphorylée de l’ARN polymérase
CPSF (cleavage/polyadenylation specificity factor)
CstF (cleavage stimulation factor)
Fonction des facteurs de clivage CPSF et CstF
Sont transférés sur la séquence de terminaison AAUAAA et aide au clivage
Quelle est la séquence de terminaison de la transcription de l’ARN
AAUAAA
Fonction de la séquence AAUAAA de l’ARN
Sert de signal de clivage et à l’addition de la queue polyA
Sur quelle extrémité est recruté la Poly-A polymérase (PAP)
3’ de l’ARN
Quelle enzyme clive l’ARN
poly-A polymérase
2 fonction de la poly-A polymérase
clive l’ARN après la séquence de terminaison AAUAAA
ajout d’une chaine poly-A sur le bout 3’ de l’ARNm
Après combien de nucléotides après la séquence de terminaison est-ce qu’il y a clivage
15 nucléotides après
Est-ce que la séquence AAUAAA est la dernière séquence sur l’ARNm
Non, puisque le clivage se produit 15 nucléotides après et il y a une chaîne poly-A
Que ce passe il après l’ajout de chaine poly-A par l’enzyme PAP
recrutement de protéines PABP liant le poly-A qui assurent la stabilité de la queue polyA de l’ARNm
3 fonctions de l’addition de la queue de polyA par l’enzyme PAP
augmente la stabilité
facilite exportation vers le cytoplasme
favorise la traductionC
Comment est ce que la queue de poly-A augmente la stabilité de l’ARNm
protège l’extrémité 3’ de la dégradation progressive dans le cytoplasme
Comment est ce que la queue de poly-A favorise la traduction
identifient les molécules de ARNm matures prêtes à être traduites
Étapes avant la maturation de l’ARNm
- Début de la transcription par l’ARN polymérase
- Ajout d’une coiffe 7-méthyl-guanosine à l’extrémité 5’ du pré-ARNm dès qu’il a atteint 25 nucléotides de longueur
- ARN polymérase synthétise séquence de terminaison AAUAAA
- Facteurs de clivage CPSF et CtsF qui se trouvait sur la queue hyperphosphorylée de l’ARN polymérase vont sur le pré-ARNm et commence la formation du complexe de clivage
- Après 15 nucléotides de la séquence AAUAAA, poly-a polymérase est ajoutée au complexe et clive le pré-ARNm
- Ajout de chaine poly-A et recrutement de protéines liant le poly-A qui assurent la stabilité de la queue polyA
Que contient habituellement les premiers et derniers exons d’un gène d’un eucaryote
des séquences non-codantes en 5’ et 3’ respectivement
qu’est ce que l’épissage de lARN
processus par lequel les séquences des introns sont excisées du pré-ARN et les exons reliés entre eux pour donner naissance à l’ARNm mature
Quelle partie de la séquence doit toujours être de la même séquence, sinon l’épissage ne fonctionne pas
La jonction entre exon-intron
2 sites de la séquence essentiels à l’épissage de l’ARN
site donneur
site accepteur
Fonction des snRNR (snurps)
reconnait les séquences spécifiques des jonctions entre exons et introns 5’ 3’
assite à la coupure de l’ARN aux jonctions
relient les exons entre eux de façon covalente
Quelle est toujours la séquence de la fin d’un exon (bout 3’)
AG
Quelle est toujours la séquence du début d’Un exon (bout 5’)
G
Que représente le site donneur
passage de exon à intron
Que représente le site accepteur
passage de intron à exon
Comment s’appelle la machinerie d’épissage
spliceosome
Où se lie le U1 snRNP lors de l’épissage
jonction exon1-intron
Où se lie le U2 snRNP
jonction intron-exon 2
Quelle est la séquence du branch site
UAAC
Où se trouve le branch site
jonction intron-exon 2 (U2)
Comment se lient les U1/U2 snRNP aux jonctions exon-intron
elles possèdent de l’ARN complémentaire aux séquences d’ARN (donc par complémentarité)
Qu’est ce qui force l’association de U1 à U2 snRNP
le recrutement des snRNP U4-U5-U6
Comment se déroule l’association de U1 et U2 snRNP (2 choses)
l’adénine du branch site est amené par U2 et attaque le G en 5’ de l’intron (G du GURAGU) = formation de lasso
Relâchement u1 et u4
Comment se déroule l’association des deux exons
extrémité OH de l’exon 1 attaque le premier nucléotide G de l’exon 2 en hydrolysant le lien phsophodiester entre l’intron et l’exon 2
Que ce passe il aux snRNP et introns après l’épissage
snRNP: vont être recyclés
introns: dégradés dans le noyau
Vrai ou faux: les exons ont contribué à l’évolution
vrai
Comment s’explique la diversité des protéines
épissage alternatif
Vrai ou faux: un transcrit primaire doit toujours être épissé de la même manière selon le type de la cellule
faux, il peut être épissé différemment selon le type cellulaire
Que se produit il lors de l’épissage alternatif
élimination ou inclusion de certains exons, produisant de cette manière différents ARNm qui seront traduits en protéines différents
Rôle de l’épissage alternatif dans la transcription du gène alpha tropomyosine
Cette protéine peut controler la contraction des muscles (actine myosine)
Peut aussi réguler le cytosquelette lorsque pas dans des cellules musculaires
Est ce que le queue poly-A doivent toujours être ajouté à la même place sur un gène
Non
Fonction des activateurs et répresseurs de l’épissage
Répresseur: peut inclure un intron dans l’ARNm mature
Activateur: peut exclure un intron dans l’ARN mature
Est ce que tout les introns sont éliminés par épissage
normalement, mais certains introns peuvent se comporter comme des exons optionnels et vont être traduit en protéines
Est ce que les ARN non mature peuvent passer dans le cytoplasme
Non, les pores nucléaires de la membrane nucléaire peut reconnaitre ceux qui sont correctement mature
Protéines qui signalent aux pores nucléaires que l’ARNm a bien subi une maturation correct et est ptrête à l’exportation
protéine de liaison à la poly A
protéine de liaison à la coiffe
complexe de protéines qui se lie à la jonction d’exons
Quelle est l’étape principale pour la régulation de la plupart des gènes eucaryotes
transcription
