Maturation des ARNm Flashcards

1
Q

Entre les eucaryotes et les procaryotes, quels ARN doivent être maturés par modification

A

Eucaryotes

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Q

Différence entre l’emplacement des ARNm des eucaryotes et des procaryotes

A

eucaryotes: dans le noyau
procaryotes: dans le cytoplasme

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3
Q

Où se fait la transcription et maturation des ARN des eucaryotes

A

Dans le noyau

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4
Q

Où se fait la traduction des eucaryotes

A

dans le cytoplasme (après transport)

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5
Q

Où se fait la transcription des procaryotes

A

cytoplasme

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6
Q

Où se fait la traduction des procaryotes

A

cytoplasme

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7
Q

3 étapes de la maturation de pré-ARN

A

addition de la coife en 5’
épissage des introns
polyadénylation

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8
Q

Rôle de l’ARN polymérase dans la maturation des ARN eucaryotes

A

recrute des protéines impliquées dans la maturation de l’ARN

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9
Q

Comment est ce que l’ARN polymérase recrute des protéines pour la maturation

A

Par sa queue hyperphosphorylée

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10
Q

Quelle enzyme ajoute la coiffe CAP à l’ARN polymérase

A

capping enzyme (CE)

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11
Q

Où se trouve la coiffe CAP avant d’être placée sur l’ARNm

A

Sur la queue hyperphosphorylée de l’ARN polymérase

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12
Q

Quand est-ce que la coiffe CAP de l’ARN polymérase est ajoutée

A

après que l’ARN polymérase aie synthétisé environ 25 nucléotides

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13
Q

À quel extrémité de l’ARN est-ce que la coiffe est ajoutée

A

5’

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14
Q

Molécules se trouvant sur la coiffe CAP

A

7-méthyl-guanosine

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15
Q

Fonction de la coiffe CAP sur l’ARN

A

Stabilité (protection contre exonucléases)
Facilite export vers cytoplasme
Stimule traduction

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16
Q

Pourquoi est ce que la CAP protège contre les nucléases

A

Car elle permet une liason inhabituelle 5’ vers 5’ au début de l’ARN, ce qui résiste contre la digestion 5’ vers 3’ des nucléases

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17
Q

2 facteurs de clivage qui sont portés par la queue hyperphosphorylée de l’ARN polymérase

A

CPSF (cleavage/polyadenylation specificity factor)
CstF (cleavage stimulation factor)

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18
Q

Fonction des facteurs de clivage CPSF et CstF

A

Sont transférés sur la séquence de terminaison AAUAAA et aide au clivage

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19
Q

Quelle est la séquence de terminaison de la transcription de l’ARN

A

AAUAAA

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20
Q

Fonction de la séquence AAUAAA de l’ARN

A

Sert de signal de clivage et à l’addition de la queue polyA

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21
Q

Sur quelle extrémité est recruté la Poly-A polymérase (PAP)

A

3’ de l’ARN

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22
Q

Quelle enzyme clive l’ARN

A

poly-A polymérase

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23
Q

2 fonction de la poly-A polymérase

A

clive l’ARN après la séquence de terminaison AAUAAA
ajout d’une chaine poly-A sur le bout 3’ de l’ARNm

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24
Q

Après combien de nucléotides après la séquence de terminaison est-ce qu’il y a clivage

A

15 nucléotides après

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25
Q

Est-ce que la séquence AAUAAA est la dernière séquence sur l’ARNm

A

Non, puisque le clivage se produit 15 nucléotides après et il y a une chaîne poly-A

26
Q

Que ce passe il après l’ajout de chaine poly-A par l’enzyme PAP

A

recrutement de protéines PABP liant le poly-A qui assurent la stabilité de la queue polyA de l’ARNm

27
Q

3 fonctions de l’addition de la queue de polyA par l’enzyme PAP

A

augmente la stabilité
facilite exportation vers le cytoplasme
favorise la traductionC

28
Q

Comment est ce que la queue de poly-A augmente la stabilité de l’ARNm

A

protège l’extrémité 3’ de la dégradation progressive dans le cytoplasme

29
Q

Comment est ce que la queue de poly-A favorise la traduction

A

identifient les molécules de ARNm matures prêtes à être traduites

30
Q

Étapes avant la maturation de l’ARNm

A
  1. Début de la transcription par l’ARN polymérase
  2. Ajout d’une coiffe 7-méthyl-guanosine à l’extrémité 5’ du pré-ARNm dès qu’il a atteint 25 nucléotides de longueur
  3. ARN polymérase synthétise séquence de terminaison AAUAAA
  4. Facteurs de clivage CPSF et CtsF qui se trouvait sur la queue hyperphosphorylée de l’ARN polymérase vont sur le pré-ARNm et commence la formation du complexe de clivage
  5. Après 15 nucléotides de la séquence AAUAAA, poly-a polymérase est ajoutée au complexe et clive le pré-ARNm
  6. Ajout de chaine poly-A et recrutement de protéines liant le poly-A qui assurent la stabilité de la queue polyA
31
Q

Que contient habituellement les premiers et derniers exons d’un gène d’un eucaryote

A

des séquences non-codantes en 5’ et 3’ respectivement

32
Q

qu’est ce que l’épissage de lARN

A

processus par lequel les séquences des introns sont excisées du pré-ARN et les exons reliés entre eux pour donner naissance à l’ARNm mature

33
Q

Quelle partie de la séquence doit toujours être de la même séquence, sinon l’épissage ne fonctionne pas

A

La jonction entre exon-intron

34
Q

2 sites de la séquence essentiels à l’épissage de l’ARN

A

site donneur
site accepteur

35
Q

Fonction des snRNR (snurps)

A

reconnait les séquences spécifiques des jonctions entre exons et introns 5’ 3’
assite à la coupure de l’ARN aux jonctions
relient les exons entre eux de façon covalente

36
Q

Quelle est toujours la séquence de la fin d’un exon (bout 3’)

A

AG

37
Q

Quelle est toujours la séquence du début d’Un exon (bout 5’)

A

G

38
Q

Que représente le site donneur

A

passage de exon à intron

39
Q

Que représente le site accepteur

A

passage de intron à exon

40
Q

Comment s’appelle la machinerie d’épissage

A

spliceosome

41
Q

Où se lie le U1 snRNP lors de l’épissage

A

jonction exon1-intron

42
Q

Où se lie le U2 snRNP

A

jonction intron-exon 2

43
Q

Quelle est la séquence du branch site

A

UAAC

44
Q

Où se trouve le branch site

A

jonction intron-exon 2 (U2)

45
Q

Comment se lient les U1/U2 snRNP aux jonctions exon-intron

A

elles possèdent de l’ARN complémentaire aux séquences d’ARN (donc par complémentarité)

46
Q

Qu’est ce qui force l’association de U1 à U2 snRNP

A

le recrutement des snRNP U4-U5-U6

47
Q

Comment se déroule l’association de U1 et U2 snRNP (2 choses)

A

l’adénine du branch site est amené par U2 et attaque le G en 5’ de l’intron (G du GURAGU) = formation de lasso
Relâchement u1 et u4

48
Q

Comment se déroule l’association des deux exons

A

extrémité OH de l’exon 1 attaque le premier nucléotide G de l’exon 2 en hydrolysant le lien phsophodiester entre l’intron et l’exon 2

49
Q

Que ce passe il aux snRNP et introns après l’épissage

A

snRNP: vont être recyclés
introns: dégradés dans le noyau

50
Q

Vrai ou faux: les exons ont contribué à l’évolution

A

vrai

51
Q

Comment s’explique la diversité des protéines

A

épissage alternatif

52
Q

Vrai ou faux: un transcrit primaire doit toujours être épissé de la même manière selon le type de la cellule

A

faux, il peut être épissé différemment selon le type cellulaire

53
Q

Que se produit il lors de l’épissage alternatif

A

élimination ou inclusion de certains exons, produisant de cette manière différents ARNm qui seront traduits en protéines différents

54
Q

Rôle de l’épissage alternatif dans la transcription du gène alpha tropomyosine

A

Cette protéine peut controler la contraction des muscles (actine myosine)
Peut aussi réguler le cytosquelette lorsque pas dans des cellules musculaires

55
Q

Est ce que le queue poly-A doivent toujours être ajouté à la même place sur un gène

A

Non

56
Q

Fonction des activateurs et répresseurs de l’épissage

A

Répresseur: peut inclure un intron dans l’ARNm mature
Activateur: peut exclure un intron dans l’ARN mature

57
Q

Est ce que tout les introns sont éliminés par épissage

A

normalement, mais certains introns peuvent se comporter comme des exons optionnels et vont être traduit en protéines

58
Q

Est ce que les ARN non mature peuvent passer dans le cytoplasme

A

Non, les pores nucléaires de la membrane nucléaire peut reconnaitre ceux qui sont correctement mature

59
Q

Protéines qui signalent aux pores nucléaires que l’ARNm a bien subi une maturation correct et est ptrête à l’exportation

A

protéine de liaison à la poly A
protéine de liaison à la coiffe
complexe de protéines qui se lie à la jonction d’exons

60
Q

Quelle est l’étape principale pour la régulation de la plupart des gènes eucaryotes

A

transcription